Type III polyketide synthase family

Type III polyketide synthase family of enzymes play an important role in the biosynthesis of flavonoids and a variety of plant polyphenols by condensing multiple acetyl units derived from malonyl Co–A to thioester linked starter molecules covalently bound in the PKS active site. Turmeric (Curucma longa L.) through diverse metabolic pathways produces a large number of metabolites, of which curcuminoids had gained much attention due to its immense pharmaceutical value. Recent identification of multiple curcuminoid synthases from turmeric lead us to look for additional Type III PKS from this plant. The current study describes the occurrence of a multigene family of Type III PKS enzymes in C. longa by RT-PCR based genomic screening. We have also isolated two new Type III PKS, ClPKS9 and ClPKS10 using homology based RT-PCR and data mining. The comparative sequence and phylogenetic analysis revealed that the two PKSs belong to different groups with only 56% sequence similarity at their amino acid level. ClPKS9 shows all possible sequence requirements for a typical chalcone synthase whereas ClPKS10 shows promising variation at amino acid level and high similarity to reported curcuminoid synthases. ClPKS9 and ClPKS10 exhibited distinct tissue specific expression pattern in C. longa with the ClPKS9 transcript abundant in shoot and rhizome than leaves whereas ClPKS10 transcript was found to be high in leaf and very low in rhizome and root. Therefore it was concluded that ClPKS9 and ClPKS10 may have divergent function in planta, with possible role in typical chalcone forming reaction and curcuminoid scaffold biosynthetic pathway respectively.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

พิมพ์ตระกูล synthase โพลีคีไทด์ III เล่นเอนไซม์ที่มีบทบาทสำคัญในการสังเคราะห์ของ flavonoids และความหลากหลายของพืชโพลีฟีนโดยกลั่นตัว acetyl หลายหน่วยมา malonyl Co – การ thioester เริ่มต้นเชื่อมโยงโมเลกุล covalently ผูกในไซต์ PKS ใช้งาน ขมิ้น (Curucma ลองกา L.) ผ่านทางเดินเผาผลาญหลากหลายผลิตจำนวนมากของ metabolites ที่นอยด์ได้รับความสนใจมากเนื่องจากค่ายาของเวิ้งว้าง รหัสล่าสุดของหลาย synthases curcuminoid จากขมิ้นนำเราหา PKS III ชนิดเพิ่มเติมจากโรงงานนี้ การศึกษาปัจจุบันอธิบายการเกิดขึ้นของครอบครัว multigene เอนไซม์ชนิด III PKS ในลองกาซี โดยคัดกรอง genomic RT-PCR อยู่ เรามียังแยกสองใหม่ชนิด III PKS, ClPKS9 และ ClPKS10 ใช้ homology ใช้ RT-PCR และการทำเหมืองข้อมูล ลำดับเปรียบเทียบและวิเคราะห์ phylogenetic เปิดเผยว่า PKSs สองเป็นสมาชิกของกลุ่ม มีเพียง 56% ลำดับคล้ายที่ระดับกรดอะมิโน ClPKS9 แสดงเป็นลำดับความต้องการทั้งหมดสำหรับ synthase chalcone ทั่วไปใน ขณะที่ ClPKS10 แสดงว่าการเปลี่ยนแปลงระดับกรดอะมิโนสูงคล้ายกับรายงาน curcuminoid synthases ClPKS9 และ ClPKS10 จัดแสดงรูปแบบนิพจน์เฉพาะเนื้อเยื่อที่แตกต่างกันในลองการาวกับเสียงบรรยาย ClPKS9 มากในการยิงและเหง้ากว่าใบในขณะที่เสียงบรรยาย ClPKS10 พบได้สูงในใบ และต่ำมากในรากและเหง้า ดังนั้น จึงได้สรุปว่า ClPKS9 และ ClPKS10 อาจมีฟังก์ชันขันติธรรมลเวียมานอร์ กับบทบาทสุดใน chalcone ปกติเป็นปฏิกิริยาและทางเดิน biosynthetic นั่งร้าน curcuminoid ตามลำดับ

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

ประเภทที่สาม polyketide synthase ครอบครัวของเอนไซม์ที่มีบทบาทสำคัญในการสังเคราะห์ของ flavonoids และความหลากหลายของโพลีฟีนพืชโดยการกลั่นหน่วย acetyl หลายมาจาก malonyl ร่วมเพื่อ thioester โมเลกุลเริ่มต้นเชื่อมโยงผูกพัน covalently ในการใช้งานเว็บไซต์ PKS ขมิ้นชัน (Curucma Longa L. ) ผ่านการเผาผลาญเซลล์ที่มีความหลากหลายผลิตจำนวนมากของสารซึ่งขมิ้นชันได้รับความสนใจมากเนื่องจากค่ายาของตนอันยิ่งใหญ่ บัตรประจำตัวล่าสุดของ synthases curcuminoid หลายจากขมิ้นนำเราไปมองหาประเภทเพิ่มเติม III PKS จากพืชชนิดนี้ การศึกษาในปัจจุบันอธิบายการเกิดขึ้นของครอบครัว multigene ของประเภทที่สามเอนไซม์ PKS ในซี Longa โดย RT-PCR ตรวจคัดกรองตามจีโนม เราได้แยกยังมีสองประเภทใหม่ III PKS, ClPKS9 และ ClPKS10 ใช้คล้ายคลึงกันตาม RT-PCR และการทำเหมืองข้อมูล ลำดับเปรียบเทียบและการวิเคราะห์สายวิวัฒนาการเปิดเผยว่าทั้งสอง PKSs อยู่ในกลุ่มที่แตกต่างกันมีเพียง 56% เหมือนลำดับที่ระดับกรดอะมิโนของพวกเขา ClPKS9 แสดงให้เห็นว่าทุกความต้องการลำดับเป็นไปได้สำหรับเทส chalcone ทั่วไปในขณะที่แสดงให้เห็นถึงการเปลี่ยนแปลง ClPKS10 มีแนวโน้มที่ระดับกรดอะมิโนและความคล้ายคลึงกันสูงเพื่อรายงาน curcuminoid synthases ClPKS9 และ ClPKS10 แสดงเนื้อเยื่อรูปแบบการแสดงออกเฉพาะที่แตกต่างกันใน Longa C. กับหลักฐาน ClPKS9 มากมายในการถ่ายภาพและเหง้ากว่าใบในขณะที่หลักฐาน ClPKS10 ถูกพบว่าเป็นที่สูงในใบและต่ำมากในเหง้าและราก ดังนั้นจึงสรุปได้ว่า ClPKS9 และ ClPKS10 อาจจะมีฟังก์ชั่นที่แตกต่างกันในพืชที่มีบทบาทเป็นไปได้ในการขึ้นรูป chalcone ทั่วไปปฏิกิริยาและทางเดินชีวสังเคราะห์นั่งร้าน curcuminoid ตามลำดับ

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

ประเภทที่ 3 และครอบครัวโดยเอนไซม์มีบทบาทสำคัญในการสังเคราะห์สารโพลีฟีนอลและความหลากหลายของพืชโดยหลายหน่วยกลั่น อะได้มาจาก malonyl Co –เพื่อเชื่อมโยงโมเลกุล covalently ไทโอเ เทอร์เริ่มต้นผูกพันใน pks การใช้งานเว็บไซต์ ขมิ้น ( curucma ขมิ้นชัน L . ) ผ่านเส้นทางการเผาผลาญอาหารที่หลากหลายผลิตจำนวนมากของ metabolitesซึ่งได้รับความสนใจมาก เนื่องจากสารของมูลค่ายาที่เวิ้งว้าง ตัวล่าสุดของเคอร์คูมินอยด์จากขมิ้นชันหลาย แต่ไม่ทำให้เราดูแบบเพิ่มเติม 3 pks จากโรงงานนี้ การศึกษาปัจจุบันอธิบายการเกิดของครอบครัว multigene ประเภท III pks เอนไซม์ในซีขมิ้นชันโดยวิธี RT-PCR ) จีโนมการคัดกรองตามเรายังแยก pks สองชนิดใหม่ 3 clpks9 clpks10 ใช้ตัวนี้และใช้ข้อมูลเหมืองแร่ ลำดับเปรียบเทียบและวิเคราะห์ ซึ่งพบว่า สอง pkss เป็นสมาชิกของกลุ่มที่แตกต่างกันมีเพียง 56% ลำดับกรดอะมิโน ความเหมือนในระดับของพวกเขา .clpks9 แสดงลำดับความต้องการที่เป็นไปได้ทั้งหมดโดยทั่วไปและในขณะที่ chalcone clpks10 แสดงสัญญาที่การเปลี่ยนแปลงในระดับกรดอะมิโนและความคล้ายคลึงกันสูงเพื่อรายงานเคอร์คูมินอยด์แต่ไม่ . clpks9 clpks10 แตกต่างกันและมีเนื้อเยื่อเฉพาะรูปแบบการแสดงออกในค .ขมิ้นชันกับ clpks9 หลักฐานมากมายในการยิงและเหง้าใบและกว่า clpks10 หลักฐานพบว่ามีค่าสูงในใบและต่ำมากในเหง้า และราก จึงสรุปได้ว่า clpks9 clpks10 และอาจมีฟังก์ชันอเนกใน planta ที่มีบทบาทที่สุดในทั่วไป chalcone สร้างปฏิกิริยาและเคอร์คูมินอยด์นั่งร้านลุงแซมเดินตามลำดับ