เด็กชายในชุดนอนลายทาง เป็นเรื่องราวของเด็กชายสองคนที่มีอายุเท่าเทียมกัน แต่มีความแตกต่างกันในเรื่องของ ฐานะ ครอบครัว และเชื้อชาติ แต่สิ่งที่เด็กชายทั้งสองมีเหมือนกันคือ หัวใจที่สะอาดบริสุทธิ์ ภาพยนตร์เรื่องนี้จะเล่าเรื่องราวในช่วงก่อนสงครามโลกครั้งที่สอง เด็กชายบรูโน อายุ 8 ขวบ อาศัยอยู่กับพ่อที่เป็นนายทหารเยอรมันชั้นผู้ใหญ่ แม่และพี่สาว ในครอบครัวที่ร่ำรวย สะดวกสบาย เขาเป็นเด็กที่สุขภาพไม่ค่อยแข็งแรง จึงมักจะถูกพ่อและแม่ห้ามไม่ให้ออกไปวิ่งเล่นกับเพื่อนๆ เมื่อพ่อของบรูโนได้เลื่อนตำแหน่งสูงขึ้น ภาระหน้าที่ความรับผิดชอบก็สูงขึ้นตามไปด้วย งานใหม่ของพ่อทำให้ครอบครัวของเขาต้องย้ายไปที่ห่างไกลจากกรุงเบอร์ลิน นั่นก็คือค่ายกักกันนักโทษชาวยิว ซึ่งมีทั้งเด็ก ผู้ใหญ่ หญิงชาย และคนแก่ ต่างก็ใส่ชุดนอนลายทางเหมือนกันทุกคน ระหว่างบ้านและค่ายกักกันนั้นมีรั้วลวดหนามไฟฟ้าขวางกั้นอยู่ ด้วยความที่บรูโนชอบออกไปวิ่งเล่นในป่าเพียงลำพังวันหนึ่งเขาได้เจอเด็กชายวัยเดียวกัน เด็กชายผู้สวมชุดนอนลายทาง เขามีชื่อว่า “ชมูเอล” ทั้งสองจึงเริ่มรู้จัก ทักทาย พูดคุยกันตั้งแต่นั้นมา ทั้งคู่กลายเป็นเพื่อนกัน บรูโนไม่เคยรู้ว่าพ่อทำงานอะไรนอกจากว่า พ่อเป็นทหาร หรือเรื่องราวเกี่ยวกับสิ่งต่างๆ นอกบ้าน เป็นสิ่งที่ทางครอบครัวพยายามปิดกั้นการรับรู้ของเขา โลกของเขาจึงสะอาดบริสุทธิ์ เขาไม่เคยรู้เลยว่าเด็กชายที่เขาคบหาเป็นเพื่อนนั้นเป็น นักโทษชาวยิวที่อยู่ในการดูแลของพ่อ... มิตรภาพที่แม้รั้วไฟฟ้าก็ไม่อาจกั้นของเด็กชายสองคนงดงามและบริสุทธิ์เกินกว่าผู้ใหญ่จะคาดคิด และมันนำพาความสลดหดหู่ใจมาให้กับผู้ใหญ่บางคนที่ไม่เคยเห็นคุณค่าของชีวิตใครนอกจากคนที่ตัวเองรัก