Reverse transcriptional competence
Reverse transcription of foreign molecules (including cellular tRNAs) by LINE RT is an extremely rare event compared with the reverse transcription of LINE RNA. Currently, we know two systems protecting LINE RTs from processing foreign templates: sequence recognition of the RNA encoding the enzyme and cis-preference, when the RNA molecule used for RT translation is used by the translated enzyme as the template for reverse transcription (Esnault et al., 2000; Wei et al., 2001; Kajikawa and Okada, 2002). Overcoming this protection is an essential step in SINE formation. In the first case, it is realized by the acquisition of the fragment(s) recognized by the RT. The mechanism of cis-preference violation remains unclear; the SINE RNA interaction with the factors of the RT complex can be proposed. For instance, B1 and Alu (as well as 7SL) RNAs form a complex with SRP proteins SRP9/14 (Weichenrieder et al., 2000), which can bind to polyribosomes. This way B1 and Alu transcripts can be presented to the synthesized L1 RT as the template for reverse transcription. A similar mechanism can be proposed for SINEs derived from tRNAs or 5S rRNA, components of the ribosomal complex. The cis-preference violation can be mediated by poly(A)-binding protein, which can bind proteins of the translational machinery (Roy-Engel et al., 2002b); in this case, the acquisition of an A-tail should be an essential step in the evolution of SINEs mobilized by an RT with cis-preference. In some SINEs (for example, rodent B2), a polyadenylation signal at the 3′ end provides for the A-tail synthesis (Borodulina and Kramerov, 2008).
กลับความสามารถ transcriptionalReverse transcription of foreign molecules (including cellular tRNAs) by LINE RT is an extremely rare event compared with the reverse transcription of LINE RNA. Currently, we know two systems protecting LINE RTs from processing foreign templates: sequence recognition of the RNA encoding the enzyme and cis-preference, when the RNA molecule used for RT translation is used by the translated enzyme as the template for reverse transcription (Esnault et al., 2000; Wei et al., 2001; Kajikawa and Okada, 2002). Overcoming this protection is an essential step in SINE formation. In the first case, it is realized by the acquisition of the fragment(s) recognized by the RT. The mechanism of cis-preference violation remains unclear; the SINE RNA interaction with the factors of the RT complex can be proposed. For instance, B1 and Alu (as well as 7SL) RNAs form a complex with SRP proteins SRP9/14 (Weichenrieder et al., 2000), which can bind to polyribosomes. This way B1 and Alu transcripts can be presented to the synthesized L1 RT as the template for reverse transcription. A similar mechanism can be proposed for SINEs derived from tRNAs or 5S rRNA, components of the ribosomal complex. The cis-preference violation can be mediated by poly(A)-binding protein, which can bind proteins of the translational machinery (Roy-Engel et al., 2002b); in this case, the acquisition of an A-tail should be an essential step in the evolution of SINEs mobilized by an RT with cis-preference. In some SINEs (for example, rodent B2), a polyadenylation signal at the 3′ end provides for the A-tail synthesis (Borodulina and Kramerov, 2008).
การแปล กรุณารอสักครู่..
ย้อนกลับสามารถถอดรหัสถอดรหัสย้อนกลับของโมเลกุลต่างประเทศ (รวมทั้ง tRNAs มือถือ) โดยสาย RT เป็นเหตุการณ์ที่หายากมากเมื่อเทียบกับการถอดรหัสย้อนกลับของสายอาร์เอ็นเอ
ขณะนี้เราทราบว่าทั้งสองระบบปกป้อง RTS สายจากการประมวลผลต่างประเทศแม่แบบ: การรับรู้ลำดับของอาร์เอ็นเอเข้ารหัสเอนไซม์และถูกต้อง-การตั้งค่าเมื่อโมเลกุล RNA ที่ใช้สำหรับการแปล RT จะใช้เอนไซม์แปลว่าแม่แบบสำหรับการถอดรหัสย้อนกลับ (Esnault et อัล, 2000. Wei et al, 2001;. Kajikawa และโอคาดะ, 2002) การเอาชนะการป้องกันนี้เป็นขั้นตอนสำคัญในการก่อ SINE ในกรณีแรกก็เป็นที่รู้โดยการซื้อกิจการของชิ้น (s) ได้รับการยอมรับโดย RT กลไกของการละเมิดถูกต้อง-การตั้งค่ายังคงไม่ชัดเจน; การทำงานร่วมกับอาร์เอ็นเอ SINE ปัจจัยที่ซับซ้อน RT สามารถนำเสนอ ยกตัวอย่างเช่น B1 และอลูมิเนียม (เช่นเดียวกับ 7SL) RNAs รูปแบบที่ซับซ้อนที่มีโปรตีน SRP SRP9 / 14 (Weichenrieder et al., 2000) ซึ่งสามารถผูกกับ polyribosomes B1 วิธีนี้และจิตบำบัด Alu สามารถนำเสนอให้กับสังเคราะห์ L1 RT เป็นแม่แบบสำหรับการถอดความย้อนกลับ กลไกที่คล้ายกันสามารถเสนอส์มาจาก tRNAs หรือ 5S rRNA ส่วนประกอบของไรโบโซมที่ซับซ้อน ละเมิดถูกต้อง-การตั้งค่าสามารถไกล่เกลี่ยโดยโพลี (A) -binding โปรตีนซึ่งสามารถผูกโปรตีนของเครื่องจักรแปล (รอย Engel, et al, 2002b.); ในกรณีนี้การซื้อกิจการของ A-หางควรจะเป็นขั้นตอนสำคัญในการวิวัฒนาการของ Sines ระดมโดย RT-ถูกต้องกับการตั้งค่า ในบางส์ (ตัวอย่างเช่นหนู B2), สัญญาณ Polyadenylation ที่ปลาย 3 'ให้สำหรับการสังเคราะห์หาง (Borodulina และ Kramerov 2008)
การแปล กรุณารอสักครู่..