Photoactive yellow protein (PYP) ha

Photoactive yellow protein (PYP) has a characteristic hydrogen bond (H bond) between p-coumaric acid chromophore
and Glu46, whose OH bond length has been observed to be 1.21 Å by the neutron diffraction technique
[Proc. Natl. Acad. Sci. 106, 440–4]. Although it has been expected that such a drastic elongation of the OH bond
could be caused by the quantum effect of the hydrogen nucleus, previous theoretical computations including
the nuclear quantum effect have so far underestimated the bond length by more than 0.07 Å. To elucidate the origin
of the difference, we performed a vibrational analysis of the H bond on potential energy curve with O…O distance
of 2.47 Å on the equilibrium structure, and that with O…O distance of 2.56 Å on the experimental crystal
structure. While the vibrationally averaged OH bond length for equilibrium structure was underestimated, the
corresponding value for crystal structure was in reasonable agreement with the corresponding experimental
values. The elongation of the O…O distance by the quantum mechan

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

เป็นลักษณะพันธะไฮโดรเจน (H พันธะ) ระหว่าง chromophore กรด p-coumaric มีโปรตีนสีเหลือง photoactive (PYP)และ Glu46, OH ซึ่งมีตราสารหนี้ยาวถูกตรวจสอบเป็น 1.21 Å โดยเทคนิคการเลี้ยวเบนของนิวตรอน[Proc. Natl. Acad. Sci. 106, 440 – 4] แม้ว่ามี การคาดว่า พันธบัตรดังกล่าวมี elongation รุนแรงของ OHอาจเกิดจากผลของควอนตัมของนิวเคลียสไฮโดรเจน ทฤษฎีการประมวลผลก่อนหน้านี้รวมถึงผลควอนตัมนิวเคลียร์ได้จน underestimated ความยาวพันธะ โดยÅมากกว่า 0.07 การ elucidate ต้นกำเนิดความแตกต่าง เราทำการวิเคราะห์ vibrational ของพันธะ H บนโค้งพลังงานศักย์โอ... O ระยะของ 2.47 Åโครงสร้างสมดุล และที่มีโอ... O ระยะ 2.56 Åในคริสตัลทดลองโครงสร้างการ ขณะที่ความยาวพันธะ OH vibrationally เฉลี่ยสำหรับโครงสร้างสมดุลเป็น underestimated การค่าที่ตรงกันสำหรับโครงสร้างผลึกอยู่ในข้อตกลงที่เหมาะสมกับให้สอดคล้องกับทดลองค่า Elongation โอ... O ระยะ โดย mechan ควอนตัม

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

โปรตีน photoactive สีเหลือง (PYP) มีลักษณะพันธะไฮโดรเจน (H พันธบัตร) ระหว่าง P-coumaric chromophore
กรดและGlu46 ซึ่ง OH พันธบัตรระยะเวลาได้รับการปฏิบัติที่จะเป็น 1.21 Åโดยใช้เทคนิคการเลี้ยวเบนนิวตรอน
[พร Natl Acad วิทย์ 106, 440-4] แม้ว่าจะได้รับการคาดหวังว่าเช่นการยืดตัวที่รุนแรงของพันธบัตร OH
อาจจะเกิดจากผลกระทบของควอนตัมนิวเคลียสไฮโดรเจนก่อนหน้าการคำนวณทางทฤษฎีรวมทั้งผลกระทบที่เกิดควอนตัมนิวเคลียร์เพื่อให้ห่างไกลประเมินระยะเวลาในตราสารหนี้มากกว่า 0.07 Å
เพื่ออธิบายที่มาของความแตกต่างที่เราดำเนินการวิเคราะห์การสั่นของพันธบัตรเอชบนเส้นโค้งพลังงานที่มีศักยภาพกับ O ... ระยะ O 2.47 Åโครงสร้างสมดุลและที่มี O ... ระยะ O 2.56 Åในคริสตัลทดลองโครงสร้าง ในขณะที่พันธบัตรระยะเวลาเฉลี่ย vibrationally OH โครงสร้างสมดุลได้รับการประเมินที่ค่าที่เกี่ยวข้องสำหรับโครงสร้างผลึกอยู่ในข้อตกลงที่เหมาะสมกับการทดลองที่สอดคล้องกันค่า การยืดของ O ... ระยะ O โดยควอนตัม mechan