The pyrosequencing data was initial

The pyrosequencing data was initially processed as follows: (i) the terminal adaptor sequences and the reverse primer sequences were removed, as were reads containing multiple Ns, poly A/T tails, and low quality sequences; (ii) the barcode index sequences and forward primer sequences were removed; (iii) sequences with lengths

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

ข้อมูล pyrosequencing ประมวลผลขั้นต้นดังนี้: (i) เทอร์มินัลอะแดปเตอร์ลำดับและลำดับรองพื้นกลับออก ตามที่ได้อ่านประกอบด้วย Ns หางลี A/T และหลายคุณภาพต่ำ ลำดับ (ii)ลำดับดัชนีบาร์โค้ดและลำดับรองพื้นไปข้างหน้าออก (iii) ลำดับ ด้วยความยาว < 200 bp หรือที่ประกอบด้วยฐานไม่แน่นอน หรือออกอ่านซึ่งคะแนนเฉลี่ยคุณภาพไม่ต่ำกว่า 25 ซอ Seqcln (ส่วน http://sourceforge.net/projects/seqclean/) ใช้สำหรับตรวจหาอะแดปเตอร์และตัดแต่งปลาย และใช้ซอฟต์แวร์ mothur ซึ่งดาวน์โหลดจากในเว็บไซต์ http://www.mothur.org/wiki/Main_Page กรองอ่านลำดับ

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

ข้อมูล pyrosequencing การประมวลผลขั้นต้นดังนี้ (i) ลำดับอะแดปเตอร์ terminal และลำดับไพรเมอร์กลับถูกถอดออกเช่นเดียวกับที่อ่านมีหลายณ์โพลี A / T หางและลำดับที่มีคุณภาพต่ำ (ii) ลำดับดัชนีบาร์โค้ดและลำดับไพรเมอร์ที่ถูกถอดออกไปข้างหน้า; (iii) ลำดับที่มีความยาว <200 bp หรือที่มีฐานความไม่แน่นอนหรืออ่านที่มีคุณภาพคะแนนเฉลี่ยต่ำกว่า 25 ถูกถอดออก ซอฟแวร์ Seqcln (http://sourceforge.net/projects/seqclean/) ถูกนำมาใช้ในการตรวจหาอะแดปเตอร์และสิ้นสุดการตัดแต่งและซอฟแวร์ mothur ซึ่งดาวน์โหลดได้จากเว็บไซต์ http://www.mothur.org/wiki/Main_Page, ถูกนำมาใช้ในการกรองลำดับอ่าน

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

การไพโรซีเควนซิงข้อมูลก็เริ่มประมวลผล ( 1 ) อาคารแสดงลำดับและย้อนกลับลำดับรองพื้นออก เหมือนอ่านหนังสือที่มีหลาย NS , โพลี / T หางและคุณภาพต่ำลำดับ 2 ) บาร์โค้ดดัชนีลำดับและส่งต่อรองพื้นลำดับออก ; ( 3 ) ลำดับความยาว < 200 BP หรือที่มีความไม่แน่นอนฐานหรืออ่านที่คะแนนคุณภาพโดยเฉลี่ยต่ำกว่า 25 ออก seqcln ซอฟต์แวร์ ( http://sourceforge.net/projects/seqclean/ ) คือการใช้ตรวจหาอะแดปเตอร์และจุดสิ้นสุดการตัดแต่งและ mothur ซอฟต์แวร์ที่ถูกดาวน์โหลดจากเว็บไซต์ http://www.mothur.org/wiki/main_page เคยใช้กรองลำดับคนอ่าน