We previously reported endogenous G

We previously reported endogenous Glycoside Hydrolase Family (GHF) 9 β-1,4-glucanase gene, CjCel9A, from common Japanese freshwater clam Corbicula japonica. Here we identified another endogenous β-1,4-glucanase genes which belong to GHF45 (CjCel45A, CjCel45B). Both genes encode ORF of 627 bp corresponding to 208 amino acids. CjCel45A and CjCel45B are different in 5′ and 3′-untranslated regions and six nucleotides in the ORF. CjCEL45 has only one GHF45 catalytic domain without any carbohydrate binding modules as is the case with other molluskan GHF45 enzymes. Phylogenetic analysis and genomic structure of CjCel45 gene implies that this gene is likely to be acquired from fungi by common ancestor of mollusks. Reverse transcription (RT)-PCR analysis and in situ hybridization revealed that CjCel45A is likely to be expressed in the secretory cells in the digestive gland, suggesting that this cellulase is produced in the same site as CjCEL9A. CjCEL45A was successfully expressed in E. coli cells and zymographic analysis of the recombinant CjCEL45A showed that CjCEL45A is a functional β-1,4-glucanase. The finding of multiple cellulase genes in C. japonica strongly supports our hypothesis that this species function as a cellulose decomposer in estuarine environments.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

นอกจากนี้เราเคยรายงาน endogenous Glycoside Hydrolase ครอบครัว (GHF) 9 β-1,4-คัดยีน CjCel9A จากหอยน้ำจืดทั่วไปญี่ปุ่น Corbicula japonica ที่นี่เราระบุอีกยีนβ-1,4-คัด endogenous ซึ่งเป็นสมาชิกของ GHF45 (CjCel45A, CjCel45B) ยีนทั้งสองเข้า ORF ของ 627 bp ที่สอดคล้องกับกรดอะมิโนที่ 208 CjCel45A และ CjCel45B แตกต่างกันใน 5′ 3′ untranslated ภูมิภาค และนิวคลีโอไทด์ที่หกในการ ORF CjCEL45 มีเพียง GHF45 โดเมนตัวเร่งปฏิกิริยา โดยโมดูลที่รวมคาร์โบไฮเดรตเป็นในกรณีของเอนไซม์อื่น ๆ GHF45 molluskan วิเคราะห์ phylogenetic และ genomic โครงสร้างของยีน CjCel45 บ่งชี้ว่า ยีนนี้มีแนวโน้มที่จะได้มาจากเชื้อรา โดยทั่วไปบรรพบุรุษของ mollusks กลับ transcription (RT) -วิเคราะห์ PCR และใน situ hybridization เปิดเผยว่า CjCel45A จะแสดงในเซลล์ในต่อมย่อยอาหาร secretory cellulase นี้ผลิตในไซต์เดียวกันเป็น CjCEL9A แนะนำ CjCEL45A ได้เสร็จเรียบร้อยแสดงออกในเซลล์ E. coli และการวิเคราะห์ zymographic ของ recombinant CjCEL45A พบว่า CjCEL45A ทำงานβ-1,4-คัด ค้นหาของหลายยีน cellulase ใน C. japonica ขอสนับสนุนสมมติฐานของเราว่า นกชนิดนี้ทำหน้าที่เป็น decomposer เซลลูโลสในสภาพแวดล้อมที่ปากแม่น้ำ

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

ก่อนหน้านี้เราได้รายงานภายนอก glycoside hydrolase ครอบครัว (GHF) 9 β-1,4-glucanase ยีน CjCel9A จากน้ำจืดที่พบบ่อยญี่ปุ่นหอย Corbicula japonica ที่นี่เราระบุอีกยีนβ-1,4-glucanase ภายนอกซึ่งเป็น GHF45 (CjCel45A, CjCel45B) ยีนทั้งสองเข้ารหัส ORF 627 bp 208 สอดคล้องกับกรดอะมิโน CjCel45A CjCel45B และมีความแตกต่างใน 5 'และภูมิภาค 3'-untranslated หกนิวคลีโอใน ORF CjCEL45 มีเพียงหนึ่ง GHF45 โดเมนเร่งปฏิกิริยาโดยไม่มีคาร์โบไฮเดรตโมดูลที่มีผลผูกพันใด ๆ เป็นกรณีที่มีเอนไซม์ GHF45 molluskan อื่น ๆ การวิเคราะห์วิวัฒนาการและโครงสร้างจีโนมของยีน CjCel45 หมายความว่ายีนนี้มีแนวโน้มที่จะได้มาจากเชื้อราโดยบรรพบุรุษร่วมกันของหอย ถอดความย้อนกลับ (RT) การวิเคราะห์ -PCR และในแหล่งกำเนิดพันธุ์เปิดเผยว่า CjCel45A มีแนวโน้มที่จะแสดงออกในเซลล์หลั่งในการย่อยอาหารต่อมบอกว่าเซลลูเลสนี้จะผลิตในเว็บไซต์เดียวกับ CjCEL9A CjCEL45A ถูกแสดงออกมาประสบความสำเร็จในเซล E.coli และการวิเคราะห์ zymographic ของ CjCEL45A recombinant แสดงให้เห็นว่าเป็น CjCEL45A ทำงานβ-1,4-glucanase การค้นพบของยีนเซลลูเลสหลายแห่งในซี japonica ขอสนับสนุนสมมติฐานของเราที่ฟังก์ชั่นสายพันธุ์นี้เป็นย่อยสลายเซลลูโลสในสภาพแวดล้อมที่น้ำเค็ม

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

เรารายงานว่า ก่อนหน้านี้พบไกลโคไซด์ไฮโดรเลสครอบครัว ( ghf ) 9 บีตา - ยีน 1,4-glucanase cjcel9a จากญี่ปุ่นทั่วไปหอยกาบ corbicula จาป . ที่นี่เราพบยีนบีตา - ระบุอีก 1,4-glucanase ซึ่งเป็นของ ghf45 ( cjcel45a cjcel45b , ) ทั้งยีนเข้ารหัส ORF ของ 627 BP ที่ 208 กรดอะมิโนและ cjcel45a cjcel45b แตกต่างกันใน 5 และ 3 ’ - ’ภูมิภาคแปลและ 6 นิวคลีโอไทด์ใน ORF . cjcel45 มีเพียงหนึ่ง ghf45 catalytic โดเมนไม่มีคาร์โบไฮเดรตผูกพันโมดูลเป็นกรณีกับเอนไซม์ ghf45 molluskan อื่น ๆ และการวิเคราะห์จีโนม ซึ่งโครงสร้างของยีน cjcel45 หมายความว่ายีนนี้มีแนวโน้มที่จะได้รับจากเชื้อราโดยบรรพบุรุษของหอย .ตรงกันข้ามการถอดความ ( RT ) - เทคนิคการวิเคราะห์และใน situ hybridization พบว่า cjcel45a มีแนวโน้มที่จะแสดงออกในเซลล์ที่พบในต่อมย่อยอาหาร แนะนำว่า เอนไซม์นี้จะถูกผลิตในเว็บไซต์เดียวกัน cjcel9a . cjcel45a ได้แสดงออกใน E . coli เซลล์และการวิเคราะห์ zymographic ของ cjcel45a recombinant พบว่า cjcel45a เป็นฟังก์ชันบีตา - 1,4-glucanase .ผลของยีนเซลหลายใน C . ญี่ปุ่นขอสนับสนุนสมมติฐานของเราที่ทำหน้าที่เป็นผู้ย่อยสลายเซลลูโลสชนิดนี้ในสภาพแวดล้อมน้ำเค็ม .