Once a mapping population has been

Once a mapping population has been created, the next step in the genetic mapping process is
to genotype individual F2 progeny using genetic markers distributed throughout the genome.
For our mapping experiments we made use of insertion/deletion (INDEL) polymorphisms
between the Col and Ler ecotypes that had been previously characterized (Salathia et al.,
2007). The 22 INDEL markers that we chose are spaced across all five chromosomes so that
a given gene is no more than ca. 20 centiMorgans from the nearest marker (Figure 2b and
Table S1). We designed PCR primers for each marker that are able to amplify products from
both Landsberg and Columbia templates (Figure 2c). Differences in the sizes of the PCR
products amplified from the two ecotypes allow one to determine if plants are homozygous
Col, homozygous Ler, or heterozygous at each of the marker loci (Figure 2d).

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

เมื่อมีการสร้างการแม็ปประชากร ขั้นตอนถัดไปในกระบวนการแผนที่ทางพันธุกรรมคือกับลักษณะทางพันธุกรรมแต่ละ F2 ลูกหลานโดยใช้เครื่องหมายพันธุกระจายทั่วจีโนมสำหรับใช้ทดลองการแม็ปของเราเราทำ polymorphisms แทรก/ลบ (INDEL)ระหว่างคอลัมน์และเลอ ecotypes ที่ได้รับก่อนหน้านี้ลักษณะ (Salathia et al.,2007) เครื่องหมาย 22 INDEL ที่เราเลือกอยู่ในตำแหน่งระหว่าง chromosomes ห้าทั้งหมดนั้นยีนกำหนดคือไม่เกินกว่า ca. 20 centiMorgans จากเครื่องที่ใกล้ที่สุด (รูปที่ 2b และตาราง S1) เราออกแบบไพรเมอร์ PCR สำหรับแต่ละเครื่องหมายที่สามารถขยายผลิตภัณฑ์จากLandsberg และโคลัมเบียเท็มเพล (รูป 2c) ความแตกต่างในขนาดของ PCRผลิตภัณฑ์ที่ขยายจาก ecotypes สองให้หนึ่งเพื่อกำหนดว่า พืชมี homozygousคอลัมน์ เลอ homozygous หรือ heterozygous ในแต่ละเครื่องหมาย loci (รูปที่ 2d)

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

เมื่อแผนที่ประชากรได้ถูกสร้างขึ้น ขั้นตอนถัดไปในกระบวนการทำแผนที่พันธุกรรมเป็นไทป์ F2
กับบุคคลโดยใช้เครื่องหมายพันธุกรรมลูกหลานกระจายทั่วจีโนม .
สำหรับการทำแผนที่การทดลองเราใช้แทรก / ลบ ( INDEL ) ล
ระหว่างคอลัมน์ : ชุดและที่ได้รับก่อนหน้านี้ลักษณะ ( salathia et al .
, 2550 )22 INDEL เครื่องหมายที่เราเลือกมีระยะห่างทั้งห้าที่ได้รับยีนโครโมโซม
ไม่เกินประมาณ 20 centimorgans จากจุดที่ใกล้ที่สุด ( รูปที่ 2B และ
ตาราง S1 ) เราออกแบบ PCR ไพรเมอร์สำหรับแต่ละเครื่องหมายที่สามารถขยายผลิตภัณฑ์จาก
ทั้งสองและแม่แบบที่โคลัมเบีย ( รูปที่ 2 ) ความแตกต่างในขนาดของ PCR
ผลิตภัณฑ์ขยายจากสองชุดให้หนึ่งเพื่อตรวจสอบว่าพืชเป็นโฮโมไซกัสยีนคอลัมน์ :
, , หรือการสร้างในแต่ละเครื่องหมายตามลำดับ ( รูปที่ 2 )