2.3. Sample processingAll samples w

2.3. Sample processing
All samples were extracted using the Qiagen® EZ1® DNA Investigator Kit on the EZ1 Advanced Instrument (Qiagen, Venlo, Limburg, The Netherlands). The wet/dry swabbed ESDA samples were lysed separately, and the lysates were combined into a single tube for extraction on the EZ1 instrument. Quantification was performed with the Quantifiler® Duo DNA Quantification Kit (Life Technologies™, Carlsbad, CA). Samples that contained less that 0.1 nanogram per microliter (ng/μl) of DNA were concentrated with Vivacon® 500–30 K columns (Vivaproducts, Littleton, MA). Amplification was performed with the AmpFℓSTR® Identifiler®Plus PCR Amplification Kit (Life Technologies, Carlsbad, CA). A template DNA concentration of 1 ng was targeted for each amplification reaction (28 cycles, 12.5 μl reaction volumes). Capillary electrophoresis was performed on the 3130xL Genetic Analyzer (Life Technologies, Carlsbad, CA), and results were analyzed using ABI GeneMapper® v3.2.1 software (Life Technologies, Carlsbad, CA) with an analytical threshold of 50 relative fluorescent units (RFU). Appropriate substrate negative controls, extraction positives, reagent blanks, positive amplification controls, and negative amplification controls were employed. JMP® Software: Classic Design of Experiments (DOE) (SAS, Cary, NC) was used to perform trend analysis of the data based on the effects of multiple factors (i.e. substrate, collection method, and donor).

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

2.3. ตัวอย่างการประมวลผลตัวอย่างทั้งหมดถูกสกัดโดยใช้ Qiagen ® EZ1 ®ดีเอ็นเอตรวจสอบชุดบน EZ1 ขั้นสูงเครื่องมือ (Qiagen ใน Venlo, Limburg ประเทศเนเธอร์แลนด์) ตัวอย่างฝุ่น swabbed ESDA ได้ lysed แยก และ lysates ได้รวมเป็นท่อเดียวสำหรับสกัดบนหน้าปัด EZ1 นับที่ดำเนินการ ด้วย Quantifiler ® Duo ดีเอ็นเอนับชุด (™เทคโนโลยีชีวิต คาร์ลส CA) ตัวอย่างที่ประกอบด้วยน้อยที่ nanogram 0.1 ต่อไมโครลิตร (ng μl) ของดีเอ็นเอ เข้มข้น ด้วย Vivacon ® K 500 – 30 คอลัมน์ (Vivaproducts, Littleton, MA) ขยายที่ดำเนินการ ด้วย AmpFℓSTR ® Identifiler ®และ PCR ขยายชุด (เทคโนโลยีชีวิต คาร์ลส CA) แบบเข้มข้นดีเอ็นเอ 1 ng มีเป้าหมายแต่ละปฏิกิริยาขยาย (รอบ 28, 12.5 ปริมาณปฏิกิริยา μl) เส้นเลือดฝอย electrophoresis ทำตามที่ 3130xL พันธุกรรมวิเคราะห์ (เทคโนโลยีชีวิต คาร์ลส CA), และผลลัพธ์ถูกวิเคราะห์ด้วยซอฟต์แวร์ v3.2.1 ABI GeneMapper ® (เทคโนโลยีชีวิต คาร์ลส CA) ขีดจำกัดการวิเคราะห์ของหน่วยฟลูออเรส 50 ญาติ (RFU) มีจ้างควบคุมลบพื้นผิวที่เหมาะสม ทำงานผิดพลาดสกัด ช่องรีเอเจนต์ บวกขยายควบคุม และตัวควบคุมขยายลบ เจ®ซอฟต์แวร์: คลาสสิคออกแบบของทดลองจาป (SAS แครีแกรนต์ NC) ถูกใช้เพื่อทำการวิเคราะห์แนวโน้มของข้อมูลขึ้นอยู่กับผลของหลายปัจจัย (เช่นพื้นผิว วิธีเก็บ และผู้บริจาค)

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

2.3 ตัวอย่างการประมวลผล
ทั้งหมดตัวอย่างถูกสกัดโดยใช้Qiagen®EZ1®ดีเอ็นเอชุดสืบสวนใน EZ1 ขั้นสูงตราสาร (Qiagen, โล, บูร์ก, เนเธอร์แลนด์) เปียก / แห้ง swabbed ตัวอย่าง ESDA ถูก lysed แยกกันและ lysates ถูกรวมกันเป็นหลอดเดียวสำหรับการสกัดในตราสาร EZ1 ปริมาณได้ดำเนินการกับQuantifiler® Duo ดีเอ็นเอ Quantification Kit (ไลฟ์เทคโนโลยี™, คาร์ลส, CA) ตัวอย่างที่มีน้อยกว่าที่ 0.1 นาโนกรัมต่อไมโครลิตร (ng / ไมโครลิตร) ของดีเอ็นเอมีความเข้มข้นกับVivacon® 500-30 K คอลัมน์ (Vivaproducts ลิตเทิล, MA) ขยายได้ดำเนินการกับAmpFℓSTR®Identifiler®Plus PCR Amplification Kit (ไลฟ์เทคโนโลยีส์, คาร์ลส, CA) แม่แบบความเข้มข้นของดีเอ็นเอ 1 ศึกษาเป็นเป้าหมายสำหรับการเกิดปฏิกิริยาการขยายแต่ละ (28 รอบ 12.5 ไมโครลิตรปริมาณปฏิกิริยา) อิเล็กฝอยได้รับการดำเนินการเกี่ยวกับการวิเคราะห์ทางพันธุกรรม 3130xL (ไลฟ์เทคโนโลยีส์, คาร์ลส, CA) และผลที่ได้มาวิเคราะห์โดยใช้ซอฟแวร์ ABI GeneMapper® v3.2.1 (ไลฟ์เทคโนโลยีส์, คาร์ลส, CA) โดยมีเกณฑ์การวิเคราะห์ของ 50 หน่วยเรืองแสงสัมพัทธ์ (RFU) . การควบคุมเชิงลบที่เหมาะสมตั้งต้นบวกสกัดช่องว่างน้ำยาควบคุมการขยายสัญญาณบวกและควบคุมการขยายสัญญาณเชิงลบที่ถูกว่าจ้าง JMP®ซอฟท์แว: การออกแบบคลาสสิกของการทดลอง (DOE) (SAS, แครี, NC) ถูกนำมาใช้ในการดำเนินการวิเคราะห์แนวโน้มของข้อมูลที่อยู่บนพื้นฐานของผลกระทบจากหลายปัจจัย (เช่นพื้นผิววิธีการเก็บรวบรวมและบริจาค)

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

2.3 ตัวอย่างการประมวลผล
ตัวอย่างทั้งหมดที่ใช้ภายในปี® ez1 ®ดีเอ็นเอนักสืบชุดบน ez1 ขั้นสูงเครื่องมือ ( QIAGEN Venlo , Limburg , เนเธอร์แลนด์ , ) เปียก / แห้งทำความสะอาด esda จำนวน lysed ต่างหาก และ lysates ถูกรวมเป็นท่อเดียวสำหรับการสกัดใน ez1 เครื่องดนตรีปริมาณแสดงกับ quantifiler ®คู่ดีเอ็นเอปริมาณ Kit ( ไลฟ์ เทคโนโลยี™ Carlsbad , CA ) ตัวอย่างที่มีน้อยกว่า 0.1 นาโนกรัมต่อไมโครลิตร ( ng / μ L ) ของดีเอ็นเอมีความเข้มข้นกับ vivacon ® 500 – 30 K ( vivaproducts Littleton , คอลัมน์ , MA ) ขยายได้ด้วย ampf ℓ STR ® identifiler ®บวกชุดขยาย PCR ( เทคโนโลยี , Carlsbad , CA )แม่แบบดีเอ็นเอเข้มข้น 1 ng เป็นเป้าหมายสำหรับแต่ละการเพิ่มปฏิกิริยา ( 28 รอบ μ 12.5 L ปริมาณปฏิกิริยา ) ผู้ชมแสดงบน 3130xl พันธุกรรมวิเคราะห์ ( เทคโนโลยี , Carlsbad , CA ) และวิเคราะห์ผลโดยใช้ ABI genemapper ® v3.2.1 ซอฟต์แวร์ เทคโนโลยี ชีวิต Carlsbad , CA ) กับเกณฑ์วิเคราะห์ 50 หน่วยฟลูออเรสเซนต์สัมพัทธ์ ( RFU )สารสกัดในการควบคุมที่เหมาะสมลบ , บวก รีเอเจนต์ช่องว่างการควบคุม ( บวก ลบและการควบคุมแบบงาน ซอฟต์แวร์®เพลง : คลาสสิกออกแบบการทดลอง ( DOE ) ( จิม แครี่ , NC ) ถูกใช้เพื่อวิเคราะห์แนวโน้มของข้อมูลขึ้นอยู่กับปัจจัยหลาย ๆ ( เช่น ทำการเก็บรวบรวม และผู้บริจาค ) .