Among the 41 differentially express

Among the 41 differentially expressed genes, some were
involved in genetic information and environmental processing (mainly for membrane transporters of nutrients), the others having active roles in intermediary metabolism. The decrease lipid intake in trout fed diet LL was associated with apparent lower capacity of fatty acid transport as confirmed by real time RT-PCR analysis with the FABL gene expression. Original data obtained here on other differentially expressed genes involved in amino acid/ion transport, cell motility, transcription, signal transduction suggest for example an increased apoptosis and a decreased hepatic cell proliferation: further studies are needed to explain these observations.

The post-transcriptomic analysis on hepatic intermediary metabolism shows that the major part of the differentially expressed genes between HL and LL fish are involved in intermediary metabolism: fatty acid metabolism, protein metabolism and energy metabolism. We confirmed some of these data using specific real time PCR with a higher number of individuals per dietary groups. Decreased gene expression for proteins involved Table 6 Selected genes analysed by real time PCR: effect of dietary fish oil removal.
Statistical differences in gene expression between samples were evaluated in group means by randomisation tests (Pfaffl et al., 2002) using REST© software: down and up regulation means that the target gene is expressed at a lower or higher level, respectively Gene Foldregulation P-values CV HL (%) CV LL (%) Up-expressed genes in microarrays Fatty acid synthase +3.8 P= 0.001 1.4 0.7
Elongation of very long fatty acid protein +2.0 P= 0.001 1.0 1.1 Long-chain fatty acid-CoA ligase +1.8 P= 0.005 1.9 0.2 Down-expressed genes in microarrays Acyl-CoA oxidase −1.7 P= 0.003 0.2 0.3 Fatty acid-binding protein −1.3 P= 0.03 0.7 0.7 Cytochrome c oxidase polypeptide II −1.3 P= 0.006 0.9 1.2 Ubiquitin-E2-protein
ligase −1.5 P= 0.004 1.2 0.7 Proteasome-subunit α3 −1.5 P= 0.02 1.5 1.9 Transcript level of target genes normalised with EF1α expressed transcripts. S. Panserat et al. / Aquaculture 275 (2008) 235–241 239 in energy metabolism such as cytochrome c oxidase polypeptide II in fish fed without fish oil is in agreement with data by Salem et al. (2007) who showed this protein to be highly dependent on nutritional status, being induced in refed rainbow trout compared
to fasted trout

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

ระหว่างยีนแสดง differentially 41 บางคนเกี่ยวข้องกับข้อมูลทางพันธุกรรม และสิ่งแวดล้อมการประมวลผล (ส่วนใหญ่สำหรับเยื่อผู้สารอาหาร), อื่น ๆ มีงานบทบาทในเมแทบอลิซึมของตัวกลาง การบริโภคไขมันลดลงในเทราต์เลี้ยงอาหารจะถูกเชื่อมโยงกับความจุต่ำกว่าชัดเจนการขนส่งกรดไขมันเป็นยืนยันแล้ว โดยวิเคราะห์ RT-PCR เวลาจริงกับ FABL ยีน ข้อมูลต้นฉบับได้ที่นี่บนยีนอื่น ๆ differentially แสดงที่เกี่ยวข้องกับการขนส่งกรดอะมิโน/ไอออน เซลล์ motility, transcription สัญญาณ transduction แนะนำเช่นการ apoptosis เพิ่มและขยายเซลล์ตับที่ลดลง: เพิ่มเติม การศึกษาจำเป็นต้องอธิบายข้อสังเกตเหล่านี้วิเคราะห์ transcriptomic ลงการเผาผลาญตัวกลางตับแสดงว่า ส่วนใหญ่ของยีน differentially แสดงระหว่างปลา HL และจะเกี่ยวข้องกับเมแทบอลิซึมของตัวกลาง: เผาผลาญกรดไขมัน เผาผลาญโปรตีน และการเผาผลาญพลังงาน เรายืนยันข้อมูลเหล่านี้ใช้เวลาจริงเฉพาะ PCR ของบุคคลต่อกลุ่มอาหารบางอย่าง ลดยีนสำหรับโปรตีนเกี่ยวข้องกับตาราง 6 เลือกยีน analysed ตามเวลาจริง PCR: ผลของอาหารปลาน้ำมันเอาไว้มีประเมินในกลุ่มหมายถึงยีนระหว่างตัวอย่างความแตกต่างทางสถิติ โดยการทดสอบ randomisation (Pfaffl และ al., 2002) ใช้เหลือ © ซอฟต์แวร์: ลง และ ค่าระเบียบหมายถึง ว่า ยีนเป้าหมายจะแสดงระดับที่ต่ำกว่า หรือสูงกว่า CV ยีน Foldregulation P ค่า HL (%) ตามลำดับ จะ CV (%) ยีนที่แสดงขึ้นใน microarrays synthase กรดไขมัน +3.8 P = 0.001 1.4 0.7Elongation ของกรดไขมันยาวมากโปรตีนเบา + 2.0 P = 0.001 1.0 1.1 ลองโซ่กรดไขมัน-CoA ligase +1.8 P = 0.005 1.9 0.2 แสดงลงใน microarrays Acyl CoA oxidase −1.7 P = 0.003 0.2 0.3 กรดไขมันรวมโปรตีน −1.3 P = 0.03 0.7 0.7 Cytochrome c oxidase polypeptide II −1.3 P = 0.006 0.9 1.2 Ubiquitin-E2-โปรตีน−1.5 ligase P = 0.004 1.2 0.7 Proteasome ย่อย α3 −1.5 P = 0.02 1.5 1.9 ระดับเสียงบรรยายของยีนเป้าหมาย normalised กับ EF1α ที่แสดงใบแสดงผลการ S. Panserat et al. / 275 การเพาะเลี้ยงสัตว์น้ำ (2008) 235-241 239 ในการเผาผลาญพลังงานเช่น cytochrome c oxidase polypeptide II ในปลาเลี้ยง โดยน้ำมันปลา จะยังคงข้อมูลโดย Salem et al. (2007) ที่พบโปรตีนนี้จะสูงขึ้นอยู่กับสถานะทางโภชนาการ การเกิดใน refed เรนโบว์เทราต์เปรียบเทียบเทราต์ถึงเชื่อ

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

ในบรรดา 41 ยีนที่แสดงออกแตกต่างกันบางคน
มีส่วนร่วมในข้อมูลทางพันธุกรรมและการประมวลผลด้านสิ่งแวดล้อม (ส่วนใหญ่สำหรับการขนส่งเมมเบรนของสารอาหาร), อื่น ๆ ที่มีบทบาทในการเผาผลาญตัวกลาง ปริมาณไขมันลดลงในอาหารเลี้ยงปลาเทราท์ LL มีความสัมพันธ์กับกำลังการผลิตที่ต่ำกว่าที่เห็นได้ชัดของการขนส่งกรดไขมันที่ได้รับการยืนยันจากเวลาจริงการวิเคราะห์ RT-PCR ที่มีการแสดงออกของยีน FABL ข้อมูลเดิมที่ได้รับที่นี่ในยีนที่แสดงออกแตกต่างกันอื่น ๆ ที่เกี่ยวข้องในกรดอะมิโน / ไอออนการขนส่ง, การเคลื่อนที่ของเซลล์ถอดความสัญญาณชี้ให้เห็นตัวอย่างการตายที่เพิ่มขึ้นและการเพิ่มจำนวนเซลล์ของตับลดลง. การศึกษาต่อไปมีความจำเป็นที่จะอธิบายการสังเกตเหล่านี้โพสต์ transcriptomic การวิเคราะห์เกี่ยวกับการเผาผลาญอาหารตัวกลางตับแสดงให้เห็นว่าเป็นส่วนหนึ่งที่สำคัญของยีนที่แสดงออกแตกต่างกันระหว่าง HL และปลา LL มีส่วนร่วมในการเผาผลาญตัวกลาง: การเผาผลาญกรดไขมัน, การเผาผลาญโปรตีนและการเผาผลาญพลังงาน เราได้รับการยืนยันข้อมูลบางส่วนเหล่านี้โดยใช้เวลา PCR จริงเฉพาะที่มีจำนวนที่สูงขึ้นของประชาชนต่อกลุ่มอาหาร การลดลงของการแสดงออกของยีนโปรตีนที่เกี่ยวข้องกับตารางที่ 6 ที่เลือกยีนวิเคราะห์ตามเวลาจริง PCR:. ผลของการกำจัดน้ำมันปลาอาหารที่แตกต่างกันทางสถิติในการแสดงออกของยีนระหว่างกลุ่มตัวอย่างที่ได้รับการประเมินในกลุ่มหมายถึงการทดสอบโดยการสุ่ม (Pfaffl et al, 2002.) โดยใช้ซอฟแวร์© REST : ขึ้นและลงระเบียบหมายความว่ายีนเป้าหมายจะแสดงอยู่ในระดับที่ต่ำกว่าหรือสูงกว่าตามลำดับยีน Foldregulation ค่า P-CV HL (%) CV LL (%) ขึ้นแสดงยีนใน microarrays synthase กรดไขมัน 3.8 p = 0.001 1.4 0.7 การยืดตัวของโปรตีนกรดไขมันที่ยาวมาก 2.0 p = 0.001 1.0 1.1 ยาวโซ่ลิกาเซกรดไขมัน 1.8 CoA p = 0.005 1.9 0.2 ลงแสดงออกของยีนใน microarrays oxidase Acyl-CoA -1.7 p = 0.003 0.2 0.3 กรดไขมัน โปรตีน -1.3 p = 0.03 0.7 0.7 Cytochrome polypeptide ค oxidase II -1.3 p = 0.006 0.9 1.2 Ubiquitin-E2 โปรตีนลิกาเซ -1.5 p = 0.004 1.2 0.7 Proteasome-subunit α3 -1.5 p = 0.02 1.5 1.9 ระดับสำเนาของยีนเป้าหมาย ปกติกับEF1αแสดงใบรับรองผลการเรียน เอส Panserat et al, / เพาะเลี้ยงสัตว์น้ำ 275 (2008) 235-241 239 ในการเผาผลาญพลังงานเช่น cytochrome oxidase polypeptide คครั้งที่สองในปลาที่เลี้ยงโดยไม่ต้องน้ำมันปลาที่อยู่ในข้อตกลงที่มีข้อมูลจากซาเลมและอัล (2007) ที่แสดงให้เห็นว่าโปรตีนนี้จะสูงขึ้นอยู่กับภาวะโภชนาการที่ถูกเหนี่ยวนำให้เกิดในเรนโบว์เทราท์ refed เมื่อเทียบกับการอดอาหารปลาเทราท์

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

ระหว่าง 41 แสดงออกแตกต่างกันยีน บ้าง
เกี่ยวข้องกับข้อมูลทางพันธุกรรมและการประมวลผลด้านสิ่งแวดล้อม ( ส่วนใหญ่สำหรับเมมเบรนขนส่งสารอาหาร ) , ผู้อื่นที่มีบทบาทการใช้งานในการเผาผลาญอาหารกลางลดปริมาณไขมันในปลาที่ได้รับอาหารจะถูกเชื่อมโยงกับล่างชัดเจน ความจุของการขนส่งกรดไขมันที่ยืนยันโดยวิธีวิเคราะห์เวลาจริงกับ fabl ยีนสีหน้า ข้อมูลต้นฉบับได้ที่นี่อื่น ๆที่แสดงออกแตกต่างกันยีนที่เกี่ยวข้องกับการขนส่งกรดอะมิโน / ไอออนเซลล์การเคลื่อนที่ บัณฑิตยสถานการแปรสัญญาณชี้ให้เห็นตัวอย่างเช่นเซลล์ตับเพิ่มขึ้นและลดลงเซลล์ proliferation : การศึกษาเพิ่มเติมจะต้องอธิบายการสังเกตเหล่านี้

โพสต์ transcriptomic การวิเคราะห์เอนไซม์เมแทบอลิซึมของตัวกลางพบว่าส่วนหลักของยีนระหว่าง HL จะแสดงออกแตกต่างกันและปลาที่เกี่ยวข้องในการเผาผลาญกรดไขมันคนกลาง : เมแทบอลิซึมเมแทบอลิซึมของโปรตีนและพลังงานการเผาผลาญ เรายืนยันได้ว่าบางส่วนของข้อมูลเหล่านี้ใช้ Real Time PCR ที่เฉพาะเจาะจงกับตัวเลขที่สูงขึ้นของบุคคล / กลุ่มอาหาร การแสดงออกของยีนสำหรับโปรตีนที่เกี่ยวข้องลดลงตารางที่ 6 เลือกยีนวิเคราะห์เวลาจริงโดย : ผลของการเสริมน้ำมันปลา
.ความแตกต่างทางสถิติในการแสดงออกของยีนระหว่างกลุ่มตัวอย่างประเมินในกลุ่ม ซึ่งจากการทดสอบ randomisation ( pfaffl et al . , 2002 ) โดยใช้ซอฟต์แวร์สงวนลิขสิทธิ์ส่วนที่เหลือ : ขึ้นและลงระเบียบหมายความว่ายีนเป้าหมายอยู่ในระดับต่ำ หรือ สูงกว่า คือยีน foldregulation p-values พันธุ์ HL ( % ) CV จะ ( % ) แสดงออกยีนใน ิกรดไขมันและ 3.8 p = 0.001 1.4 0.7
การยืดตัวของนานกรดไขมันโปรตีน 2.0 p = 0.001 1.0 1.1 กรดไขมันโซ่ยาวแขนเสื้อไลเกส 1.8 P = 0.005 1.9 0.2 ลงแสดงออกยีนในการแสดงฉลาก COA ของ− 1.7 , p = 0.003 0.2 0.3 กรดไขมันโปรตีน− 1.3 p = 0.03 0.7 0.7 polypeptide อุปกรณ์ข้อมูลออก 2 − 1.3 p = 0.006 0.9 1.2 ubiquitin-e2-protein
ไลเกส− 1.5 P = 0.004 1.2 0.7 โปรตีเ ซม 3 − 1 α 1.5 P = 0.02 1.5 19 . ระดับของยีนเป้าหมายผลกำไรกับ ef1 αแสดงรายงาน เอส panserat et al . การเพาะเลี้ยงสัตว์น้ำ / 275 ( 2008 ) 235 – 241 239 ในการเผาผลาญ พลังงาน เช่น ไซโตโครมซีออกซิเดสโพลีเพปไทด์ 2 น้ำมันปลา ปลาไม่สอดคล้องกับข้อมูลจากซาเลม et al . ( 2007 ) ที่แสดงให้เห็นว่าโปรตีนนี้จะสูงขึ้นในภาวะโภชนาการ การเกิดใน refed เทียบ
ปลาเรนโบว์เทราท์ต้องอดอาหารปลาเทราท์