HLA Typing and KIR Ligand Matching

HLA Typing and KIR Ligand Matching of
Donor–Recipient Pairs
High-resolution typing for HLA-A, -B, -C, and
-DRB1 were available for all donor–recipient pairs.
All selected donor–recipient pairs were matched for
HLA-A and -DRB1 alleles. Cases were divided into
those matched for MHC class I alleles (HLA-A, -B,
-C) and those mismatched for HLA-B and/or -C
alleles. KIR ligand status of donor–recipient pairs was
determined from HLA typing; KIR typing was not
performed. Donor–recipient pairs mismatched for the
HLA-B and/or -C loci were subdivided into KIR
ligand–matched, KIR ligand–mismatched in the hostversus-
graft (HVG) direction, and KIR ligand–mismatched
in the GVH direction. Cases with bidirectional
mismatches of KIR ligands were included with
those mismatched in the GVH direction. KIR ligand
mismatch was defined by the absence of donor KIR
ligand class I alleles in the recipient using an algorithm
described by Ruggeri et al [10]. The KIR and MHC
class I ligands considered included KIR2DL1 with
group 2 HLA-C molecules, KIR2DL2/3 with group 1
HLA-C molecules, and KIR3DL1 with HLA-B molecules
carrying the Bw4 epitope as defined by their
predicted amino acid sequences.

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

HLA พิมพ์ดีดและ KIR
แกนด์จับคู่ของคู่ผู้บริจาคผู้รับการพิมพ์ความละเอียดสูงสำหรับ
HLA-A -B, -C และ
-DRB1 มีอยู่สำหรับทุกคู่ที่มีผู้บริจาคผู้รับ.
ทั้งหมดที่เลือกคู่ที่มีผู้บริจาคผู้รับถูกจับคู่สำหรับ
HLA-A และอัลลีล -DRB1 กรณีที่ถูกแบ่งออกเป็นผู้ที่จับคู่สำหรับการเรียน MHC ฉันอัลลีล (HLA-A -B, -C) และผู้ที่ไม่ตรงกันสำหรับ HLA-B และ / หรือ -C อัลลีล สถานะแกนด์ KIR ของคู่ผู้บริจาคผู้รับถูกกำหนดจากHLA พิมพ์; KIR พิมพ์ไม่ได้ดำเนินการ คู่ผู้บริจาคผู้รับที่ไม่ตรงกันสำหรับHLA-B และ / หรือตำแหน่ง -C ถูกแบ่งออกเป็น KIR แกนด์ที่จับคู่, KIR แกนด์-ไม่ตรงกันใน hostversus- รับสินบน (HVG) ทิศทางและ KIR แกนด์-ไม่ตรงกันในทิศทางGVH กรณีที่มีทิศทางที่ไม่ตรงกันของแกนด์ KIR ถูกรวมอยู่กับผู้ที่ไม่ตรงกันในทิศทางGVH แกนด์ KIR ไม่ตรงกันถูกกำหนดโดยตัวตนของผู้บริจาค KIR ระดับแกนด์ผมอัลลีลในผู้รับใช้ขั้นตอนวิธีการอธิบายโดย Ruggeri et al, [10] KIR และ MHC ระดับแกนด์ผมถือว่า KIR2DL1 รวมกับกลุ่มที่2 โมเลกุล HLA-C KIR2DL2 / 3 กับกลุ่มที่ 1 โมเลกุล HLA-C และ KIR3DL1 กับโมเลกุล HLA-B ถือ epitope Bw4 ตามที่กำหนดโดยพวกเขาลำดับกรดอะมิโนที่คาดการณ์ไว้

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

และพิมพ์งานคีร์ลิแกนด์การตการจับคู่ผู้บริจาคและผู้รับคู่

พิมพ์ความละเอียดสูงโปรแกรม , - B - C ,
- DRB1 ที่มีอยู่ทั้งหมดของผู้บริจาคและผู้รับคู่ .
ที่ผู้บริจาค–ผู้รับคู่ถูกจับคู่กับ
โปรแกรมและ DRB1 อัลลีล กรณีแบ่งออกเป็น
เหล่านั้นตรงกับ MHC class I อัลลีล ( โปรแกรม , - B ,
- C ) และผู้ที่ไม่ตรงกันสำหรับ hla-b และ / หรือ c -
อัลลีลคีร์ ) สถานะของผู้รับบริจาค–คู่
พิจารณาจากค่าสัมประสิทธิ์พิมพ์ ; คีร์พิมพ์ไม่ได้
แสดง ผู้บริจาคและผู้รับคู่ไม่ตรงกันสำหรับ
hla-b และ / หรือ c - โลไซมีคีร์
) –จับคู่คีร์ ) –ไม่ตรงกันใน hostversus -
ทาบกิ่ง ( hvg ) ทิศทาง และคีร์ ) –ไม่ตรงกัน
ใน Gvh ทิศทาง กรณีมีลำดับชั้นของคีร์ลิแกนด์คือความไม่

ด้วยผู้ที่ไม่ตรงกันใน Gvh ทิศทาง คีร์ลิแกนด์
ไม่ตรงกันได้นิยามโดยขาดผู้บริจาคคีร์
) ผมเรียนอัลลีลผู้รับโดยใช้อัลกอริทึม
อธิบายโดย Ruggeri et al [ 10 ] และที่คีร์ MHC
ชั้นลิแกนด์ถือว่ารวมกับเด็กกลุ่ม kir2dl1
2 โมเลกุล kir2dl2 / 3 กลุ่ม 1
เด็กโมเลกุลและโมเลกุล kir3dl1 กับ hla-b
แบกไวรัสระหว่างตามที่กำหนดโดย
ทำนายลำดับกรดอะมิโน .