Studying niche differentiation An e

Studying niche differentiation
An exciting new direction in molecular microbial ecology is
the analysis of enzyme encoding genes. Generally these
genes have more sequence variation than the relatively
conserved 16s rRNA encoding genes, and might, therefore,
be better molecular markers to discriminate between close-
ly related but ecologically different populations [41”].
Moreover, the use of functional genes makes it possible to
study the specific activities of bacterial populations.

Wawer et a/. [42”] were the first to use DGGE analysis of
[NiFe] hydrogenase gene fragments of Desu~owibrio
species, an important group of sulfate-reducing bacteria.
By comparative analysis of PCR products obtained from
genomic DNA and mRNA extracted from bioreactor sam-
ples incubated with hydrogen, the substrate for the [NiFe]
hydrogenase enzyme, the authors could demonstrate the
presence of different Desu~ofonihio populations, but only
the preferential expression of the [NiFe] hydrogenase
gene by one population. It was concluded that this popu-
lation might be better adapted to growth on hydrogen than
other Desulfoovibrio populations suggesting a niche differen-
tiation of closely related bacterial populations performing
different functions in the community. As more sequences
for other functional genes become available in the future,
we will soon be able to use PCR-DGGE/TGGE to relate
community structure and function.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

ศึกษาเฉพาะสร้างความแตกต่าง ทิศทางใหม่ที่น่าตื่นเต้นในโมเลกุลนิเวศวิทยาจุลินทรีย์คือ การวิเคราะห์เอนไซม์เข้ารหัสยีน โดยทั่วไปเหล่านี้ ยีนมีการเปลี่ยนแปลงลำดับที่เพิ่มมากขึ้นกว่าค่อนข้าง อาศัย 16s rRNA เข้ารหัสยีน และอาจ ดังนั้น จะดีกว่าเครื่องหมายโมเลกุลเพื่อเหยียดระหว่างปิด-ลีที่เกี่ยวข้องแต่ประชากรนิเวศวิทยาต่าง ๆ [41"] นอกจากนี้ การใช้ยีนที่ทำงานทำให้ ศึกษากิจกรรมที่เฉพาะเจาะจงของประชากรแบคทีเรีย Wawer ร้อยเอ็ดมี / [42"] ถูกครั้งแรกจะใช้วิเคราะห์ DGGE ชิ้นส่วนยีน hydrogenase [NiFe] ของ Desu ~ owibrio สปีชีส์ กลุ่มความสำคัญของซัลเฟตลดแบคทีเรีย โดยวิเคราะห์เปรียบเทียบผลิตภัณฑ์ PCR ที่ได้รับจาก genomic DNA และ mRNA ที่สกัดจาก bioreactor สาม-ples incubated กับไฮโดรเจน พื้นผิวสำหรับ [NiFe] เอนไซม์ hydrogenase ผู้เขียนได้แสดงให้เห็นถึงการ ของอื่น Desu ~ ofonihio ประชากร แต่ ค่าต้องของ hydrogenase [NiFe] ยีน โดยประชากรหนึ่ง ได้สรุปที่ popu นี้ -เครื่องดูดอาจถูกดัดแปลงเพื่อการเจริญเติบโตในไฮโดรเจนมากกว่า ประชากร Desulfoovibrio อื่น ๆ แนะนำ differen โพรงเป็น-tiation ของประชากรแบคทีเรียที่เกี่ยวข้องอย่างใกล้ชิดที่ดำเนินการ ฟังก์ชันต่าง ๆ ในชุมชน เพิ่มมากขึ้นเป็นลำดับ สำหรับยีนอื่น ๆ ทำงานในอนาคต เราจะได้ใช้ PCR-DGGE/TGGE ที่เกี่ยวข้อง โครงสร้างชุมชนและการทำงาน

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

การศึกษาความแตกต่างเฉพาะทิศทางใหม่ที่น่าตื่นเต้นในระบบนิเวศของจุลินทรีย์โมเลกุลวิเคราะห์เอนไซม์เข้ารหัสยีน โดยทั่วไปเหล่านี้ยีนที่มีการเปลี่ยนแปลงลำดับมากกว่าค่อนข้าง16s rRNA อนุรักษ์เข้ารหัสยีนและอาจจึงเป็นโมเลกุลดีกว่าที่จะเห็นความแตกต่างระหว่างระยะใกล้ระยะเหมือนที่เกี่ยวข้องแต่ประชากรที่แตกต่างกันทางด้านนิเวศวิทยา [41] ". นอกจากนี้ยังมีการใช้การทำงานของยีนที่ทำให้ ไปได้ที่จะศึกษากิจกรรมที่เฉพาะเจาะจงของประชากรแบคทีเรีย. Wawer และบาร์ / [42] "เป็นคนแรกที่ใช้การวิเคราะห์ DGGE ของ[NiFe] ชิ้นส่วนของยีน hydrogenase Desu ~ owibrio ชนิดกลุ่มที่สำคัญของซัลเฟตลดแบคทีเรีย. โดยการวิเคราะห์เปรียบเทียบผลิตภัณฑ์ PCR ที่ได้รับจากดีเอ็นเอและmRNA สกัดจาก sam- เครื่องปฏิกรณ์ชีวภาพPles บ่มกับไฮโดรเจนสารตั้งต้นสำหรับ [NiFe] เอนไซม์ hydrogenase ผู้เขียนจะแสดงให้เห็นถึงการปรากฏตัวของที่แตกต่างกันDesu ~ ofonihio ประชากร แต่การแสดงออกของสิทธิพิเศษ[NiFe] hydrogenase ยีนโดยหนึ่งในประชากร ก็สรุปได้ว่า popu- นี้lation อาจจะมีการปรับตัวที่ดีขึ้นในการเจริญเติบโตในไฮโดรเจนกว่าประชากรอื่นๆ Desulfoovibrio บอกช่อง differen- tiation ประชากรแบคทีเรียเกี่ยวข้องอย่างใกล้ชิดที่มีประสิทธิภาพการทำงานที่แตกต่างกันในชุมชน ในฐานะที่เป็นลำดับมากขึ้นสำหรับการทำงานอื่น ๆ ยีนกลายเป็นใช้ได้ในอนาคตเราเร็วๆ นี้จะสามารถที่จะใช้ PCR-DGGE / TGGE ที่จะเกี่ยวข้องกับโครงสร้างและการทำงานของชุมชน

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

ศึกษาเฉพาะความแตกต่าง
ทิศทางใหม่ที่น่าตื่นเต้นในระบบนิเวศจุลินทรีย์โมเลกุล
การวิเคราะห์เอนไซม์การเข้ารหัสยีน โดยทั่วไปยีนเหล่านี้มีการเปลี่ยนแปลงกว่าอีก

ลำดับเบส 16S rRNA ยีนค่อนข้างอนุรักษ์ การเข้ารหัส และอาจจึง
เป็นเครื่องหมายโมเลกุลที่ดีกว่าที่จะแยกแยะระหว่างปิด -
ลี เกี่ยวข้อง แต่ประชากรนิเวศวิทยา " [ 41 ]
นอกจากนี้การใช้ยีนที่ทํางานทำให้มันเป็นไปได้ที่จะ
ศึกษากิจกรรมเฉพาะของประชากรแบคทีเรีย

wawer ET / . [ 42 ] เป็นครั้งแรกที่จะใช้การทดลองการวิเคราะห์
[ ] nife ไฮโดรจีเนสยีนเศษ desu ~ owibrio
ชนิด กลุ่มที่สำคัญของซัลเฟตลดแบคทีเรีย
โดยการวิเคราะห์เปรียบเทียบผลิตภัณฑ์ PCR ) และ สารสกัดจาก genomic DNA mRNA
( แซม -
ples แยกไฮโดรเจน , ผสม [ nife ]
ไฮโดรจีเนสเอนไซม์ ผู้เขียนจะแสดงให้เห็นถึงการปรากฏตัวของแตกต่างกัน desu ~

ofonihio ประชากร เพียงแต่การแสดงออกพิเศษของ [ nife ] ไฮโดรจีเนส
ยีนหนึ่งประชากร สรุปได้ว่า -
lation popu อาจจะดีกว่าเหมาะกับการเจริญเติบโตในไฮโดรเจนมากกว่า
อื่น ๆ desulfoovibrio ประชากรแนะนำช่องคิด -
tiation ของประชากรที่เกี่ยวข้องอย่างใกล้ชิดที่มีการแสดง
หน้าที่แตกต่างกันในชุมชน เป็นลำดับ
เพิ่มเติมสำหรับยีนทํางานอื่น ๆกลายเป็นใช้ได้ในอนาคต
เราเร็ว ๆนี้จะสามารถใช้กับดีเอ็นเอ 9 แถบบ่งชี้ / tgge
โครงสร้างชุมชน และฟังก์ชัน