MicroRNAs play an important role in

MicroRNAs play an important role in post-transcriptional gene regulation. Experimental approaches to identify microRNAs are expensive and time-consuming. Computational approaches have proven to be useful for identifying microRNA candidates. Most approaches rely on features extracted from miroRNA precursors (pre-microRNA) and their secondary structure. Selecting the appropriate set of features plays a critical role in improving the prediction accuracy of pre-microRNA candidates. This work aims to investigate the triplet elements encoding scheme and to identify essential features needed for the correct classification of pre-microRNAs. To achieve these goals, an extension of the triplet elements encoding scheme is introduced. Features extracted using the extended scheme were combined with global features introduced in the literature, and fuzzy decision tree (FDT) is used as a classification and a feature selection tool. Unlike previous machine-learning-based approaches, FDT produces a human comprehensible classification model. The interpretability of the classification model provides a means to identify the essential features needed to recognize microRNA candidates and offers a better understanding of this problem. Our results indicate that the triplet elements scheme is not superior to any of its proposed extensions. Further analysis revealed that including the features extracted using triplet elements scheme does not add any value to this classification problem but rather introduces some noisy features, and comparable classification results can be achieved by using only the six global features identified by FDT.

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

microRNAs มีบทบาทสำคัญในการควบคุมของยีนหลังการถอดรหัส วิธีการทดลองเพื่อแจ้ง microRNAs มีราคาแพงและใช้เวลานาน วิธีการคำนวณได้พิสูจน์แล้วว่าเป็นประโยชน์สำหรับการระบุผู้สมัคร microRNA วิธีการส่วนใหญ่พึ่งพาคุณสมบัติที่สกัดจากสารตั้งต้น miroRNA (ก่อน microRNA) และโครงสร้างทุติยภูมิของพวกเขา เลือกชุดที่เหมาะสมของคุณสมบัติที่มีบทบาทสำคัญในการปรับปรุงความถูกต้องของการคาดการณ์ของผู้สมัครก่อน microRNA งานนี้มีวัตถุประสงค์เพื่อศึกษาแฝดเข้ารหัสรูปแบบองค์ประกอบและการระบุคุณสมบัติที่สำคัญที่จำเป็นสำหรับการจัดประเภทที่ถูกต้องของก่อน microRNAs เพื่อให้บรรลุเป้าหมายเหล่านี้เป็นส่วนหนึ่งของการเข้ารหัสรูปแบบองค์ประกอบแฝดเป็นที่รู้จัก คุณสมบัติสกัดโดยใช้โครงการขยายกำลังรวมกับคุณสมบัติระดับโลกที่นำมาใช้ในวรรณคดีและคลุมเครือต้นไม้ตัดสินใจ (FDT) จะถูกใช้เป็นเครื่องมือในการจำแนกและการเลือกคุณลักษณะ ซึ่งแตกต่างจากวิธีการเรียนรู้ของเครื่องที่ใช้ก่อนหน้านี้ FDT ผลิตรูปแบบการจัดหมวดหมู่ของมนุษย์เข้าใจ interpretability ของรูปแบบการจัดหมวดหมู่ให้หมายถึงการระบุคุณสมบัติที่สำคัญที่จำเป็นในการรับรู้ของผู้สมัคร microRNA และมีความเข้าใจที่ดีขึ้นของปัญหานี้ ผลของเราแสดงให้เห็นว่าโครงการองค์ประกอบแฝดไม่ได้ดีกว่าส่วนขยายที่เสนอ การวิเคราะห์เพิ่มเติมพบว่ารวมถึงคุณลักษณะที่สกัดโดยใช้รูปแบบองค์ประกอบแฝดไม่เพิ่มค่าใด ๆ ในการแก้ไขปัญหาการจัดหมวดหมู่นี้ แต่แนะนำคุณสมบัติที่มีเสียงดังบางส่วนและผลการจัดหมวดหมู่เทียบเคียงสามารถทำได้โดยการใช้เพียงหกคุณลักษณะที่ระบุโดย FDT

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

micrornas มีบทบาทสำคัญในการโพสต์ particle ของระเบียบ ทดลองวิธีการระบุ micrornas มีราคาแพงและใช้เวลานาน วิธีการเชิงคำนวณได้พิสูจน์แล้วว่าเป็นประโยชน์สำหรับการระบุ MIC ผู้สมัคร วิธีการส่วนใหญ่พึ่งพาคุณสมบัติสารสกัดจาก mirorna ( Pre MIC ) และโครงสร้างทุติยภูมิ การเลือกการตั้งค่าที่เหมาะสมของลักษณะมีบทบาทในการปรับปรุงการคาดการณ์ความถูกต้องของ Pre MIC ผู้สมัคร งานวิจัยนี้เป็นการศึกษาองค์ประกอบสามรูปแบบการเข้ารหัสและการระบุคุณลักษณะที่จำเป็นที่จำเป็นสำหรับหมวดหมู่ที่ถูกต้องก่อน micrornas . เพื่อให้บรรลุเป้าหมายเหล่านี้ , ส่วนขยายของแฝดสามองค์ประกอบรูปแบบการเข้ารหัสที่เป็นที่รู้จัก คุณสมบัติสกัดใช้ขยายโครงการร่วมกับทั่วโลกมีใช้ในวรรณคดี และการตัดสินใจแบบต้นไม้ ( fdt ) ใช้เป็นประเภทและคุณสมบัติการเลือกเครื่องมือ ซึ่งแตกต่างจากก่อนหน้าเครื่องการเรียนรู้ตามแนว fdt สร้างรูปแบบการเข้าใจมนุษย์ การ interpretability ของการจำแนกรูปแบบมีวิธีการที่จะระบุคุณลักษณะสําคัญที่ต้องจำ MIC ผู้สมัครและมีความเข้าใจที่ดีขึ้นของปัญหานี้ ผลของเราระบุว่าองค์ประกอบสามแบบจะไม่เหนือกว่าใด ๆของตนที่เสนอต่อ พบว่า รวมทั้งคุณสมบัติสกัดโดยใช้สามองค์ประกอบนี้ไม่ได้เพิ่มค่าใด ๆ ปัญหาประเภทนี้ แต่แนะนำบางดังคุณสมบัติและผลการจำแนกเปรียบเทียบสามารถทำได้โดยใช้เพียงหกคุณสมบัติระดับโลกระบุ fdt .