Comparison with the NCBI database u

Comparison with the NCBI database using BLAST
revealed that all 37 nirK and all 31 nosZ clones amplified
with primers F1aCu:R3Cu-GC and nosZF:
nosZ1622R-GC, respectively, showed homology with
known nirK and nosZ sequences. No heteroduplex
molecules were observed. The resolution of nirK and
nosZ amplicons was satisfactory. For the 24 nirK bands
that were excised, five bands contained two sequences
and the bands PK6, UK4, BK3 and BK4 held three
sequences. For nosZ, five of the 22 bands were composed
of two different sequences and three sequences
were found in bands BZ5 and HZ9. Sequences appearing
in the same band were in most cases closely related
and were therefore difficult to separate. However, a few
bands contained distantly related nirK and nosZ clones,
indicating co-migration of DNA. This is not unusual
[45], and to resolve these sequences either cloning or
running the fragment on new DGGE can be employed.
The cloning approach is often used for sequencing

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

เปรียบเทียบกับฐานข้อมูล NCBI ใช้ระเบิดเปิดเผยที่ nirK 37 ทั้งหมดและทั้งหมด 31 nosZ โคลนที่ขยายด้วยไพรเมอร์ F1aCu:R3Cu-GC และ nosZF:nosZ1622R GC ตามลำดับ พบ homology กับเรียกลำดับที่ nirK และ nosZ ไม่ heteroduplexโมเลกุลถูกสังเกต ความละเอียดของ nirK และnosZ amplicons ประทับใจ สำหรับวงดนตรี nirK 24ที่ถูกสรรพสามิต วงห้าอยู่ลำดับที่สองวงดนตรี PK6, UK4, BK3 และ BK4 จัดสามลำดับนั้น สำหรับ nosZ ห้า 22 วงดนตรีประกอบด้วยลำดับอื่นที่สองและลำดับที่สามพบในวง BZ5 และ HZ9 ลำดับที่ปรากฏในวงเดียวกันได้ในกรณีส่วนใหญ่ที่เกี่ยวข้องอย่างใกล้ชิดและดังนั้นจึงยากที่จะแยก อย่างไรก็ตาม บางวงอยู่ที่เกี่ยวข้อง distantly nirK และ nosZ โคลนระบุร่วมโยกย้ายของดีเอ็นเอ ไม่ผิดปกติ[45], และ การแก้ไขเหล่านี้ลำดับใดโคลน หรือสามารถใช้ทำงานส่วนตัวบน DGGE ใหม่วิธีการโคลนมักใช้สำหรับการจัดลำดับ

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

เปรียบเทียบกับฐานข้อมูล NCBI ใช้ระเบิด
เปิดเผยว่าทั้งหมด 37 nirK และทุกวันที่ 31 โคลน nosZ ขยาย
ด้วยไพรเมอร์ F1aCu: R3Cu-GC และ nosZF:
nosZ1622R-GC ตามลำดับแสดงให้เห็นว่าคล้ายคลึงกันกับ
ที่รู้จักกัน nirK และ nosZ ลำดับ ไม่มี heteroduplex
โมเลกุลถูกตั้งข้อสังเกต ความละเอียดของ nirK และ
nosZ amplicons เป็นที่น่าพอใจ สำหรับวงดนตรีที่ 24 nirK
ที่ถูกตัดห้าวงดนตรีที่มีลำดับสอง
และวงดนตรีที่ PK6, UK4, BK3 และ BK4 จัดขึ้นสาม
ลำดับ สำหรับ nosZ ห้าจาก 22 วงดนตรีที่ประกอบด้วย
สองลำดับที่แตกต่างกันและสามลำดับ
ถูกพบอยู่ในวงดนตรีที่ BZ5 และ HZ9 ลำดับที่ปรากฏ
ในวงเดียวกันอยู่ในกรณีส่วนใหญ่ที่เกี่ยวข้องอย่างใกล้ชิด
และดังนั้นจึงเป็นการยากที่จะแยก อย่างไรก็ตามไม่กี่
วงดนตรีที่มีอยู่ห่างไกลที่เกี่ยวข้อง nirK และ nosZ โคลน
บ่งชี้ร่วมการย้ายถิ่นของดีเอ็นเอ นี้ไม่ได้เป็นเรื่องผิดปกติ
[45] และในการแก้ไขลำดับเหล่านี้อย่างใดอย่างหนึ่งหรือโคลน
ทำงานชิ้นส่วนใน DGGE ใหม่สามารถทำงาน.
วิธีการโคลนมักจะใช้สำหรับการจัดลำดับ

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

เปรียบเทียบกับฐานข้อมูล ncbi ใช้ระเบิดพบทั้งหมด 37 เนิร์กและทั้งหมด 31 nosz โคลนอัตราด้วยไพรเมอร์ f1acu : r3cu GC และ noszf :nosz1622r GC ตามลำดับ แสดงให้เห็นว่าโรคด้วยเนิร์กรู้จักและ nosz ลำดับ ไม่ heteroduplexโมเลกุลลดลง ความละเอียดของเนิร์ก และnosz amplicons เป็นที่น่าพอใจ สำหรับ 24 เนิร์ก วงดนตรีที่ถูกตัด 5 วงที่มีอยู่สองลำดับและวงดนตรี pk6 uk4 bk3 , , และสาม bk4 จัดขึ้นลำดับ สำหรับ nosz 5 จาก 22 วง ได้แก่สองและสามลำดับลำดับต่าง ๆพบในแถบ bz5 และ hz9 . ลำดับปรากฏอยู่วงเดียวกัน ในกรณีที่เกี่ยวข้องอย่างใกล้ชิดที่สุดและดังนั้นจึงยากที่จะแยกจากกัน อย่างไรก็ตาม ไม่กี่แถบที่อยู่ห่างเหินเกี่ยวข้องกับเนิร์ก nosz และโคลน ,แสดง Co การย้ายถิ่นของดีเอ็นเอ นี้ไม่ได้ผิดปกติ[ 45 ] และแก้ไขลำดับเหล่านี้อย่างใดอย่างหนึ่ง โคลนนิ่ง หรือใช้ในการทดลองชิ้นใหม่สามารถใช้ส่วนวิธีการมักจะใช้สำหรับการโคลนนิ่ง