Teak (Tectona grandis Linn.f.) is a

Teak (Tectona grandis Linn.f.) is an important forest

tree of Thailand valued for its wood. Teakwood is resistant

against termite (Coptotermes gestroi) attack. However,

teak trees suffer from insect pests feeding on the leaves

(among them teak skeletonizer and teak defoliator) and

shoots (teak shoot borer) which lead to lost growth and

lower value of the wood. Therefore this project aimed to

make a compilation of genes that have been demonstrated

to be involved in resistance against insect pests in various

plants and discover the corresponding genes in teak.

The Arabidopsis Information Resource was searched for

genes which had been annotated to be involved in insect

resistance and the corresponding coding sequences

(CDS) were retrieved. The BLASTN programme was used

to search for similar coding sequences derived from plant

species phylogenetically more closely related to teak in the

NCBI Databases (NR and EST databases). These

sequences were then used to retrieve teak genome

regions (scaffolds) from the teak genome assembly using

BLASTN. The AUGUSTUS programme was used to

predict gene coding regions in the selected scaffolds

which resulted in the discovery of seven genes with high

similarity to resistance gene against insect pests.

Alignments were constructed to compare the nucleotide

sequences of the genes from teak with those from other

plants. The results confirmed the location of the genes in

teak including potential start and stop codons and introns.

This information could be combined with the discovery of

polymorphisms in teak for future research such as the

design of DNA-based markers to study the function and

inheritance of these genes.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

ไม้สัก (สัก Linn.f.) เป็นป่าสำคัญ ต้นไม้ของไทยมูลค่าไม้ของ ไม้สักมีความทนทานต่อ ปลวก (Coptotermes gestroi) โจมตี อย่างไรก็ตาม ต้นไม้สักที่ประสบปัญหาจากแมลงศัตรูพืชกินใบ (ในหมู่พวกเขา skeletonizer ไม้สักและไม้สัก defoliator) และ หน่อ (มอดไม้สักยิง) ซึ่งนำไปสู่การสูญเสียเจริญเติบโต และ ค่าที่ต่ำกว่าไม้ ดังนั้น โครงการนี้มีวัตถุประสงค์เพื่อ ทำการรวบรวมของยีนที่มีการแสดง การมีส่วนร่วมในความต้านทานต่อแมลงศัตรูพืชในที่ต่าง ๆ พืช และการค้นพบยีนที่เกี่ยวข้องในไม้สักทรัพยากรข้อมูล Arabidopsis ถูกค้นหา ยีนที่ได้รับคำอธิบายประกอบส่วนในแมลง ความต้านทานและการลำดับการเขียนโค้ดการเกี่ยวข้อง (ซี) ถูกเรียก ใช้โปรแกรม BLASTN การค้นหาลำดับการเขียนคล้ายมาจากโรงงาน เพิ่มเติม phylogenetically สายพันธุ์ที่เกี่ยวข้องกับการสักในการ ฐานข้อมูล NCBI (ฐานข้อมูล NR และ EST) เหล่านี้ ลำดับนั้นใช้เรียกพันธุไม้สัก ภูมิภาค (เกิด) จากแอสเซมบลีพันธุไม้สักที่ใช้ BLASTN ใช้โปรแกรม AUGUSTUS ทำนายรหัสภูมิภาคเกิดเลือกยีน ซึ่งส่งผลให้เกิดการค้นพบยีนเจ็ดมีสูง ความคล้ายคลึงกับยีนต้านทานต่อแมลงศัตรูพืช จัดแนวถูกสร้างขึ้นเพื่อเปรียบเทียบการนิวคลีโอไทด์ ลำดับของยีนจากสักกับจากอื่น ๆ พืช ผลการยืนยันตำแหน่งของยีนใน ไม้สักรวมถึงการเริ่มต้น และหยุด codons และ introns ข้อมูลนี้อาจจะรวมกับการค้นพบ วิจัย polymorphisms ในไม้สักสำหรับอนาคตเช่นการ การออกแบบของเครื่องหมายดีเอ็นเอตามการศึกษาการทำงาน และ สืบทอดของยีนเหล่านี้

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

สัก (Tectona grandis Linn.f. ) เป็นป่าที่สำคัญต้นไม้แห่งประเทศไทยมูลค่าสำหรับไม้ ไม้สักทนกับปลวก (Coptotermes gestroi) โจมตี อย่างไรก็ตามต้นสักทุกข์ทรมานจากแมลงศัตรูพืชกินใบ(ในหมู่พวกเขา skeletonizer สักและไม้สัก defoliator) และหน่อ (ไม้สักยิงหนอนเจาะ) ซึ่งนำไปสู่การเจริญเติบโตหายไปและค่าที่ต่ำกว่าของไม้ ดังนั้นโครงการนี้มีวัตถุประสงค์เพื่อทำให้การสะสมของยีนที่ได้รับการแสดงให้เห็นถึงการมีส่วนร่วมในความต้านทานต่อแมลงศัตรูพืชต่าง ๆ ในพืชและค้นพบยีนที่เกี่ยวข้องในสัก. ข้อมูลทรัพยากร Arabidopsis ถูกค้นหายีนที่ได้รับข้อเขียนจะมีส่วนร่วมในแมลงความต้านทานและสอดคล้องลำดับการเข้ารหัส(CDS) ถูกดึง โปรแกรมดังกล่าวหาได้ถูกใช้ในการค้นหาสำหรับลำดับการเข้ารหัสที่คล้ายกันมาจากพืชชนิดที่เกี่ยวข้องกับ phylogenetically อย่างใกล้ชิดกับไม้สักในNCBI ฐานข้อมูล (NR และฐานข้อมูล EST) เหล่านี้วนเวียนอยู่แล้วถูกนำมาใช้เพื่อดึงจีโนมสักภูมิภาค (โครง) จากการชุมนุมจีโนมไม้สักโดยใช้ดังกล่าวหา โปรแกรม AUGUSTUS ถูกใช้ในการคาดการณ์ของยีนเข้ารหัสภูมิภาคในโครงที่เลือกซึ่งมีผลในการค้นพบของเจ็ดยีนที่มีสูงความคล้ายคลึงกันกับความต้านทานยีนกับแมลงศัตรูพืช. Alignments ถูกสร้างขึ้นเพื่อเปรียบเทียบเบื่อหน่ายลำดับของยีนจากไม้สักกับคนอื่น ๆ จากพืช . ผลการยืนยันสถานที่ตั้งของยีนในไม้สักรวมทั้งจุดเริ่มต้นที่มีศักยภาพและหยุด codons และ introns. ข้อมูลนี้อาจนำมารวมกับการค้นพบของความหลากหลายในไม้สักสำหรับการวิจัยในอนาคตเช่นการออกแบบของเครื่องหมายดีเอ็นเอที่ใช้ในการเรียนการทำงานและมรดกของ ยีนเหล่านี้

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

ไม้สัก ( ต้นสัก Linn . ) เป็นป่าที่สำคัญต้นไม้ไทย มูลค่าของไม้ ไม้สัก เป็นป้องกันป้องกันปลวก ( coptotermes gestroi ) โจมตี อย่างไรก็ตามไม้สักประสบจากแมลงศัตรูพืช การให้อาหารทางใบ( ในหมู่พวกเขา และการให้บริการตามสัญญา skeletonizer ไม้สักไม้สัก ) และยิง ( ไม้สักยิงหนอน ) ซึ่งนำไปสู่การสูญเสียการเจริญเติบโตและลดคุณค่าของไม้ ดังนั้นโครงงานนี้จึงได้ให้รวบรวมยีนที่ถูกแสดงจะเกี่ยวข้องกับความต้านทานต่อแมลงศัตรูพืชต่าง ๆพืชและการค้นพบยีนที่เกี่ยวข้องในไม้สักการค้นหาข้อมูลทรัพยากร Arabidopsisยีนที่ถูกแสดงอยู่ในแมลงความต้านทานและสอดคล้องกันดังนี้นะครับ( ซีดี ) ถูกดึงมา การใช้ blastn รายการต้องการค้นหาที่คล้ายกันนะครับ ลำดับที่ได้มาจากพืชชนิด phylogenetically อย่างใกล้ชิดที่เกี่ยวข้องกับไม้สัก ใน( ncbi ฐานข้อมูลและฐานข้อมูล ( EST ) เหล่านี้แล้วใช้เรียกลำดับจีโนม ไม้สักภูมิภาค ( นั่งร้าน ) จากไม้สักประกอบโดยใช้จีโนมblastn . ใช้โปรแกรมออกัสตัสทำนายยีนรหัสภูมิภาคในเลือกนั่งร้านซึ่งมีผลในการค้นพบยีนสูงเจ็ดความคล้ายคลึงกับยีนที่ต้านทานต่อแมลงศัตรูพืชการสร้างการเปรียบเทียบยีนที่ลำดับของยีนจากไม้สักจากอื่น ๆพืช ผลที่ได้รับการยืนยันตำแหน่งของยีนในไม้สัก รวมทั้งเริ่มและหยุดและศักยภาพ ras introns .ข้อมูลนี้อาจจะรวมกับการค้นพบความหลากหลายในไม้สักสำหรับอนาคตของการวิจัย เช่นการออกแบบดีเอ็นเอเครื่องหมายเพื่อศึกษาหน้าที่และตามมรดกของยีนเหล่านี้