MBGD is a workbench system for comp

MBGD is a workbench system for comparative analysis of completely sequenced microbial genomes. The heart of MBGD function is to create orthologous or homologous gene cluster table. For this purpose, similarities between all genes are precomputed and stored into the database, in addition to the annotations of genes such as function categories that were assigned by the original authors and motifs that were found in the translated sequence. Using these homology data, MBGD dynamically creates orthologous gene cluster table. Users can change a set of organisms or cutoff parameters to create their own orthologous grouping. Based on this cluster table, users can further analyze multiple genomes from various points of view with the functions such as global map comparison, local map comparison, multiple sequence alignment and phylogenetic tree construction.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

MBGD เป็นระบบที่ปรับแต่งสำหรับการวิเคราะห์เปรียบเทียบของ genomes จุลินทรีย์อย่างสมบูรณ์ตามลำดับ ของฟังก์ชัน MBGD จะสร้าง orthologous หรือยีน homologous คลัสเตอร์ตาราง สำหรับวัตถุประสงค์นี้ ความคล้ายคลึงระหว่างยีนทั้งหมดที่ precomputed และจัดเก็บลงในฐานข้อมูล นอกจากคำอธิบายของยีนเช่นประเภทฟังก์ชันที่ถูกกำหนด โดยผู้เขียนเดิมและโดดเด่นที่พบในลำดับแปล MBGD ใช้ข้อมูลเหล่านี้ homology แบบไดนามิกสร้างตาราง orthologous ยีนคลัสเตอร์ ผู้ใช้สามารถเปลี่ยนชุดของพารามิเตอร์การตัดยอดเพื่อสร้าง orthologous ของตนเองจัดหรือสิ่งมีชีวิต ตามตารางนี้คลัสเตอร์ ผู้ใช้สามารถเพิ่มเติมวิเคราะห์ genomes หลายจากจุดมุมมองต่าง ๆ กับฟังก์ชันเช่นแผนที่โลกเปรียบเทียบ เปรียบเทียบแผนภายใน หลายตำแหน่งลำดับ และก่อสร้าง phylogenetic tree

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

MBGD เป็นระบบปรับแต่งสำหรับการวิเคราะห์เปรียบเทียบจีโนมของจุลินทรีย์ติดใจสมบูรณ์ หัวใจของการทำงาน MBGD คือการสร้างตารางกลุ่มยีน orthologous หรือคล้ายคลึงกัน เพื่อจุดประสงค์นี้คล้ายคลึงกันระหว่างยีนทั้งหมดจะถูกเก็บไว้และ precomputed ลงในฐานข้อมูลที่นอกเหนือไปจากคำอธิบายประกอบของยีนเช่นประเภทฟังก์ชั่นที่ได้รับมอบหมายจากผู้เขียนต้นฉบับและลวดลายที่พบในลำดับแปล โดยใช้ข้อมูลที่คล้ายคลึงกันเหล่านี้ MBGD แบบไดนามิกสร้างตารางกลุ่มยีน orthologous ผู้ใช้สามารถเปลี่ยนการตั้งค่าของสิ่งมีชีวิตหรือพารามิเตอร์ทางลัดในการสร้างการจัดกลุ่มของตัวเอง orthologous ขึ้นอยู่กับตารางกลุ่มนี้ผู้ใช้ยังสามารถวิเคราะห์จีโนมจากหลายจุดต่าง ๆ ในมุมมองกับการทำงานเช่นการเปรียบเทียบแผนที่โลกเปรียบเทียบแผนที่ท้องถิ่นลำดับการจัดเรียงหลายก่อสร้าง phylogenetic ต้นไม้

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

mbgd เป็นปรับแต่งระบบสำหรับการวิเคราะห์เปรียบเทียบลำดับเบสจีโนมของจุลินทรีย์ทั้งหมด . หัวใจของการทำงาน mbgd คือการสร้าง orthologous หรือโฮโมโลกัสยีนกลุ่มตาราง สำหรับวัตถุประสงค์นี้ ความคล้ายคลึงกันระหว่างยีน precomputed และจัดเก็บลงในฐานข้อมูลนอกเหนือไปจากการจัดการของยีน เช่น ฟังก์ชันประเภทที่ได้รับมอบหมายจากผู้เขียนต้นฉบับและลวดลายที่พบในการแปลตามลําดับ ซึ่งใช้ข้อมูลเหล่านี้ mbgd แบบไดนามิกสร้างตารางกลุ่มยีน orthologous . ผู้ใช้สามารถเปลี่ยนการตั้งค่าของสิ่งมีชีวิตหรือพารามิเตอร์การสร้างกลุ่ม orthologous ของตัวเอง ตามนี้กลุ่มตารางผู้ใช้ยังสามารถวิเคราะห์หาจากหลายจุดต่างๆของมุมมองกับฟังก์ชันเช่นการเปรียบเทียบแผนที่ทั่วโลก , การเปรียบเทียบแผนที่ท้องถิ่น จัดลำดับหลายและสร้าง phylogenetic ต้นไม้ .