. วัสดุและวิธีการ2.1 การไซต์อธิบายและสุ่มตัวอย่างของพืชในพื้นที่ชุ่มน้ำในการวิเคราะห์และการเพาะปลูกแร่ เหล็กคีร์รูนาเหมืองได้อยู่ ca 125 กม.จากขั้วโลกเหนือวงกลม (50′ 67 ° N, 10′ 20 ° E) ในสวีเดน และดำเนินการ โดยบริษัทเหมืองแร่ LKAB ไนโตรเจนจากวัตถุระเบิด undetonated ป้อนเข้าระบายน้ำเหมือง ซึ่งสูบจากเหมือง และผ่าน tailings impoundment และบ่อชี้แจง น้ำจะนำกลับมาใช้เป็นกระบวนการน้ำแร่ประมวลผลและ pelletization พืช และกระบวนการเกินน้ำจะปล่อยระบบ Rakkurijoki ซึ่งเชื่อมต่อกับแม่น้ำ Kalix ที่ไหลลงสู่ทะเลบอลติก ตาม LKAB ตรวจสอบโครงการในระหว่าง 10 ปี N เนื้อหาทั้งหมดในบ่อถูกครอบงำ ด้วยไนเตรต (18 – 28 มิลลิกรัม N L−1) และค่า pH เป็นด่างเล็กน้อย (7.5-8.7)เว็บไซต์การศึกษาเป็นบ่อกึ่งธรรมชาติขนาดเล็ก (< 1 ฮา) ปลายน้ำบ่อชี้แจงในพื้นที่ทำเหมืองและโซนเหนือ boreal พืช (Ahti และ Hämet-Ahti, 1968) ความยาวของรอบระยะเวลาพืชพรรณในภูมิภาคคือ ca 120 วัน (Raab และ Vedin, 1995) 5 พื้นที่ชุ่มน้ำพันธุ์ทั่วไปในพื้นที่ชุ่มน้ำที่ขั้วโลกเหนือย่อยได้ศึกษาทั้ง ในซิ และใน ระหว่างการเพาะปลูกในการเจริญเติบโตของหอการค้า (ดูด้านล่าง): aquatilis helophytes C. (น้ำ sedge), Carex แอฟริกัน (sedge ขวด), angustifolium Eriophorum (ทั่วไป cottongrass) และ fluviatile Equisetum (หางม้าน้ำ), และ fluitans D. มอน้ำ ระบบการตั้งชื่อพืชสคิวตาม Karlsson และ Agestam (2014) ทุกชนิดมีตัวอย่างที่สองโอกาส: 26 – 27 กรกฎาคมและ 4 กันยายน 2012 แสดงสูงสุดและสิ้นสุดของรอบระยะเวลาพืชพรรณ ตามลำดับ มีขุดราก specimens มีไพ่โพดำ และมอน้ำตัวอย่างด้วยมือ และวางไว้ในถังน้ำจากไซต์สุ่มตัวอย่าง ซึ่งมีตะกอนจำเป็นสำหรับการเพาะปลูกเพิ่มเติมได้มาจากอเมริกาสามฝั่ง inundated ของบ่อที่สุ่มตัวอย่างครั้งแรก ตะกอนและพืชสคิวถูกวางไว้ในถังพลาสติก และเพิ่มเว็บไซต์สุ่มตัวอย่างน้ำที่ระดับน้ำได้ ca 10 ซม.เหนือพื้นผิวของตะกอน น้ำจากไซต์มีตัวอย่างสำหรับใช้ในการเพาะปลูกในหอเจริญเติบโต วัสดุทั้งหมดถูกจัดส่ง โดยถนนที่อุณหภูมิ (10-23 ° C) และมาถึงภายใน 5 วันที่ห้องปฏิบัติการที่อำนวยความสะดวกมหาวิทยาลัยเกษตรศาสตร์ใน Uppsala อุณหภูมิอากาศในคีร์รูนาแตกต่างกันระหว่าง 3.9 และ 16.7 ° C มีค่าเฉลี่ย 10.1 องศาเซลเซียสในระหว่างรอบระยะเวลาศึกษาเมื่อมาถึงในห้องปฏิบัติการ specimens ห้าตัวแทนแต่ละชนิดพืชที่ใช้สำหรับวิเคราะห์และห้าสำหรับการเพาะปลูก เฉพาะสดใช้วัสดุ เช่น detritus ตายทิ้ง และออกรากตาย วัสดุโรงงานแรก rinsed อย่างละเอียดกับน้ำประปาตาม ด้วยน้ำ deionized น้ำถูกเอาออกจากวัสดุพืช โดยสั่นมันดั่งห้าครั้ง วิเคราะห์ พืชทั้งหมดถูกแบ่งออกเป็นเนื้อเยื่อด้านบน และด้านล่างพื้นดิน ยกเว้นมอที่มี rhizoids ในนกชนิดนี้ เราเพียงใช้การถ่ายภาพ หินราก การถ่ายภาพในกรณี D. fluitans ถูกตัดเป็น 0.5 – 1 ซม.ชิ้น ก่อนสกัดดีเอ็นเอ และ เป็น 5 cm ชิ้นสำหรับการ denitrification กิจกรรมประเมิน วัสดุโรงงาน สำหรับสกัดดีเอ็นเอ และ การวิเคราะห์เนื้อหา N ถูกเก็บไว้ที่ −18 ° C จนถึงการวิเคราะห์ Denitrification ถูกวัดโดยใช้รากสดหลังจากเก็บค้างคืนหากฝ่าฝืนที่ 2 องศาเซลเซียส2.2 การเพาะปลูกพืชในพื้นที่ชุ่มน้ำในหอเจริญเติบโตตะกอนมีการกระจายในภาชนะพลาสติก 14 L สำหรับปลูกพืชชนิดของหลอดเลือดที่ตัวอย่างในเดือนกรกฎาคม สำหรับพันธุ์ rooted, specimens ห้าแต่ละพันธุ์ที่ปลูกเป็น monocultures ในคอนเทนเนอร์ และเพิ่มน้ำจากไซต์สุ่มตัวอย่าง ระดับน้ำถูกเก็บไว้คงที่ที่ 12 – 14 เซนติเมตรเหนือพื้นผิวของตะกอน ยกเว้นสำหรับ E. angustifolium มี ca ได้ 5 – 7 ซม.ถึงสภาพธรรมชาติ มอน้ำถูกปลูกใน aquariums แก้ว 3 L 5 ที่เต็มไป ด้วยน้ำจากไซต์สุ่มตัวอย่าง สำหรับปรับระดับน้ำ น้ำจากไซต์สุ่มตัวอย่างถูกเก็บ แช่แข็ง (−18 ° C) ก่อนการใช้ประโยชน์ เรียนสามารถโต้ตอบระหว่างพืชดูดซับชนิด N ศักยภาพทางพันธุกรรมสำหรับ N ผ่าน denitrification เรายัง cultivated วัฒนธรรมผสม (n = 5) C. aquatilis และ fluitans D. มอสส์ในน้ำ มีไว้เป็นตัวอย่างที่ 5 สำหรับแต่ละชนิด เลือกชนิดเหล่านี้เนื่องจากทั้งสองมีทั่วไปในพื้นที่ชุ่มน้ำที่ขั้วโลกเหนือ ร่วมเกิดขึ้น และแสดงฟอร์มเติบโตแตกต่างกันกับ aquatilis C. ถูกรากกับถ่ายภาพที่เกิดขึ้นข้างต้นตารางน้ำและ D. fluitans อาศัยราก หรือไม่ใช่รากลอยถ่ายภาพในคอลัมน์น้ำ พืชได้ปลูกในช่วง 50 วันในหอเจริญเติบโตมีอุณหภูมิคง 10 ° C ความชื้น 70% และ ไฟ 24 ชม mimicking เงื่อนไขธรรมชาติทางตอนเหนือของอาร์กติกเซอร์เคิลในระหว่างฤดูร้อนในประเทศสวีเดน เมื่อสิ้นสุดระยะฟักตัว สปีชีส์พืชได้ตัวอย่างที่อธิบายข้างต้นสำหรับ N-เนื้อหาและนับของแบคทีเรีย และ denitrifying ชุมชนเชื่อมโยงกับราก2.3 การวิเคราะห์วัสดุโรงงานสำหรับการประเมินกำลังการดูดธาตุอาหาร Nการประเมินกำลังการดูดธาตุอาหาร N ของชีวมวลดังกล่าว และ belowground พันธุ์ตรวจสอบ พืชความใน situ และหลังจากการบ่มในห้องเติบโต 50 วันได้วิเคราะห์เนื้อหาทั้งหมด N (%ของเรื่องแห้ง) ก่อน N-วิเคราะห์ ตัวอย่างพืชได้ครั้งแรกอบที่ 50 องศาเซลเซียสแล้ว grinded และเจ่ากับ HNO3/H2O2 ในไมโครเวฟในภาชนะบรรจุปิดเทฟลอน พืชเนื้อเยื่อที่ N-เนื้อหาถูกวิเคราะห์ตามภาษาสวีเดนมาตรฐาน SS-ISO 13878 (SSI, 1999) โดยห้องปฏิบัติการยังสแกนดิเนเวีย AB, Luleå พืช aboveground N เนื้อหาที่สุ่มใน situ ที่สองถูกใช้เพื่อประเมินศักยภาพดูดธาตุอาหาร N ปี เนื่องจากการสุ่มตัวอย่างครั้งนี้สะท้อนให้เห็นถึงจุดสิ้นสุดของฤดูกาลเติบโต ค่าเหล่านี้ได้ถือเป็นการดูดธาตุอาหาร N ปี โดยชีวมวลยืน2.4. DNA สกัดและ PCR เชิงปริมาณเพื่อกำหนดปริมาณยีน abundances รากพันธุ์พืชสคิว และหน่อพืชมอส ดีเอ็นเอที่สกัดจากพืช 3 ชนิดแต่ละตัวอย่างในซิโอกาสสุ่มตัวอย่างที่สอง และหลัง จากปลูกในหอเจริญเติบโต ดีเอ็นเอที่สกัดจาก 0.14 0.19 g วัสดุโรงงานที่ใช้การ FastDNA ทางชีวการแพทย์ MP ®หมุนชุดดินตามคำแนะนำของผู้ผลิตเพื่อ ดีเอ็นเอแยกถูก quantified ใช้ fluorometer Qubit ® (ชีวิตเทคโนโลยี คอร์ปอเรชั่น)Quantitative real-time PCR (qPCR) based on the SYBR green detection was used to quantify the denitrification genes nirS and nirK, coding for the two nitrite reductases, and nosZI and nosZII, coding for the nitrous oxide reductase from clade I and II, respectively ( Hallin et al., 2009 and Jones et al., 2013). In addition, the bacterial 16S rRNA gene was quantified as a proxy for the total bacterial community ( Lopez-Gutierrez et al., 2004). The qPCR reactions were performed in duplicate in a total reaction volume of 20 μL using DyNAmo Flash SYBR Green qPCR kit (Thermo Fisher Scientific Inc.), 0.1% Bovine Serum Albumin, 0.5–1.0 μM of each primer and 15 ng DNA on the Biorad CFX Connect Real-Time System (Biorad). Primers and amplification protocols are listed in Table S1 (Supplementary Data). Standard curves for each assay were generated by serial dilutions of linearized plasmids with cloned fragments of 16S rRNA genes from Pseudomonas aeruginosa PAO1, nirS from Pseudomonas stutzeri (ATCC 14405), nirK from Sinorhizobium meliloti 1021, nosZI from Bradyrhizobium japonicum USDA 110, and nosZII from Gemmatimonas aurentica 27-T. Standard curves were linear (R2 = 0.999) in the range used and amplification efficiency was 97% for the 16S rRNA gene and varied between 73 and 85% for the functional genes. All samples were run on an agarose gel after the qPCR reaction to confirm amplicon size, and the melting curves for the amplified fragments from the samples were compared with those from the cloned fragments. Non-template controls resulted in negligible values. Potential inhibition of the PCR reactions was checked by amplifying a known amount of the pGEM-T plasmid (Promega) with the plasmid specific T7 and SP6 primers when added to the DNA extracts or non-template controls. No inhibition of the amplification reactions was detected with the amount of DNA used.2.5 การเกิด denitrification ราคาทำให้เกิดพื้นผิวเกิด denitrification ราคา สะท้อนเอนไซม์เปิด ใช้เทคนิคยับยั้งกับอะเซทิลีน โดย chloramphenicol (Pell et al., 1996) ได้กำหนดสำหรับพืชตัวอย่างครั้งที่สองใน situ มีวิเคราะห์ตัวอย่างห้าแต่ละพันธุ์ Slurries 5 กรัม ของรากพืช หรือ g 2 ของมอน้ำ หั่นเล็ก ๆ และเพิ่มน้ำ deionized กอซ 40 mL เพื่อนำก๊าซแน่น 100 มล Headspace ถูกเปลี่ยนเป็น 1 atm N2 ให้เงื่อนไข anoxic slurries นำ incubated ก่อนใน 30 นาทีที่ 15 ° C มีอาการกังวลต่อ (175 รอบต่อนาที) กับอะเซทิลีน (10 มล.) และการแก้ไขปัญหาพื้นผิวที่ประกอบด้วยส่วนผสมของ KNO3 และผู้บริจาคอิเล็กตรอนถูกฉีดเข้าไปในน้ำผ่าน septa ในความเข้มข้นสุดท้ายของกลูโคส 0.5 มม. acetate โซเดียม 1.5 mM, succinate โซเดียม 0.75 มม. และ 1.5 มม. KNO3 – N. Slurries ถูก incubated h 22 ที่ 15 ° C มีอาการกังวลต่อ (175 รอบต่อนาที) ตัวอย่างแก๊ส 0.5 mL ถูกถอนจาก headspace ที่ในช่วงเวลาปกติ และวิเคราะห์สำหรับ N2O บน chromatograph แก๊สที่พร้อมจับผิดจับอิเล็กตรอน (Clarus 500 GC เพอร์เอลเมอ CT สหรัฐอเมริกา) มีคำนวณอัตราการ denitrification จากการถดถอยเชิงเส้นของ N2O ที่ผลิตในระหว่างการบ่ม2.6. สถิติวิเคราะห์การวิเคราะห์ความแปรปรวน multifactorial ที่ดำเนินการเพื่อกำหนดแนวโน้มทั่วไปในเนื้อหาของ N ในชีวมวลด้านบน - และ belowground พันธุ์แตกต่างกันที่โอกาสสุ่มตัวอย่างแรก และสองใน situ เป็นในหอเจริญเติบโต ในการวิเคราะห์ จำลองสำหรับ angustifolium ตะวันออกที่สุดของห้องปฏิบัติการทดลองหนึ่งถูกคัดออกเนื่องจากมีการระบุไว้เป็น outlier การ สำหรับอัตราการ denitrification อาจเกิดขึ้นบนพื้นผิวของราก
การแปล กรุณารอสักครู่..