Foodborne outbreaks, involving pine nuts and peanut butter, illustrate the need to rapidly detect Salmonella in low moisture foods. However, the current Bacteriological Analytical Manual (BAM) culture method for Salmonella, using lactose broth (LB) as a pre enrichment medium, has not reliably supported real-time quantitative PCR (qPCR) assays for certain foods. We evaluated two qPCR assays in LB and four other pre enrichment media: buffered peptone water (BPW), modified BPW (mBPW), Universal Pre enrichment broth (UPB), and BAX® MP media to detect Salmonella in naturally-contaminated pine nuts (2011 outbreak). A four-way comparison among culture method, Pathatrix® Auto, VIDAS® Easy SLM, and qPCR was conducted. Automated DNA extraction techniques were compared with manual extraction methods (boiling or InstaGene™). There were no significant differences (P > 0.05) among the five pre enrichment media for pine nuts using the culture method. While both qPCR assays produced significantly (P ≤ 0.05) higher false negatives in 24 h pre enriched LB than in the other four media, they were as sensitive as the culture method in BPW, mBPW, UPB, and BAX media. The VIDAS Easy and qPCR were equivalent; Pathatrix was the least effective method. The Automatic PrepSEQ™ DNA extraction, using 1000 μL of pre enrichment, was as effective as manual extraction methods
การระบาดของโรคที่เกิดจากอาหารที่เกี่ยวข้องกับถั่วสนและเนยถั่วลิสง, แสดงให้เห็นถึงความจำเป็นในการตรวจสอบอย่างรวดเร็ว Salmonella ในอาหารมีความชื้นต่ำ อย่างไรก็ตามปัจจุบันคู่มือวิเคราะห์แบคทีเรีย (BAM) วิธีวัฒนธรรม Salmonella โดยใช้น้ำซุปแลคโตส (LB) เป็นสื่อกลางในการเพิ่มคุณค่าก่อนยังไม่ได้รับการสนับสนุนอย่างน่าเชื่อถือแบบ real-time PCR เชิงปริมาณ (qPCR) สำหรับการตรวจอาหารบางชนิด เราประเมินสองตรวจ qPCR ใน LB และสี่สื่ออื่น ๆ เพิ่มคุณค่าก่อนน้ำเปปโตนบัฟเฟอร์ (BPW) แก้ไข BPW (mBPW), ยูนิเวอร์แซน้ำซุปเพิ่มคุณค่าพื้นฐาน (UPB) และBAX®สื่อ MP ในการตรวจสอบเชื้อ Salmonella ในธรรมชาติที่ปนเปื้อนถั่วสน ( 2011 ระบาด) เปรียบเทียบสี่ทางในหมู่วิธีวัฒนธรรมPathatrix®อัตโนมัติ, SLM VIDAS®ง่ายและ qPCR ได้ดำเนินการ อัตโนมัติเทคนิคการสกัดดีเอ็นเอเปรียบเทียบกับวิธีการสกัดคู่มือ (เดือดหรือ InstaGene ™) ไม่มีความแตกต่างอย่างมีนัยสำคัญ (P> 0.05) ในห้าสื่อการตกแต่งล่วงหน้าสำหรับถั่วไพน์โดยใช้วิธีการเพาะเลี้ยง ขณะที่ทั้งสองชุดตรวจ qPCR ผลิตอย่างมีนัยสำคัญ (P ≤ 0.05) เชิงลบเท็จที่สูงขึ้นใน 24 ชั่วโมงก่อนอุดม LB กว่าในอีกสี่สื่อที่พวกเขามีความละเอียดอ่อนเป็นวิธีการเพาะเลี้ยงใน BPW, mBPW, UPB และสื่อ BAX Vidas ง่ายและ qPCR เทียบเท่า; Pathatrix เป็นวิธีที่มีประสิทธิภาพน้อย การสกัดดีเอ็นเออัตโนมัติ PrepSEQ ™โดยใช้ 1,000 ไมโครลิตรของการเพิ่มปริมาณก่อนเป็นที่มีประสิทธิภาพเป็นวิธีการสกัดคู่มือ
การแปล กรุณารอสักครู่..
