The structure of scorpion toxin II,

The structure of scorpion toxin II, isolated from the scorpion Androctonus Australis Hector, was determined by D.Housset, C.Habersetzer-Rochat, J.-P.Astier, and J.C.Fontecilla-Camps using X-ray diffraction.(1) According to the Structural Classification of Proteins databank (SCOP), the toxin is classified as a small protein, dominated by disulfide bridges, with a knottin fold, " a disulfide-bound fold and a beta-hairpin with two adjacent disulfides." (2) The primary structure of the molecule is made up of sixty-four residues.

author's structure determination According to the author's secondary structure determination, the molecule contains one alpha helix and three beta sheets. The alpha helix (magenta structure at right) begins at asn19 and ends at lys28. The first beta sheet (yellow structure at right)starts at the second residue, lysine, and stops at the fourth residue, glycine. Residues glu32 to gln37 make up the second beta sheet. The third, and longest, sheet is composed of amino acids ala45 through leu51.
DSSP structure determination Kabsch and Sander's DSSP algorithm identified secondary structure not reported by the authors. In addition to the alpha helix and three beta sheets above, the DSSP calculation found six beta sheets and ten turns. All of the six are made up of only a single amino acid, and so would probably not be considered true beta sheets. These six sheets were made up of the following residues; lys2, thr13, ser40, gly43, leu51, and thr57. Ten turns were reported by the algorithm at asp9-asn11, gly17, leu29-lys30, glu32, trp38-ala39, pro41-tyr42, asn44, lys50, asp53-val55, and pro60-gly61.
The Androctonus genus of scorpion produces a very toxic venom that may induce "malignant hypothermia, myocarditis, pulmonary edema," or even death. All of the "important" residues appear to be grouped on one side of the toxin, indicating that "this solvent-exposed hydrophobic surface" is the point of interaction and that "adjacent areas modulate the specificity of the interaction." The toxicity, therefore, lies in the residues that make up this conserved hydrophobic surface as well as the C- and N-terminals.(3) According to an article in the European Journal of Biochemistry in 1989, tryptophan 38 in scorpion toxin II was replaced with nitrophenylsulfenyl chloride, resulting in a less active substance.(4) This would seem to support that the conserved surface controls the reactivity of the toxin.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

โครงสร้างพิษแมงป่อง II แยกต่างหากจากแมงป่อง Androctonus ออสเตรลินาง ถูกกำหนด โดย J. D.Housset, C.Habersetzer-โฮเต็ลโรชาท -P.Astier และ J.C.Fontecilla-ค่ายเอ็กซ์เรย์การเลี้ยวเบน(1) ตามที่จะ databank ประเภทโครงสร้างโปรตีน (SCOP), สารพิษถูกจัดประเภทเป็นโปรตีนขนาดเล็ก ครอบงำ โดยสะพานไดซัลไฟด์ กับพับ knottin "พับผูกไดซัลไฟด์และเบต้ากิ๊บกับ disulfides สองอยู่ติดกัน" (2)โครงสร้างหลักของโมเลกุลถูกสร้างขึ้นจากตกหกสี่

การกำหนดโครงสร้างของผู้ตามผู้กำหนดโครงสร้างรอง โมเลกุลประกอบด้วยหนึ่งเกลียวแอลฟาและเบต้า 3 แผ่น เกลียวอัลฟา (โครงสร้างม่วงขวา) เริ่มต้นที่ asn19 และสิ้นสุดที่ lys28 เบต้าแรกแผ่น (โครงสร้างสีเหลืองขวา) เริ่มต้นที่สองตกค้าง แอล-ไลซีน และหยุดที่ตกค้างสี่ glycine Glu32 ตกไป gln37 แต่งแผ่นเบต้าสอง แผ่นที่สาม และยาวนานที่ สุด ประกอบด้วยกรดอะมิโน ala45 ผ่าน leu51
กำหนดโครงสร้าง DSSP Kabsch และอัลกอริทึม DSSP ของแซนเดอร์ระบุโครงสร้างรองที่ไม่มีรายงาน โดยผู้เขียน เกลียวแอลฟาและแผ่นเบต้าสามข้างต้น การคำนวณ DSSP พบเบต้า 6 แผ่นและเปิดสิบ 6 ทั้งหมดมีเพียงตัวเดียวกรดอะมิโน และดังนั้น อาจจะไม่พิจารณาแผ่นเบต้าจริง แผ่นเหล่านี้หกทำขึ้นตกต่อไปนี้ lys2, thr13, ser40, gly43, leu51 และ thr57 เปิดสิบได้รายงาน โดยอัลกอริทึมที่ asp9-asn11, gly17 leu29-lys30, glu32, trp38 ala39, pro41 tyr42, asn44, lys50, asp53 val55 ก pro60 gly61
Androctonus ตระกูลนี้ของแมงป่องทำให้เกิดพิษมากเป็นพิษที่อาจก่อให้เกิด "ภูต hypothermia, myocarditis ได้แก่ระบบทางเดินหายใจ หรือแม้แต่ความตาย ของตกค้าง "สำคัญ" จะปรากฏบนด้านหนึ่งของสารพิษ ระบุว่า "นี้สัมผัสตัวทำละลาย hydrophobic พื้นผิว" จุดของการโต้ตอบ และว่า "พื้นที่ติด modulate specificity การโต้ตอบ" ความเป็นพิษ ดังนั้น อยู่ในตกค้างที่ทำขึ้นนี้อยู่ผิว hydrophobic เป็น C - และ N-มินัล(3) ตามที่จะเป็นบทความยุโรปสมุดของชีวเคมีใน 1989 ทริปโตเฟน 38 ในแมงป่องพิษ II ถูกแทนที่ ด้วย nitrophenylsulfenyl คลอไรด์ ผลของสารที่ใช้งานน้อยลง(4) นี้จะดูเหมือนจะสนับสนุนให้นำพื้นผิวควบคุมการเกิดปฏิกิริยาของสารพิษ

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

โครงสร้างของแมงป่องพิษครั้งที่สองแยกออกจากแมงป่อง Androctonus Australis เฮคเตอร์ที่ถูกกำหนดโดย D.Housset, C.Habersetzer-Rochat เจ-P.Astier และ JCFontecilla ค่ายโดยใช้ X-ray diffraction (1). ตามที่ โครงสร้างการจัดหมวดหมู่ของโปรตีน Databank (SCOP), สารพิษจัดเป็นโปรตีนขนาดเล็กที่โดดเด่นด้วยซัลไฟด์สะพานกับพับ knottin "เท่าซัลไฟด์ จำกัด และเบต้าปิ่นกับสอง disulfides ติด". (2) โครงสร้างหลักของโมเลกุลถูกสร้างขึ้นจากหกสิบสี่ตกค้างโครงสร้างการตัดสินใจของผู้เขียนตามที่กำหนดโครงสร้างของผู้เขียนรองโมเลกุลมีเกลียวอัลฟาและเบต้าแผ่นสาม เกลียวอัลฟา (โครงสร้างสีแดงที่ด้านขวา) เริ่มต้นที่ asn19 และสิ้นสุดที่ lys28 เบต้าแผ่นแรก (โครงสร้างสีเหลืองที่ด้านขวา) เริ่มต้นที่สองตกค้างไลซีนและหยุดที่สี่ตกค้างไกลซีน ตกค้าง glu32 เพื่อ gln37 ทำขึ้นเบต้าแผ่นที่สอง ที่สามและยาวที่สุดแผ่นประกอบด้วยกรดอะมิโน ala45 ผ่าน leu51 กำหนดโครงสร้าง DSSP Kabsch และซานเดอร์ของอัลกอริทึม DSSP ระบุโครงสร้างทุติยภูมิไม่ได้รายงานโดยผู้เขียน นอกจากเกลียวอัลฟาและเบต้าแผ่นสามข้างต้นในการคำนวณ DSSP พบแผ่นเบต้าหกสิบรอบ ทั้งหมดหกที่สร้างขึ้นจากกรดอะมิโนเพียงคนเดียวและอื่น ๆ อาจจะไม่ได้รับการพิจารณาแผ่นเบต้าจริง เหล่านี้หกแผ่นที่ถูกสร้างขึ้นจากสารตกค้างดังต่อไปนี้ lys2, thr13, ser40, gly43, leu51 และ thr57 สิบรอบได้รับรายงานจากอัลกอริทึมที่ asp9-asn11, gly17, leu29-lys30, glu32, trp38-ala39, pro41-tyr42, asn44, lys50, asp53-val55 และ PRO60-gly61 ประเภท Androctonus ของแมงป่องผลิตที่เป็นพิษมาก พิษที่อาจทำให้เกิดการ "อุณหภูมิร้าย myocarditis, อาการบวมน้ำที่ปอด" หรือแม้แต่ความตาย ทั้งหมดของ "ที่สำคัญ" สารตกค้างปรากฏที่จะจัดกลุ่มบนด้านหนึ่งของสารพิษที่ระบุว่า "นี้พื้นผิวที่ไม่ชอบน้ำเป็นตัวทำละลายสัมผัส" เป็นจุดของการมีปฏิสัมพันธ์และ "พื้นที่ใกล้เคียงปรับความจำเพาะของการทำงานร่วมกัน". ความเป็นพิษจึงอยู่ในที่เกิดเหตุที่ทำขึ้นบนพื้นผิวที่ไม่ชอบน้ำป่าสงวนนี้รวมทั้งซีและ N-ขั้ว (3). อ้างอิงจากบทความในวารสารของชีวเคมีในยุโรปในปี 1989, โพรไบโอ 38 ในพิษแมงป่องเป็นครั้งที่สอง แทนที่ด้วย nitrophenylsulfenyl คลอไรด์ที่เกิดขึ้นในสารที่ใช้งานน้อยลง (4). นี้จะดูเหมือนจะสนับสนุนว่าพื้นผิวอนุรักษ์ควบคุมการเกิดปฏิกิริยาของสารพิษ

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

โครงสร้างของแมงป่องพิษ 2 แยกจากแมงป่อง androctonus Australis เฮคเตอร์ถูกกำหนดโดย housset c.habersetzer-rochat J , -p.astier และ j.c.fontecilla-camps โดยใช้การเลี้ยวเบนของรังสีเอ็กซ์ ( 1 ) จําแนกตามโครงสร้างของโปรตีน databank ( สก็อป ) , พิษจัดเป็นโปรตีนขนาดเล็กที่โดดเด่นด้วยไดสะพานด้วย knottin พับ" ไดถูกพับและกิ๊บเบต้ากับสอง ไดซัลไฟต์ติดกัน " ( 2 ) โครงสร้างหลักของโมเลกุลที่ถูกสร้างขึ้นจากหกตกค้าง

เขียนคือการหาโครงสร้างตามที่ผู้เขียนของโครงสร้างทุติยภูมิความมุ่งมั่น โมเลกุลประกอบด้วยเกลียวอัลฟาและเบต้า 3 แผ่น อัลฟ่าเฮลิกซ์ ( บานเย็นโครงสร้างที่ถูกต้อง ) เริ่มต้นที่ asn19 และสิ้นสุดที่ lys28 .แผ่นเบต้าแรก ( เหลืองโครงสร้างที่ถูกต้อง ) เริ่มที่ 2 ตกค้าง , ไลซีน , และหยุดที่ตกค้าง 4 , ไกลโคเจน ตกค้าง glu32 เพื่อ gln37 แต่งหน้าแผ่นเบต้า สาม และที่แผ่นจะประกอบด้วยกรดอะมิโน ala45 ผ่าน leu51 .
dssp และการหาโครงสร้าง kabsch แซนเดอร์เป็น dssp ขั้นตอนวิธีการระบุโครงสร้างทุติยภูมิไม่ได้รายงานโดยผู้เขียนนอกจากส่วนที่เป็นเกลียวอัลฟาและเบต้า 3 แผ่นด้านบน dssp การคำนวณพบ 6 เบต้าแผ่นสิบรอบ ทั้งหมดของหกถูกสร้างขึ้นเพียงครั้งเดียว กรดอะมิโน และดังนั้นจะไม่ถือว่าเป็นแผ่น Beta จริง เหล่านี้หกแผ่นถูกสร้างขึ้นของสารพิษตกค้าง ดังนี้ lys2 thr13 ser40 gly43 , , , , leu51 และ thr57 . สิบเปลี่ยนรายงานโดยขั้นตอนวิธีที่ asp9-asn11 gly17 , ,leu29-lys30 glu32 trp38-ala39 pro41-tyr42 , , , , lys50 asn44 , , asp53-val55 และ pro60-gly61 .
สกุล androctonus แมงป่องผลิตพิษเป็นพิษมากที่อาจก่อให้เกิด " มะเร็ง hypothermia อายุปอดบวม หรือแม้แต่ความตาย ทั้งหมดของ " สำคัญ " ที่ตกค้างอยู่ตามข้างหนึ่งของสารพิษที่ระบุว่า " นี่เป็นตัวทำละลาย ) สัมผัสพื้นผิว " เป็นจุดของการปฏิสัมพันธ์และ " พื้นที่ใกล้เคียงปรับความจำเพาะของปฏิสัมพันธ์ " ความเป็นพิษ ดังนั้นจึงอยู่ในที่ตกค้างที่ทำขึ้นนี้ ) อนุรักษ์พื้นผิวรวมทั้ง C - และ n-terminals ( 3 ) ตามบทความในวารสารยุโรปชีวเคมีใน 1989ทริป 38 ในแมงป่องพิษ 2 ถูกแทนที่ด้วย nitrophenylsulfenyl คลอไรด์ ซึ่งเป็นสารใช้งานน้อย ( 4 ) นี้จะดูเหมือนที่สนับสนุนการอนุรักษ์พื้นผิวการควบคุมปฏิกิริยาของสารพิษ