In the present study, molecular div

In the present study, molecular diversity among the Indian vetiver germplasm collection was assessed using RAPD and ISSR markers. A total of 131 accessions of vetiver germplasm were collected from northern and southern parts of India (Rajasthan, Uttar Pradesh, Kerala, Tamil Nadu, Uttarakhand and Delhi). Out of 140 RAPD and 60 ISSR primers initially screened, 18 RAPD primers and 10 ISSR primers that produced a clear and reproducible band were chosen for further study. A total of 82 bands were amplified with 18 selected RAPD polymorphic primers (4.5 bands per primer), of which 73 (89.02%) were polymorphic with an average of 4.05 band per primer ranging between 3 (OPH-18, OPI-14 and OPZ-11) to 7 (OPI-18). ISSR primers amplified a total of 54 scorable fragments (5.4 bands per primer) ranging between 4 (UBC-811, UBC-826, UBC-864 and UBC-881) to 8 (UBC-816) fragments. Forty-six fragments (85.18%) with an average of 4.6 per primer were polymorphic. The Mantel matrix correlation value (r) = 0.83 (between RAPD and ISSR) suggests a good correlation between the two marker systems. Analysis of molecular variance (AMOVA) indicated that 3% diversity was attributed to differences among regions, 1% at the level of populations and 96% contributed by the individuals in the populations. The highest diversity at individual level has been due to clonal method of propagation used to maintain the germplasm. Further, transferability of the rice SSR markers in vetiveria was also studied. A set of 120 hypervariable simple sequence repeat (HvSSR) markers of rice were attempted for the transferability study. 36 HvSSR markers (30%) were found successful in cross-genera transferability. All these markers were optimized and tried in a set of 35 Vetiveria accessions for polymorphism study. The size and number of the alleles amplified by these markers in vetiveria varied from that of the rice species. The RAPD and ISSR markers may be utilized for characterization of large collection of vetiver germplasm. The SSR markers which have been amplified successfully in vetiver can be potentially utilized for locus specific characterization and for genetic improvement using molecular breeding methods.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

ในการศึกษาปัจจุบัน ความหลากหลายทางชีวภาพระดับโมเลกุลระหว่างชุด germplasm หญ้าแฝกอินเดียถูกประเมินโดยใช้เครื่องหมายอาร์เอพีดีและ ISSR จำนวน 131 accessions ของหญ้าแฝก germplasm ถูกเก็บรวบรวมจากส่วนภาคเหนือ และภาคใต้ของอินเดีย (รัฐราชสถาน รัฐอุตตรประเทศ Kerala ทมิฬ Nadu, Uttarakhand และเดลี) อาร์เอพีดี 140 และไพรเมอร์ ISSR 60 เริ่มฉาย ไพรเมอร์ 18 อาร์เอพีดีและไพรเมอร์ ISSR 10 ที่ผลิตวงชัดเจน และจำลองถูกเลือกสำหรับการศึกษาต่อ จำนวนวง 82 ถูกขยาย ด้วย 18 เลือกอาร์เอพีดี polymorphic ไพรเมอร์ (4.5 วงต่อรองพื้น), ที่ 73 (ร้อยละ 89.02) มี polymorphic โดยเฉลี่ย 4.05 วงต่อรองพื้นระหว่าง 3 (OPH-18, OPI-14 และ OPZ 11) ถึง 7 (OPI-18) ไพรเมอร์ ISSR ขยายจำนวนบางส่วนของ scorable 54 (5.4 วงต่อรองพื้น) ระหว่าง 4 (UBC 811 ยูบีซี-826 ยูบีซี-864 และ UBC-881) เพื่อการกระจายตัว (ยูบีซี-816) 8 บางส่วนของสี่สิบหก (85.18%) โดยเฉลี่ย 4.6 ต่อรองพื้นมี polymorphic ค่าเมตริกซ์สหสัมพันธ์หิ้ง (r) = 0.83 (ระหว่างอาร์เอพีดีและ ISSR) ชี้ให้เห็นความสัมพันธ์ที่ดีระหว่างระบบสองเครื่อง การวิเคราะห์ผลต่างโมเลกุล (AMOVA) ระบุว่า ความหลากหลาย 3% ถูกบันทึกความแตกต่างระหว่างภูมิภาค โดยบุคคลในประชากรที่ 96% และ 1% ของประชากร มีความหลากหลายสูงสุดในแต่ละระดับเนื่องจาก clonal วิธีการใช้เพื่อรักษา germplasm เผยแพร่ เพิ่มเติม นอกจากนี้ยังมีศึกษา transferability เครื่องหมาย SSR ข้าวในไม่ไวแสง ชุด 120 hypervariable ลำดับซ้ำเครื่องหมาย (HvSSR) ของข้าวได้มีความพยายามศึกษา transferability เครื่องหมาย HvSSR 36 (30%) พบประสบความสำเร็จใน transferability ข้ามสกุล เครื่องหมายทั้งหมดเหล่านี้ถูกปรับให้เหมาะสม และพยายามในชุด 35 accessions ไม่ไวแสงสำหรับการศึกษาโพลีมอร์ฟิซึม ขนาดและจำนวนของ alleles ที่ขยาย โดยเครื่องหมายเหล่านี้ในแตกต่างจากพันธุ์ข้าวไม่ไวแสง อาจจะใช้เครื่องหมายอาร์เอพีดีและ ISSR สำหรับคุณสมบัติของหญ้าแฝก germplasm จำนวนมาก เครื่องหมาย SSR ซึ่งได้ถูกขยายเสร็จเรียบร้อยในหญ้าแฝกสามารถจะอาจใช้โลกัสโพลระบุจำแนก และปรับปรุงพันธุกรรมโดยใช้วิธีการผสมพันธุ์ระดับโมเลกุล

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

ในการศึกษาความหลากหลายทางโมเลกุลในการเก็บรวบรวมเชื้อพันธุกรรมแฝกอินเดียได้รับการประเมินโดยใช้เทคนิค RAPD และ ISSR เครื่องหมาย รวม 131 accessions ของหญ้าแฝกพันธุ์ถูกเก็บมาจากภาคเหนือและภาคใต้ของอินเดีย (ราชสถานอุตตร, เกรละ, ทมิฬนาฑู, Uttarakhand และนิวเดลี) ออกจาก 140 RAPD และ 60 ไพรเมอร์ ISSR การคัดเลือกในขั้นต้น 18 ไพรเมอร์ RAPD และ 10 ไพรเมอร์ ISSR ท​​ี่ผลิตวงดนตรีที่ชัดเจนและสามารถทำซ้ำได้รับการแต่งตั้งในการศึกษาต่อ รวม 82 วงถูกขยายกับ 18 ไพรเมอร์ที่เลือก RAPD polymorphic (4.5 วงต่อไพรเมอร์) ที่ 73 (89.02%) เป็น polymorphic กับค่าเฉลี่ยของวง 4.05 ต่อระหว่างไพรเมอร์ 3 (OPH-18, OPI-14 และ OPZ -11) ถึง 7 (OPI-18) ไพรเมอร์ ISSR ขยายจำนวน 54 ชิ้นส่วน scorable (5.4 วงต่อไพรเมอร์) อยู่ระหว่าง 4 (UBC-811, UBC-826, UBC-864 และยูบีซี-881) ถึง 8 (UBC-816) ชิ้นส่วน สี่สิบหกชิ้นส่วน (85.18%) โดยเฉลี่ย 4.6 ต่อไพรเมอร์ที่มีความหลากหลาย หิ้งค่าสหสัมพันธ์เมทริกซ์ (r) = 0.83 (ระหว่าง RAPD และ ISSR) ชี้ให้เห็นความสัมพันธ์ที่ดีระหว่างทั้งสองระบบเครื่องหมาย การวิเคราะห์ความแปรปรวนโมเลกุล (AMOVA) ชี้ให้เห็นว่ามีความหลากหลาย 3% เป็นผลมาจากความแตกต่างระหว่างภูมิภาค, 1% ในระดับของประชากรและ 96% ส่วนโดยบุคคลในประชากร ความหลากหลายมากที่สุดในระดับบุคคลที่ได้รับเนื่องจากการวิธี clonal ของการขยายพันธุ์ที่ใช้ในการรักษาเชื้อพันธุกรรม นอกจากนี้การถ่ายโอนของเครื่องหมาย SSR ข้าวในหญ้าที่ถูกศึกษายัง ชุด 120 hypervariable ซ้ำลำดับง่าย (HvSSR) เครื่องหมายของข้าวได้พยายามที่สำหรับการศึกษาการถ่ายโอน 36 เครื่องหมาย HvSSR (30%) พบว่าประสบความสำเร็จในการข้ามจำพวกโอน เครื่องหมายเหล่านี้ได้รับการปรับให้เหมาะสมและพยายามอยู่ในชุดจาก 35 accessions หญ้าสำหรับการศึกษาความแตกต่าง ขนาดและจำนวนของอัลลีลขยายโดยเครื่องหมายเหล่านี้แตกต่างกันในหญ้าจากที่ของสายพันธุ์ข้าว RAPD และ ISSR เครื่องหมายอาจจะใช้สำหรับลักษณะของคอลเลกชันขนาดใหญ่ของหญ้าแฝกพันธุ์ SSR เครื่องหมายที่ได้รับการประสบความสำเร็จในการขยายหญ้าแฝกสามารถนำไปใช้อาจเกิดขึ้นกับตนลักษณะเฉพาะและการปรับปรุงทางพันธุกรรมโดยใช้วิธีการเพาะพันธุ์ในระดับโมเลกุล

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

ในการศึกษาความหลากหลายทางพันธุกรรมระดับโมเลกุลระหว่างอินเดียหญ้าแฝกรวบรวมการประเมินโดยใช้เทคนิค RAPD และ issr เครื่องหมาย ทั้งหมด 131 สายพันธุ์หญ้าแฝกพันธุ์ที่เก็บจากภาคเหนือและภาคใต้ของอินเดียในรัฐราชสถานรัฐอุตตรประเทศ , เกรละ , ทมิฬนาฑู , Uttarakhand และนิวเดลี ) จาก 140 เพียง 60 issr ไพรเมอร์เริ่มคัดกรอง18 ด้วยไพรเมอร์และ 10 ชนิด ที่ผลิตชัดเจน และ issr วงดนตรี ) ถูกเลือกสำหรับการศึกษาต่อไป ทั้งหมด 82 รัดของ RAPD จำนวน 18 เลือกไพรเมอร์ ( 4.5 วงต่อ ไพรเมอร์ ) ที่ 73 ( 89.02 เปอร์เซ็นต์ ) มีค่าเฉลี่ย 4.05 วงดนตรีที่มีต่อแนวทางในช่วงระหว่าง 3 ( oph-18 opi-14 , และ opz-11 ) 7 ( opi-18 )issr ไพรเมอร์ของทั้งหมด 54 scorable เศษ ( 5.4 วงต่อรองพื้น ) ช่วงระหว่าง 4 ( ubc-811 ubc-826 ubc-864 , และ , ubc-881 ) 8 ( ubc-816 ) เศษ สี่สิบหกเศษ ( 85.18 % ) โดยเฉลี่ย 4.6 ต่อ ไพรเมอร์ที่สร้างความแตกต่าง หิ่งเมทริกซ์สหสัมพันธ์ ( r ) = 0.83 ค่า ( ระหว่างเทคนิค RAPD และ issr ) แสดงให้เห็นถึงความสัมพันธ์ที่ดีระหว่างสองเครื่องหมายระบบการวิเคราะห์ความแปรปรวน ( ANOVA ) พบว่าโมเลกุลชนิด 3 % ประกอบกับความแตกต่างระหว่างภูมิภาค 1 % ที่ระดับ 96% ของประชากรและสนับสนุนโดยบุคคลในประชากร ที่มีความหลากหลายในระดับบุคคลได้ เนื่องจากรูปแบบของวิธีการขยายพันธุ์ใช้รักษาเชื้อพันธุกรรม เพิ่มเติมกำหนดการของข้าวที่ได้รับเครื่องหมายในหญ้า ยังศึกษา ชุด 120 ออกง่ายลำดับซ้ำ ( hvssr ) เครื่องหมายของข้าว คือ พยายาม สำหรับกำหนดการเรียน 36 hvssr เครื่องหมาย ( 30% ) พบความสําเร็จในการโอนย้ายข้ามสกุล . ที่หมายทั้งหมดเหล่านี้และพยายามในชุด 35 หญ้า ตัวอย่างรูปแบบการศึกษาขนาดและจำนวนของอัลลีลโดยขยายเครื่องหมายเหล่านี้ในหญ้า แตกต่างจากที่ของข้าวสายพันธุ์ โดยเทคนิค RAPD และ issr เครื่องหมายอาจจะใช้สำหรับคุณสมบัติของคอลเลกชันขนาดใหญ่ของหญ้าแฝกเชื้อพันธุกรรมที่ได้รับเครื่องหมายที่ได้รับของเรียบร้อยแล้วในหญ้าแฝกสามารถที่อาจใช้สำหรับคุณสมบัติเฉพาะด้าน และการปรับปรุงพันธุ์โดยใช้วิธีผสมพันธุ์ของโมเลกุล