Species belonging to the genus ofPa

Species belonging to the genus ofPantoeaare commonly isolated from plants, humans and the natural environment.
The species of the genus are phenotypically closely related, making rapid identification ofPantoeastrains to the species
level difficult. Multilocus sequence analysis (MLSA) was evaluated as a means for rapid classification and
identification of Pantoeastrains. Four housekeeping genes, gyrB, rpoB, atpDandinfB, were sequenced for strains
assigned to the genus. Included in the study were (1) reference strains from the seven currently recognized species of
Pantoea, (2) strains belonging to Brenner DNA groups II, IV and V, previously isolated from clinical samples and
difficult to identify because of high phenotypic similarity toP. agglomeransorP. ananatisand (3) isolates from
diseasedEucalyptus, maize and onion, assigned to the genus on the basis of phenotypic tests. Phylogenetic trees were
constructed from the sequences of the four housekeeping genes. The ‘‘core’’Pantoeaspecies formed a cluster separate
from the ‘‘Japanese’’ species which formed a tight cluster that included the genusTatumellawhen the tree was based on
concatenated sequences of the four genes. The MLSA data further suggested the existence of ten potential novel
species, phylogenetically related to the currently recognized Pantoea species and the possible inclusion of
Pectobacterium cypripediiin the genus Pantoea. When compared with DNA–DNA hybridization data, a good
congruence was observed between both methods, withgyrBsequence data being the most consistent. In conclusion,
MLSA of partial nucleotide sequences of the genesgyrB, rpoB, atpD and infB can be used for classification,
identification and phylogenetic analyses of Pantoeastrains.
r2008 Elsevier GmbH. All rights reserved

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

สายพันธุ์ของ ofPantoeaare สกุลมักแยกต่างหากจากพืช มนุษย์ และสิ่งแวดล้อมธรรมชาติพันธุ์ตระกูลนี้มี phenotypically ความสัมพันธ์ ทำ ofPantoeastrains อย่างรวดเร็วระบุสายพันธุ์ระดับยาก มีประเมินวิเคราะห์ลำดับ multilocus (MLSA) เป็นวิธีการจัดอย่างรวดเร็ว และรหัสของ Pantoeastrains 4 ทำความสะอาดยีน gyrB, rpoB atpDandinfB มีการเรียงลำดับสำหรับสายพันธุ์กับตระกูลนี้ รวมอยู่ในการศึกษาได้เจ็ดปัจจุบันรู้จักพันธุ์สายพันธุ์อ้างอิง (1)Pantoea, (2) สายพันธุ์ของ Brenner DNA กลุ่ม II, IV และ V ก่อนหน้านี้ แยกต่างหากจากตัวอย่างที่ทางคลินิก และยากต่อการระบุเนื่องจากด้านบนคล้ายไทป์สูง agglomeransorP ananatisand (3) ที่แยกได้จากdiseasedEucalyptus ข้าวโพดและหัวหอม กับตระกูลนี้โดยทดสอบไทป์ มีต้นไม้ phylogeneticสร้างจากลำดับของยีนที่ทำความสะอาด 4 คลัสเตอร์ที่เกิดขึ้น ''หลัก '' Pantoeaspecies แยกจากพันธุ์ ''ญี่ปุ่น '' ซึ่งรูปแบบคลัสเตอร์แน่นที่รวม genusTatumellawhen ต้นเป็นไปตามลำดับการต่อของยีน 4 MLSA ข้อมูลเพิ่มเติมแนะนำการดำรงอยู่ของนวนิยายเป็นสิบสปีชีส์ phylogenetically ที่เกี่ยวข้องกับสายพันธุ์ Pantoea ในปัจจุบันรู้จักและรวมได้Pectobacterium cypripediiin สกุล Pantoea เมื่อเปรียบเทียบกับดีเอ็นเอ-DNA hybridization ข้อมูล ดีลงตัวที่สังเกตระหว่างทั้งสองวิธี withgyrBsequence ข้อมูลสอดคล้องมากที่สุด ในสรุปMLSA ลำดับนิวคลีโอไทด์บางส่วนของ genesgyrB, rpoB, atpD และ infB สามารถใช้สำหรับการจัดประเภทระบุและวิเคราะห์ phylogenetic ของ Pantoeastrainsr2008 Elsevier GmbH สงวนลิขสิทธิ์ทั้งหมด

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

สายพันธุ์ที่เป็นสกุล Species belonging to the genus ofPantoeaare commonly isolated from plants, humans and the natural environment.
สายพันธุ์ของพืชและสัตว์ที่มีลักษณะภายนอกเกี่ยวข้องอย่างใกล้ชิดทำให้ The species of the genus are phenotypically closely related, making rapid identification ofPantoeastrains to the species
ประจำตัวประชาชนอย่างรวดเร็วชนิดระดับที่ยาก การวิเคราะห์ลำดับ level difficult. Multilocus sequence analysis (MLSA) was evaluated as a means for rapid classification and
ถูกประเมินเป็นวิธีการจัดหมวดหมู่อย่างรวดเร็วและมีบัตรประจำตัวของPantoeastrains สี่ยีนดูแลทำความสะอาด identification of Pantoeastrains. Four housekeeping genes, gyrB, rpoB, atpDandinfB, were sequenced for strains
มีลำดับขั้นตอนสำหรับสายพันธุ์ที่ได้รับมอบหมายให้พืชและสัตว์ รวมอยู่ในการศึกษาที่ได้รับนี้ assigned to the genus. Included in the study were (1) reference strains from the seven currently recognized species of
Pantoea (2) Pantoea, (2) strains belonging to Brenner DNA groups II, IV and V, previously isolated from clinical samples and
แยกจากตัวอย่างก่อนหน้านี้ทางคลินิกและยากที่จะระบุเพราะความคล้ายคลึงกันฟีโนไทป์สูง agglomeransorP ananatisand (3) difficult to identify because of high phenotypic similarity toP. agglomeransorP. ananatisand (3) isolates from
diseasedEucalyptus diseasedEucalyptus, maize and onion, assigned to the genus on the basis of phenotypic tests. Phylogenetic trees were
ต้นไม้ที่ถูกสร้างขึ้นมาจากลำดับของยีนสี่ทำความสะอาด constructed from the sequences of the four housekeeping genes. The '' ‘‘แกนcore'' ’’Pantoeaspecies Pantoeaspecies formed a cluster separate
กลายเป็นกลุ่มแยกจากfrom the '' ‘‘ญี่ปุ่นJapanese'' ’’ สายพันธุ์ที่เกิดขึ้นเป็นกลุ่มแน่นที่รวม species which formed a tight cluster that included the genusTatumellawhen the tree was based on
ต้นไม้ก็ขึ้นอยู่กับลำดับการตัดแบ่งในสี่ของยีน ข้อมูล concatenated sequences of the four genes. The MLSA data further suggested the existence of ten potential novel
แนะนำต่อการดำรงอยู่ของสิบนวนิยายที่มีศักยภาพชนิดที่เกี่ยวข้องกับphylogenetically species, phylogenetically related to the currently recognized Pantoea species and the possible inclusion of
Pectobacterium cypripediiin Pectobacterium cypripediiin the genus Pantoea. When compared with DNA–DNA hybridization data, a good
congruence was observed between both methods, withgyrBsequence data being the most consistent. In conclusion,
MLSA of partial nucleotide sequences of the genesgyrB, rpoB, atpD and infB can be used for classification,
identification and phylogenetic analyses of Pantoeastrains.
r2008 Elsevier GmbH. All rights reserved

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

ชนิดของพืช ofpantoeaare มักแยกจากพืช มนุษย์ และธรรมชาติสิ่งแวดล้อม .
สายพันธุ์สกุลเป็น phenotypically เกี่ยวข้องอย่างใกล้ชิด ทำให้ ofpantoeastrains ระบุอย่างรวดเร็วชนิด
ระดับยาก ลำดับการวิเคราะห์ ( mlsa ) ถูกประเมินเป็นวิธีการจัดการอย่างรวดเร็วและ
pantoeastrains . สี่แม่บ้านยีนgyrb rpob atpdandinfb , , เป็นลำดับสำหรับสายพันธุ์
มอบหมายให้สกุล รวมอยู่ในการศึกษา คือ ( 1 ) สายพันธุ์อ้างอิงจากเจ็ดในปัจจุบันรู้จักชนิดของ
pantoea ( 2 ) สายพันธุ์ของเบรนเนอร์ DNA กลุ่มที่ 2 , 4 และ 5 แยกก่อนหน้านี้ จากตัวอย่างทางคลินิกและ
ยากที่จะระบุ เพราะความเหมือนใกล้เคียงด้านบนสูง agglomeransorp . ananatisand ( 3 ) ที่แยกได้จาก
diseasedeucalyptus ข้าวโพด หัวหอม และ ได้รับมอบหมายให้ทำงานในประเภทบนพื้นฐานของการทดสอบคุณสมบัติ . ต้นไม้ phylogenetic ถูก
สร้างจากลำดับสี่แม่บ้านยีน ' 'core ''pantoeaspecies รูปแบบที่กลุ่มแยก
จาก ' 'japanese ' ' ชนิด ซึ่งรูปแบบที่แน่น กลุ่มที่ประกอบด้วย genustatumellawhen ต้นไม้ขึ้นอยู่กับ
ตัดแบ่งลำดับสี่ยีน ข้อมูล mlsa เพิ่มเติมแนะนำการดำรงอยู่ของสิบศักยภาพนวนิยาย
ชนิด phylogenetically เกี่ยวข้องกับปัจจุบัน pantoea รู้จักชนิดและรวมที่สุดของ
pectobacterium cypripediiin สกุล pantoea . เมื่อเปรียบเทียบกับดีเอ็นเอ–ข้อมูลดีเอ็นเอ hybridization , ความสอดคล้องที่ดี
พบระหว่างทั้งสองวิธีข้อมูล withgyrbsequence เป็นสอดคล้องกันมากที่สุด สรุป ลำดับนิวคลีโอไทด์ของ
mlsa บางส่วนของ genesgyrb rpob atpd infb , , และสามารถใช้สำหรับการระบุและยืนยันการวิเคราะห์ pantoeastrains
.
r2008 GmbH บริษัทสงวนสิทธิทั้งหมด