Bombyx mori, the domesticated silkw

Bombyx mori, the domesticated silkworm, is a major insect model for research, and the first lepidopteran
for which draft genome sequences became available in 2004. Two independent data sets from wholegenome
shotgun sequencing were merged and assembled together with newly obtained fosmid- and
BAC-end sequences. The remarkably improved new assembly is presented here. The 8.5-fold sequence
coverage of an estimated 432 Mb genome was assembled into scaffolds with an N50 size ofw3.7 Mb; the
largest scaffold was 14.5 million base pairs. With help of a high-density SNP linkage map, we anchored
87% of the scaffold sequences to all 28 chromosomes. A particular feature was the high repetitive
sequence content estimated to be 43.6% and that consisted mainly of transposable elements. We predicted
14,623 gene models based on a GLEAN-based algorithm, a more accurate prediction than the
previous gene models for this species. Over three thousand silkworm genes have no homologs in other
insect or vertebrate genomes. Some insights into gene evolution and into characteristic biological
processes are presented here and in other papers in this issue. The massive silk production correlates
with the existence of specific tRNA clusters, and of several sericin genes assembled in a cluster. The
silkworm’s adaptation to feeding on mulberry leaves, which contain toxic alkaloids, is likely linked to the
presence of new-type sucrase genes, apparently acquired from bacteria. The silkworm genome also
revealed the cascade of genes involved in the juvenile hormone biosynthesis pathway, and a large
number of cuticular protein genes.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

ไหม ไหม บ้านเป็นแบบแมลงสำคัญสำหรับการวิจัย และ lepidopteran แรกซึ่งร่างจีโนมลำดับเป็นว่างในปี 2004 ชุดข้อมูลสองอิสระจาก wholegenomeลำดับปืนถูกผสาน และประกอบกับเพิ่งได้รับ fosmid - และบัคสิ้นสุดลำดับงาน แสดงประกอบใหม่ปรับปรุงต่าง ๆ มากมายที่นี่ ลำดับที่ 8.5-foldความครอบคลุมของจีโนม 432 Mb โดยประมาณถูกประกอบเป็น scaffolds กับการ N50 ขนาด ofw3.7 Mb ที่นั่งร้านที่ใหญ่ที่สุดเป็น 14.5 ล้านฐานคู่ ด้วยความช่วยเหลือของแผนผังความเชื่อมโยงของ SNP high-density เรายึด87% ลำดับนั่งร้านที่ chromosomes ทั้งหมด 28 คุณลักษณะเฉพาะสูงซ้ำลำดับเนื้อหาประมาณ 43.6% และที่ประกอบด้วยส่วนใหญ่ขององค์ประกอบ transposable เราคาดการณ์ไว้โมเดลยีน 14,623 ตามการ GLEAN ตามอัลกอริทึม การคาดการณ์ที่แม่นยำยิ่งกว่าการก่อนหน้านี้รูปแบบยีนสำหรับพันธุ์นี้ กว่าสามพันไหมยีนมี homologs ไม่ในที่อื่น ๆแมลงหรือ genomes หลอด ข้อมูลเชิงลึกบาง เป็นวิวัฒนาการของยีน และ เป็นลักษณะทางชีวภาพกระบวนจะแสดงที่นี่ และ ในเอกสารอื่น ๆ ในฉบับนี้ สัมพันธ์กับการผลิตผ้าไหมขนาดใหญ่มีการดำรงอยู่ ของคลัสเตอร์ tRNA เฉพาะ และยีนเซหลายประกอบในคลัสเตอร์ ที่ปรับไหมของอาหารบนหม่อน ซึ่งประกอบด้วยพิษ alkaloids อาจจะเชื่อมโยงกับการสถานะของยีนชนิดใหม่ sucrase เห็นได้ชัดว่ามาจากเชื้อแบคทีเรีย จีโนมไหมยังเปิดเผยทั้งหมดของยีนที่เกี่ยวข้องกับทางเดินการสังเคราะห์ฮอร์โมนเยาวชน และขนาดใหญ่จำนวนยีนโปรตีน cuticular

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

ไหม, ไหมโดดเด่น, เป็นรูปแบบของแมลงที่สำคัญสำหรับการวิจัยและ Lepidopteran แรก
ที่ร่างลำดับจีโนมกลายเป็นใช้ได้ในปี 2004 สองชุดข้อมูลอิสระจาก wholegenome
ลำดับปืนลูกซองรวมและชุมนุมกันกับที่ได้รับใหม่ fosmid- และ
BAC- ลำดับท้าย ประกอบใหม่ที่ดีขึ้นอย่างน่าทึ่งนำเสนอที่นี่ 8.5 เท่าตามลำดับ
การรายงานข่าวของประมาณ 432 Mb จีโนมที่ถูกประกอบเป็นโครงที่มีขนาด N50 ofw3.7 Mb;
นั่งร้านใหญ่ที่สุดคือ 14,500,000 ฐานคู่ ด้วยความช่วยเหลือของความหนาแน่นสูงแผนที่เชื่อมโยง SNP เราทอดสมอ
87% ของลำดับนั่งร้านทั้งหมด 28 โครโมโซม คุณลักษณะเฉพาะเป็นซ้ำสูง
เนื้อหาลำดับคาดว่าจะมี 43.6% และส่วนใหญ่ประกอบด้วยองค์ประกอบ transposable เราคาดการณ์ไว้
14,623 ยีนรุ่นขึ้นอยู่กับขั้นตอนวิธีการรวบรวมตามการคาดการณ์ที่ถูกต้องมากขึ้นกว่า
รุ่นก่อนหน้านี้สำหรับยีนชนิดนี้ กว่าสามพันยีนไหมมี homologs อื่น ๆ ใน
จีโนมของแมลงหรือสัตว์ที่มีกระดูกสันหลัง บางข้อมูลเชิงลึกในการวิวัฒนาการของยีนและลักษณะทางชีวภาพเป็น
กระบวนการที่จะนำเสนอที่นี่และในเอกสารอื่น ๆ ในเรื่องนี้ การผลิตผ้าไหมขนาดใหญ่มีความสัมพันธ์
กับการดำรงอยู่ของกลุ่ม tRNA ที่เฉพาะเจาะจงและเซริซินของยีนหลายประกอบในคลัสเตอร์
การปรับตัวไหมที่จะกินใบหม่อนซึ่งมีอัลคาลอยพิษมีการเชื่อมโยงแนวโน้มที่จะ
ปรากฏตัวของใหม่ชนิดยีนซูเครสที่ได้มาเห็นได้ชัดจากเชื้อแบคทีเรีย จีโนมไหมยัง
เผยให้เห็นน้ำตกของยีนที่เกี่ยวข้องกับเด็กและเยาวชนฮอร์โมนสังเคราะห์ทางเดินและขนาดใหญ่
จำนวนของยีนโปรตีน cuticular

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

หนอนไหม Bombyx mori , โดดเด่น , เป็นรูปแบบแมลง สาขาวิจัยและ
lepidopteran จีโนมลำดับแรกที่ร่างกลายเป็นใช้ได้ใน 2004 อิสระ 2 ชุดข้อมูลจาก wholegenome
ปืนลูกซองจัดลำดับถูกผสาน และประกอบกันใหม่ได้ fosmid -
บั๊กสิ้นสุด ลำดับ ปรับปรุงใหม่อย่างน่าทึ่ง ประกอบที่แสดงที่นี่ การ 8.5-fold ลำดับ
รายงานข่าวจากประมาณ 432 MB จีโนมประกอบเป็นโครงที่มี 50 ขนาด ofw3.7 MB ;
นั่งร้านที่ใหญ่ที่สุดคือ 14.5 ล้านคู่เบส ด้วยความช่วยเหลือของ high-density SNP การเชื่อมโยงแผนที่เรายึด
87% ของนั่งร้านลำดับทั้งหมด 28 โครโมโซม คุณลักษณะเฉพาะเป็นสูงลำดับเนื้อหาซ้ำ
คาดว่าจะเป็น 43.6 % และที่ประกอบด้วยส่วนใหญ่ขององค์ประกอบที่ตรวจ .เราคาดการณ์ไว้
14623 ยีนรุ่นตามเก็บเกี่ยวขั้นตอนวิธีพื้นฐาน , ทำนายถูกต้อง มากกว่า
ก่อนหน้านี้รูปแบบยีนชนิดนี้ กว่าสามพันไหมยีนไม่มีโฮโมลอกส์ในแมลงอื่น ๆหรือสัตว์มีกระดูกสันหลัง
ยีนส์ใหม่ . บางข้อมูลเชิงลึกเข้าไปในกระบวนการวิวัฒนาการของยีนและลักษณะทางชีวภาพเสนอ
ที่นี่และในเอกสารอื่น ๆ ในเรื่องนี้การผลิตผ้าไหมขนาดใหญ่ที่เกี่ยวข้องกับการดำรงอยู่ของกลุ่มการเมารถ
เฉพาะของยีนและโปรตีนต่าง ๆรวมตัวกันในกลุ่ม
ของหนอนไหมกินใบหม่อน การปรับตัว ซึ่งประกอบด้วยอัลคาลอยด์เป็นพิษ อาจเชื่อมโยงกับการปรากฏตัวของยีนชนิดใหม่
ตรงว่าได้มาจากแบคทีเรีย จีโนมยัง
ตัวไหมพบน้ำตกของยีนที่เกี่ยวข้องในวิถีการสังเคราะห์ฮอร์โมนของเด็กและเยาวชน และจํานวนมาก
ของยีนโปรตีนลำตัว .