All computer algorithms were writte

All computer algorithms were written in the C programming
language under the UNIX operating system The Genpept database was obtained as an ASCII
text file in the FASTA format from the National Center for Biotechnology Information by anonymous ftp
(NCBI-Genbank Release 77.0; release date 06/15/93;74,938 proteins containing 29,127,050 amino acids). This database contains protein sequences translated from nucleotide sequences. A search of the entire Genpept
database reauired anuroximatelv lo-15 mm on an HP9000 mi&omput& (Hewlettll’ackard, Palo Alto,
CA). The amino acid masses used to calculate the mass
of peptides were based on average chemical masses.To account for changes in mass created by chemical
The obiectives of the research renorted here are
modification, the mass of the appropriate amino acid
can be changed. Species-specific databases were created
by combining protein sequences derived from
Homo sapiens (16,340 sequences), E. coli (6637 sequences),
and 5. cereuisiue (4285 sequences) from the
Genpept and PIR database (National Biomedical Research
Foundation, Washington, DC). Sequences of
[Glu’]-fibrinopeptide and the peptide CRGDSY were
added to the Homo sapiens database. To allow a more
representative assessment of searches with peptides
derived from @lactoglobulin (Bos taaums) and ru-casein
(Bos faltrus), these protein sequences were added to
the human database. The sequence of trypsin (Bos
tuurus) was added to the E. coli database to screen for
autolysis products. A search of a species-specific
database requires approximately 3-5 min on the
HI9000 minicomputer.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

เขียนอัลกอริทึมคอมพิวเตอร์ทั้งหมดในการเขียนโปรแกรม Cภาษาใต้ฐาน Genpept ระบบปฏิบัติการ UNIX ได้รับเป็นการ ASCIIแฟ้มข้อความในรูปแบบ FASTA จากศูนย์แห่งชาติสำหรับข้อมูลเทคโนโลยีชีวภาพ โดย ftp แบบไม่ระบุชื่อ(NCBI Genbank 77.0 ปล่อย ปล่อยวัน 06/15/93; 74,938 โปรตีนที่ประกอบด้วยกรดอะมิโน 29,127,050) ฐานข้อมูลนี้ประกอบด้วยโปรตีนลำดับจากลำดับของนิวคลีโอไทด์ การค้นหาของ Genpept ทั้งหมดฐานข้อมูล reauired anuroximatelv หล่อ-15 มม.มี HP9000 mi & omput & (Hewlettll'ackard พาโลอัล โตCA) มวลของกรดอะมิโนที่ใช้ในการคำนวณมวลของเปปไทด์ถูกมวลสารเคมีเฉลี่ยตาม การบัญชีสำหรับการเปลี่ยนแปลงในมวลสร้าง โดยเคมีมี obiectives ของ renorted วิจัยที่นี่ปรับเปลี่ยน มวลของกรดอะมิโนที่เหมาะสมสามารถเปลี่ยน สร้างฐานข้อมูลสายโดยการรวมลำดับโปรตีนที่มาจากSapiens ตุ๊ด (16,340 ลำดับ), E. coli (6637 ลำดับ),และ 5 cereuisiue (ลำดับที่ 4285) จากการฐานข้อมูล Genpept และ PIR (ชาติวิจัยทางการแพทย์มูลนิธิ วอชิงตัน DC) ลำดับของ[Glu']-เปปไทด์ CRGDSY และ fibrinopeptideเพิ่มไปยังฐานข้อมูล sapiens ตุ๊ด ให้มากขึ้นประเมินตัวแทนของการค้นหาด้วยเปปไทด์มาจาก @lactoglobulin (Bos taaums) และเคซีน ru(Bos faltrus), ลำดับโปรตีนเหล่านี้ถูกเพิ่มเข้าไปมนุษย์แล้ว ลำดับของทริปซิน (Bostuurus) ถูกเพิ่มไปยังฐานข้อมูลของ E. coli จะหน้าจอสำหรับautolysis ผลิตภัณฑ์นี้ การค้นหาของเครื่องสายฐานข้อมูลต้องการประมาณ 3-5 นาทีในการHI9000 minicomputer

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

อัลกอริทึมคอมพิวเตอร์ทั้งหมดถูกเขียนในการเขียนโปรแกรม C
ภาษาภายใต้ระบบปฏิบัติการยูนิกซ์ฐานข้อมูล Genpept ที่ได้รับในฐานะที่เป็น ASCII
แฟ้มข้อความในรูปแบบ FASTA จากแห่งชาติศูนย์ข้อมูลเทคโนโลยีชีวภาพโดย FTP ที่ไม่ระบุชื่อ
(NCBI-Genbank Release 77.0; วันที่วางจำหน่าย 06 / 15/93; 74,938 โปรตีนที่มีกรดอะมิโน 29127050) ฐานข้อมูลนี้มีโปรตีนแปลมาจากลำดับเบส การค้นหาของ Genpept ทั้ง
ฐานข้อมูล reauired anuroximatelv ทองหล่อ 15 มมบน HP9000 ไมล์และ omput (Hewlettll'ackard พาโลอัลโต,
แคลิฟอร์เนีย) ฝูงกรดอะมิโนที่ใช้ในการคำนวณมวล
ของเปปไทด์อยู่บนพื้นฐานของบัญชี masses.To เคมีเฉลี่ยสำหรับการเปลี่ยนแปลงในมวลที่สร้างขึ้นโดยทางเคมี
obiectives ของการวิจัย renorted ที่นี่มี
การปรับเปลี่ยนมวลของกรดอะมิโนที่เหมาะสม
สามารถเปลี่ยนแปลงได้ ฐานข้อมูลสายพันธุ์เฉพาะที่ถูกสร้างขึ้น
โดยการรวมโปรตีนที่ได้มาจาก
ที่ Homo sapiens (16,340 ลำดับ) E. coli (6637 ลำดับ)
และ 5. cereuisiue (4285 ลำดับ) จาก
Genpept และ PIR ฐานข้อมูล (National วิจัยทางการแพทย์
มูลนิธิกรุงวอชิงตันดีซี ) ลำดับของ
[Glu '] - fibrinopeptide และ CRGDSY เปปไทด์ที่ถูก
เพิ่มเข้าไปในฐานข้อมูล Homo sapiens เพื่อให้เพิ่มเติม
การประเมินที่เป็นตัวแทนของการค้นหาด้วยเปปไทด์
ที่ได้มาจาก @lactoglobulin (taaums บอส) และ RU-เคซีน
(Bos faltrus) เหล่านี้โปรตีนถูกเพิ่มเข้าไปใน
ฐานข้อมูลของมนุษย์ ลำดับของ trypsin (Bos
tuurus) ถูกบันทึกอยู่ในฐานข้อมูลเชื้อ E. coli ไปยังหน้าจอสำหรับ
ผลิตภัณฑ์ย่อยตัวเอง การค้นหาของสายพันธุ์เฉพาะ
ฐานข้อมูลต้องใช้เวลาประมาณ 3-5 นาทีใน
มินิคอมพิวเตอร์ HI9000

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

ที่ใช้เขียนในการเขียนโปรแกรมคอมพิวเตอร์ภาษาภายใต้ระบบปฏิบัติการยูนิกซ์ที่ genpept ฐานข้อมูลได้เป็นแอสกีแฟ้มข้อความในรูปแบบ fasta จากศูนย์ข้อมูลเทคโนโลยีชีวภาพแห่งชาติโดย FTP ไม่ระบุชื่อ( ncbi ขนาดปล่อย 77.0 ; วันที่ 06 / 15 / 93 ; 74938 29127050 โปรตีนที่มีกรดอะมิโน ) ฐานข้อมูลนี้ประกอบด้วยโปรตีนจากลำดับนิวคลีโอไทด์แปลดังนี้ ค้นหาของ genpept ทั้งหมดฐานข้อมูล reauired anuroximatelv lo-15 มม. บน hp9000 มิ & omput & ( hewlettll"ackard , พาโลอัลโตแคลิฟอร์เนีย ) ฝูงกรดอะมิโนใช้ในการคำนวณมวลเปปไทด์จากมวลทางเคมีทั่วไป ไปยังบัญชีสำหรับการเปลี่ยนแปลงในมวลที่สร้างโดยเคมีการ obiectives ของการวิจัย renorted ที่นี่การปรับเปลี่ยน , มวลของกรดอะมิโนที่เหมาะสมสามารถเปลี่ยนได้ สร้างฐานข้อมูลเฉพาะชนิดโดยการรวมยีนที่ได้มาจากโปรตีนโฮโม ซาเปียน ( 16340 ลำดับ ) , E . coli ( 6637 ลำดับ )และ 5 . cereuisiue ( แท่ง ) ) จากและฐานข้อมูลวิจัยแห่งชาติ genpept เทคโนโลยีชีวการแพทย์มูลนิธิ , Washington , DC ) ลำดับของ[ ซึ่ง ] - fibrinopeptide และเปปไทด์ crgdsy คือเพิ่มโฮโม ซาเปียน ฐานข้อมูล ให้มากขึ้นการประเมินฯ การค้นหาที่มีเปปไทด์ได้มาจาก @ แลคโตกลอบูลิน ( บอส taaums ) และ รุ เคซีน( บอส faltrus ) ลำดับโปรตีนเหล่านี้เพิ่มฐานข้อมูลของมนุษย์ ลำดับของเอนไซม์ ( บอสtuurus ) ถูกเพิ่มลงใน E . coli ฐานข้อมูลไปยังหน้าจอสำหรับผลิตภัณฑ์แหล่ง . การค้นหาของเผ่าพันธุ์ - เฉพาะฐานข้อมูลต้องประมาณ 3-5 นาทีบนhi9000 มินิคอมพิวเตอร์ .