Abstract
The major energy currency molecule of the cell, ATP, is evaluated in the context of creationism. This complex molecule is critical for all life from the simplest to the most complex. It is only one of millions of enormously intricate nanomachines that needs to have been designed in order for life to exist on earth. This motor is an excellent example of irreducible complexity because it is necessary in its entirety in order for even the simplest form of life to survive.
Introduction
IIn order to function, every machine requires specific parts such as screws, springs, cams, gears, and pulleys. Likewise, all biological machines must have many well-engineered parts to work. Examples include units called organs such as the liver, kidney, and heart. These complex life units are made from still smaller parts called cells which in turn are constructed from yet smaller machines known as organelles. Cell organelles include mitochondria, Golgi complexes, microtubules, and centrioles. Even below this level are other parts so small that they are formally classified as macromolecules (large molecules).
Fig. 1. Views of ATP and related structures.
A critically important macromolecule—arguably “second in importance only to DNA”—is ATP. ATP is a complex nanomachine that serves as the primary energy currency of the cell (Trefil, 1992, p.93). A nanomachine is a complex precision microscopic-sized machine that fits the standard definition of a machine. ATP is the “most widely distributed high-energy compound within the human body” (Ritter, 1996, p. 301). This ubiquitous molecule is “used to build complex molecules, contract muscles, generate electricity in nerves, and light fireflies. All fuel sources of Nature, all foodstuffs of living things, produce ATP, which in turn powers virtually every activity of the cell and organism. Imagine the metabolic confusion if this were not so: Each of the diverse foodstuffs would generate different energy currencies and each of the great variety of cellular functions would have to trade in its unique currency” (Kornberg, 1989, p. 62).
ATP is an abbreviation for adenosine triphosphate, a complex molecule that contains the nucleoside adenosine and a tail consisting of three phosphates. (See Figure 1 for a simple structural formula and a space filled model of ATP.) As far as known, all organisms from the simplest bacteria to humans use ATP as their primary energy currency. The energy level it carries is just the right amount for most biological reactions. Nutrients contain energy in low-energy covalent bonds which are not very useful to do most of kinds of work in the cells.
These low energy bonds must be translated to high energy bonds, and this is a role of ATP. A steady supply of ATP is so critical that a poison which attacks any of the proteins used in ATP production kills the organism in minutes. Certain cyanide compounds, for example, are poisonous because they bind to the copper atom in cytochrome oxidase. This binding blocks the electron transport system in the mitochondria where ATP manufacture occurs (Goodsell, 1996, p.74).
How ATP Transfers Energy
Energy is usually liberated from the ATP molecule to do work in the cell by a reaction that removes one of the phosphate-oxygen groups, leaving adenosine diphosphate (ADP). When the ATP converts to ADP, the ATP is said to be spent. Then the ADP is usually immediately recycled in the mitochondria where it is recharged and comes out again as ATP. In the words of Trefil (1992, p. 93) “hooking and unhooking that last phosphate [on ATP] is what keeps the whole world operating.”
The enormous amount of activity that occurs inside each of the approximately one hundred trillion human cells is shown by the fact that at any instant each cell contains about one billion ATP molecules. This amount is sufficient for that cell’s needs for only a few minutes and must be rapidly recycled. Given a hundred trillion cells in the average male, about 1023 or one sextillion ATP molecules normally exist in the body. For each ATP “the terminal phosphate is added and removed 3 times each minute” (Kornberg, 1989, p. 65).
The total human body content of ATP is only about 50 grams, which must be constantly recycled every day. The ultimate source of energy for constructing ATP is food; ATP is simply the carrier and regulation-storage unit of energy. The average daily intake of 2,500 food calories translates into a turnover of a whopping 180 kg (400 lbs) of ATP (Kornberg, 1989, p. 65).
The Structure of ATP
ATP contains the purine base adenine and the sugar ribose which together form the nucleoside adenosine. The basic building blocks used to construct ATP are carbon, hydrogen, nitrogen, oxygen, and phosphorus which are assembled in a complex that contains the number of subatomic parts equivalent to over 500 hydrogen atoms. One phosphate ester bond and two phosphate anhydride bonds hold the three phosphates (PO4) and the ribose together. The construction also contains a b-N glycoside bond holding the ribose and the adenine together.
Fig. 2. The two-dimensional stick model of the adenosine phosphate family of molecules, showing the atom and bond arrangement.
Phosphates are well-known high-energy molecules, meaning that comparatively high levels of energy are released when the phosphate groups are removed. Actually, the high energy content is not the result of simply the phosphate bond but the total interaction of all the atoms within the ATP molecule.
Because the amount of energy released when the phosphate bond is broken is very close to that needed by the typical biological reaction, little energy is wasted. Generally, ATP is connected to another reaction—a process called coupling which means the two reactions occur at the same time and at the same place, usually utilizing the same enzyme complex. Release of phosphate from ATP is exothermic (a reaction that gives off heat) and the reaction it is connected to is endothermic (requires energy input in order to occur). The terminal phosphate group is then transferred by hydrolysis to another compound, a process called phosphorylation, producing ADP, phosphate (Pi) and energy.
The self-regulation system of ATP has been described as follows:
The high-energy bonds of ATP are actually rather unstable bonds. Because they are unstable, the energy of ATP is readily released when ATP is hydrolyzed in cellular reactions. Note that ATP is an energy-coupling agent and not a fuel. It is not a storehouse of energy set aside for some future need. Rather it is produced by one set of reactions and is almost immediately consumed by another. ATP is formed as it is needed, primarily by oxidative processes in the mitochondria. Oxygen is not consumed unless ADP and a phosphate molecule are available, and these do not become available until ATP is hydrolyzed by some energy-consuming process. Energy metabolism is therefore mostly self-regulating (Hickman, Roberts, and Larson, 1997, p.43). [Italics mine]
ATP is not excessively unstable, but it is designed so that its hydrolysis is slow in the absence of a catalyst. This insures that its stored energy is “released only in the presence of the appropriate enzyme” (McMurry and Castellion, 1996, p. 601).
The Function of ATP
The ATP is used for many cell functions including transport work moving substances across cell membranes. It is also used for mechanical work, supplying the energy needed for muscle contraction. It supplies energy not only to heart muscle (for blood circulation) and skeletal muscle (such as for gross body movement), but also to the chromosomes and flagella to enable them to carry out their many functions. A major role of ATP is in chemical work, supplying the needed energy to synthesize the multi-thousands of types of macromolecules that the cell needs to exist.
ATP is also used as an on-off switch both to control chemical reactions and to send messages. The shape of the protein chains that produce the building blocks and other structures used in life is mostly determined by weak chemical bonds that are easily broken and remade. These chains can shorten, lengthen, and change shape in response to the input or withdrawal of energy. The changes in the chains alter the shape of the protein and can also alter its function or cause it to become either active or inactive.
The ATP molecule can bond to one part of a protein molecule, causing another part of the same molecule to slide or move slightly which causes it to change its conformation, inactivating the molecule. Subsequent removal of ATP causes the protein to return to its original shape, and thus it is again functional. The cycle can be repeated until the molecule is recycled, effectively serving as an on and off switch (Hoagland and Dodson, 1995, p.104). Both adding a phosphorus (phosphorylation) and removing a phosphorus from a protein (dephosphorylation) can serve as either an on or an off switch.
How is ATP Produced?
ATP is manufactured as a result of several cell processes including fermentation, respiration and photosynthesis. Most commonly the cells use ADP as a precursor molecule and then add a phosphorus to it. In eukaryotes this can occur either in the soluble portion of the cytoplasm (cytosol) or in special energy-producing structures called mitochondria. Charging ADP to form ATP in the mitochondria is called chemiosmotic phosphorylation. This process occurs in specially constructed chambers located in the mitochondrion’s inner membranes.
Fig. 3. An outline of the ATP-synthase macromolecule showing its subunits and nanomachine traits. ATP-synthase converts ADP into ATP, a process called charging. Shown behind ATP-synthase is the membrane in which the ATP-synthase is mounted. For the ATP that is charged in the mitochondria, ATP-synthase is located in the inner membrane.
The mitochondrion itself functions to produce an electrical chemical gradient—somewhat like a battery
บทคัดย่อโมเลกุลสกุลพลังงานหลักของเซลล์ ATP รับการประเมินในบริบทของการทรงสร้างตามพระ โมเลกุลที่ซับซ้อนนี้เป็นสิ่งสำคัญสำหรับชีวิตทั้งหมดจากง่ายที่สุดจะซับซ้อนมากที่สุด มันเป็นเพียงหนึ่งในล้านของ nanomachines ซับซ้อนมหาศาลที่ต้องได้รับการออกแบบเพื่อให้ชีวิตอยู่บนโลก มอเตอร์นี้เป็นตัวอย่างที่ดีของความซับซ้อนอย่างต่ำเนื่องจากมีความจำเป็นทั้งหมดในใบสั่งสำหรับแม้แต่รูปแบบที่ง่ายที่สุดของชีวิตเพื่อความอยู่รอดแนะนำสั่งสองฟังก์ชัน ทุกเครื่องจำเป็นเฉพาะส่วน เช่นสกรู สปริง กล้อง เกียร์ รอก ในทำนองเดียวกัน ชีวภาพทุกเครื่องต้องมีหลายห้องพักออกแบบส่วนการทำงาน ตัวอย่างเช่นหน่วยที่เรียกว่าอวัยวะ เช่นตับ ไต หัวใจ หน่วยชีวิตที่ซับซ้อนเหล่านี้จะทำจากส่วนที่เรียกว่าเซลล์ซึ่งจะถูกสร้างจากเครื่องยังมีขนาดเล็กที่เรียกว่า organelles ยังเล็ก Organelles เซลล์มี mitochondria, Golgi คอมเพล็กซ์ microtubules และ centrioles ต่ำกว่าระดับนี้แม้มีส่วนอื่น ๆ ขนาดเล็กเพื่อให้พวกเขาอย่างเป็นกิจจะลักษณะจัดเป็น macromolecules (โมเลกุลขนาดใหญ่)Fig. 1 มุมมองของ ATP และโครงสร้างที่เกี่ยวข้องMacromolecule มิสำคัญตัวว่า "สองความสำคัญเฉพาะกับดีเอ็นเอ" — เป็น ATP Nanomachine ซับซ้อนที่เป็นสกุลเงินหลักพลังงานของเซลล์ คือ ATP (Trefil, 1992, p.93) Nanomachine มีความซับซ้อนด้วยกล้องจุลทรรศน์ขนาดเครื่องที่เหมาะสมกับข้อกำหนดมาตรฐานของเครื่อง ATP คือ "วางจำหน่ายอย่างแพร่หลาย high-energy บริเวณภายในร่างกายมนุษย์" (ริทเตอร์ 1996, p. 301) โมเลกุลนี้แพร่หลายเป็น "ใช้ในการสร้างโมเลกุลที่ซับซ้อน สัญญากล้ามเนื้อ สร้างไฟฟ้าในเส้นประสาท และแสงหิ่งห้อย ทั้งหมดแหล่งเชื้อเพลิงธรรมชาติ อาหารทั้งหมดของสิ่งมีชีวิต ผลิต ATP ซึ่งอำนาจในแทบทุกกิจกรรมของเซลล์และสิ่งมีชีวิต คิดสับสนเผาผลาญถ้าไม่เพื่อ: ของกินหลากหลายจะสร้างสกุลเงินพลังงานแตกต่างกัน และหลากหลายฟังก์ชั่นโทรศัพท์มือถือจะมีค้าในสกุลเงินเฉพาะที่ " (Kornberg, 1989, p. 62)ATP เป็นอะดีโนซีนไตรฟอสเฟต โมเลกุลซับซ้อนที่ประกอบด้วยอะดี nucleoside และหางประกอบด้วยฟอสเฟต 3 (ดูรูปที่ 1 สูตรโครงสร้างง่าย ๆ และช่องเติมของ ATP) เป็นที่รู้จักกัน สิ่งมีชีวิตทั้งหมดจากแบคทีเรียที่ง่ายที่สุดเพื่อมนุษย์ใช้ ATP เป็นสกุลเงินหลักพลังงาน ระดับพลังงานที่จะดำเนินเป็นเพียงเหมาะสำหรับปฏิกิริยาทางชีวภาพมากที่สุด สารอาหารที่ประกอบด้วยพลังงานในพลังงานต่ำพันธบัตรโคเวเลนต์ที่ไม่มีประโยชน์มากเมื่อต้องการทำส่วนใหญ่ในเซลล์ของพลังงานต่ำพันธบัตรเหล่านี้ต้องแปลเป็นพันธบัตรพลังงานสูง และเป็นบทบาทของ ATP อุปทานคงที่ของ ATP ดังนั้นสำคัญว่า พิษซึ่งโจมตีของโปรตีนที่ใช้ในการผลิต ATP ฆ่าสิ่งมีชีวิตที่ในนาทีนั้น สารประกอบไซยาไนด์บางอย่าง เช่น มีพิษเนื่องจากพวกเขาผูกกับอะตอมทองแดงใน cytochrome oxidase ระบบขนส่งอิเล็กตรอนใน mitochondria ที่ผลิต ATP เกิดบล็อกนี้รวม (Goodsell, 1996, p.74) วิธี ATP โอนพลังงานพลังงานเป็นปกติเมื่อพ้นโมเลกุล ATP ในการทำงานในเซลล์ โดยปฏิกิริยาที่เอาหนึ่งในกลุ่มฟอสเฟตออกซิเจน ออกอะดี diphosphate (ADP) เมื่อ ATP แปลง ADP, ATP ได้กล่าวว่า การใช้ แล้วทันทีมักจะมีการรีไซเคิล ADP ใน mitochondria ซึ่งเป็น recharged และมาออกอีกเป็น ATP ในคำพูดของ Trefil (1992, p. 93) "สะดวก และ unhooking ฟอสเฟตล่าสุด [ใน ATP] ว่าอะไรทำให้โลกทั้งโลกการทำงาน"จำนวนกิจกรรมที่เกิดขึ้นภายในเซลล์ของมนุษย์ประมาณหนึ่งร้อยแสนล้านแต่ละ ขนาดใหญ่จะแสดงความจริงว่า ที่ใด ๆ ทันที แต่ละเซลล์ประกอบด้วยโมเลกุล ATP ประมาณหนึ่งพันล้าน ยอดเงินนี้เพียงพอสำหรับความต้องการของเซลล์เพียงไม่กี่นาที และต้องรีไซเคิลอย่างรวดเร็ว ให้เซลล์ล้านล้านเป็นร้อยในเพศชายเฉลี่ย เกี่ยวกับ sextillion 1023 หรือหนึ่ง ATP โมเลกุลปกติมีอยู่ในร่างกาย สำหรับ ATP แต่ละ "ฟอสเฟตเทอร์มินัลถูกเพิ่ม และเอาออก 3 ครั้งแต่ละนาที" (Kornberg, 1989, p. 65)ร่างกายมนุษย์รวมเนื้อหาของ ATP เท่านั้นประมาณ 50 กรัม ซึ่งต้องนำกลับมาใช้อย่างต่อเนื่องทุกวัน แหล่งที่ดีที่สุดของพลังงาน ATP ที่สร้างเป็นอาหาร ATP เป็นเพียงบริษัทขนส่งและจัดเก็บระเบียบหน่วยของพลังงาน การบริโภคประจำวันโดยเฉลี่ยของแคลอรี่อาหาร 2500 แปลเป็นการหมุนเวียนของการประวัติการ 180 กิโลกรัม (400 ปอนด์) ของ ATP (Kornberg, 1989, p. 65)โครงสร้างของ ATPATP ประกอบด้วย adenine ฐาน purine และ ribose น้ำตาลซึ่งแบบอะดี nucleoside การสร้างบล็อกพื้นฐานที่ใช้สร้าง ATP คือ คาร์บอน ไฮโดรเจน ไนโตรเจน ออกซิเจน และฟอสฟอรัสซึ่งประกอบในคอมเพล็กซ์ที่ประกอบด้วยหมายเลขของส่วนเท่ากับ 500 กว่าไฮโดรเจนอะตอม subatomic ฟอสเฟตหนึ่งเอสตราสารหนี้และพันธบัตร anhydride ฟอสเฟตสองสมานฟอสเฟต 3 (PO4) และ ribose การก่อสร้างยังประกอบด้วยพันธบัตร b N glycoside ถือ ribose และ adenine ร่วมกันFig. 2 แบบไม้สองครอบครัวฟอสเฟตอะดีของโมเลกุล การแสดงการจัดเรียงอะตอมและพันธะฟอสเฟตมีโมเลกุล high-energy รู้จัก หมายความ ว่า ระดับสูงที่ดีอย่างหนึ่งของพลังงานที่ปล่อยออกมาเมื่อกลุ่มฟอสเฟตจะถูกเอาออก จริง เนื้อหาพลังงานสูงได้ผลเพียงพันธะฟอสเฟตแต่การโต้ตอบทั้งหมดของอะตอมภายในโมเลกุล ATPเนื่องจากจำนวนของพลังงานที่ปล่อยออกมาเมื่อมีการละเมิดพันธะฟอสเฟตมากกับที่จำเป็น โดยทั่วไปปฏิกิริยาชีวภาพ เป็นการสิ้นเปลืองพลังงานน้อย ทั่วไป การเชื่อมต่อของ ATP กับปฏิกิริยาอื่นซึ่งเป็นกระบวนการที่เรียกว่า coupling ซึ่งหมายถึง ปฏิกิริยาที่ 2 เกิดขึ้น ในเวลาเดียวกัน และ ที่ ตำแหน่งเดียวกัน มักใช้เอนไซม์เดียวซับซ้อน ปล่อยของฟอสเฟตจาก ATP เป็น exothermic (ปฏิกิริยาที่ความร้อน) และเชื่อมปฏิกิริยาดูดความร้อน (ต้องป้อนข้อมูลเพื่อให้เกิดพลังงาน) กลุ่มฟอสเฟตเทอร์มินัลอยู่แล้ว ด้วยไฮโตรไลซ์กับสารประกอบอื่น เป็นกระบวนการที่เรียกว่า phosphorylation ผลิต ADP ฟอสเฟต (Pi) และพลังงานรายละเอียดระบบควบคุมตนเองของ ATP ดัง:พันธบัตร high-energy ของ ATP มีพันธบัตรจริงค่อนข้างเสถียร เนื่องจากไม่เสถียร พลังงาน ATP พร้อมออกเมื่อมี hydrolyzed ATP ในเซลล์ปฏิกิริยา ทราบว่า ATP เป็นตัวแทนคลัปพลังงานและเชื้อเพลิงไม่ มันไม่ใช่บ้านดองบางอย่างในอนาคตความต้องการพลังงาน ค่อนข้างมันผลิต โดยปฏิกิริยาหนึ่งชุด และมีการบริโภค โดยอีกเกือบจะทันที ATP จะเกิดขึ้น ตามความจำเป็น เป็นหลัก ด้วยกระบวนการ oxidative ใน mitochondria ไม่มีใช้ออกซิเจนยกเว้นมี ADP และโมเลกุลฟอสเฟต และเหล่านี้ไม่พร้อมใช้งานจนกระทั่งเป็น hydrolyzed ATP ด้วยกระบวนการที่พลังงานบาง เผาผลาญพลังงานดังนั้นส่วนใหญ่เป็นกำกับดูแลตนเอง (Hickman โรเบิตส์ และ Larson, 1997, p.43) [เอียงเหมือง]ATP ไม่เสถียรมากเกินไป แต่มันถูกออกแบบมาเพื่อให้ไฮโตรไลซ์ความช้าของตัวเศษ นี้มั่นใจได้ว่า พลังงานเก็บไว้ "ปล่อยเฉพาะในต่อหน้าของเอนไซม์ที่เหมาะสม" (McMurry และ Castellion, 1996, p. 601)การทำงานของ ATPATP ถูกใช้สำหรับการทำงานเซลล์มากมายรวมทั้งงานขนย้ายสารผ่านเยื่อหุ้มเซลล์ นอกจากนี้ยังใช้สำหรับงานเครื่องจักรกล การจัดหาพลังงานที่จำเป็นสำหรับการหดตัวของกล้ามเนื้อ ส่งพลังงานไม่เท่ากับกล้ามเนื้อหัวใจ (การไหลเวียนของเลือด) อีกกล้ามเนื้อ (เช่นสำหรับการเคลื่อนไหวร่างกายขั้นต้น), แต่ยังรวมถึง chromosomes และ flagella จะทำให้สามารถปฏิบัติหน้าที่ใน บทบาทหลักของ ATP ในงานเคมี การจัดหาพลังงานต้องสังเคราะห์มากมายหลายชนิดของ macromolecules ที่เซลล์ต้องมีได้ยังจะใช้ ATP เป็นสวิตช์ปิดควบคุมปฏิกิริยาเคมี ทั้งส่งข้อความ ส่วนใหญ่มีกำหนดรูปร่างของโซ่โปรตีนที่ทำให้เกิดการสร้างบล็อกและโครงสร้างอื่น ๆ ที่ใช้ในชีวิต โดยพันธบัตรเคมีอ่อนที่เสียง่าย และ remade กลุ่มเหล่านี้สามารถทำให้สั้นลง ยืด กเปลี่ยนรูปร่างเป็นการป้อนข้อมูลหรือถอนพลังงาน การเปลี่ยนแปลงในห่วงโซ่การเปลี่ยนรูปร่างของโปรตีน และสามารถยังเปลี่ยนหน้าที่ หรือทำให้กลายเป็นใช้งานอยู่ หรือไม่ โมเลกุล ATP สามารถตราสารหนี้ส่วนหนึ่งของโมเลกุลโปรตีน ทำให้ส่วนอื่นของโมเลกุลเดียวเลื่อน หรือย้ายเล็กน้อยซึ่งทำให้เปลี่ยน conformation ของ ยกโมเลกุล ต่อมาเอาของ ATP ทำให้โปรตีนกลับสู่สภาพเดิม และดังนั้น จึงเป็นอีกงาน วงจรสามารถทำซ้ำได้จนกว่าโมเลกุลจะรีไซเคิล ให้บริการอย่างมีประสิทธิภาพเป็นการเปิด และ ปิดสวิตช์ (Hoagland และ Dodson, 1995, p.104) เพิ่มฟอสฟอรัส (phosphorylation) และฟอสฟอรัสเอาออกจากโปรตีน (dephosphorylation) สามารถทำหน้าที่เป็นตัวบน หรือสลับการออกได้วิธีคือผลิต ATPมีผลิต ATP จากกระบวนการเซลล์ต่าง ๆ รวมทั้งการหมัก การหายใจ และการสังเคราะห์ด้วยแสง ทั่วเซลล์ใช้ ADP โมเลกุลสารตั้งต้น และเพิ่มฟอสฟอรัสที่จะ ใน eukaryotes นี้สามารถเกิดขึ้นได้ทั้ง ในส่วนของไซโทพลาซึม (ไซโตซอล) ละลาย หรือ ในพิเศษผลิตพลังงานโครงสร้างเรียกว่า mitochondria ชาร์จ ADP ฟอร์ม ATP ใน mitochondria ถูกเรียกว่า chemiosmotic phosphorylation กระบวนการนี้เกิดขึ้นในหอสร้างพิเศษอยู่ในเยื่อหุ้มภายในของ mitochondrionFig. 3 เค้า macromolecule ATP synthase แสดง subunits ความลักษณะ nanomachine ATP synthase แปลง ADP ให้เป็น ATP กระบวนการที่เรียกว่าชาร์จ แสดงหลัง ATP synthase เป็นเยื่อที่ติด ATP synthase สำหรับ ATP ที่คิดใน mitochondria, ATP synthase อยู่ในเยื่อหุ้มภายในMitochondrion เองฟังก์ชั่นการผลิตการไล่ระดับสีเคมีไฟฟ้า — เช่นแบตเตอรี่ค่อนข้าง
การแปล กรุณารอสักครู่..
