thioesterase is an enzyme involved

thioesterase is an enzyme involved in
the biosynthesis pathway of fatty acids and derivatives thereof (such as
triacylglycerol (triglyceride)). This enzyme hydrolyzes a thioester bond of an
acyl-ACP to form free fatty acids in a plastid such as a chloroplast of plants and
algae or in a cytoplasm of bacteria, fungi and animals. The acyl-ACP is a
25 composite composed of an acyl group as a fatty acid residue and an acyl carrier
protein, and is an intermediate in the process of fatty acid biosynthesis. The
function of the thioesterase completes the synthesis of the fatty acid synthesis on
the ACP, and then the thus-produced free fatty acids are supplied to the synthesis of triglyceride and the like. To date, several acyl-ACP thioesterases having different reaction specificities depending on the number of carbon atoms and the number of unsaturated bonds of acylgroup (fatty acid residue) of acyl-
ACP substrate are identified. Therefore, they are considered to be an important 5 factor in determining fatty acid composition of an organism.
In the present invention, the "having thioesterase activity" means having an activity of hydrolyzing a thioester bond of an acyl-ACP.

One example of nucleotide sequences encoding the amino acid
sequence set forth in SEQ ID NO: 1 is a nucleotide sequence set forth in SEQ ID
NO: 2. The gene consisting of the nucleotide sequence set forth in SEQ ID NO:
2 is derived from Nannochloropsis qaditana. Genome sequence data of
Nannochloropsis gaditana has been published in 2012 (see Randor Radakovits,
et al., "Draft genome sequence and genetic transformation of the oleaginous alga 15 Nannochloropsis gaditana", Nature Communications, D01:10.1038/ncomms1688,
2012).
The present inventors have identified the gene consisting of the
nucleotide sequence set forth in SEQ ID NO: 2 as an acyl-ACP thioesterase gene.
Further, they have identified an important region for acyl-ACP thioesterase
20 activity in the amino acid sequence encoded by the gene.
A recombinant protein at least having an amino acid sequence of the
115th to 274th amino acids set forth in SEQ ID NO: 1 acts as an acyl-ACP
thioesterase as demonstrated in the working examples below. That is, it is
thought that the region from 115th to 274th amino acids is sufficient for acyl-ACP 25 thioesterase activity, with respect to the amino acid sequence set forth in SEQ ID
NO: 1.
In the protein (b), the sequence identity of amino acid sequence is

preferably 60% or more, more preferably 70% or more, further preferably 80% or more, further more preferably 90% or more, and particularly preferably 95% or more, in view of acyl-ACP thioesterase activity.
In the present specification, the sequence identity of the amino acid
sequence and nucleotide sequence is calculated through the Lipman-Pearson
method (see Science, 227, pp.1435, (1985)). Specifically, the identity can be determined through use of a homology analysis (homology search) program of genetic information processing software Genetyx-Win (Software Development Co., Ltd.) with the unit size to compare (ktup) being set to 2.
{0019}
Specific examples of the protein (b) include the following proteins (al) and (a2).
(al) A protein consisting of an amino acid sequence of the 128th to 287th amino acids, set forth in SEQ ID NO: 14.
(a2) A protein consisting of an amino acid sequence of the 126th to 285th
amino acids set forth in SEQ ID NO: 16.
The protein consisting of the amino acid sequence set forth in SEQ ID
NO: 14 is a novel acyl-ACP thioesterase derived from Nannochloropsis oculata.
The amino acid sequence of the 128th to 287th amino acids set forth in SEQ ID 20 NO: 14 has about 91°/0 identity with the amino acid sequence of the 115th to 274th
amino acids set forth in SEQ ID NO: 1.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

thioesterase เป็นเอนไซม์เกี่ยวข้องในทางเดินชีวสังเคราะห์ของกรดไขมันและอนุพันธ์ดังกล่าว (เช่นtriacylglycerol (ไตรกลีเซอไรด์)) เอนไซม์นี้ hydrolyzes thioester พันธะของการacyl-ACP แบบกรดไขมันอิสระในพลาสติดเช่นคลอโรพลาสต์ของพืช และ สาหร่ายหรือ ในไซโทพลาซึมของแบคทีเรีย เชื้อรา และสัตว์ Acyl ACP เป็นการ คอมโพสิตที่ 25 ประกอบด้วยกลุ่ม acyl ที่เป็นสารตกค้างเป็นกรดไขมันและการขนส่ง acyl โปรตีน และเป็นกลางในกระบวนการสังเคราะห์กรดไขมัน ที่ ฟังก์ชันของ thioesterase เสร็จสิ้นการสังเคราะห์สังเคราะห์กรดไขมันใน ใน ACP และไขมันกรดอิสระที่ผลิตจึงถูกกำหนดให้สังเคราะห์ไตรกลีเซอไรด์และเช่น วันที่ acyl ACP thioesterases หลายที่มี specificities ปฏิกิริยาแตกต่างกันขึ้นอยู่กับจำนวนอะตอมของคาร์บอนและจำนวนของพันธบัตรในระดับที่สมของ acylgroup (กรดไขมันตกค้าง) ของ acyl-มีระบุพื้นผิว ACP ดังนั้น พวกเขาจะถือเป็น 5 ปัจจัยสำคัญในการกำหนดองค์ประกอบกรดไขมันของชีวิตในปัจจุบันประดิษฐ์ หมายถึงการ "มีกิจกรรม thioesterase" ที่มีกิจกรรมของ hydrolyzing thioester พันธะของ ACP acyl การ ตัวอย่างหนึ่งของลำดับของนิวคลีโอไทด์ที่เข้ารหัสกรดอะมิโน ลำดับชุดออกมาในเลขลำดับ ID: 1 เป็นลำดับนิวคลีโอไทด์ที่กำหนดไว้ในรหัสลำดับNO: 2. ยีนประกอบด้วยลำดับนิวคลีโอไทด์ที่กำหนดไว้ในลำดับ ID ไม่:2 มาจาก Nannochloropsis qaditana จีโนมลำดับข้อมูลNannochloropsis gaditana ได้เผยแพร่ในปี 2012 (ดูที่ Randor Radakovits ร้อยเอ็ด al. "ลำดับร่างจีโนมและการเปลี่ยนแปลงทางพันธุกรรมของ gaditana Nannochloropsis oleaginous alga 15" ธรรมชาติการสื่อสาร D01:10.1038 / ncomms1688 2012)นักประดิษฐ์ปัจจุบันระบุยีนที่ประกอบด้วยการลำดับนิวคลีโอไทด์ที่กำหนดไว้ในลำดับ ID: 2 เป็น acyl ACP thioesterase ยีน เพิ่มเติม พวกเขาได้ระบุภูมิภาคสำคัญใน acyl ACP thioesterase กิจกรรมที่ 20 ลำดับกรดอะมิโนที่เข้ารหัส โดยยีน โปรตีน recombinant ที่น้อย มีการลำดับกรดอะมิโนกรดอะมิโน 115th กับ 274th ที่กำหนดไว้ในลำดับ ID: 1 ทำหน้าที่เป็นการ acyl-ACPthioesterase ดังที่แสดงในตัวอย่างการทำงานด้านล่าง กล่าวคือ มันเป็นคิดว่า บริเวณนี้จาก 115th เพื่อ 274th กรดอะมิโนเพียงพอสำหรับ acyl ACP 25 thioesterase กิจกรรม เกี่ยวกับลำดับกรดอะมิโนที่กำหนดไว้ในรหัสลำดับ ไม่มี: 1ในโปรตีน (b), มีการระบุลำดับของกรดอะมิโนลำดับควร 60% หรือมากกว่า เพิ่มเติมควร 70% หรือมากกว่า เพิ่มเติมควร 80% หรือ มากกว่า เพิ่มเติมควรขึ้น 90% หรือ มากกว่า และโดยเฉพาะอย่างยิ่งควร 95% หรือ มากกว่า มุมมองกิจกรรม acyl ACP thioesteraseในข้อมูลจำเพาะปัจจุบัน การระบุลำดับของกรดอะมิโน ลำดับนิวคลีโอไทด์และลำดับคำนวณผ่าน Lipman-เพียร์method (see Science, 227, pp.1435, (1985)). Specifically, the identity can be determined through use of a homology analysis (homology search) program of genetic information processing software Genetyx-Win (Software Development Co., Ltd.) with the unit size to compare (ktup) being set to 2. {0019}Specific examples of the protein (b) include the following proteins (al) and (a2).(al) A protein consisting of an amino acid sequence of the 128th to 287th amino acids, set forth in SEQ ID NO: 14. (a2) A protein consisting of an amino acid sequence of the 126th to 285thamino acids set forth in SEQ ID NO: 16.The protein consisting of the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 14 is a novel acyl-ACP thioesterase derived from Nannochloropsis oculata. The amino acid sequence of the 128th to 287th amino acids set forth in SEQ ID 20 NO: 14 has about 91°/0 identity with the amino acid sequence of the 115th to 274th amino acids set forth in SEQ ID NO: 1.

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

thioesterase เป็นเอนไซม์ที่เกี่ยวข้องในการ
เดินการสังเคราะห์กรดไขมันและอนุพันธ์ดังกล่าว (เช่น
triacylglycerol (ไตรกลีเซอไรด์)) เอนไซม์นี้ไฮโดรไลซ์พันธบัตร thioester ของ
acyl-ACP ในรูปแบบกรดไขมันอิสระใน plastid เช่นคลอโรพลาของพืชและ
สาหร่ายหรือในพลาสซึมของแบคทีเรียเชื้อราและสัตว์ acyl-ACP เป็น
25 คอมโพสิตประกอบด้วยกลุ่ม acyl เป็นกรดไขมันที่ตกค้างและผู้ให้บริการ acyl
โปรตีนและเป็นสื่อกลางในกระบวนการของการสังเคราะห์กรดไขมัน
ฟังก์ชั่นของ thioesterase เสร็จสิ้นการสังเคราะห์ของการสังเคราะห์กรดไขมันใน
ACP และจากนั้นจึงผลิตกรดไขมันอิสระจะจ่ายให้กับการสังเคราะห์ไตรกลีเซอไรด์และไม่ชอบ ในวันที่หลาย acyl-ACP thioesterases มีปฏิกิริยาจำเพาะที่แตกต่างกันขึ้นอยู่กับจำนวนของอะตอมคาร์บอนและจำนวนของพันธบัตรไม่อิ่มตัวของ acylgroup (สารตกค้างกรดไขมัน) ของ acyl-
พื้นผิว ACP จะมีการระบุ ดังนั้นพวกเขาจะถือว่าเป็นสิ่งที่สำคัญ 5 ปัจจัยในการกำหนดองค์ประกอบของกรดไขมันของสิ่งมีชีวิต.
ในการประดิษฐ์ในปัจจุบันที่ "มีกิจกรรม thioesterase" หมายถึงการมีกิจกรรมไฮโดรไลซ์พันธบัตร thioester ของ acyl-ACP. ตัวอย่างหนึ่งของการเบื่อหน่าย ลำดับการเข้ารหัสกรดอะมิโน ลำดับที่กำหนดไว้ใน SEQ ID NO: 1 เป็นลำดับเบสที่กำหนดไว้ใน SEQ ID NO: 2 ยีนประกอบด้วยลำดับเบสที่กำหนดไว้ใน SEQ ID NO: 2 มาจาก Nannochloropsis qaditana ข้อมูลจีโนมลำดับของNannochloropsis gaditana ได้รับการตีพิมพ์ในปี 2012 (ดู Randor Radakovits, et al, "ร่างลำดับจีโนมและการเปลี่ยนแปลงทางพันธุกรรมของสาหร่ายน้ำมัน 15 Nannochloropsis gaditana" ธรรมชาติสื่อสาร D01. 10.1038 / ncomms1688, 2012). ในปัจจุบัน นักประดิษฐ์ได้ระบุยีนที่ประกอบด้วยลำดับเบสที่กำหนดไว้ใน SEQ ID NO. 2 acyl-ACP ยีน thioesterase นอกจากนี้พวกเขาได้ระบุภูมิภาคที่สำคัญสำหรับ acyl-ACP thioesterase 20 กิจกรรมในลำดับกรดอะมิโนเข้ารหัสโดยยีน . โปรตีนอย่างน้อยมีลำดับของกรดอะมิโน115 เพื่อกรดอะมิโน 274 ที่กำหนดไว้ใน SEQ ID NO: 1 ทำหน้าที่เป็น acyl-ACP thioesterase แสดงให้เห็นในตัวอย่างการทำงานดังต่อไปนี้ นั่นคือมันเป็นความคิดที่ว่าภูมิภาคจาก 115 ไปกรดอะมิโน 274 ก็เพียงพอแล้วสำหรับ acyl-ACP 25 thioesterase กิจกรรมที่เกี่ยวกับลำดับกรดอะมิโนที่กำหนดไว้ใน SEQ ID NO: 1. โปรตีนใน (ข) ตามลำดับ ตัวตนของลำดับกรดอะมิโนเป็นอย่างยิ่ง 60% หรือมากขึ้นโดยเฉพาะอย่างยิ่ง 70% หรือมากกว่านั้นต่อไปโดยเฉพาะอย่างยิ่ง 80% หรือมากกว่านั้นต่อไปอีกโดยเฉพาะอย่างยิ่งหรือมากกว่า 90% และโดยเฉพาะอย่างยิ่ง 95% หรือมากกว่านั้นในมุมมองของ acyl-ACP กิจกรรม thioesterase . ในสเปคปัจจุบันที่ตัวตนลำดับของกรดอะมิโน ลำดับและลำดับเบสคำนวณผ่านลิปแมนเพียร์สันวิธี (ดูวิทยาศาสตร์ 227 pp.1435, (1985)) โดยเฉพาะเอกลักษณ์สามารถระบุได้ผ่านการใช้การวิเคราะห์ที่คล้ายคลึงกัน (เหมือนการค้นหา) โปรแกรมของการประมวลผลข้อมูลทางพันธุกรรมซอฟต์แวร์ Genetyx-Win (Software Development Co. , Ltd) ซึ่งมีขนาดของหน่วยเพื่อเปรียบเทียบ (KTUP) ถูกตั้งค่าให้ 2 { 0019} เฉพาะตัวอย่างของโปรตีน (ข) รวมถึงโปรตีนดังต่อไปนี้ (อัล) และ (a2). (อัล) โปรตีนประกอบด้วยกรดอะมิโนลำดับของ 128 เพื่อกรดอะมิโน 287, ที่กำหนดไว้ใน SEQ ID NO: 14 (a2) โปรตีนประกอบด้วยกรดอะมิโนลำดับของ 126 ไป 285 กรดอะมิโนที่กำหนดไว้ใน SEQ ID NO: 16 โปรตีนประกอบด้วยกรดอะมิโนลำดับที่กำหนดไว้ใน SEQ ID NO: 14 เป็นนวนิยาย acyl-ACP thioesterase ที่ได้มาจาก Nannochloropsis oculata. ลำดับกรดอะมิโน 128 เพื่อกรดอะมิโน 287 ที่กำหนดไว้ใน ID SEQ NO 20: 14 มีประมาณ 91 ° / 0 ตัวตนที่มีลำดับของกรดอะมิโน 115 ไป 274 กรดอะมิโนที่กำหนดไว้ใน ID SEQ NO : 1

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

thioesterase เป็นเอนไซม์ที่เกี่ยวข้องกับ
วิถีการสังเคราะห์กรดไขมันและอนุพันธ์ของมัน ( เช่น
triacylglycerol ( ? ) ) เอนไซม์นี้เป็นพันธบัตรของไทโอเ เทอร์ hydrolyzes
, ACP เพื่อสร้างกรดไขมันอิสระในพลาสติดเช่นคลอโรพลาสต์ของพืชและสาหร่ายหรือในไซโตพลาสซึม
แบคทีเรีย , เชื้อรา และสัตว์ ใน ACP เป็น
,25 ผสมประกอบด้วยของไอเวอร์แมกตินเป็นเศษกรดไขมันและผู้ให้บริการ
, โปรตีน , และเป็นสื่อกลางในกระบวนการชีวสังเคราะห์ของกรดไขมัน .
ฟังก์ชันของ thioesterase เสร็จสิ้นการสังเคราะห์การสังเคราะห์กรดไขมันใน
ACP แล้วจึงผลิตกรดไขมันอิสระที่จัดเพื่อการสังเคราะห์ไตรกลีเซอไรด์และชอบ วันที่thioesterases ACP , - หลายมีปฏิกิริยาที่แตกต่างกันขึ้นอยู่กับจำนวนของคาร์บอนอะตอมและจำนวนของกรดไขมันไม่อิ่มตัวพันธบัตรของ acylgroup ( กรดไขมันกาก ) ,
ACP ( จะระบุ จึงถือว่าเป็นสิ่งสำคัญในการกำหนดองค์ประกอบ 5 องค์ประกอบกรดไขมันของสิ่งมีชีวิต .
ในการประดิษฐ์ของขวัญ" มีกิจกรรม " thioesterase หมายถึง การมีกิจกรรมการย่อยเป็นไทโอเ เทอร์พันธบัตรของ , ACP .

ตัวอย่างหนึ่งของลำดับนิวคลีโอไทด์ของการเข้ารหัสกรดอะมิโน
ลำดับไว้ใน seq id : 1 เป็นลำดับนิวคลีโอไทด์ที่กำหนดไว้ใน seq id
: 2 ยีนประกอบด้วยลำดับนิวคลีโอไทด์ที่กำหนดไว้ใน seq id :
2 ได้มาจาก nannochloropsis qaditana . จีโนมลำดับข้อมูล
nannochloropsis gaditana ได้รับการตีพิมพ์ในปี 2012 ( ดู randor radakovits
, et al . , " ร่างจีโนมลำดับและการถ่ายทอดทางพันธุกรรมของสาหร่ายที่ผสมด้วยน้ำมัน 15 nannochloropsis gaditana " ธรรมชาติการสื่อสาร d01: 10.1038/ncomms1688

, 2012 ) นักประดิษฐ์ปัจจุบันได้ระบุยีนประกอบด้วย
ลำดับนิวคลีโอไทด์ที่กำหนดไว้ใน seq id ไม่ : 2 เป็น , ACP thioesterase ยีน
นอกจากนี้พวกเขาได้ระบุพื้นที่ที่สำคัญสำหรับ , ACP thioesterase
20 กิจกรรมในลำดับของกรดอะมิโนที่เข้ารหัสโดยยีน
โปรตีนรีคอมบิแนนท์อย่างน้อยมีลำดับกรดอะมิโนของ
รัฐมนตรีว่าการที่จะ 274th กรดอะมิโนที่กำหนดไว้ใน seq id : 1 ทำหน้าที่เป็น , ACP
thioesterase ดังที่แสดงในการทำงานตัวอย่างด้านล่าง นั่นคือมันเป็น
คิดว่าพื้นที่จากรัฐมนตรีว่าการ 274th กรดอะมิโนให้มีเพียงพอ , ACP 25 กิจกรรม thioesterase ด้วยความเคารพกับลำดับกรดอะมิโนที่กำหนดไว้ใน seq id
: 1 .
ในโปรตีน ( B ) ตามลําดับ เอกลักษณ์ของลำดับกรดอะมิโนเป็น

เด่นกว่า 60% หรือมากกว่ามากขึ้นกว่า 70 เปอร์เซ็นต์ หรือมากกว่า , เพิ่มเติมกว่า 80% หรือมากกว่า , เพิ่มเติมมากขึ้นกว่า 90% หรือมากกว่า