This study characterized the fecal

This study characterized the fecal bacterial community structure and inter-individual variation in 30-week-old Duroc pigs, which are known for their excellent meat quality. Pyrosequencing of the V1-V3 hypervariable regions of the 16S rRNA genes generated 108,254 valid reads and 508 operational taxonomic units at a 95% identity cut-off (genus level). Bacterial diversity and species richness as measured by the Shannon diversity index were significantly greater than those reported previously using denaturation gradient gel electrophoresis; thus, this study provides substantial information related to both known bacteria and the untapped portion of unclassified bacteria in the population. The bacterial composition of Duroc pigfecal samples was investigated at the phylum, class, family, and genus levels. Firmicutes and Bacteroidetes predominated at the phylum level, while Clostridia and Bacteroidia were most abundant at the class level. This study also detected prominent inter-individual variation starting at the family level. Among the core microbiome, which was observed at the genus level, Prevotella was consistently dominant, as well as a bacterial phylotype related to Oscillibacter valericigenes, a valerate producer. This study found high bacterial diversity and compositional variation among individuals of the same breed line, as well as high abundance of unclassified bacterial phylotypes that may have important functions in the growth performance of Duroc pigs.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

ศึกษาลักษณะโครงสร้างชุมชน fecal แบคทีเรียและระหว่างแต่ละการเปลี่ยนแปลงในอายุ 30 สัปดาห์ Duroc สุกร ซึ่งเป็นที่รู้จักสำหรับคุณภาพเนื้อดีของพวกเขา Pyrosequencing ในภูมิภาค hypervariable V1 V3 ของยีน 16S rRNA สร้างอ่าน 108,254 ถูกต้องและ 508 ปฏิบัติหน่วยอนุกรมวิธานที่ตัดตัว 95% (ระดับสกุล) ความหลากหลายของแบคทีเรียและพันธุ์ร่ำรวยวัดจากดัชนีความหลากหลายแชนนอนได้อย่างมีนัยสำคัญมากกว่าที่รายงานก่อนหน้านี้ ใช้ electrophoresis denaturation เจลไล่ระดับสี ดังนั้น การศึกษานี้แสดงข้อมูลที่เกี่ยวข้องกับแบคทีเรียที่รู้จักและใช้ส่วนของแบคทีเรียไม่ได้แยกประเภทในประชากร ส่วนประกอบแบคทีเรียอย่าง pigfecal Duroc ถูกสอบสวนที่ไฟลัม คลาส ครอบครัว และระดับสกุล Bacteroidetes และ Firmicutes predominated ในระดับไฟลัม ขณะที่ Clostridia และ Bacteroidia มากที่สุดในระดับชั้น การศึกษานี้ยังพบความผันแปรระหว่างแต่ละที่โดดเด่นราคาเริ่มต้นที่ระดับครอบครัว ระหว่าง microbiome หลัก ซึ่งถูกตรวจสอบในระดับสกุล Prevotella ได้อย่างโดดเด่น เป็น phylotype แบคทีเรียที่เกี่ยวข้องกับ Oscillibacter valericigenes ผลิต valerate การศึกษานี้พบความหลากหลายทางชีวภาพของแบคทีเรียสูง compositional ความผันแปรระหว่างบุคคลบรรทัดสายพันธุ์เดียวกัน รวมทั้งความอุดมสมบูรณ์สูงของแบคทีเรียไม่ได้แยกประเภท phylotypes ที่มีฟังก์ชั่นที่สำคัญในการทำงานเจริญเติบโตของสุกร Duroc

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

การศึกษาครั้งนี้มีลักษณะโครงสร้างชุมชนแบคทีเรียในอุจจาระและการเปลี่ยนแปลงระหว่างบุคคลใน 30 สัปดาห์อายุสุกร Duroc ซึ่งเป็นที่รู้จักสำหรับคุณภาพเนื้อของพวกเขาที่ดีเยี่ยม pyrosequencing ของ V1-V3 ภูมิภาค hypervariable ของยีน 16S rRNA สร้าง 108254 ที่ถูกต้องอ่านและ 508 หน่วยอนุกรมวิธานดำเนินการใน 95% ตัวตนตัด (ระดับสกุล) ความหลากหลายและความอุดมสมบูรณ์ของแบคทีเรียสายพันธุ์ที่วัดจากดัชนีความหลากหลายนอนอย่างมีนัยสำคัญมากขึ้นกว่าที่รายงานก่อนหน้านี้โดยใช้การไล่ระดับสีเจลอิเล็ก denaturation; ดังนั้นการศึกษานี้ให้ข้อมูลที่สำคัญที่เกี่ยวข้องกับทั้งแบคทีเรียที่เป็นที่รู้จักและส่วนที่ไม่ได้ใช้ของแบคทีเรียที่ไม่เป็นความลับในประชากร องค์ประกอบของแบคทีเรีย Duroc ตัวอย่าง pigfecal ถูกตรวจสอบในไฟลัมระดับครอบครัวและระดับประเภท Firmicutes และ Bacteroidetes อำนาจในระดับไฟลัมในขณะที่ Clostridia และ Bacteroidia มีความอุดมสมบูรณ์มากที่สุดในระดับชั้นเรียน การศึกษาครั้งนี้ยังตรวจพบการเปลี่ยนแปลงระหว่างบุคคลที่ประสบความสำเร็จเริ่มต้นที่ระดับครอบครัว ท่ามกลาง microbiome หลักซึ่งได้รับการตั้งข้อสังเกตในระดับสกุล, Prevotella เป็นที่โดดเด่นอย่างต่อเนื่องเช่นเดียวกับ phylotype แบคทีเรียที่เกี่ยวข้องกับ valericigenes Oscillibacter ผู้ผลิตวา การศึกษาครั้งนี้พบความหลากหลายของเชื้อแบคทีเรียสูงและรูปแบบ compositional ในหมู่ประชาชนของสายพันธุ์เดียวกันเช่นเดียวกับความอุดมสมบูรณ์สูงของ phylotypes แบคทีเรียไม่เป็นความลับที่อาจมีหน้าที่สำคัญในการเจริญเติบโตของสุกร Duroc

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

การศึกษาลักษณะโครงสร้างชุมชนแบคทีเรีย fecal Inter และการเปลี่ยนแปลงบุคคลใน 30 สัปดาห์เก่าดูร็อคสุกรซึ่งเป็นที่รู้จักสำหรับคุณภาพเนื้อที่ยอดเยี่ยมของพวกเขา ไพโรซีเควนซิงของออกของยีน 16S rRNA ภูมิภาค v1-v3 สร้าง 108254 ถูกต้องอ่าน 508 หน่วยที่ปฏิบัติการอนุกรมวิธานและตัดตัว 95 % ( ระดับ 7 )ความหลากหลายของชนิดและความมั่งคั่งเป็นวัดโดยแชนนอนดัชนีความหลากหลายอย่างมีนัยสำคัญมากกว่าที่รายงานก่อนหน้านี้ ( การใช้เจล ดังนั้น การศึกษานี้มีข้อมูลมากที่เกี่ยวข้องกับทั้งสองรู้จักแบคทีเรียและไม่ได้ใช้ส่วนของ Unclassified แบคทีเรียในประชากรองค์ประกอบของเชื้อแบคทีเรีย pigfecal ดีที่สุดตัวอย่างถูกสอบสวนที่ไฟลัม , ชั้น , ครอบครัวและสกุลระดับ และ bacteroidetes predominated Firmicutes ระดับไฟลัม ในขณะที่ Clostridia bacteroidia ชุกชุมมากที่สุดและอยู่ในระดับคลาส การศึกษานี้ยังพบการเปลี่ยนแปลงที่โดดเด่นระหว่างบุคคล เริ่มตั้งแต่ในระดับครอบครัว ระหว่างไมโครไบโแกน ,ซึ่งสังเกตได้ในระดับสกุล prevotella , เด่นอย่างต่อเนื่อง รวมทั้งแบคทีเรียที่เกี่ยวข้องกับ oscillibacter phylotype valericigenes , valerate โปรดิวเซอร์ การศึกษานี้พบความหลากหลายของแบคทีเรียสูงและการเปลี่ยนแปลงส่วนประกอบของบุคคลสายพันธุ์เดียวกันรวมทั้งความอุดมสมบูรณ์ของแบคทีเรียสูง Unclassified phylotypes ที่อาจมีการทำงานที่สำคัญในการเจริญเติบโตของดูร็อค สุกร