2.3. Sequence analysisThe nucleotid

2.3. Sequence analysis
The nucleotide and the deduced amino acid sequences were analyzed against the National Center for Biotechnology Information (NCBI) database using the BLAST server (http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi). The CDS of the alpaca Slc7a11 gene was predicted using the Open Reading Frame (ORF) Finder (http://www.ncbi.nlm.nih.gov/projects/gorf/). Alignment of amino acid sequences was performed using the ClustalW2 program (http://www.ebi.ac.uk/Tools/msa/clustalw2) and the phylogenetic tree was generated by the neighbor-joining method with 1000 bootstrap replicates in MEGA 6.06. The transmembrane regions of xCT and conserved domains were predicted by TMHMM and Pfam programs from ExPASy proteomics tools (http://www.expasy.org/resources).

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

2.3 การวิเคราะห์นิวคลีโอไทด์และลำดับกรดอะมิโน deduced ได้วิเคราะห์กับศูนย์แห่งชาติในฐานข้อมูลข้อมูลเทคโนโลยีชีวภาพ (NCBI) โดยใช้เซิร์ฟเวอร์ระเบิด (http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi) ซีดีของยีน Slc7a11 อัลปากาถูกทำนายโดยใช้ตัวค้นหาเปิดอ่านเฟรม (ORF) (http://www.ncbi.nlm.nih.gov/projects/gorf/) จัดลำดับกรดอะมิโนถูกดำเนินการโดยใช้โปรแกรม ClustalW2 (http://www.ebi.ac.uk/Tools/msa/clustalw2) และต้น phylogenetic ถูกสร้างขึ้น โดยวิธีรวมใกล้เคียงกับ 1000 เริ่มต้นระบบเหมือนกับในร็อค 6.06 ภูมิภาค transmembrane xCT และนำโดเมนถูกทำนาย โดยโปรแกรม TMHMM และ Pfam จากมือโปรตีโอมิกส์ ExPASy (http://www.expasy.org/resources)

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

2.3 การวิเคราะห์ลำดับ
เบสและลำดับกรดอะมิโนอนุมานได้ถูกนำมาวิเคราะห์กับศูนย์แห่งชาติสำหรับข้อมูลเทคโนโลยีชีวภาพ (NCBI) ฐานข้อมูลโดยใช้เซิร์ฟเวอร์ระเบิด (http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi) CDS ของยีน Alpaca Slc7a11 เป็นที่คาดการณ์โดยใช้กรอบการอ่านเปิด (ORF) Finder (http://www.ncbi.nlm.nih.gov/projects/gorf/) การจัดลำดับของกรดอะมิโนที่ได้ดำเนินการโดยใช้โปรแกรม ClustalW2 (http://www.ebi.ac.uk/Tools/msa/clustalw2) และต้นไม้สายวิวัฒนาการถูกสร้างขึ้นโดยวิธีเพื่อนบ้านเข้ากับ 1000 บูตซ้ำใน MEGA 6.06 ภูมิภาค transmembrane ของ XCT และโดเมนป่าสงวนถูกคาดการณ์โดย TMHMM และโปรแกรม Pfam จาก ExPASy เครื่องมือโปรตีน (http://www.expasy.org/resources)

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

2.3 ลำดับการวิเคราะห์
ลำดับเบสและกรดอะมิโนข้อมูลกับศูนย์ข้อมูลเทคโนโลยีชีวภาพแห่งชาติ ( ncbi ) ฐานข้อมูลโดยใช้ระเบิดเซิร์ฟเวอร์ ( http : / / ระเบิด ncbi . nlm . NIH . gov / ระเบิด CGI ) ซีดีของลามะ slc7a11 ยีนทำนายโดยใช้กรอบเปิดอ่าน ( ORF ) Finder ( http : / / www.ncbi . nlm . NIH . gov / โครงการ / gorf / )การเรียงตัวของกรดอะมิโนถูกวิเคราะห์โดยใช้โปรแกรม clustalw2 ( http://www.ebi.ac.uk/tools/msa/clustalw2 ) และ phylogenetic ต้นไม้ที่ถูกสร้างขึ้นโดยเพื่อนบ้านร่วมด้วยวิธีบูตสแตรปซ้ำ 1 , 000 เมกะโดยใน . ที่หัวภูมิภาคของ xct และรักษาโดเมนถูกทำนายโดยโปรแกรม tmhmm pfam จากเครื่องมือและ expasy โอมิกส์ ( http : / / www.expasy . org / ทรัพยากร )