AbstractDevelopment of rapid molecu

Abstract
Development of rapid molecular approaches for pathogen detection is key to improving treatment of infectious diseases. For this study, the kinetics and temperature-dependence of DNA probe hybridization to uropathogen species-speciWc sequences were examined. A set of oligonucleotide probes were designed based on variable regions of the 16S gene of the Escherichia coli, Proteus mirabilis, Klebsiella oxytoca, and Pseudomonas aeruginosa. A universal bacterial probe and probes-speciWc for gram-positive and gram-negative organisms were also included. The oligonucleotide probes discriminated among 16S genes derived from 11 diVerent species of uropathogenic bacteria applied to nylon membranes in a dot-blot format. SigniWcant binding of oligonucleotide probes to target DNA and removal of nonspeciWc binding by membrane washing could both be achieved rapidly, requiring as little as 10min. An oligonucleotide probe from the same species-speciWc region of the E. coli 16S gene was used as a capture probe in a novel electrochemical 16-sensor array based on microfabrication technology. Sequence-speciWc hybridization of target uropathogen 16S rDNA was detected through horseradish peroxidase acting as an electrochemical transducer via a second, detector probe. The sensor array demonstrated rapid, species-speciWc hybridization in a time course consistent with the rapid kinetics of the dot-blot hybridization studies. As in the dot-blot hybridization studies, species-speciWc detection of bacterial nucleic acids using the sensor array approach was demonstrated both at 65°C and at room temperature. These results demonstrate that molecular hybridization approaches can be adapted to rapid, room temperature conditions ideal for an electrochemical sensor array platform. Published by Elsevier Inc.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

บทคัดย่อพัฒนาแนวทางโมเลกุลอย่างรวดเร็วตรวจการศึกษาเป็นสำคัญเพื่อปรับปรุงการรักษาโรคติดเชื้อ Hybridization เพื่อลำดับสายพันธุ์ speciWc uropathogen ถูกตรวจสอบสำหรับการศึกษานี้ จลนพลศาสตร์ และอุณหภูมิการพึ่งพาของดีเอ็นเอโพรบ ชุด oligonucleotide คลิปปากตะเข้ถูกออกแบบตามพื้นที่ผันแปรของยีน 16S Escherichia coli, Proteus mirabilis, Klebsiella oxytoca และ Pseudomonas aeruginosa โพรบแบคทีเรียสากลและคลิปปากตะเข้-speciWc สำหรับสิ่งมีชีวิตแบคทีเรียแกรมบวก และแบคทีเรียแกรมลบก็ยังอยู่ คลิปปากตะเข้ oligonucleotide discriminated ในหมู่ยีน 16S มา 11 diVerent พันธุ์แบคทีเรีย uropathogenic กับเยื่อหุ้มไนลอนในรูปจุดคืนในตา รวม SigniWcant oligonucleotide probes ดีเอ็นเอเป้าหมายและกำจัด nonspeciWc ผูก โดยล้างเมมเบรนสามารถทั้งทำได้รวดเร็ว ต้องการน้อยเป็น 10 นาที เป็น oligonucleotide โพรบจาก coli E. ที่มีใช้ยีน 16S เป็นจับโพรบในตัวนวนิยายไฟฟ้า 16 เซนเซอร์อาร์เรย์ตามเทคโนโลยี microfabrication ภูมิภาค speciWc ชนิดเดียวกัน SpeciWc ลำดับ hybridization ของเป้าหมาย uropathogen 16S rDNA พบผ่าน horseradish peroxidase ซึ่งทำหน้าที่เป็นพิกัดการไฟฟ้าผ่านสอง จับโพรบ ที่เซนเซอร์อาร์เรย์ที่แสดงอย่างรวดเร็ว พันธุ์ speciWc hybridization ในเวลาหลักสูตรสอดคล้องกับจลนพลศาสตร์อย่างรวดเร็วศึกษา hybridization จุดคืนในตา ในศึกษา hybridization จุดคืนในตา ตรวจสายพันธุ์ speciWc กรดนิวคลีอิกแบคทีเรียโดยใช้วิธีอาร์เรย์เซนเซอร์ถูกแสดง ที่ 65 ° C และอุณหภูมิห้อง ผลเหล่านี้แสดงให้เห็นว่า วิธีการ hybridization โมเลกุลสามารถดัดแปลงไปอย่างรวดเร็ว อุณหภูมิห้องเงื่อนไขเหมาะสำหรับแพลตฟอร์มเป็นเรย์เซนเซอร์ทางเคมีไฟฟ้า เผยแพร่ โดย Elsevier อิงค์

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

บทคัดย่อการพัฒนาวิธีการโมเลกุลอย่างรวดเร็วในการตรวจหาเชื้อโรคที่เป็นกุญแจสำคัญในการปรับปรุงการรักษาโรคติดเชื้อ การศึกษาครั้งนี้จลนพลศาสตร์และอุณหภูมิพึ่งพาอาศัยกันของพันธุ์สอบสวนดีเอ็นเอ uropathogen ลำดับชนิด speciWc มีการตรวจสอบ ชุดของยานสำรวจ oligonucleotide ได้รับการออกแบบบนพื้นฐานของภูมิภาคตัวแปรของยีน 16S ของเชื้อ Escherichia coli, Proteus mirabilis, Klebsiella oxytoca และเชื้อ Pseudomonas aeruginosa สอบสวนแบคทีเรียสากลและฟิวส์-speciWc มีชีวิตแกรมบวกและแกรมลบก็รวม ยานสำรวจ oligonucleotide จำแนกหมู่ยีน 16S มาจาก 11 ชนิดของเชื้อแบคทีเรีย diVerent uropathogenic นำไปใช้กับเยื่อไนลอนในรูปแบบจุดลบ SigniWcant ผูกพันของยานสำรวจ oligonucleotide ดีเอ็นเอในการกำหนดเป้าหมายและการกำจัดของ nonspeciWc ผูกพันโดยการล้างเมมเบรนทั้งสองจะประสบความสำเร็จอย่างรวดเร็วต้องเป็นเพียง 10 นาที สอบสวน oligonucleotide จากภูมิภาค speciWc ชนิดเดียวกันของยีนเชื้อ E. coli 16S ใช้เป็นหัววัดการจับภาพในอาร์เรย์ที่ 16 เซ็นเซอร์นวนิยายไฟฟ้าที่ใช้เทคโนโลยีชิ้นงานขนาดเล็ก การผสมพันธุ์ลำดับ speciWc เป้าหมาย uropathogen 16S rDNA พบผ่าน peroxidase พืชชนิดหนึ่งที่ทำหน้าที่เป็นตัวแปลงสัญญาณไฟฟ้าผ่านทางที่สองการสอบสวนตรวจจับ อาร์เรย์เซ็นเซอร์แสดงให้เห็นอย่างรวดเร็วพันธุ์สายพันธุ์ speciWc ในเวลาที่แน่นอนสอดคล้องกับจลนศาสตร์อย่างรวดเร็วของการศึกษาไฮบริดอท blot ในขณะที่การศึกษาการผสมพันธุ์ dot-blot ชนิด-speciWc การตรวจสอบของแบคทีเรียกรดนิวคลิอิกใช้วิธีอาร์เรย์เซ็นเซอร์ก็แสดงให้เห็นทั้งที่ 65 องศาเซลเซียสและที่อุณหภูมิห้อง ผลการศึกษานี้แสดงให้เห็นว่าวิธีการผสมพันธุ์โมเลกุลสามารถนำไปปรับใช้อย่างรวดเร็วสภาพอุณหภูมิห้องที่เหมาะสำหรับการเซ็นเซอร์ไฟฟ้าแพลตฟอร์มอาร์เรย์ เผยแพร่โดยเอลส์อิงค์

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

บทคัดย่อ การพัฒนาวิธีการตรวจหาโมเลกุลอย่างรวดเร็ว
เชื้อคีย์การปรับปรุงการรักษาของโรคติดเชื้อ สำหรับการศึกษาจลนพลศาสตร์และดีเอ็นเอ hybridization การพึ่งพาอุณหภูมิ uropathogen ชนิด speciwc ลำดับ 1 ปี ชุด ซึ่งวิธีการได้รับการออกแบบขึ้นอยู่กับตัวแปรภูมิภาคของยีน 16S ของมก. ที่มี Escherichia coli ,Klebsiella oxytoca , และ Pseudomonas aeruginosa สากลของโพรบโพรบและแกรมบวกและแกรมลบ speciwc สำหรับสิ่งมีชีวิตจำนวนรวม การเลือกใช้ ซึ่งวิธีการของยีนที่ได้มาจาก diverent uropathogenic 11 ชนิดของแบคทีเรียที่ใช้ไนลอน membranes ใน dot blot ในรูปแบบsigniwcant ผูก ซึ่งวิธีการเป้าหมายดีเอ็นเอและการกำจัด nonspeciwc ผูกโดยเยื่อแผ่นซักผ้าได้ ทั้งได้อย่างรวดเร็ว โดยเป็นเพียงวัน การสอบสวน ซึ่งจากชนิดเดียวกัน speciwc ภูมิภาคของ E . coli ( ยีนที่ใช้เป็น probe ในนวนิยายจับเซนเซอร์ไฟฟ้าเคมี 16 ตาม รองรับชิ้นงานขนาดเล็ก เทคโนโลยีลำดับเบสของ speciwc เป้าหมาย uropathogen 16S rDNA พบผ่านเอนไซม์มะรุมทำเป็นใช้ตัวแปลงสัญญาณผ่านโพรบตรวจจับวินาที . เซนเซอร์แสดงให้เห็นอย่างรวดเร็ว เซ speciwc สปีชีส์ในเวลาหลักสูตรที่สอดคล้องกับแบบ dot blot hybridization อย่างรวดเร็วของการศึกษา ใน dot blot hybridization ศึกษาชนิด speciwc การตรวจหากรดนิวคลีอิกแบคทีเรียโดยใช้เซนเซอร์แบบทั้ง 65 ° C และแสดงอุณหภูมิห้อง ผลลัพธ์เหล่านี้แสดงให้เห็นว่าสารโมเลกุลวิธีที่สามารถปรับให้เข้ากับสภาพห้องอุณหภูมิอย่างรวดเร็ว เหมาะสำหรับเป็นเซนเซอร์ทางเคมีไฟฟ้าแพลตฟอร์ม จัดพิมพ์โดย Elsevier Inc .