Isolation and characterization of C

Isolation and characterization of CsZfp of tea: nucleotide and deduced amino acid sequence (a), multiple sequence alignment (b), phylogenetic tree for deduced amino acid sequences of CsZfp and other A20/AN1-zinc-finger protein (c) and southern analysis of CsZfp (d). Start and stop codons are indicated by asterisks and double asterisks, respectively. Nucleotides in small letters represent 5′ and 3′ untranslated regions. The A20 and AN1 zinc-finger domains are also indicated by a line over the domains. Conserved cysteine and histidine residues are indicated by bold type. Residues varying between sequences are shown with gray background. The neighbor-joining tree was constructed using MEGA 6.06 with 1000 bootstrap replications. The GenBank accession numbers mentioned in parentheses are as follows: PpZFP (Prunus persica, XP_007218502.1), PmSAP8 (Prunus mume, XP_008231312.1), MdSAP8 (Malus domestica, XP_008375158.1), PdSAP8 (Phoenix dactylifera, XP_008782899.1), VvSAP8 (Vitis vinifera, XP_002283046.1), SlSAP5 (Solanum lycopersicum, ACM68442.1), SpSAP5 (Solanum pennellii, ACM68455.1), FaZnF (Festuca arundinacea, AEZ53300.1), OsSAP8 (Oryza sativa, A2YEZ6.2), SoSAP1 (Saccharum officinarum, ADM33793.1), AtSAP2 (Arabidopsis thaliana, NP_001185194.1), AtSAP5 (A. thaliana, NP_566429.1), AtSAP3 (A. thaliana, NP_001189620.1), AtSAP4 (A. thaliana, NP_565844.1), AtSAP6 (A. thaliana, NP_190848.1), OsZFP177 (O. sativa, AAP37480.1), AtSAP1 (A. thaliana, NP_172706.1), AtSAP7 (A. thaliana, NP_192941.1), AtSAP9 (A. thaliana, NP_194013.1), AtSAP8 (A. thaliana, NP_680686.1) and AtSAP10 (A. thaliana, NP_194268.1). Values at the node denote percentage bootstrap value. The genetic distances are indicated by the horizontal bar.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

การแยกและคุณสมบัติของ CsZfp ชา: นิวคลีโอไทด์และกรดอะมิโน deduced ลำดับ (ก) หลายลำดับตำแหน่ง (b) ทรี phylogenetic deduced กรดอะมิโนลำดับของ CsZfp และอื่น ๆ โปรตีน A20/AN1-สังกะสีลายนิ้วมือ (c) และภาคใต้วิเคราะห์ CsZfp (d) เริ่มต้น และหยุด codons จะแสดง ด้วยเครื่องหมายดอกจันและเครื่องหมายดอกจันสอง ตามลำดับ นิวคลีโอไทด์ในตัวอักษรขนาดเล็กแสดงถึง 5′ และ 3′ untranslated ภูมิภาค โดเมนสังกะสีนิ้ว A20 และ AN1 ยังจะแสดง ด้วยเส้นผ่านโดเมน นำตก cysteine และ histidine จะแสดง ด้วยหนา ตกที่แตกต่างกันระหว่างลำดับจะมีพื้นหลังสีเทา ต้นไม้เพื่อนบ้านเข้าร่วมถูกสร้างด้วยร็อค 6.06 1000 ระยะเริ่มต้นระบบ หมายเลขทะเบียน GenBank ที่กล่าวไว้ในวงเล็บจะเป็นดังนี้: PpZFP (นาง persica, XP_007218502.1), PmSAP8 (นาง mume, XP_008231312.1), MdSAP8 (Malus domestica, XP_008375158.1), PdSAP8 (อินทผลัม XP_008782899.1), VvSAP8 (Vitis vinifera, XP_002283046.1), SlSAP5 (Solanum lycopersicum, ACM68442.1), SpSAP5 (Solanum pennellii, ACM68455.1), FaZnF (Festuca arundinacea, AEZ53300.1), OsSAP8 (Oryza ซา A2YEZ6.2), SoSAP1 (กำแพงแสน officinarum, ADM33793.1), AtSAP2 (Arabidopsis thaliana, NP_001185194.1), AtSAP5 (A. thaliana , NP_566429.1), AtSAP3 (A. thaliana, NP_001189620.1), AtSAP4 (A. thaliana, NP_565844.1), AtSAP6 (A. thaliana, NP_190848.1), OsZFP177 (โอซา AAP37480.1), AtSAP1 (A. thaliana, NP_172706.1), AtSAP7 (A. thaliana, NP_192941.1), AtSAP9 (A. thaliana, NP_194013.1), AtSAP8 (A. thaliana, NP_680686.1) และ AtSAP10 (A. thaliana, NP_194268.1) ค่าในโหนดแสดงเปอร์เซ็นต์ค่าเริ่มต้นระบบ ระยะทางพันธุกรรมจะแสดง ด้วยแถบแนวนอน

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

การแยกและลักษณะของ CsZfp ชา: เบื่อหน่ายและอนุมานลำดับกรดอะมิโน (ก), ลำดับการจัดเรียงหลาย (ข), phylogenetic ต้นไม้สำหรับลำดับกรดอะมิโนอนุมานของ CsZfp และอื่น ๆ ที่ A20 / โปรตีน AN1 สังกะสีนิ้ว (ค) และการวิเคราะห์ทางตอนใต้ ของ CsZfp (ง) เริ่มต้นและหยุด codons จะมีการแสดงเครื่องหมายดอกจันดอกจันและสองตามลำดับ นิวคลีโอในตัวอักษรขนาดเล็กเป็นตัวแทนของ 5 'และ 3' ไม่ได้แปลภูมิภาค A20 และ AN1 โดเมนสังกะสีนิ้วนอกจากนี้ยังจะมีการแสดงเส้นโดเมนที่ cysteine​​ ป่าสงวนและสารตกค้างฮิสติดีนจะมีการแสดงตัวหนา ตกค้างที่แตกต่างกันระหว่างลำดับที่จะแสดงกับพื้นหลังสีเทา ต้นไม้เพื่อนบ้านเข้าถูกสร้างขึ้นโดยใช้ MEGA 6.06 1000 บูตซ้ำ หมายเลขภาคยานุวัติ GenBank กล่าวถึงในวงเล็บมีดังนี้ PpZFP (Prunus persica, XP_00721​​8502.1) PmSAP8 (บ๊วย, XP_008231312.1) MdSAP8 (Malus domestica, XP_008375158.1) PdSAP8 (Phoenix dactylifera, XP_008782899.1) , VvSAP8 (Vitis vinifera, XP_002283046.1) SlSAP5 (Solanum lycopersicum, ACM68442.1) SpSAP5 (มะเขือ pennellii, ACM68455.1) FaZnF (Festuca arundinacea, AEZ53300.1) OsSAP8 (Oryza sativa, A2YEZ6.2) , SoSAP1 (Saccharum officinarum, ADM33793.1) AtSAP2 (Arabidopsis thaliana, NP_001185194.1) AtSAP5 (ก thaliana, NP_566429.1) AtSAP3 (ก thaliana, NP_001189620.1) AtSAP4 (ก thaliana, NP_565844 0.1) AtSAP6 (ก thaliana, NP_190848.1) OsZFP177 (O. sativa, AAP37480.1) AtSAP1 (ก thaliana, NP_172706.1) AtSAP7 (ก thaliana, NP_192941.1) AtSAP9 ( A. thaliana, NP_194013.1) AtSAP8 (ก thaliana, NP_680686.1) และ AtSAP10 (ก thaliana, NP_194268.1) ค่าที่โหนดแสดงว่าร้อยละค่าบูต ระยะทางพันธุกรรมจะถูกระบุโดยแถบแนวนอน