AbstractThe North American Beaver (

Abstract

The North American Beaver (Castor canadensis) is the second largest living rodent and an iconic symbol of Canada. The beaver is a semi-aquatic browser whose diet consists of lignocellulose from a variety of plants. The beaver is a hindgut fermenter and has an enlarged ceacum that houses a complex microbiome. There have been few studies examining the microbial diversity in gastrointestinal tract of hindgut fermenting herbivores. To examine the bacterial and archaeal communities inhabiting the gastrointestinal tract of the beaver, the microbiome of the ceacum and feaces was examined using culture-independent methods. DNA from the microbial community of the ceacum and feaces of 4 adult beavers was extracted, and the16S rRNA gene was sequenced using either bacterial or archaeal specific primers. A total of 1447 and 1435 unique bacterial OTUs were sequenced from the ceacum and feaces, respectively. On average, the majority of OTUs within the ceacum were classified as Bacteroidetes (49.2%) and Firmicutes (47.6%). The feaces was also dominated by OTUs from Bacteroidetes (36.8%) and Firmicutes (58.9%). The composition of bacterial community was not significantly different among animals. The composition of the ceacal and feacal microbiome differed, but this difference is due to changes in the abundance of closely related OTUs, not because of major differences in the taxonomic composition of the communities. Within these communities, known degraders of lignocellulose were identified. In contrast, to the bacterial microbiome, the archaeal community was dominated by a single species of methanogen, Methanosphaera stadtmanae. The data presented here provide the first insight into the microbial community within the hindgut of the beaver.

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

บทคัดย่ออเมริกาเหนือช่องคลอด (canadensis ลูกล้อ) เป็นหนูที่อยู่อาศัยใหญ่เป็นอันดับสองและสัญลักษณ์ที่โดดเด่นของประเทศแคนาดา ช่องคลอดเป็นเบราว์เซอร์กึ่งน้ำที่ทานอาหารที่ประกอบด้วยลิกโนเซลลูโลสจากความหลากหลายของพืช ช่องคลอดเป็นถังหมัก hindgut และมีการขยาย ceacum ที่บ้าน microbiome ซับซ้อน มีการศึกษาไม่กี่ตรวจสอบความหลากหลายของจุลินทรีย์ในทางเดินอาหารของสัตว์กินพืชหมัก hindgut เพื่อตรวจสอบชุมชนแบคทีเรียและ archaeal พำนักอยู่ในระบบทางเดินอาหารของสัตว์ชนิดหนึ่งที่ microbiome ของ ceacum และ feaces ถูกตรวจสอบโดยใช้วิธีการทางวัฒนธรรมที่เป็นอิสระ ดีเอ็นเอจากชุมชนจุลินทรีย์ของ ceacum และ feaces 4 บีเว่อผู้ใหญ่ถูกสกัดและ the16S rRNA ยีนลำดับขั้นตอนโดยใช้แบคทีเรียหรือ archaeal ไพรเมอร์ที่เฉพาะเจาะจง รวมเป็น 1447 และ 1435 ที่ไม่ซ้ำกันแบคทีเรีย Otus มีลำดับขั้นตอนจาก ceacum และ feaces ตามลำดับ โดยเฉลี่ยส่วนใหญ่ของ Otus ภายใน ceacum ที่ถูกจัดให้เป็น Bacteroidetes (49.2%) และ Firmicutes (47.6%) feaces ยังถูกครอบงำโดย Otus จาก Bacteroidetes (36.8%) และ Firmicutes (58.9%) องค์ประกอบของชุมชนแบคทีเรียไม่แตกต่างกันอย่างมีนัยสำคัญในหมู่สัตว์ องค์ประกอบของ microbiome ceacal และ feacal แตกต่างกัน แต่ความแตกต่างนี้เกิดจากการเปลี่ยนแปลงในความอุดมสมบูรณ์ของ Otus เกี่ยวข้องอย่างใกล้ชิดไม่ได้เพราะความแตกต่างที่สำคัญในองค์ประกอบของการจัดหมวดหมู่ของชุมชน ภายในชุมชนเหล่านี้เป็นที่รู้จักกันของ degraders ลิกโนเซลลูโลสที่ถูกระบุ ในทางตรงกันข้ามกับ microbiome แบคทีเรียชุมชน archaeal ถูกครอบงำโดยเป็นสายพันธุ์เดียวของ methanogen, Methanosphaera stadtmanae ข้อมูลที่นำเสนอที่นี่ให้ความเข้าใจแรกที่เข้ามาในชุมชนจุลินทรีย์ภายใน hindgut ของช่องคลอดที่

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

บทคัดย่อบีเวอร์อเมริกาเหนือ ( ละหุ่ง canadensis ) เป็นที่ใหญ่ที่สุดที่สองอยู่หนูและเป็นสัญลักษณ์ที่โดดเด่นของแคนาดา บีเวอร์เป็นสัตว์กึ่งเบราว์เซอร์ที่มีอาหารที่ประกอบด้วยลิกโนเซลลูโลสจากพืชที่หลากหลาย ช่องคลอดเป็น hindgut ถังหมัก และมีการขยาย ceacum ที่บ้านไมโครไบโ ที่ซับซ้อน มีการศึกษาน้อยการตรวจสอบความหลากหลายของจุลินทรีย์ในทางเดินอาหารของ hindgut หมักพืช การตรวจสอบเชื้อแบคทีเรียและ archaeal ชุมชนที่อาศัยอยู่ในระบบทางเดินอาหารของสัตว์ชนิดหนึ่ง , ไมโครไบโ ของ ceacum feaces และตรวจสอบวัฒนธรรมอิสระ โดยใช้วิธี ดีเอ็นเอจากชุมชนจุลินทรีย์ของ ceacum feaces 4 ผู้ใหญ่และตัวสกัด และ the16s rRNA ยีนยีนโดยใช้แบคทีเรียหรือ archaeal ไพรเมอร์จำเพาะ ทั้งหมดเป็นผู้ที่เป็นเอกลักษณ์และมีแบคทีเรียในลำดับจาก ceacum และ feaces ตามลำดับ โดยเฉลี่ยส่วนใหญ่ในภายใน ceacum แบ่งเป็น bacteroidetes ( 49.2 % ) และ Firmicutes ( 50% ) การ feaces ถูกครอบงำโดยในจาก bacteroidetes ( 36.8 % ) และ Firmicutes ( ต้น % ) องค์ประกอบของชุมชนแบคทีเรียไม่แตกต่างระหว่างสัตว์ องค์ประกอบของ ceacal feacal ไมโครไบโ และแตกต่าง แต่ความแตกต่างนี้เกิดจากการเปลี่ยนแปลงของมากมายที่เกี่ยวข้องอย่างใกล้ชิดใน ไม่ใช่เพราะความแตกต่างที่สำคัญในองค์ประกอบของการศึกษาของชุมชน ภายในชุมชนเหล่านี้ เรียกว่าความสามารถในการย่อยสลายของลิกโนเซลลูโลสถูกระบุ ในทางตรงกันข้ามกับไมโครไบโแบคทีเรีย , ชุมชน archaeal ถูกครอบงำโดยชนิดเดียวของจุลินทรีย์ methanosphaera , stadtmanae . ข้อมูลที่นำเสนอที่นี่ให้ข้อมูลเชิงลึกก่อนเข้าสู่ประชาคมจุลินทรีย์ภายใน hindgut ของบีเวอร์