Structural Similarities for the Ent

Structural Similarities for the Entities in PDB 3P7K

The following structural similarities have been found using the jFATCAT-rigid algorithm [1,2]. To reduce the number of hits, a 40% sequence identity clustering has been applied and a representative chain taken from each cluster. If the representative chain consists of multiple domains, each domain is included in the search. If available, the SCOP 1.75 domain assignment [3] is used. Otherwise algorithmic domain assignments are computed using the ProteinDomainParser [4].

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

ความเหมือนโครงสร้างสำหรับเอนทิตีใน PDB 3P7Kความเหมือนที่โครงสร้างต่อไปนี้ถูกพบโดยใช้ขั้นตอนวิธี jFATCAT แข็ง [1, 2] เพื่อลดจำนวนการเยี่ยมชม ลำดับ 40% ตัวคลัสเตอร์ได้ถูกใช้ และห่วงโซ่ตัวแทนมาจากแต่ละคลัสเตอร์ ถ้าโซ่ตัวแทนของโดเมนหลาย แต่ละโดเมนถูกรวมในการค้นหา ถ้ามี เป็นใช้การกำหนดโดเมน SCOP 1.75 [3] กำหนดโดเมน algorithmic มิฉะนั้น จะคำนวณโดยใช้ ProteinDomainParser [4]

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

โครงสร้างคล้ายคลึงกันสำหรับหน่วยงานใน PDB 3P7K ต่อไปนี้ความคล้ายคลึงกันของโครงสร้างได้รับพบว่าการใช้อัลกอริทึม jFATCAT แข็ง [1,2] เพื่อลดจำนวนครั้งการจัดกลุ่มลำดับบัตร 40% มีการใช้และห่วงโซ่ตัวแทนที่นำมาจากแต่ละกลุ่ม ถ้าห่วงโซ่ตัวแทนประกอบด้วยหลายโดเมนแต่ละโดเมนจะรวมอยู่ในการค้นหา ถ้ามีการ SCOP 1.75 การกำหนดโดเมน [3] ถูกนำมาใช้ มิฉะนั้นการกำหนดโดเมนอัลกอริทึมที่มีการคำนวณโดยใช้ ProteinDomainParser ส่วน [4]

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

ความคล้ายคลึงกันของโครงสร้างองค์กรใน PDB 3p7k

ต่อไปนี้จะพบความคล้ายคลึงกันของโครงสร้างโดยใช้ขั้นตอนวิธี jfatcat แข็ง [ 1 , 2 ] เพื่อลดจำนวนของผู้ชม , 40% เอกลักษณ์การจัดกลุ่มลำดับได้ใช้โซ่และตัวแทนจากแต่ละกลุ่ม ถ้าตัวแทนโซ่ประกอบด้วยหลายโดเมนแต่ละโดเมนจะถูกรวมอยู่ในการค้นหา ถ้าใช้งานได้การกำหนดราคาโดเมนสก็อป [ 3 ] ใช้ มิฉะนั้นงานจะคำนวณโดยใช้ขั้นตอนวิธีการ proteindomainparser
[ 4 ]