Genomic DNA was extracted from the mycobacterial strains. PCR-amplifications and DNA sequencing were carried out for the almost complete 16S rRNA gene, the almost complete internal transcribed spacer 1 (ITS) and the hypervariable regions of the 65 kDa heat-shock protein (hsp65) and the beta-subunit of the RNA polymerase (rpoB) genes, as previously described (Shojaei et al., 1997; Kirschner et al., 1993; McNabb et al., 2004; Ade´kambi et al., 2003; Roth et al., 1998). For each gene, the sequences were aligned with those of the most closely related mycobacterial species retrieved from the GenBank database and were analysed using CLUSTAL W (Thompson et al., 1997).
Genomic DNA ถูกแยกจากสายพันธุ์ mycobacterial PCR amplifications และลำดับดีเอ็นเอได้ดำเนินการสำหรับยีนเกือบสมบูรณ์ 16S rRNA ที่เกือบเสร็จสมบูรณ์แล้วภายในทับเป็นตัวเว้นวรรค 1 (ของ) และแคว้น hypervariable 65 kDa ไล่ความร้อนโปรตีน (hsp65) และเบต้าย่อยของอาร์เอ็นเอพอลิเมอเรส (rpoB) ยีน อธิบายไว้ก่อนหน้านี้ได้ (Shojaei และ al., 1997 Kirschner et al., 1993 McNabb et al., 2004 Ade´kambi และ al., 2003 รอดและ al., 1998) สำหรับแต่ละยีน ลำดับที่ได้สอดคล้องกับชนิด mycobacterial ที่เกี่ยวข้องอย่างใกล้ชิดที่สุดที่ดึงมาจากฐานข้อมูลของ GenBank และมี analysed ใช้ CLUSTAL W (ทอมป์สันและ al., 1997)
การแปล กรุณารอสักครู่..
ดีเอ็นเอถูกสกัดจากสายพันธุ์เชื้อ PCR-เครื่องขยายเสียงและลำดับดีเอ็นเอได้ดำเนินการเกือบเสร็จสมบูรณ์ 16S rRNA ยีนที่ถ่ายภายในเกือบเสร็จสมบูรณ์ spacer 1 (ITS) และภูมิภาค hypervariable ของโปรตีนร้อนช็อก kDa 65 (hsp65) และเบต้า subunit ของอาร์เอ็นเอ โพลิเมอร์ (rpoB) ยีนตามที่อธิบายไว้ก่อนหน้านี้ (ดโช, et al, 1997;. ริชเนอร์, et al, 1993;.. McNabb et al, 2004; Ade'kambi et al, 2003;.. Roth, et al, 1998) สำหรับยีนแต่ละลำดับถูกจัดชิดกับผู้ที่เกี่ยวข้องอย่างใกล้ชิดที่สุดสายพันธุ์เชื้อที่ดึงมาจากฐานข้อมูล GenBank และได้รับการวิเคราะห์โดยใช้ Clustal วัตต์ (ธ อมป์สัน et al., 1997)
การแปล กรุณารอสักครู่..
จีโนมดีเอ็นเอจากสายพันธุ์ดีเอ็นเอ . amplifications PCR และ ดีเอ็นเอ พบว่าสำหรับเกือบสมบูรณ์เบส 16S rRNA ยีนเกือบสมบูรณ์ภายในและ spacer 1 ( ของมัน ) และภูมิภาคออก 65 กิโลดาลตันของฮีตช็อกโปรตีน ( hsp65 ) และเบต้า subunit ของอาร์เอ็นเอพอลิเมอเรส ( rpob ) ยีน ตามที่อธิบายไว้ก่อนหน้านี้ ( shojaei et al . , 1997 ; kirschner et al ., 1993 ; เมิ่กแน็บ et al . , 2004 ; เอดใหม่ kambi et al . , 2003 ; Roth et al . , 1998 ) สำหรับแต่ละยีน ลำดับ ชิด กับ ผู้ที่เกี่ยวข้องอย่างใกล้ชิดมากที่สุดเวลาดึงข้อมูลจากฐานข้อมูลชนิดขนาดและวิเคราะห์ข้อมูลโดยใช้ clustal W ( Thompson et al . , 1997 )
การแปล กรุณารอสักครู่..