Using flow cytometry determinations

Using flow cytometry determinations, it was discovered that body and head lice have the smallest genomes of any hemimetabolous insect reported to date, spanning 108 Mb [46]. Sequencing of the body louse genome validated this finding and revealed that despite its small size the genome retained a remarkably complete basal insect repertoire of 10,775 draft body louse gene models [34]. Reduction of the genome size was accomplished by removing intergenic DNA,reducing the size and number of introns within genes and reducing the number of genes within large gene families, particularly those involved in environmental sensing and response, including odorant and gustatory receptor, detoxification enzyme and innate immune response genes [34,47,48]. Comparison of the transcriptional profiles of body and head lice using expressed sequence tag data sets identified 10,771 body and 10,770 head louse transcripts [35].Illumina sequence reads were mapped to the 10,775 body louse gene models and identified nine presence/absence differences. Only one gene difference between the two transcriptomes was determined using quantitative real time PCR and that gene was determined to be translated into a hypothetical protein with no function, indicating that these two organisms share virtually the same genome and are ecotypes of the same species.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

ใช้กระแสเซลล์ determinations เป็นการค้นพบว่า ร่างกายและศีรษะเหามี genomes ที่เล็กที่สุดของแมลง hemimetabolous การรายงานวันที่ รัฐ 108 Mb [46] ลำดับของจีโนม louse ตัวค้นหานี้การตรวจสอบ และเปิดเผยว่า แม้ มีขนาดที่เล็กของ จีโนมที่สะสมละครโรคแมลงที่สมบูรณ์อย่างยิ่งรุ่น 10,775 ร่างกาย louse ยีน [34] ลดขนาดกลุ่มได้สำเร็จ ด้วยการเอา DNA intergenic การลดขนาดและจำนวนของ introns ภายในยีน และลดจำนวนของยีนภายในครอบครัวยีนขนาดใหญ่ โดยเฉพาะอย่างยิ่งผู้เกี่ยวข้องในสภาพแวดล้อมการตรวจและตอบรับ รวมทั้ง odorant ตัวรับ gustatory เอ็นไซม์ล้างพิษ และยีนตอบสนองภูมิคุ้มกันโดยธรรมชาติ [34,47,48] เปรียบเทียบโพรไฟล์ transcriptional ของร่างกายและศีรษะเหาใช้แสดงลำดับข้อมูลชุดระบุร่างกาย 10,771 และหัว 10,770 louse ใบแสดงผล [35] อ่านลำดับ Illumina ถูกแมปไป 10,775 louse ร่างกายยีน และระบุความแตกต่างของสถานะ/ขาดงานเก้า กำหนดความแตกต่างของยีนเดียวระหว่าง transcriptomes สองใช้เวลาจริงเชิงปริมาณ PCR และยีนที่กำหนดจะแปลเป็นโปรตีนสมมุติด้วยฟังก์ชันไม่ บ่งชี้ว่า สิ่งมีชีวิตเหล่านี้สองร่วมกลุ่มเดียวกันจริง และ ecotypes พันธุ์เดียวกัน

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

ใช้โฟหาความมันก็พบว่าเหาร่างกายและศีรษะมีจีโนมที่เล็กที่สุดของแมลง hemimetabolous ใด ๆ ที่ต้องไปรายงานตัววันที่ทอด 108 Mb [46] ลำดับของจีโนมเหาร่างกายการตรวจสอบและการค้นพบนี้แสดงให้เห็นว่าแม้จะมีขนาดที่เล็กของจีโนมที่สมบูรณ์เก็บรักษาไว้อย่างน่าทึ่งละครแมลงฐาน 10,775 ร่างรูปแบบยีนร่างกายเหา [34] การลดลงของขนาดจีโนมก็ประสบความสำเร็จโดยการเอาดีเอ็นเอ intergenic ลดขนาดและจำนวนของ introns ภายในยีนและการลดจำนวนของยีนที่อยู่ในครอบครัวของยีนที่มีขนาดใหญ่โดยเฉพาะอย่างยิ่งผู้ที่เกี่ยวข้องในการตรวจวัดสิ่งแวดล้อมและการตอบสนองรวมทั้งกลิ่นและรับรสชาติเอนไซม์ล้างพิษและ ยีนที่ตอบสนองของภูมิคุ้มกันโดยธรรมชาติ [3​​4,47,48] การเปรียบเทียบรูปแบบการถอดรหัสของเหาร่างกายและศีรษะโดยใช้แสดงชุดข้อมูลแท็กลำดับที่ระบุ 10771 ร่างกายและจิตบำบัดเหาหัว 10,770 [35] ลำดับ .Illumina อ่านถูกแมปไปยังรุ่นยีนร่างกาย 10775 เหาและระบุเก้ามี / ไม่มีตัวตนที่แตกต่างกัน เพียงคนเดียวที่แตกต่างของยีนระหว่างสองรานถูกกำหนดโดยใช้เวลาจริง PCR เชิงปริมาณและยีนที่ได้รับการมุ่งมั่นที่จะได้รับการแปลเป็​​นโปรตีนที่มีฟังก์ชั่สมมุติไม่แสดงให้เห็นว่าทั้งสองมีชีวิตร่วมกันแทบจีโนมที่เหมือนกันและเป็นสายพันธุ์ของสายพันธุ์เดียวกัน

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

การไหล ( รวมทั้งพบว่าร่างกายและเหามีจีโนมของแมลงที่เล็กที่สุด hemimetabolous รายงานวันที่ครอบคลุม 108 MB [ 46 ] ลำดับของจีโนมตรวจสอบพบตัวเหาและเปิดเผยว่า แม้จะมีขนาดที่เล็กของจีโนมที่สมบูรณ์อย่างน่าทึ่ง แรกเริ่มจะมีแมลงละครของ 10775 ร่างตัวเหายีนรุ่น [ 34 ]การลดขนาดของจีโนมที่ประสบความสำเร็จโดยการเอาส่าดีเอ็นเอ , การลดขนาดและจำนวนของ introns ภายในยีนและการลดจำนวนของยีนภายในครอบครัวของยีนที่มีขนาดใหญ่ โดยเฉพาะอย่างยิ่งผู้ที่เกี่ยวข้องในด้านสิ่งแวดล้อมและการตอบสนอง รวมถึง กลิ่น รสชาติ รีเซพเตอร์เอนไซม์ล้างพิษและภูมิคุ้มกันตอบสนองแหล่งยีน [ 34,47,48 ]การเปรียบเทียบของไฟล์ลองใช้ร่างกาย และเหา แสดงชุดลำดับข้อมูลแท็กระบุ 10771 ร่างกายและ 10770 หัวเหา transcripts [ 35 ] . Illumina ลำดับอ่านถูกแมปไปยัง 10775 ตัวเหายีนรูปแบบและระบุเก้ามี / ไม่มีความแตกต่างเพียงหนึ่งชนิด ความแตกต่างระหว่างสอง transcriptomes ตั้งใจใช้ Real Time PCR คือ ยีนที่ถูกกำหนดให้แปลเป็นโปรตีนสมมุติที่ไม่มีฟังก์ชั่น แสดงให้เห็นว่าทั้งสองสิ่งมีชีวิตแบ่งปันจวนเดียวกันจีโนมและเป็นแหล่งพันธุ์ของสายพันธุ์เดียวกัน