ฝ่ายเครื่องจักรกล มีหน้าที่ที่ปฏิบัติงานในฝ่าย ดังนี้
- งานทางด้านวิศวกรรมเครื่องจักรกล
- งานข้อมูลทางด้านวิชาการใช้ยานพาหนะและเครื่องจักรกล
- งานติดตามควบคุมการใช้ยานพาหนะและเครื่องจักรกล
- งานควบคุมการใช้และการเบิกจ่ายวัสดุอะไหล่ น้ำมันเชื้อเพลิง และหล่อลื่น
- งานซ่อมบำรุงและพัฒนายานพาหนะและเครื่องจักรกล
- งานช่วยเหลือสนับสนุนทางด้านวิชาการและวิศวกรรมเครื่องกลแก่ส่วนราชการอื่น