The main entry point into the STRIN

The main entry point into the STRING website is the
protein search box on its start page. It supports queries
for multiple proteins, can be restricted to certain organisms
or clades of organisms, and uses a weighted scheme
to rank annotation text matches and identifier matches.
Users can also arrive via a number of external websites (29–
32) that maintain cross-links with STRING, including the
partner resources Search Tool for Interactions of Chemicals
(STITCH; 33) and eggNOG (34)––the latter both
share protein sequences, annotations and name-spaces with
STRING.Athirdway to enter STRING is via logging on to
the My Data section; this allows users to upload gene-lists,
create identifier mappings, view their browsing history and
provide additional ‘payload’ data to be displayed alongside
the interactions.
Once a protein or set of proteins is identified, users proceed
to the network view (Figure 1). From there, it is possible
to inspect the interaction evidence, to re-adjust the
score-cutoffs and network size limits and to view detailed
information about the interacting proteins. Upon switching
to the ‘advanced’ mode (via the tool panel below the
network), users can also cluster and rearrange the network
and test for statistical enrichments in the network. The latter
feature has been enhanced for the current version 10.0
of STRING: enrichment detection now also covers human
disease associations and tissue annotations, which might
be statistically enriched in a given network. For this feature,
STRING connects with the partner databases TISSUES
(http://tissues.jensenlab.org) and DISEASES (http:
//diseases.jensenlab.org), which also share sequence and
name spaces with STRING, and which annotate proteins
to tissues or to disease entities based on a combination of
automated text-mining and knowledge imports.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

เป็นจุดหลักในเว็บไซต์ของสายการกล่องค้นหาโปรตีนเป็นเพจเริ่มต้น สนับสนุนแบบสอบถามสำหรับโปรตีนหลาย สามารถถูกจำกัดให้สิ่งมีชีวิตบางอย่างหรือ clades ของสิ่งมีชีวิต และแบบถ่วงน้ำหนักอันดับคำอธิบายข้อความตรงกันและตรงกับรหัสผู้ใช้สามารถยังเดินทางมาจำนวนเว็บไซต์ภายนอก (29-32) ที่รักษา cross-links กับสตริง รวมทั้งการหุ้นส่วนทรัพยากรเครื่องมือค้นหาการโต้ตอบของสารเคมี(ตะเข็บ 33) และ eggNOG (34) – – หลังทั้งลำดับโปรตีนใช้ร่วมกัน คำอธิบาย และชื่อช่องว่างด้วยสตริงการ Athirdway การป้อนสายอักขระจะผ่านสู่ระบบส่วนข้อมูลของฉัน นี้ช่วยให้ผู้ใช้สามารถอัปโหลดรายการยีนสร้างการแม็ปรหัส ดูประวัติการเรียกดูของพวกเขา และให้ข้อมูลเพิ่มเติม "ส่วนของข้อมูล' จะแสดงควบคู่ไปกับการโต้ตอบเมื่อโปรตีนหรือชุดของโปรตีนมีระบุ ผู้ดำเนินการเครือข่ายดู (รูปที่ 1) จากที่นั่น อาจเป็นไปได้การตรวจสอบหลักฐานโต้ตอบ การปรับปรุงใหม่คะแนน cutoffs และเครือข่ายขนาดขีดจำกัด และเมื่อต้องการดูรายละเอียดข้อมูลเกี่ยวกับวิลเลียม interacting เมื่อสลับไปยังโหมด 'ขั้นสูง' (ผ่านแผงเครื่องมือด้านล่างนี้เครือข่าย), ผู้ใช้สามารถคลัสเตอร์ และจัดเครือข่ายและทดสอบทางสถิติ enrichments ในเครือข่าย หลังมีการเพิ่มคุณลักษณะสำหรับเวอร์ชันปัจจุบัน 10.0ของสตริงที่: ขอตรวจสอบขณะนี้ยังครอบคลุมถึงบุคคลความสัมพันธ์ของโรคและเนื้อเยื่อคำอธิบายประกอบ ซึ่งอาจทางสถิติอุดมไปในเครือข่ายให้ สำหรับคุณลักษณะนี้สายอักขระเชื่อมต่อกับฐานข้อมูลคู่เนื้อเยื่อ(http://tissues.jensenlab.org) และโรค (http:diseases.jensenlab.org), ซึ่งกันลำดับ และเว้นวรรคชื่อกับสตริง ซึ่งอธิบายประกอบโปรตีนเนื้อเยื่อ หรือใช้ชุดข้อมูลของเอนทิตีของโรคอัตโนมัติการทำเหมืองข้อความและความรู้นำเข้านั้น

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

จุดเริ่มต้นที่สำคัญในเว็บไซต์ STRING เป็น
โปรตีนกล่องค้นหาในหน้าเริ่มต้น สนับสนุนคำสั่ง
โปรตีนหลายสามารถ จำกัด สิ่งมีชีวิตบางอย่าง
หรือ clades ของสิ่งมีชีวิตและการใช้รูปแบบการถ่วงน้ำหนัก
ในการจัดอันดับการแข่งขันข้อความคำอธิบายประกอบและการแข่งขันที่ระบุ.
ผู้ใช้ยังสามารถผ่านมาถึงจำนวนของเว็บไซต์ภายนอก (29-
32) ที่รักษาข้าม -links กับ STRING รวมทั้ง
ทรัพยากรพันธมิตรเครื่องมือค้นหาปฏิสัมพันธ์ของสารเคมี
(STITCH; 33) และ eggnog (34) - หลังทั้ง
ลำดับโปรตีนหุ้นบันทึกย่อและชื่อที่มีช่องว่าง
ที่จะเข้า STRING.Athirdway STRING ผ่านการเข้าสู่ระบบ เพื่อ
ส่วนข้อมูลของฉัน; นี้จะช่วยให้ผู้ใช้อัปโหลดยีนรายการ,
สร้างแมประบุดูประวัติการเรียกดูของพวกเขาและ
ให้ข้อมูลเพิ่มเติม 'อัตรา' ที่จะแสดงควบคู่ไปกับ
การมีปฏิสัมพันธ์.
เมื่อโปรตีนหรือชุดของโปรตีนที่มีการระบุผู้ใช้ดำเนินการต่อ
ไปยังมุมมองเครือข่าย (รูปที่ 1 ) จากนั้นก็เป็นไปได้
ในการตรวจสอบหลักฐานการทำงานร่วมกันเพื่อให้อีกครั้งปรับ
คะแนนแต่งตัวและ จำกัด ขนาดของเครือข่ายและเพื่อดูรายละเอียด
ข้อมูลเกี่ยวกับโปรตีนที่มีปฏิสัมพันธ์ เมื่อเปลี่ยน
ไปยังโหมด 'ขั้นสูง' (ผ่านแผงเครื่องมือด้านล่าง
ระบบเครือข่าย) ผู้ใช้ยังสามารถจัดกลุ่มและจัดเรียงเครือข่าย
และการทดสอบทางสถิติ enrichments ในเครือข่าย หลัง
คุณลักษณะที่ได้รับการปรับปรุงสำหรับรุ่นปัจจุบัน 10.0
ของ STRING: การตรวจสอบการเพิ่มคุณค่าในขณะนี้ยังครอบคลุมถึงมนุษย์
สมาคมโรคและคำอธิบายประกอบเนื้อเยื่อซึ่งอาจ
จะอุดมสถิติในเครือข่ายที่กำหนด สำหรับคุณสมบัตินี้
STRING เชื่อมต่อกับฐานข้อมูลคู่เนื้อเยื่อ
(http://tissues.jensenlab.org) และโรค (http:
//diseases.jensenlab.org) ซึ่งยังมีการแบ่งลำดับและ
พื้นที่ที่มีชื่อ STRING และที่อธิบายโปรตีน
ไปยังเนื้อเยื่อหรือหน่วยงานโรคจากการรวมกันของ
การทำเหมืองข้อความอัตโนมัติและนำเข้าความรู้

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

หลักจุดเป็นเว็บไซต์สตริงเป็น
กล่องค้นหาโปรตีนในหน้าเริ่มต้นของ มันสนับสนุนแบบสอบถาม
โปรตีนหลาย สามารถจํากัดบางสิ่งมีชีวิต
หรือ clades ของสิ่งมีชีวิต และใช้วิธีการถ่วงน้ำหนัก
อันดับหมายเหตุข้อความตรงกันและระบุตรงกัน
ผู้ใช้ยังสามารถเดินทางผ่านทางหมายเลขของเว็บไซต์ภายนอก ( 29 )
32 ) ที่ รักษา ข้ามการเชื่อมโยงด้วยเชือก รวมทั้ง
ทรัพยากรพันธมิตรเครื่องมือค้นหาสำหรับปฏิกิริยาของสารเคมี
( Stitch ; 33 ) และเครื่องดื่ม ( 34 ) ––หลังทั้งคู่
แบ่งโปรตีน ลำดับบันทึกย่อและชื่อเป็นด้วย
string.athirdway ป้อนสตริงผ่านเข้าใน
ของฉันข้อมูลส่วนนี้ช่วยให้ผู้ใช้เพื่ออัปโหลดรายชื่อระบุยีน
สร้างแมป มุมมองของตนเองเรียกดูประวัติและ
ให้ข้อมูลเพิ่มเติมของ ' ' แสดงร่วมกับ

เมื่อโปรตีนเพิ่มขึ้น หรือชุดของโปรตีนจะถูกระบุที่ผู้ใช้ดำเนินการ
เพื่อดูเครือข่าย ( รูปที่ 1 ) จากที่นั่น มันเป็นไปได้เพื่อตรวจสอบการปฏิสัมพันธ์

หลักฐานอีกครั้ง ปรับคะแนน cutoffs และเครือข่ายขนาดจำกัดและเพื่อดูข้อมูลรายละเอียด
เกี่ยวกับปฏิสัมพันธ์โปรตีน เมื่อเปลี่ยน
กับขั้นสูง ' ' โหมด ( ผ่านเครื่องมือแผงด้านล่าง
เครือข่าย ) , ผู้ใช้ยังสามารถแบ่งกลุ่มและจัดเรียงเครือข่าย
และทดสอบ enrichments สถิติในระบบเครือข่าย หลัง
คุณลักษณะได้รับการปรับปรุงสำหรับรุ่นปัจจุบัน 10.0
ของสตริง : การตรวจสอบตอนนี้ยังครอบคลุมถึงสมาคมโรคมนุษย์

และเนื้อเยื่ออื่น ซึ่งอาจเป็นสถิติที่อุดมสมบูรณ์ในให้เครือข่ายสำหรับคุณสมบัตินี้ สายเชื่อมต่อกับคู่ค้า

( http://tissues.jensenlab.org ฐานข้อมูลเนื้อเยื่อ ) และโรค ( http : โรค .
/ / jensenlab . org ) ซึ่งยังแบ่งลำดับและ
ชื่อเป็นสตริงที่อธิบายและโปรตีน
เนื้อเยื่อหรือองค์กรโรคขึ้นอยู่กับการรวมกันของ
อัตโนมัติเหมืองแร่และนำเข้าข้อความ ความรู้