cell-cycle-regulated kinases [7]. CtrA activity is also
restricted by temporally and spatially controlled
proteolysis [7,8].
CtrA-dependent genes represent only a fraction of
the roughly 500 Caulobacter genes whose expression
varies significantly over the course of the cell cycle [9],
suggesting that other major cell-cycle regulators could
be operative. Presuming that such regulators should be
essential for growth of Caulobacter cells, as is the case
with CtrA, Holtzendorff et al. [2] examined mutant
strains with conditionally lethal phenotypes. One mutation that gave rise to such a phenotype lay in a gene
encoding a 25 kDa protein of unknown function. Intriguingly, levels of this protein — dubbed GcrA, for global
cell-cycle regulator — oscillate out of phase with CtrA
over the course of the cell cycle. CtrA is present in
swarmer cells but removed by proteolysis at the transition to stalked cells, freeing the replication origin to initiate DNA synthesis. Transcription of gcrA rises as the
level of CtrA falls, with GcrA protein level peaking early
in S phase; gcrA transcription then declines later in S
phase, as ctrAexpression is reactivated (Figure 1).
Controlled depletion of GcrA affects the expression
of 125 genes, including ctrA. (Surprisingly, given the
extent to which GcrA levels fluctuate through the cell
cycle, less than half of these genes also exhibit cellcycle-dependent expression patterns.) Many of the
GcrA-responsive genes are involved in DNA metabolism, as might be expected given the association of
GcrA with S phase. GcrA appears to repress expression
of critical replication initiation factors — DnaA, DNA
helicase (dnaB), and primase (dnaG) — but activates
several other genes involved in DNA metabolism:
gyrase subunit A (gyrA), topoisomerase IV (parE), DNA
polymerase III subunits (dnaC and dnaQ), the HU DNA
packaging protein, and the damage response genes
lexAand dinP. Thus, although the ‘GcrA regulon’ is not
a comprehensive set of replication factors (and includes
many genes not obviously involved in DNA metabolism), it seems to be oriented toward supporting replication progression and chromosome partitioning.
The reciprocal oscillation of CtrA and GcrA protein
levels suggests a potential regulatory circuit. Indeed,
GcrA turns out to be necessary for the activation of one
(P1) of two promoters that drive expression of ctrA
(Figure 1B). The P1 promoter is responsible for initial
expression of CtrA during S phase, priming the stronger,
CtrA-dependent P2 promoter to be activated in a positive feedback loop [10]. How GcrA affects transcription
is not clear. Holtzendorff et al. [2] show through in vivo
cross-linking and chromatin immunoprecipitation that
GcrA is associated with the promoter regions of several
target genes, including ctrA, though the GcrA sequence
contains no recognizable DNA-binding motifs.
The activity of the ctrA P1 promoter is affected by
DNA methylation, and the timing of activation in vivo
correlates well with the time at which the replication fork
would pass through the ctrA locus to generate
เซลล์รอบระเบียบ kinases [7] มีกิจกรรมอยู่จำกัดโดย temporally และ spatially ควบคุม proteolysis [7,8]เพียงเศษเสี้ยวของที่เป็นตัวแทนของยีนอยู่ขึ้นอยู่กับยีน Caulobacter ประมาณ 500 ซึ่งนิพจน์ไปอย่างมีนัยสำคัญของวงจรเซลล์ [9],เร็คกูเลเตอร์วงจรเซลล์สำคัญอื่น ๆ สามารถแนะนำมีวิธีปฏิบัติตนภาย Presuming เร็คกูเลเตอร์ดังกล่าวควรจะจำเป็นต่อการเจริญเติบโตของเซลล์ Caulobacter เป็นกรณีมีอยู่ mutant Holtzendorff et al. [2] ตรวจสอบเงียฟียุทธภัณฑ์อย่างมีเงื่อนไข การกลายพันธุ์หนึ่งที่ให้ phenotype เช่นวางในยีนรหัสโปรตีน 25 kDa ของฟังก์ชันที่ไม่รู้จัก Intriguingly ระดับของโปรตีนนี้ — พากย์ GcrA ในโลกควบคุมวงจรเซลล์ — oscillate จากระยะที่มีอยู่ผ่านหลักสูตรของวัฏจักรเซลล์ อยู่อยู่ในเซลล์ swarmer แต่เอาโดย proteolysis ที่เปลี่ยนแปลงไล่เซลล์ เพิ่มพื้นที่จุดเริ่มต้นของการจำลองแบบเพื่อเริ่มต้นการสังเคราะห์ดีเอ็นเอ Transcription ของ gcrA ขึ้นเป็นอยู่ในระดับตก ระดับโปรตีน GcrA จุดก่อนในระยะ S gcrA transcription แล้วปฏิเสธในภายหลังในเฟส ขณะที่มีการเรียกใช้ ctrAexpression (รูปที่ 1)นิพจน์ที่มีผลต่อการลดลงของควบคุมของ GcrAของ 125 รวมอยู่ด้วย (น่าแปลกใจ ให้การขอบเขตการ GcrA ที่ระดับผันผวนผ่านเซลล์รอบ น้อยกว่าครึ่งหนึ่งของยีนเหล่านี้แสดงขึ้นอยู่กับ cellcycle ร่าย) จำนวนมากยีนตอบสนอง GcrA เกี่ยวข้องในการเผาผลาญดีเอ็นเอ ตามที่คาดหมายให้สมาคมGcrA ด้วยระยะ S GcrA ปรากฏปราบปรามนิพจน์ปัจจัยสำคัญจำลองเริ่มต้น — DnaA ดีเอ็นเอhelicase (dnaB), และ primase (dnaG) — แต่เรียกใช้งานหลายอื่น ๆ ยีนที่เกี่ยวข้องในการเผาผลาญดีเอ็นเอ:gyrase ย่อย (gyrA), topoisomerase IV (parE), ดีเอ็นเอพอลิเมอเรส III subunits (dnaC และ dnaQ), ดีเอ็นเอฮูบรรจุภัณฑ์โปรตีนและยีนตอบสนองเสียหายlexAand dinP ดังนั้น แม้ว่าไม่มี 'GcrA regulon'ครอบคลุมตั้งจำลองปัจจัย (และรวมถึงยีนหลายไม่แน่นอนเกี่ยวข้องในการเผาผลาญดีเอ็นเอ), มันดูเหมือนจะมุ่งเน้นไปทางสนับสนุนจำลองแบบก้าวหน้าและการแบ่งพาร์ทิชันโครโมโซมสั่นซึ่งกันและกันของโปรตีนอยู่และ GcrAระดับแนะนำวงจรศักยภาพกำกับดูแล แน่นอนGcrA เปิดออกจะจำเป็นสำหรับการเปิดใช้งานหนึ่ง(P1) ของก่อสองที่ไดรฟ์ของอยู่(รูปที่ 1B) โปรโมเตอร์ P1 รับผิดชอบสำหรับการเริ่มต้นค่าของอยู่ที่ระยะ S ปั๊มแข็งแกร่งโปรโมเตอร์ p 2 ขึ้นอยู่กับอยู่เพื่อเรียกใช้ในลูปป้อนกลับเชิงบวก [10] Transcription กระทบ GcrAไม่ได้ชัดเจน ดู Holtzendorff et al. [2] โดยในสัตว์ทดลองcross-linking และโครมาติน immunoprecipitation ที่GcrA จะเชื่อมโยงกับภูมิภาคโปรโมเตอร์หลายชนิดเป้าหมายลำดับ GcrA ยีน รวมอยู่ แม้ว่าประกอบด้วยความผูกพันดีเอ็นเอไม่รู้จักกิจกรรมของโปรโมเตอร์ P1 อยู่ที่ได้รับผลกระทบโดยปรับ และระยะเวลาของการเปิดใช้งานในสัตว์ทดลองคู่กับเวลาที่ส้อมจำลองจะผ่านโลกัสโพลอยู่เพื่อสร้าง
การแปล กรุณารอสักครู่..
วงจรควบคุมยา [ 7 ] กิจกรรมหน้าที่ยัง
เปลี่ยนชั่วคราว จำกัด โดยควบคุมและโปรตีโ ลซิส [ 7 , 8 ] .
Ctra ขึ้นอยู่กับยีนเป็นตัวแทนเพียงเศษเสี้ยวของ
ประมาณ 500 caulobacter ยีนที่มีการแสดงออกแตกต่างกันอย่างมีนัยสำคัญมากกว่าหลักสูตรของวัฏจักรเซลล์ [ 9 ] ,
แนะนำว่า เรกูเลเตอร์วงจรหลักอื่น ๆได้
เป็นหัตถการ ทะนงว่าหน่วยงานควร
ที่จำเป็นสำหรับการเจริญเติบโตของ caulobacter เซลล์เป็นกรณีที่
กับหน้าที่ holtzendorff , et al . [ 2 ] การตรวจสอบสายพันธุ์ที่กลายพันธุ์
กับเงื่อนไขร้ายแรงเกิด . หนึ่งเปลี่ยนแปลงที่ให้สูงขึ้นเช่นการวางในยีน
25 กิโลดาลตันของฟังก์ชันที่ไม่รู้จักการเข้ารหัส ฟังดู ระดับของโปรตีน - ขนานนาม gcra สำหรับเซลล์ควบคุม - แกว่งไปมารอบโลก
กับหน้าที่ออกจากเฟสผ่านหลักสูตรของวัฏจักรของเซลล์ หน้าที่ คือปัจจุบัน
swarmer เซลล์ แต่ออกโดยโปรตีโ ลซิสที่การติดตามเซลล์ , พ้นซ้ำที่มาประเดิม การสังเคราะห์ดีเอ็นเอ การถอดความของ gcra เพิ่มขึ้นเป็น
ระดับหน้าที่ตก ที่มีระดับโปรตีน gcra แฮ่กก่อน
ในเฟส gcra ถอดความแล้วปฏิเสธในภายหลังใน S
เฟส คือ เปิดเป็น ctraexpression
( รูปที่ 1 )ควบคุมการ gcra มีผลต่อการแสดงออกของยีนรวมถึง
125 , Ctra . ( น่าแปลกที่ได้รับ
ขอบเขตที่ gcra ระดับความผันผวนผ่านเซลล์
รอบ น้อยกว่าครึ่งหนึ่งของเหล่านี้ยีนมี cellcycle ขึ้นอยู่กับการแสดงออกรูปแบบ มากมายของ
gcra ตอบสนองยีนที่เกี่ยวข้องในการเผาผลาญ DNA เป็นอาจจะคาดหวังให้สมาคม
gcra กับเฟสgcra ปรากฏระงับการแสดงออกของการเริ่มต้นปัจจัยวิกฤต dnaa
-
โมเลกุลดีเอ็นเอ ( dnab ) และไพรเมส ( dnag ) แต่ใช้
หลายยีนอื่น ๆที่เกี่ยวข้องในการเผาผลาญ DNA :
gyrase subunit ( Gyra ) , 4 ( ตัดใหม่ )
3 ( dnac ดีเอ็นเอโดยหน่วยย่อย และ dnaq ) Hu
บรรจุภัณฑ์ดีเอ็นเอโปรตีนและยีน
ตอบสนองความเสียหาย lexaand เมนู . ดังนั้นแม้ว่า gcra ' ปกติ ' ไม่ใช่
ชุดครอบคลุมของปัจจัยดังกล่าว ( และรวมถึง
ยีนมากไม่ชัดที่เกี่ยวข้องในการเผาผลาญ DNA ) ดูเหมือนว่าจะมุ่งเน้นไปทางสนับสนุนความก้าวหน้าและการแบ่งโครโมโซม .
ความผันผวนส่วนกลับของหน้าที่และระดับโปรตีน
gcra ชี้ให้เห็นศักยภาพกฎระเบียบของวงจร แน่นอน
gcra กลับกลายเป็นสิ่งจำเป็นสำหรับการเปิดใช้งานของหนึ่ง
( P1 ) สองโปรโมเตอร์ที่ทำให้การแสดงออกของ Ctra
( รูปที่ 1A ) การส่งเสริมการขายที่รับผิดชอบสำนวน P1
ของหน้าที่ในช่วงระยะเริ่มต้นของรองพื้นที่แข็งแกร่ง
หน้าที่โปรโมเตอร์ P2 ) จะเปิดใช้งานในการตอบรับเชิงบวกห่วง [ 10 ] วิธี gcra มีผลต่อการถอดรหัส
ไม่ชัดเจน holtzendorff et al . [ 2 ] แสดงถึงฤทธิ์ใน
และเมื่อพบ immunoprecipitation ที่
gcra เกี่ยวข้องกับโปรโมเตอร์ของยีนหลายภูมิภาค
เป้าหมาย รวมถึงหน้าที่ แม้ว่า gcra ลำดับ
ไม่รู้จักดีเอ็นเอมัดลวดลาย
กิจกรรมของผู้ได้รับผลกระทบ โดยหน้าที่ P1
methylation ดีเอ็นเอ และระยะเวลาของการกระตุ้นในสัตว์มีความสัมพันธ์กับเวลาที่
ซึ่ง การปรับปรุงทางแยก
จะผ่านหน้าที่ตนเพื่อสร้าง
การแปล กรุณารอสักครู่..