Piriformospora indica, an endophyti

Piriformospora indica, an endophytic fungus of Sebacinales, colonizes the roots of a wide range of host plants and establishes various benefits for the plants. In this work, we describe miRNAs which are upregulated in Oncidium orchid roots after colonization by the fungus. Growth promotion and vigorous root development were observed in Oncidium hybrid orchid, while seedlings were colonized by P. indica. We performed a genome-wide expression profiling of small RNAs in Oncidium orchid roots either colonized or not-colonized by P. indica. After sequencing, 24,570,250 and 24744,141 clean reads were obtained from two libraries. 13,736 from 17,036,953 unique sequences showed homology to either 86 miRNA families described in 41 plant species, or to 46 potential novel miRNAs, or to 51 corresponding miRNA precursors. The predicted target genes of these miRNAs are mainly involved in auxin signal perception and transduction, transcription, development and plant defense. The expression analysis of miRNAs and target genes demonstrated the regulatory functions they may participate in. This study revealed that growth stimulation of the Oncidium orchid after colonization by P. indica includes an intricate network of miRNAs and their targets. The symbiotic function of P. indica on Oncidium orchid resembles previous findings on Chinese cabbage. This is the first study on growth regulation and development of Oncidium orchid by miRNAs induced by the symbiotic fungus P. indica.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

Piriformospora indica เชื้อรา Sebacinales การ endophytic อาณานิคมรากของพืชโฮสต์หลากหลาย และสร้างสิทธิประโยชน์ต่าง ๆ สำหรับพืช ในงานนี้ เราอธิบาย miRNAs ที่ upregulated ในราก Oncidium กล้วยไม้หลังจากการล่าอาณานิคมโดยเชื้อรา ส่งเสริมการเจริญเติบโตและพัฒนารากแข็งแรงถูกสังเกตใน Oncidium ไฮบริออร์คิด ในขณะที่ต้นกล้ามีอาณานิคม P. indica เราสามารถดำเนินการนิพจน์พันธุทั้งครบของ RNAs เล็กในรากกล้วยไม้ Oncidium การ colonized หรือ colonized ไม่ โดย P. indica หลังจากจัดลำดับ 24,570,250 และ 24744,141 อ่านสะอาดรับจากไลบรารีสอง 13,736 จากลำดับเฉพาะ 17,036,953 พบว่า homology ทั้งครอบครัวเที่ยว 86 ที่อธิบายไว้ใน 41 พันธุ์พืช หรือ 46 miRNAs นวนิยายอาจเกิดขึ้น หรือสารตั้งต้นเที่ยวที่สอดคล้องกัน 51 ยีนเป้าหมายที่คาดการณ์ของ miRNAs เหล่านี้ส่วนใหญ่เกี่ยวข้องรับรู้สัญญาณออกซิน และส่ง ถอด พัฒนาและโรงงาน การวิเคราะห์การแสดงออกของยีน miRNAs และเป้าหมายแสดงฟังก์ชันด้านกฎระเบียบที่พวกเขาอาจมีส่วนร่วมใน การศึกษานี้เปิดเผยที่กระตุ้นการเจริญเติบโตของออร์คิด Oncidium หลังจากการล่าอาณานิคม โดย P. indica มีเครือข่ายซับซ้อนของ miRNAs และเป้าหมายของพวกเขา ฟังก์ชันการอยู่ของ P. indica ใน Oncidium ออร์คิดคล้ายกับผลการวิจัยก่อนหน้านี้บนปลี นี้เป็นการศึกษาแรกควบคุมการเจริญเติบโตและพัฒนาของ orchid Oncidium โดย miRNAs เกิดจาก indica P. เชื้อราอยู่

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

Piriformospora indica เป็นเชื้อราเอนโดไฟท์ของ Sebacinales, โคโลนีที่รากของความหลากหลายของพืชและกำหนดสิทธิประโยชน์ต่างๆสำหรับพืช ในงานนี้เราจะอธิบาย miRNAs ซึ่งมี upregulated ใน Oncidium รากกล้วยไม้หลังจากการล่าอาณานิคมจากเชื้อรา โปรโมชั่นการเจริญเติบโตและการพัฒนารากแข็งแรงพบในกล้วยไม้ลูกผสม Oncidium ในขณะที่ต้นกล้าถูกอาณานิคมโดยพี indica เราดำเนินการจีโนมทั้งโปรไฟล์การแสดงออกของ RNAs ขนาดเล็กใน Oncidium รากกล้วยไม้อาณานิคมหรือไม่อาณานิคมโดยพี indica หลังจากลำดับ 24570250 และ 24744.141 สะอาดอ่านได้จากสองห้องสมุด 13736 จาก 17,036,953 ลำดับไม่ซ้ำกันแสดงให้เห็นว่าคล้ายคลึงกันทั้ง 86 ครอบครัว miRNA อธิบายไว้ใน 41 พันธุ์พืชหรือ 46 นวนิยายที่มีศักยภาพ miRNAs หรือ 51 สอดคล้องสารตั้งต้น miRNA ยีนเป้าหมายที่คาดการณ์ของ miRNAs เหล่านี้มีส่วนร่วมในการรับรู้ส่วนใหญ่ออกซินของสัญญาณและพลังงานถอดความการพัฒนาและการป้องกันพืช การวิเคราะห์การแสดงออกของยีน miRNAs และเป้าหมายแสดงให้เห็นถึงฟังก์ชั่นการกำกับดูแลพวกเขาอาจจะมีส่วนร่วมใน. การศึกษาครั้งนี้เปิดเผยว่าการกระตุ้นการเจริญเติบโตของกล้วยไม้ Oncidium หลังจากการล่าอาณานิคมโดยพี indica รวมถึงเครือข่ายที่ซับซ้อนของ miRNAs และเป้าหมายของพวกเขา ฟังก์ชั่นทางชีวภาพของพี indica บน Oncidium กล้วยไม้มีลักษณะคล้ายกับผลการวิจัยก่อนหน้านี้ผักกาดขาวปลี นี่คือการศึกษาครั้งแรกในการควบคุมการเจริญเติบโตและการพัฒนาของ Oncidium กล้วยไม้โดย miRNAs เหนี่ยวนำโดยชีวภาพเชื้อรา P. indica

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

piriformospora indica , เป็นเชื้อราเอนโดไฟท์ของ sebacinales colonizes , รากของหลากหลายของพืชเป็นเจ้าภาพ และสร้างประโยชน์ต่างๆสำหรับพืช ในงานนี้เราอธิบาย mirnas ซึ่ง upregulated ในซิเดียมกล้วยไม้รากหลังจากการล่าอาณานิคมโดยเชื้อรา ส่งเสริมการเจริญเติบโตและการพัฒนารากแข็งแรงที่พบในลูกผสมกล้วยไม้สกุลออนซิเดียม ในขณะที่ต้นกล้าเป็นเมืองขึ้นหน้า 3 . เราได้ทำการ genome-wide แบบแผนการแสดงออกของ RNAs ขนาดเล็กในกล้วยไม้สกุลออนซิเดียมรากให้อาณานิคมหรือเมืองขึ้นหน้า 3 . หลังจากจัดลำดับ 24570250 24744141 สะอาดและอ่านได้จากสองห้องสมุด 13736 จาก 17036953 ลำดับเฉพาะพบที่มีทั้ง 86 mirna ครอบครัวอธิบายในพืช 41 ชนิด หรือ 46 ศักยภาพใหม่ mirnas หรือ 51 mirna ตั้งต้นที่สอดคล้องกัน . ทำนายเป้าหมายยีนของ mirnas เหล่านี้ส่วนใหญ่เกี่ยวข้องกับการรับรู้และการถอดความการแปรสัญญาณออกซิน , การพัฒนาและป้องกันพืช การแสดงออกของยีนเป้าหมาย mirnas การวิเคราะห์และแสดงกฎระเบียบการทำงานพวกเขาอาจมีส่วนร่วมใน การศึกษานี้พบว่า การกระตุ้นการเจริญเติบโตของกล้วยไม้สกุลออนซิเดียม หลังจากการล่าอาณานิคมโดย P . indica มีเครือข่ายที่ซับซ้อนของ mirnas และเป้าหมายของพวกเขา ฟังก์ชัน symbiotic ของ P . indica ในกล้วยไม้สกุลออนซิเดียมเหมือนก่อนหน้านี้พบในผักกาดดอง การศึกษานี้เป็นครั้งแรกที่ควบคุมการเจริญเติบโตและการพัฒนาของกล้วยไม้สกุลออนซิเดียม โดย mirnas ที่เกิดจากเชื้อราชนิดหน้า 3 .