Bovine CAII is composed of 259 amino acid residues with an
average mass of 29,090 Da. It contains a total of 449 exchangeable
hydrogens, including the acetylation at its N-terminal -amine.
Two hundred and forty of these exchangeable hydrogens are on
backbone amides (there are 19 prolines), 248 are on side chains,
and 1 is on the C-terminus. ECD fragment ions of the unlabeled
CAII were identified using an m/z uncertainty constraint of
±0.001.
Fragment ion charge states used for data analysis were 1+ for c2–c7
and z3–z9, 2+ for c8–c13 and z10–z11, 3+ for c14–c18 and z13–z27,
4+ for c21–c25, c35, c39 and z30–z36, 5+ for c26–c31, c50 and z37–z48,
6+ for c33, c51–c55, z52–z57 and z68–z89, 7+ for c41–c42, z62–z65 and
z96, 8+ for c46–c47, c59–c60 and z92, 9+ for c57, z94 and z108, 10+
for c63–c77 and z115–z116, 11+ for c80 and z125, 12+ for c79, c84
and z134, 13+ for c90 and c108, 14+ for c93, 15+ for c95 and c105,
16+ for c101–c103 and c110, 17+ for c121, 18+ for c125, 19+ for c126
and c127, and 20+ for c134. The theoretical centroid m/z values for
the unlabeled c and z• ions were obtained from ProteinProspector
(http://prospector.ucsf.edu), whereas the centroid m/z values for
fragments after HDX were determined by using HX-Express [38].
The number of protected hydrogens (Nprot) for each ECD fragment
and the amide deuteration status (D) of each residue were determined
by using the analysis strategy described previously [29]. The
deuteration level of the internal standard peptide bradikinin was
determined to be 78.4%, very close to the expected value (80%).
CAII วัวประกอบด้วยกรดอะมิโนตกค้างที่ 259 กับการมวลเฉลี่ยของดา 29,090 ประกอบด้วยทั้งหมด 449 กำนัลhydrogens รวม acetylation ที่เป็น N-เทอร์มินัล-amineสองร้อย และ 40 ของ hydrogens กำนัลเหล่านี้อยู่amides แกนหลัก (มี 19 prolines), 248 อยู่ด้านข้างโซ่และ 1 อยู่ C-เทอร์มินัส เบาะแสส่วนอ่อน ๆ ที่ไม่ระบุ CAII ใช้ข้อจำกัดของความไม่แน่นอนเป็น m/z ของ±0.001อเมริกาค่าไอออนส่วนที่ใช้สำหรับการวิเคราะห์ข้อมูลได้ 1 + สำหรับ c2 – c7และ z3 – z9, 2 + c8-c13 และ z10 – z11, 3 + c14 – c18 และ z13 – z274 + c21 – c25, c35, c39 และ z30 – z36, 5 + c26-c31, c50 และ z37 – z486 + c33, c51-c55, z52 – z57 และ z68 – z89, 7 + สำหรับ c41-c42, z62 – z65 และz96, 8 + c46 – c47, c59-c60 และ z92, 9 + c57, z94 และ z108, 10 +c63 – c77 และ z115 – z116, 11 + c80 และ z125, 12 + สำหรับ c79, c84และ z134, 13 + c90 และ c108, 14 + สำหรับ c93, 15 + c95 และ c10516 + c101-c103 และ c110, 17 + สำหรับ c121, 18 + สำหรับ c125, 19 + สำหรับ c126และ c127 ก 20 + สำหรับ c134 ค่า m/z เซนทรอยด์ทฤษฎีสำหรับc ไม่และ z• ประจุที่ได้รับจาก ProteinProspector(http://prospector.ucsf.edu), ในขณะที่เซนทรอยด์ m/z ค่าสำหรับชิ้นส่วนหลังจาก HDX ถูกกำหนดโดย HX เอ็กซ์เพรส [38]หมายเลข hydrogens ได้รับการป้องกัน (Nprot) สำหรับแต่ละส่วนเบาะแสและมีกำหนดสถานะ deuteration amide (D) ของแต่ละสารตกค้างโดยใช้การวิเคราะห์กลยุทธ์อธิบายไว้ก่อนหน้านี้ [29] ที่ระดับ deuteration bradikinin เพปไทด์มาตรฐานภายในได้กำหนดเป็น 78.4% สะดวกค่าคาดหมาย (80%)
การแปล กรุณารอสักครู่..

โค CAII ประกอบด้วย 259
กรดอะมิโนที่มีมวลเฉลี่ยของ29,090 ดา มันมีรวมทั้งสิ้น 449
แลกเปลี่ยนไฮโดรเจนรวมทั้งacetylation ที่ไม่มีขั้วได้อย่างไร -amine.
สองร้อยสี่สิบของไฮโดรเจนแลกเปลี่ยนเหล่านี้อยู่ในเอไมด์กระดูกสันหลัง (มี 19 prolines มี) 248 อยู่ในโซ่ด้านข้างและ1 อยู่บน C-ปลายทาง ECD ไอออนส่วนของที่ไม่มีป้ายกำกับCAII ถูกระบุโดยใช้ม. / z จำกัด ความไม่แน่นอนของ± 0.001. ไอออนส่วนค่าใช้จ่ายที่รัฐใช้ในการวิเคราะห์ข้อมูล 1+ สำหรับ c2-c7 และ z3-z9, 2+ สำหรับ c8-c13 และ z10-Z11 , 3+ สำหรับ c14-c18 และ Z13-Z27, 4 + สำหรับ C21-C25, C35, C39 และ Z30-z36, 5 + สำหรับ C26-C31, C50 และ z37-z48, 6 + สำหรับ C33, C51-C55, Z52 -z57 และ Z68-z89, 7 + สำหรับ C41-C42, Z62-Z65 และZ96, 8 + สำหรับ C46-C47, C59-C60 และ z92, 9 + สำหรับ C57, Z94 และ z108, 10 + สำหรับ C63-c77 และ z115 -z116, 11 + สำหรับ c80 และ z125, 12+ สำหรับ C79, C84 และ z134, 13 + สำหรับ C90 และ C108, 14+ สำหรับ c93, 15 + สำหรับ C95 และ C105, 16 ปีขึ้นไปสำหรับ C101-C110 และ c103, 17 + สำหรับ C121, C125 สำหรับ 18+, 19+ สำหรับ C126 และ c127 และ 20 + สำหรับ C134 เซนทรอยด์ทฤษฎีเมตร / z ค่าคที่ไม่มีป้ายกำกับz และ•ไอออนที่ได้รับจาก ProteinProspector (http://prospector.ucsf.edu) ในขณะที่ค่า centroid เมตร / z สำหรับชิ้นส่วนHDX หลังจากได้รับการพิจารณาโดยใช้ HX-เอ็กซ์เพรส [ 38]. จำนวนของไฮโดรเจนที่มีการป้องกัน (Nprot) สำหรับแต่ละส่วน ECD และสถานะ deuteration เอไมด์ (ที่ D) ของแต่ละสารตกค้างได้รับการพิจารณาโดยใช้กลยุทธ์การวิเคราะห์อธิบายไว้ก่อนหน้า[29] ระดับ deuteration ของเปปไทด์มาตรฐานภายใน bradikinin ได้รับการมุ่งมั่นที่จะเป็น78.4% ใกล้เคียงกับค่าที่คาดหวัง (80%)
การแปล กรุณารอสักครู่..

วัวเรียกประกอบด้วย 259 กรดอะมิโนตกค้างกับ
มวลเฉลี่ยของ 29090 ดา . มันมีทั้งหมด 449 -
ไฮโดรเจน รวมถึงการกันที่ถูก - เอมีน .
สองร้อยสี่สิบของไฮโดรเจนแลกเปลี่ยนเหล่านี้บน
กระดูกสันหลังเอไมด์ ( มี 19 prolines ) นี่ข้างโซ่ ,
1 อยู่ใน c-terminus . ส่วนไอออนของ unlabeled
บก.เรียกถูกระบุโดยใช้ M / Z ความไม่แน่นอนข้อจำกัดของ
± 0.001 ส่วนไอออนประจุสหรัฐอเมริกาที่ใช้ในการวิเคราะห์ข้อมูล ได้แก่ 1 ) C2 C7
z3 z9 และ ( 2 ) และดอง c13 ซอฟต์แวร์– z11 , 3 ) และ ( c18 C14 z13 z27
4 , c21 – c25 , C35 c39 z30 ) , และ z36 5 สำหรับ c26 – c31 c50 Z37 . ) , และ z48
6 , c33 c51 C55 , – , - z57 Z52 . และ z89 z68 – 7 สำหรับ c41 – c42 z62 ) , และ z96 z65
8 c46 – c47 c59 – z92 C60 , และ ,9 c57 z94 z108 , และ 10
สำหรับ c63 – c77 z115 –และ z116 11 สำหรับและสำหรับ c79 c80 z125 , 12 , 13 และ c84
z134 C90 c108 , และ , c93 14 15 และ 16 c95 c105
, c101 – c103 c110 c121 และ 17 , 18 , สำหรับ c125 19 สำหรับ c126
และ c127 และ 20 c134 . ทฤษฎีเซนทรอยด์ M / Z ค่าใกล้เคียง
C และ Z - ไอออนได้จาก proteinprospector
( http : / / แร่ UCSF . edu )ส่วนเคมบริดจ์ M / Z ค่า
เศษหลังจาก HDX วิเคราะห์โดยใช้ HX ด่วน [ 38 ] .
จํานวนป้องกันไฮโดรเจน ( nprot ) สำหรับแต่ละส่วน บก.
และเอไมด์ deuteration สถานะ ( D ) ของแต่ละกากตัดสินใจ
โดยใช้การวิเคราะห์กลยุทธ์ที่อธิบายไว้ก่อนหน้านี้ [ 29 ]
deuteration ระดับภายใน bradikinin เปปไทด์มาตรฐาน
ตั้งใจจะ 78.4 %ใกล้เคียงกับค่าที่คาดหวังไว้
( 80% )
การแปล กรุณารอสักครู่..
