The gyrB gene was amplified by PCR

The gyrB gene was amplified by PCR as described previously. PCR was performed using the Takara Ex Taq kit. PCR products were purified with the PCR-M clean up system (Viogene) and sequenced with a BigDye Terminator v3.1 cycle-sequencing kit on a 3730 DNA sequencer (Applied Biosystems and Hitachi). DNA sequencing was determined using gyrB degenerate primers UP-1S and UP-2Sr and BS-F (59-GAAGGCGGNACNCAYGAAG-39) and BS-R (59-CTTCRTGNGTNCCGCCTTC-39)(designed from conserved regions of gyrB nucleotide sequences of members of the B. subtilis group) at 3.2 mM concentration. The DNA sequence was double-checked by sequencing both strands. Approximately 1.5 kb of the 16S rRNA gene was determined using the MicroSeq Full Gene 16S rDNA Bacterial Identification kit (Applied Biosystems).

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

ยีน gyrB ถูกขยาย โดย PCR ตามที่อธิบายไว้ก่อนหน้านี้ ทำ PCR โดยใช้ชุด Takara Ex Taq ผลิตภัณฑ์ PCR ได้บริสุทธิ์กับ PCR-M ล้างระบบ (Viogene) และเรียงลำดับ ด้วยชุดเทอร์มิเนเตอร์ BigDye v3.1 วงจรลำดับบน 3730 DNA sequencer (ใช้ศาสตร์เชิงชีวภาพและฮิตาชิ) กำหนดลำดับดีเอ็นเอโดยใช้ไพรเมอร์ degenerate gyrB ขึ้น-1S และ 2Sr ขึ้น และบี-F (59-GAAGGCGGNACNCAYGAAG-39) และบีอาร์ (59-CTTCRTGNGTNCCGCCTTC-39) (มาจากภูมิภาคภัต gyrB ลำดับนิวคลีโอไทด์ของสมาชิกของกลุ่ม B. subtilis) ที่ความเข้มข้น 3.2 mM ลำดับดีเอ็นเอที่ถูกตรวจสอบ โดยการจัดลำดับทั้งสองสาย ประมาณ 1.5 กิโลไบต์ยีน 16S rRNA ที่ถูกกำหนดโดยใช้การ MicroSeq เต็มยีน 16S rDNA เชื้อแบคทีเรียรหัสชุด (ใช้ศาสตร์เชิงชีวภาพ)

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

ยีน gyrB ถูกขยายโดยวิธี PCR ตามที่อธิบายไว้ก่อนหน้านี้ PCR ได้ดำเนินการโดยใช้ชุด Takara Ex Taq ผลิตภัณฑ์ PCR บริสุทธิ์ด้วยวิธี PCR-M ทำความสะอาดระบบ (Viogene) และติดใจกับชุด v3.1 วงจรลำดับ BigDye Terminator ในซีเควนดีเอ็นเอ 3730 (Applied Biosystems และฮิตาชิ) ลำดับดีเอ็นเอถูกกำหนดโดยใช้ gyrB เลวไพรเมอร์ UP-1S และ up-2SR และ BS-F (59 GAAGGCGGNACNCAYGAAG-39) และ BS-R (59 CTTCRTGNGTNCCGCCTTC-39) (ได้รับการออกแบบจากภูมิภาคป่าสงวนของ gyrB ลำดับเบสของสมาชิกของ กลุ่มบี subtilis) ที่ความเข้มข้น 3.2 มิลลิ ลำดับดีเอ็นเอสองตรวจสอบโดยการจัดลำดับทั้งเส้น ประมาณ 1.5 กิโลไบต์ของยีน 16S rRNA ถูกกำหนดโดยใช้ชุด MicroSeq เต็มยีน 16S rDNA แบคทีเรียประจำตัวประชาชน (Applied Biosystems)

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

การ gyrb ยีนที่ถูกขยายโดยวิธี PCR ตามที่อธิบายไว้ก่อนหน้านี้ โดยการใช้ทาการะชุดได้ดีเช่น ผลิตภัณฑ์ทั้งหมดจะถูกแยกกับ pcr-m ทำความสะอาดระบบ ( viogene ) และลำดับเบสด้วย bigdye Terminator v3.1 ลำดับชุดวงจรใน 940 ลำดับ DNA ( Applied Biosystems และ Hitachi ) การจัดลำดับดีเอ็นเอไพรเมอร์และการพิจารณา gyrb เสื่อมสภาพและ up-1s up-2sr bs-f ( 59-gaaggcggnacncaygaag-39 ) และ bs-r ( 59-cttcrtgngtnccgccttc-39 ) ( ออกแบบจากบริเวณอนุรักษ์ของ gyrb ลำดับนิวคลีโอไทด์ของสมาชิกของ B . subtilis Group ) ที่ความเข้มข้น 3.2 มม. ลำดับของดีเอ็นเอเป็นเช็ค โดยทั้งเส้นของ ประมาณ 1.5 กิโลเบส 16S rRNA ของยีนที่ถูกกำหนดโดยยีน 16S rDNA จำแนกแบคทีเรีย microseq เต็มชุด ( Applied Biosystems )