It has been proposed that BACE1 and

It has been proposed that BACE1 and aspartic proteases catalyze peptide bond hydrolysis through an acid-base catalysis mechanism mediated by Wat1 and the Asp pair as follows. (i) After substrate binding, the free Asp pair activates Wat1 by forming a hydrogen bond with it. (ii) Next, the activated Wat1, it has been proposed, nucleophilically attacks the scissile-bond carbonyl. The resulting geminal diol intermediate is stabilized by hydrogen bonds with the carboxyl group of Asp.Finally,decomposition of the scissile C-N bond is accompanied by the transfer of a proton from Asp to the leaving amino group (see scheme 1 in reference 32). In addition, kinetics studies suggested that Wat1 competitively inhibits the binding of inhibitor to the activesite(21).On the otherhand,the second conserved water molecule (Wat2) is involved in the hydrogen bond, with a conserved Tyr residue in the flap. Wat2 also participates in a conserved hydrogen-bonding network Wat2-Ser35-Asp32- Wat1-Asp228 and was proposed to assist in the catalytic reaction (2, 8). Thus, BACE1 activity is directly affected by the behaviors of these water molecules.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

มันได้รับการเสนอชื่อว่า BACE1 และ aspartic proteases สถาบันเพปไทด์ไฮโตรไลซ์ผ่านกลไกการเร่งปฏิกิริยากรด-ฐาน mediated โดย Wat1 คู่ Asp ดัง (i) หลังจากผูกพื้นผิว ฟรี Asp คู่เรียก Wat1 โดยเป็นพันธะไฮโดรเจนกับ (ii) ถัดไป Wat1 เปิด จะได้รับการเสนอชื่อ nucleophilically โจมตี scissile-ตราสารหนี้ carbonyl เสถียร geminal diol ผลกลาง โดยพันธบัตรไฮโดรเจนกับกลุ่ม carboxyl ของ Asp.Finally,decomposition ของ scissile C N พันธะตามมา ด้วยการโอนย้ายของโปรตอนที่จาก Asp เพื่อจะออกจากอะมิโนกลุ่ม (ดูโครงร่าง 1 ใน 32 อ้างอิง) นอกจากนี้ การศึกษาจลนพลศาสตร์แนะนำว่า Wat1 ยับยั้งการรวมผลการ activesite(21) สามารถแข่งขันได้ บน otherhand สองน้ำนำโมเลกุล (Wat2) เกิดในพันธะไฮโดรเจน มีสารตกค้าง Tyr นำใน flap Wat2 ยังมีส่วนร่วมในเครือข่ายไฮโดรเจนยึดนำ Wat2-Ser35-Asp32-Wat1-Asp228 และได้เสนอให้ความช่วยเหลือในการปฏิกิริยาตัวเร่งปฏิกิริยาที่ (2, 8) ดัง กิจกรรม BACE1 ได้โดยตรงรับผลกระทบจากพฤติกรรมของโมเลกุลน้ำเหล่านี้

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

มันได้รับการเสนอว่า BACE1 และโปรตีเอส aspartic กระตุ้นการย่อยสลายพันธะเปปไทด์ผ่านกลไกการเร่งปฏิกิริยาของกรดเบสไกล่เกลี่ยโดย Wat1 และคู่งูเห่าดังต่อไปนี้ (i) หลังจากที่พื้นผิวมีผลผูกพันคู่ฟรีงูเห่า Wat1 เปิดใช้งานโดยการสร้างพันธะไฮโดรเจนกับมัน (ii) ถัดไป Wat1 เปิดใช้งานจะได้รับการเสนอ nucleophilically โจมตีคาร์บอนิล scissile พันธบัตร ผล diol geminal กลางจะมีความเสถียรด้วยพันธะไฮโดรเจนกับกลุ่ม carboxyl ของ Asp.Fi​​nally, การสลายตัวของ scissile พันธบัตร CN จะมาพร้อมกับการโอนโปรตอนจากงูเห่าในกลุ่มอะมิโนออก (ดูโครงการที่ 1 ในการอ้างอิง 32) นอกจากนี้การศึกษาจลนศาสตร์ชี้ให้เห็นว่าการแข่งขัน Wat1 ยับยั้งผูกพันของการยับยั้ง activesite (21) ในทาง otherhand, โมเลกุลของน้ำป่าสงวนที่สอง (Wat2) มีส่วนร่วมในพันธะไฮโดรเจนกับป่าสงวนตกค้างในเทอร์ AP ชั้น Wat2 ยังมีส่วนร่วมในเครือข่ายพันธะไฮโดรเจนอนุรักษ์ Wat2-Ser35-Asp32- Wat1-Asp228 และได้รับการเสนอให้ความช่วยเหลือในการเกิดปฏิกิริยาตัวเร่งปฏิกิริยา (2, 8) ดังนั้นกิจกรรม BACE1 ได้รับผลกระทบโดยตรงจากพฤติกรรมเหล่านี้โมเลกุลของน้ำ

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

ก็มีการเสนอว่า เพื่อเร่งการย่อยสลาย และเสีย bace1 พันธบัตรเปปไทด์ผ่านแจ้นกลไก ) โดย wat1 และคู่ของ ASP ได้ดังนี้ ( ผม ) หลังจากการจับคู่พื้นผิว , ASP ฟรีใช้ wat1 โดยการสร้างพันธะไฮโดรเจนกับมัน ( 2 ) ถัดไป ใช้งาน wat1 มันได้รับการเสนอ nucleophilically โจมตีคาร์บอนิลพันธบัตรซึ่งแยกออกหรือแบ่งออกได้ .ผล geminal ไดออลกลางมีเสถียรภาพโดยพันธะไฮโดรเจนกับหมู่คาร์บอกซิล ของ ASP . ในที่สุดการสลายตัวของพันธบัตร c-n ซึ่งแยกออกหรือแบ่งออกได้มาพร้อมกับการถ่ายโอนโปรตอนจาก ASP เพื่อออกจากหมู่อะมิโน ( เห็นโครงการ 1 ในการอ้างอิง 32 ) นอกจากนี้การศึกษาจลนศาสตร์ พบว่าสามารถยับยั้งการเกาะ wat1 ยับยั้งการ activesite ( 21 ) ส่วน2 ปี โมเลกุลของน้ำ ( wat2 ) มีส่วนร่วมในการเกิดพันธะไฮโดรเจนกับน้ำ tyr สารตกค้างในfl AP wat2 ยังได้มีส่วนร่วมในการอนุรักษ์และ wat2-ser35-asp32 - wat1-asp228 พันธะไฮโดรเจนเครือข่ายเสนอ เพื่อช่วยในการเร่งปฏิกิริยา ( 2 , 8 ) ดังนั้น กิจกรรม bace1 ได้รับผลกระทบโดยตรง จากพฤติกรรมของโมเลกุลของน้ำเหล่านี้