85. Establishment of cDNA library a

85. Establishment of cDNA library and EST analysis from leaves of Phyllanthus amarus
By Chattopadhyay, Sharmila; Ghosh, Aparupa Bose Mazumdar
From International Journal of Biochemistry Research & Review (2014), 4(1), 1-15, 15 pp.. Language: English,
Database: CAPLUS, DOI:10.9734/IJBCRR/2014/5262
DNA sequencing of randomly chosen clones from a cDNA library allows thousands of different transcripts to be identified.
However, since the likelihood of observing a given transcript is proportional to the expression level of that transcript in the
tissue from which the library is derived, often transcripts are represented by several EST sequences. An expressed
sequence tags (EST) anal. was undertaken to identify the genes present in the leaves of Phyllanthus amarus, which is a
small tropical, glabrous herb with several health benefits. Phyllanthin and hypophyllanthin, major bioactive components,
present in highest amts. in the leaves, are of significant therapeutic importance like hepatoprotective, antioxidant,
antiviral, hypoglycemic, etc. Taken together, sequencing of cDNA clones generated high-quality ESTs with high
similarities with genes from Ricinus communis, Onchocerca volvulus, Eucalyptus globules, Gossypium hirsutum,
Nicotiana tabacum, Solanum spp. and many more. A BLASTN anal. along with BLASTX anal. of all the unique
sequences was performed and was grouped according to the reported activities. Results represented here is the first ref.
collection of ESTs from this com. important medicinal herb. This study indicated that the leaf transcriptome contains
series of interesting sequences like ALBINO3, ribulose-1,5 bisphosphate carboxylase/oxygenase (RUBISCO),
chloroplast photosystem II chlorophyll A/B-binding protein, stress-responsive proteins like methionine sulfoxide reductase
type, etc. EST data have been submitted to the GenBank/EMBL/DDBJ database under the accession nos. JK492908-
JK492964.
~0 Citings

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

85. การจัดตั้งห้องสมุด cDNA และ EST การวิเคราะห์จากใบ Phyllanthus amarusโดย Chattopadhyay, Sharmila Ghosh, Bose Mazumdar อะปารูปาจากวารสารนานาชาติของการวิจัยทางชีวเคมีและรีวิว (2014), 4(1), 1-15, 15 pp ... ภาษา: ภาษาอังกฤษฐานข้อมูล: CAPLUS, DOI:10.9734/IJBCRR/2014/5262ลำดับดีเอ็นเอของโคลนที่สุ่มเลือกจากห้องสมุด cDNA พันใบแตกต่างกันจะระบุได้อย่างไรก็ตาม ตั้งแต่โอกาสการสังเกต เสียงบรรยายกำหนดเป็นสัดส่วนกับระดับนิพจน์นั้นเสียงบรรยายในการเนื้อเยื่อจากที่ไลบรารีมา ใบมักจะแสดง โดยหลาย EST ลำดับ การแสดงลำดับแท็ก (EST) ทวาร เพื่อระบุยีนที่อยู่ในใบของ Phyllanthus amarus ซึ่งเป็นการขนาดเล็กเขตร้อน glabrous สมุนไพร มีประโยชน์ต่อสุขภาพหลาย Phyllanthin และ hypophyllanthin ส่วนประกอบออกฤทธิ์ทางชีวภาพที่สำคัญปัจจุบันในสูงสุดจำนวนในใบ มีความสำคัญรักษาสำคัญเช่น hepatoprotective สารต้านอนุมูลอิสระต้านไวรัส ลดน้ำตาลในเลือด ฯลฯ นำมารวมกัน ลำดับของ cDNA โคลนสร้าง ESTs คุณภาพสูงความคล้ายคลึงกันกับยีน Ricinus communis, Onchocerca volvulus, globules ยูคาลิปตัส วิธีการใช้ hirsutumNicotiana tabacum, Solanum ออกซิเจน และอื่น ๆ อีกมากมาย BLASTN ทางทวารหนัก พร้อมกับ BLASTX ทางทวารหนัก ทั้งหมดไม่ซ้ำกันลำดับการดำเนินการ และถูกจัดกลุ่มตามกิจกรรมที่รายงาน ผลลัพธ์ที่แสดงที่นี่เป็นการอ้างอิงครั้งแรกคอลเลกชันของ ESTs จากสมุนไพรนี้รักษาสำคัญ com. การศึกษานี้ระบุว่า transcriptome ใบประกอบด้วยชุดของลำดับที่น่าสนใจเช่น ALBINO3, 1.5 ribulose bisphosphate carboxylase/oxygenase (RUBISCO),คลอโรพลาสต์ photosystem II เล่มหนังสือคลอโรฟิลล์ A-B โปรตีน โปรตีนที่ตอบสนองต่อความเครียดเช่นเมไทโอนีน sulfoxide ไซด์ชนิด ฯลฯ ข้อมูล EST ได้ถูกส่งไปฐานข้อมูลฐานข้อมูล GenBank/EMBL/DDBJ หมายเลขทะเบียน JK492908-JK492964~ 0 Citings

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

85. การจัดตั้งห้องสมุด cDNA และการวิเคราะห์ EST จากใบ Phyllanthus amarus
โดย Chattopadhyay, Sharmila; กอช Aparupa โบ Mazumdar
จากวารสารนานาชาติชีวเคมีวิจัยและรีวิว (2014), 4 (1), 1-15, 15 PP .. ภาษา: English,
ฐานข้อมูล CAPLUS ดอย: 10.9734 / IJBCRR / 2014/5262
ลำดับดีเอ็นเอของ โคลนสุ่มเลือกจากห้องสมุด cDNA ช่วยให้พันของยีนที่แตกต่างกันที่จะระบุ.
อย่างไรก็ตามเนื่องจากโอกาสในการสังเกตหลักฐานให้เป็นสัดส่วนกับระดับการแสดงออกของหลักฐานว่าใน
เนื้อเยื่อจากการที่ห้องสมุดที่ได้มามักจะถอดเสียงโดยมีตัวแทน ลำดับ EST หลาย แสดง
แท็กลำดับ (EST) ทางทวารหนัก ได้ดำเนินการในการระบุยีนที่อยู่ในใบของ Phyllanthus amarus ซึ่งเป็นที่
เล็ก ๆ ในเขตร้อนสมุนไพรหัวล้านมีประโยชน์ต่อสุขภาพหลาย Phyllanthin และ hypophyllanthin, ส่วนประกอบออกฤทธิ์ทางชีวภาพที่สำคัญ
ในปัจจุบัน AMTs สูงสุด ในใบที่มีความสำคัญในการรักษาอย่างมีนัยสำคัญเช่นตับ, สารต้านอนุมูลอิสระ
ต้านไวรัสลดน้ำตาลในเลือดและอื่น ๆ ที่ร่วมกันจัดลำดับของโคลนยีนที่สร้าง ESTs คุณภาพสูงที่มีสูง
มีลักษณะคล้ายคลึงกับยีนจาก Ricinus communis, Onchocerca volvulus ข้นยูคาลิป, Gossypium hirsutum,
Nicotiana tabacum มะเขือเอสพีพี และอื่น ๆ อีกมากมาย. ทางทวารหนักดังกล่าวหา พร้อมกับ BLASTX ทางทวารหนัก ของทุกคนที่ไม่ซ้ำกัน
ลำดับที่ได้ดำเนินการและได้รับการจัดกลุ่มตามกิจกรรมรายงาน ผลการแสดงที่นี่เป็นครั้งแรกที่ได้รับเตะ.
คอลเลกชันของโคลนจาก Com นี่ สมุนไพรที่สำคัญ การศึกษาครั้งนี้ชี้ให้เห็นว่ายีนใบมี
ชุดของลำดับที่น่าสนใจเช่น ALBINO3, ribulose-1,5 bisphosphate คาร์บอกซิ / oxygenase (RUBISCO)
photosystem II chloroplast คลอโรฟิล A / B-binding protein โปรตีนความเครียดตอบสนองเช่น methionine sulfoxide reductase
ชนิด ฯลฯ . ข้อมูล EST ได้ถูกส่งไปยังฐานข้อมูลของ GenBank / EMBL / DDBJ ภายใต้การภาคยานุวัติ Nos JK492908-
JK492964.
~ 0 Citings

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

85 . การจัดตั้งห้องสมุด cDNA จากใบและการวิเคราะห์สาร amarus ���โดย chattopadhyay sharmila ; ghosh , aparupa mazumdar โบส ,จากวารสารการวิจัยชีวเคมี และการทบทวน ( 2014 ) , 4 ( 1 ) , 1-15 , 15 . . ภาษา : ภาษาอังกฤษฐานข้อมูล : caplus , ดอย : 10.9734/ijbcrr/2014/5262การสุ่มเลือกโคลนจากห้องสมุด cDNA ของยีนที่แตกต่างกันช่วยให้หลายพันเพื่อระบุดีเอ็นเออย่างไรก็ตาม เนื่องจากโอกาสของการสังเกตให้หลักฐานได้สัดส่วนกับระดับการแสดงออกของที่บันทึกในเนื้อเยื่อที่ห้องสมุดได้มาใบมักจะแสดงโดยหลาย EST ลำดับ เป็นการแสดงลำดับ ( EST ) , ทวารหนัก มีวัตถุประสงค์เพื่อศึกษายีนอยู่ในใบของสาร amarus ซึ่งเป็นขนาดเล็กเขตร้อน glabrous สมุนไพรที่มีประโยชน์ต่อสุขภาพหลาย phyllanthin hypophyllanthin และ ส่วนประกอบ สารสําคัญอยู่ใน amts สูงสุด ในใบจะพบว่าผู้ที่สำคัญ เช่น ป้องกันสาร ,ฤทธิ์ต้านเบาหวาน ฯลฯ , ถ่ายด้วยกันการโคลน cDNA ที่สร้างฐานข้อมูลที่มีคุณภาพสูงความคล้ายคลึงกับยีนจาก ricinus communis onchocerca volvulus , ยูคา , เม็ดฝ้าย , ,ยาสูบ ( พืช ) โซลานัม spp . , และอีกมากมาย เป็น blastn ทวารหนัก พร้อมกับ blastx ทวารหนัก ทั้งหมดเฉพาะลำดับการปฏิบัติและถูกจัดกลุ่มตามการรายงานกิจกรรม ผลลัพธ์ที่แสดงที่นี่เป็นครั้งแรกด้วยคอลเลกชันของฐานข้อมูล จากรีวิวนี้ สมุนไพรที่สำคัญ การศึกษานี้พบว่า ใบทราน ริปโตมประกอบด้วยชุดของลำดับที่น่าสนใจ เช่น albino3 ribulose-1,5 , bisphosphate อวัยวะสืบพันธุ์ / oxygenase ( rubisco )คลอโรฟิลล์คลอ photosystem 2 / b-binding โปรตีน โปรตีน เช่น ความเครียด การตอบสนอง และเมทไธโอนีนซัลฟอกไซด์ประเภท , ฯลฯ ข้อมูลถูกส่งไปยังและขนาด / ฐานข้อมูล / ddbj สัตวภายใต้การ jk492908 - NOSjk492964 .citings ~ 0