Freshwater fishes in India are poor

Freshwater fishes in India are poorly known and plagued by many unresolved cryptic species complexes that masks some latent and endemic species. Limitations in traditional taxonomy have resulted in this crypticism. Hence, molecular approaches like DNA barcoding, are needed to diagnose these latent species. We have analyzed 1383 barcode sequences of 175 Indian freshwater fish species available in the databases, of which 172 sequences of 70 species were generated. The congeneric and conspecific genetic divergences were calculated using Kimura's 2 parameter distance model followed by the construction of a Neighbor Joining tree using the MEGA 5.1. DNA barcoding principle at its first hand approach, led to the straightforward identification of 82% of the studied species with 2.9% (S.E = 0.2) divergence between the nearest congeners. However, after validating some cases of synonymy and mislabeled sequences, 5% more species were found to be valid. Sequences submitted to the database under different names were found to represent single species. On the other hand, some sequences of the species like Barilius barna, Barilius bendelisis and Labeo bata were submitted to the database under a single name but were found to represent either some unexplored species or latent species. Overall, 87% of the available Indian freshwater fish barcodes were diagnosed as true species in parity with the existing checklist and can act as reference barcode for the particular taxa. For the remaining 13% (21 species) the correct species name was difficult to assign as they depicted some erroneous identification and cryptic species complex. Thus, these barcodes will need further assay and inclusion of barcodes of more specimens from same and sister species.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

ปลาน้ำจืดในประเทศอินเดียเป็นที่รู้จักกันดีและเต็มไปด้วยความลับหลายชนิดได้รับการแก้ไขที่มาสก์เชิงซ้อนบางชนิดแฝงและโรคประจำถิ่น ข้อ จำกัด ในอนุกรมวิธานแบบดั้งเดิมที่มีผลใน crypticism นี้ ดังนั้นวิธีการเช่นโมเลกุลดีเอ็นเอบาร์โค้ดมีความจำเป็นที่จะวินิจฉัยชนิดแฝงเหล่านี้เราได้วิเคราะห์ 1383 ลำดับบาร์โค้ดของอินเดีย 175 ชนิดปลาน้ำจืดที่มีอยู่ในฐานข้อมูลของที่ 172 ลำดับ 70 ชนิดถูกสร้างขึ้น การแตกต่างทางพันธุกรรม congeneric และชนิดเดียวกันที่ถูกคำนวณโดยใช้แบบจำลองทางคิมูระ 2 พารามิเตอร์ตามด้วยการก่อสร้างของต้นไม้เพื่อนบ้านเข้าร่วมโดยใช้ 5.1 ล้าน หลักการดีเอ็นเอบาร์โค้ดที่วิธีการที่มือแรกนำไปสู่​​การระบุตัวตนตรงไปตรงมาจาก 82% ของสายพันธุ์ที่เรียนกับ 2.9% (se = 0.2) ความแตกต่างระหว่าง congeners ที่ใกล้ที่สุด แต่หลังจากการตรวจสอบบางกรณีของคำพ้องและลำดับเรียกผิดชนิด 5% ขึ้นพบว่าถูกต้อง ลำดับส่งไปยังฐานข้อมูลภายใต้ชื่อที่แตกต่างกันพบว่าเป็นตัวแทนของสายพันธุ์เดียว ในทางกลับกันลำดับของสายพันธุ์เช่น Barna barilius, barilius bendelisis และ labeo Bata บางคนถูกส่งไปยังฐานข้อมูลภายใต้ชื่อเดียว แต่พบว่าเป็นตัวแทนของทั้งบางชนิดหรือสายพันธุ์ที่ยังมิได้สำรวจแฝง โดยรวม87% ของที่มีบาร์โค้ดอินเดียปลาน้ำจืดได้รับการวินิจฉัยว่าเ​​ป็นสายพันธุ์ที่แท้จริงในความเท่าเทียมกันกับการตรวจสอบที่มีอยู่และสามารถทำหน้าที่เป็นข้อมูลอ้างอิงสำหรับบาร์โค้ดแท็กซ่าโดยเฉพาะอย่างยิ่ง ที่เหลือ 13% (21 สายพันธุ์) ชื่อสปีชีส์ที่ถูกต้องเป็นเรื่องยากที่จะกำหนดตามที่พวกเขาแสดงให้เห็นบางตัวที่ผิดพลาดและความซับซ้อนของสายพันธุ์ที่คลุมเครือ จึงบาร์โค้ดเหล่านี้จะต้องทดสอบต่อไปและรวมของบาร์โค้ดตัวอย่างเพิ่มเติมจากสายพันธุ์เดียวกันและน้องสาว

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

ปลาน้ำจืดในประเทศอินเดียเป็นที่รู้จัก และเลือก โดยหลายพันธุ์ยังระทมคอมเพล็กซ์ที่มาสก์บางชนิดแฝงอยู่ และตรวจงาน ข้อจำกัดในระบบดั้งเดิมทำให้ crypticism นี้ ดังนั้น วิธีโมเลกุลเช่นซอฟต์แวร์ดีเอ็นเอ จะต้องวินิจฉัยชนิดเหล่านี้แฝงอยู่ เราได้วิเคราะห์ลำดับโค้ด 1383 175 อินเดียปลาชนิดในฐานข้อมูล ซึ่งมีสร้างลำดับ 172 70 พันธุ์ Divergences พันธุ congeneric และ conspecific มีคำนวณโดยใช้ของคิมุระโย 2 พารามิเตอร์จากแบบจำลองตาม ด้วยการก่อสร้างของต้นไม้เพื่อนบ้านรวมที่ใช้ 5.1 ร็อค หลักโค้ดีเอ็นเอที่วิธีของมือแรก นำไปสู่การระบุตรง 82% ของสปีชีส์ studied 2.9% (S.E = 0.2) divergence ระหว่าง congeners ที่ใกล้ที่สุด อย่างไรก็ตาม หลังจากการตรวจบางกรณีของ synonymy และ mislabeled ลำดับ ชนิด 5% พบถูกต้อง พบลำดับที่ส่งไปยังฐานข้อมูลภายใต้ชื่อที่แตกต่างกันถึงชนิดเดียว ในทางตรงข้าม ลำดับบางพันธุ์เช่น Barilius barna, Barilius bendelisis และปลา bata ถูกส่งไปยังฐานข้อมูลภายใต้ชื่อใดชื่อหนึ่ง แต่พบถึงบาง unexplored พันธุ์หรือสายพันธุ์ที่แฝงอยู่ โดยรวม 87% ของบาร์โค้ดมีอินเดียปลาถูกวินิจฉัยว่าเป็นพันธุ์แท้ในพาริตี้กับรายการตรวจสอบที่มีอยู่ และสามารถทำหน้าที่เป็นบาร์โค้ดอ้างอิงสำหรับ taxa เฉพาะ ชื่อถูกต้องได้ไม่ยากที่จะกำหนดให้แสดงรหัสข้อผิดพลาดและชนิดซับซ้อนคลุมเครือบางเหลือ 13% (21 พันธุ์) ดังนั้น บาร์โค้ดเหล่านี้จะต้องเพิ่มเติมวิเคราะห์และรวมบาร์โค้ดไว้เป็นตัวอย่างเพิ่มเติมจากสายพันธุ์เดียวกัน และ sister

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

ปลาน้ำจืดในประเทศอินเดียจะได้ไม่ดีนักที่รู้จักและสืบเนื่องจากคอมเพล็กซ์สายพันธุ์ลึกลับจำนวนมากยังไม่ได้รับคำตอบว่าการปิด ภาพ สายพันธุ์และแพร่ระบาดแฝงตัวอยู่บางส่วน ข้อจำกัดใน Taxonomy แบบดั้งเดิมมีผลทำให้ใน crypticism นี้ ดังนั้นแนวทางโมเลกุลดีเอ็นเอเหมือน barcoding จำเป็นต้องมีเพื่อการวินิจฉัยสายพันธุ์ ภายใน เหล่านี้เราได้วิเคราะห์ 1383 ซีเควนซ์ของบาร์โค้ดของ 175 สายพันธุ์ปลาน้ำจืดตามแบบอินเดียจัดให้บริการในฐานข้อมูลที่ 172 ลำดับของ 70 สายพันธุ์ถูกสร้างขึ้น ผลงานทางพันธุกรรม conspecific และ congeneric ที่มีการคำนวณโดยใช้ของในระยะทาง 2 รุ่นพารามิเตอร์ตามด้วยการก่อสร้างของทรีเข้าร่วมกับเพื่อนบ้านที่ใช้ขนาดใหญ่ 5.1 ได้ วิธีการหลักการ barcoding ดีเอ็นเออยู่ในมือเป็นครั้งแรกนำไปสู่การระบุตัวตนของ 82% ของสายพันธุ์ศึกษาด้วย 2.9% ( S . E = 0.2 )แตกออกไประหว่าง congeners ที่อยู่ใกล้ที่สุดเพื่อมาถึงได้ อย่างไรก็ตามหลังจากการตรวจสอบบางกรณีของซีเควนซ์ของการซ้อนคำและ mislabeled สายพันธุ์มากกว่า 5% ก็พบว่ามีที่ถูกต้อง ซีเควนซ์ของส่งไปที่ฐานข้อมูลให้ ภายใต้ ชื่อแตกต่างกันก็พบว่าเป็นสายพันธุ์เดียว ในอีกด้านหนึ่งได้ซีเควนซ์ของบางส่วนของสายพันธุ์ที่เหมือน barilius barna bendelisis barilius labeo บาจาและได้ส่งไปที่ฐานข้อมูลให้ ภายใต้ ชื่อคนเดียวแต่ก็พบว่าเป็นทั้งสายพันธุ์สำรวจหรือบางสายพันธุ์แฝงตัวอยู่ โดยรวมแล้ว87% ของบาร์โค้ตปลาน้ำจืดตามแบบอินเดียจัดให้บริการที่ได้วินิจฉัยว่าเป็นสายพันธุ์ความจริงในรายการตรวจสอบสำหรับพาริตี้ด้วยที่มีอยู่และสามารถทำหน้าที่เป็นบาร์โค้ดการอ้างอิงสำหรับ taxa เฉพาะที่ สำหรับส่วนที่เหลือ 13% ( 21 สายพันธุ์)ชื่อสายพันธุ์ที่ถูกต้องเป็นเรื่องยากในการกำหนดเป็นพวกเขาวาดคอมเพล็กซ์สายพันธุ์ลึกลับและการระบุตัวตนผิดพลาดบางอย่าง ดังนั้นบาร์โค้ตเหล่านี้จะต้องสอบเพิ่มเติมและการหลอมรวมของบาร์โค้ตของตัวอย่างมากขึ้นจากสายพันธุ์เดียวกันและในเครือ