2.2. Target Preparation and Validat

2.2. Target Preparation and Validation of Docking Method
The three dimensional structure of glycogen phosphorylase was obtained from Brookhaven protein databank
(PDB ID: 1LWO). The docking study was started with the definition of a binding site, in general a restricted region
of the protein. The size and location of this binding site was visualized in PyMOL. The protein target were further
validated with AutoDock Vina in PyRx 0.8 by RMSD value determination8
.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

2.2. การเตรียมและตรวจสอบการเชื่อมต่อวิธีการกำหนดเป้าหมายสามมิติโครงสร้างของไกลโคเจน phosphorylase มาจากสกายวอล์คเกอร์กลับโปรตีนท่อง(PDB ID: 1LWO) การศึกษาเชื่อมต่อเริ่มต้น ด้วยคำจำกัดความของเว็บไซต์รวม ทั่วไปภูมิภาคจำกัดของโปรตีน ขนาดและที่ตั้งของเว็บไซต์นี้ผูกถูกแสดงเป็นภาพใน PyMOL โปรตีนเป้าหมายถูกเพิ่มเติมการตรวจสอบกับวีนา AutoDock ใน PyRx 0.8 โดย determination8 ค่า RMSD.

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

2.2 การเตรียมการกำหนดเป้าหมายและการตรวจสอบของวิธีการเชื่อมต่อ
โครงสร้างสามมิติของไกลโคเจนโฟสที่ได้รับจาก Brookhaven Databank โปรตีน
(PDB ID: 1LWO) การศึกษาเทียบท่าเริ่มต้นด้วยคำนิยามของเว็บไซต์ที่มีผลผูกพันโดยทั่วไปเป็นพื้นที่ จำกัด
ของโปรตีน ขนาดและที่ตั้งของเว็บไซต์ที่มีผลผูกพันนี้ที่มองเห็นใน PyMOL เป้าหมายของโปรตีนที่ถูกต่อ
การตรวจสอบกับ AutoDock Vina ใน PyRx 0.8 โดยมูลค่า RMSD
determination8

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

2.2 . การเตรียมการสำหรับวิธีการและเป้าหมายสามมิติโครงสร้างของไกลโคเจนฟอ ฟรีเลสได้จาก Brookhaven โปรตีน databank( ID : 1lwo GAS ) การเชื่อมต่อการศึกษาเริ่มต้นด้วยคำนิยามของเว็บไซต์ผูกพัน โดยทั่วไปเขตจำกัดของโปรตีน ขนาดและตำแหน่งของเว็บไซต์นี้คือการมองเห็นในการ pymol . โปรตีนเป้าหมายที่ถูกเพิ่มเติมตรวจสอบด้วย autodock Hotel ใน pyrx 0.8 โดย determination8 ค่า rmsd.