Although 16S rRNA gene sequencing i

Although 16S rRNA gene sequencing is the most powerful
tool in bacterial taxonomy, it is limitedly used at the species
level classification due to the low phylogenetic resolution and
poor discriminatory power of 16S rRNA gene sequence at the
species level (Fox et al., 1992; Janda and Abbott, 2007). It has
been generally accepted that it would be impossible to assign
16S rRNA gene sequences to the level of species because the
taxonomies end at the level of genus and DNA relatedness
studies are necessary to provide absolute resolution to these
taxonomic problems (Schloss and Westcott, 2011). Therefore,
in this study we taxonomically classified the 16S rRNA gene
sequencing reads at the phylum and genus levels. The genera
observed on day 0 of fermentation [Bacillus, Enterococcus,
Lactobacillus, Clostridium, Staphylococcus, Corynebacterium, and
Oceanobacillus (Figure 3B)] accorded well with genera detected

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

แม้ว่า 16S rRNA ยีนลำดับมีประสิทธิภาพมากที่สุดเครื่องมือในระบบภาษีแบคทีเรีย limitedly ใช้ในการขยายพันธุ์ระดับการจัดประเภทเนื่องจากความละเอียดต่ำผล และไม่แบ่งแยกอำนาจของ 16S rRNA ยีนลำดับที่ระดับชนิด (Fox et al. 1992 Janda และแอ๊บ 2007) มีโดยทั่วไปไม่ว่า มันจะไปกำหนดลำดับยีน 16S rRNA ระดับของสายพันธุ์เนื่องจากการระบบภาษีสิ้นสุดที่ระดับสกุลและ relatedness ดีเอ็นเอการศึกษาเป็นสิ่งจำเป็นเพื่อให้สมบูรณ์แก้ปัญหาเหล่านี้ปัญหาอนุกรมวิธาน (Schloss และ Westcott, 2011) ดังนั้นในการศึกษานี้ เราจัดจำแนกยีน 16S rRNAลำดับอ่านที่ระดับไฟลัมและสกุล สกุลการสังเกตในวันที่ 0 ของหมัก [บาซิลลัส Enterococcusแลคโตบาซิลลัส Clostridium, Staphylococcus, Corynebacterium และOceanobacillus (รูปที่ 3B)] ประตูกับสกุลที่ตรวจพบ

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

แม้ว่า 16S rRNA ยีนลำดับมีประสิทธิภาพมากที่สุด
เครื่องมือในอนุกรมวิธานของแบคทีเรียจะใช้จำกัดจำเขี่ยในสายพันธุ์
จำแนกระดับเนื่องจากการที่ความละเอียดต่ำ phylogenetic และ
อำนาจการเลือกปฏิบัติที่ดีของยีน 16S rRNA ใน
ระดับสปีชีส์ (ฟ็อกซ์ et al, 1992. Janda และแอ็บบอท 2007) มันได้
รับการยอมรับโดยทั่วไปว่ามันจะเป็นไปไม่ได้ที่จะกำหนด
16S rRNA ลำดับยีนในระดับของสายพันธุ์เพราะ
taxonomies จบในระดับของพืชและสัตว์และความสัมพันธ์ดีเอ็นเอ
การศึกษามีความจำเป็นที่จะต้องให้ความละเอียดที่แน่นอนเหล่านี้
ปัญหาการจัดหมวดหมู่ (Schloss และ Westcott 2011 ) ดังนั้น
ในการศึกษาครั้งนี้เราจัด taxonomically ยีน 16S rRNA
ลำดับอ่านในไฟลัมและสกุลระดับ จำพวก
สังเกตในวันที่ 0 ของการหมัก [Bacillus, Enterococcus,
แลคโตบาซิลลัส, Clostridium, Staphylococcus, Corynebacterium และ
Oceanobacillus (รูปที่ 3B)] คบหากันได้ดีกับจำพวกตรวจพบ

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

แม้ว่าลำดับเบส 16S rRNA ยีนมีประสิทธิภาพมากที่สุดเครื่องมือในการอนุกรมวิธานแบคทีเรีย มันจำกัดจำเขี่ยใช้ที่ชนิดระดับการจำแนกชนิดและเนื่องจากความละเอียดต่ำอำนาจจำแนกของ 16S rRNA ยีนยากจนลำดับที่สายพันธุ์ระดับ ( ฟ็อกซ์ et al . , 1992 ; janda และแอ๊บบอต , 2007 ) มันมีได้รับการยอมรับโดยทั่วไปว่ามันเป็นไปไม่ได้ที่จะมอบหมายลำดับเบส 16S rRNA ยีนในระดับของชนิดเพราะส่วนประกอบสุดท้ายในระดับดีเอ็นเอ สัมพันธ์สกุลการศึกษาเป็นสิ่งจำเป็นเพื่อให้ความละเอียดที่แน่นอนเหล่านี้ปัญหาการศึกษา ( ปราสาท และเวสต์ค็อต , 2011 ) ดังนั้นในการศึกษานี้เรา taxonomically จัดเบส 16S rRNA ยีนติดตามอ่านในไฟลัม และสกุลระดับ สกุลพบในวันของการหมักเชื้อเอ็นเทโรค็อกคัส [ 0 , ,แลคโตบาซิลัส , Clostridium Staphylococcus , แผนจูงใจให้ลาออก และoceanobacillus ( รูปที่ 3B ) ] accorded ได้ดีกับสกุล ตรวจพบ