Examining the distribution of seque

Examining the distribution of sequences associated with
WUS cis-elements we found the 6-bp sequence CACGTG
was significantly over-represented 500–1000 bp upstream of DEGs from pWUS::mGFP5-ER cells in cLRP (Figure 8).
Two or more TAATTSS sequences within introns were also
observed at a higher frequency than expected, but the cutoff of P < 0.05 was not met (P = 0.056). Enrichment of
DEGs from this domain with elements mediating transcriptional responses to WUS is consistent with rapid transcriptional responses to WUS expression within cLRP.
We then examined the distribution WUS-responsive
genes identified in our transcriptome analysis of wus
mutants, and those identified by Busch et al. (2010),
amongst DEGs from pWUS::mGFP5-ER cells in cLRP. Interestingly, genes found to have increased expression in
pWUS::mGFP5-ER cells were enriched amongst those
found to have increased expression in wus (Figure 9a).
Conversely, those with decreased expression in pWUS::
mGFP5-ER cells were enriched amongst those with
decreased expression in wus (Figure 9a). Similarly,
WUS-induced and WUS-repressed genes (Busch et al.,
2010) were found to be enriched amongst those with
decreased and increased expression, respectively, in
pWUS::mGFP5-ER cells (Figure 9b). These findings mirror
those of Busch et al. (2010), who found WUS-repressed
genes were enriched within the WUS domain of the SAM,
whereas WUS-induced genes were enriched among transcripts expressed in the combined CLV3 and WUS
domains, and combined CLV3 and FIL domains. It was
suggested that this finding reflected a contribution by
both direct and indirect targets amongst WUS-responsive
genes, and linked the prevalence of transcripts with
reduced expression in the WUS domain to evidence that
WUS acts primarily as a transcriptional repressor (Leibfried et al., 2005; Ikeda et al., 2009), modulating target
gene expression. Our findings are in line with these
hypotheses, and may also reflect the duration of WUS
expression in cLRP and WUS non-cell autonomous activity (Mayer et al., 1998; Gallois et al., 2004; Yadav et al.,
2011).

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

ตรวจสอบการกระจายของลำดับที่เกี่ยวข้องกับWUS cis-องค์ประกอบที่เราพบ 6 bp ลำดับ CACGTGถูกมากมากเกินไปเป็นตัวแทน 500-1000 bp ต้นน้ำของ DEGs จากเซลล์ pWUS::mGFP5 ER ใน cLRP (8 รูป)สองลำดับ TAATTSS introns ภายในได้สังเกตที่ความถี่สูงกว่าที่คาดไว้ แต่ตัดของ P < 0.05 เป็นไปตาม (P = 0.056) เพิ่มคุณค่าDEGs จากโดเมนนี้มีองค์ประกอบที่เป็นสื่อกลางการ WUS transcriptional ตอบไม่สอดคล้องกับคำตอบ transcriptional WUS นิพจน์ภายใน cLRP อย่างรวดเร็วเราตรวจสอบการกระจาย WUS ตอบสนองแล้วยีนที่พบวิเคราะห์ transcriptome wusการกลายพันธุ์ และผู้ที่ระบุโดย Busch et al. (2010),ท่ามกลาง DEGs จากเซลล์ pWUS::mGFP5 ER ใน cLRP น่าสนใจ ยีนที่พบว่ามีเพิ่มนิพจน์ในpWUS::mGFP5 ER เซลล์ถูกอุดมผู้พบว่ามีเพิ่มนิพจน์ใน wus (รูปที่ 9 ก)ในทางกลับกัน มีลดนิพจน์ใน pWUS::mGFP5 ER เซลล์มีอุดมในหมู่ผู้ที่มีนิพจน์ที่ลดลงใน wus (รูปที่ 9 ก) ในทำนองเดียวกันยีน เกิด WUS และ อัดอั้น WUS (Busch et al.,2010) พบว่าอุดมไปในหมู่ผู้ที่มีลดลง และเพิ่มนิพจน์ ตามลำดับ ในpWUS::mGFP5 ER เซลล์ (รูปที่ 9b) สะท้อนประเด็นเหล่านี้ที่ของ Busch et al. (2010), ที่พบอัดอั้น WUSยีนมีอุดมภายในโดเมน WUS ของ SAMในขณะที่ยีนเกิด WUS มีอุดมในใบแสดงผลแสดง CLV3 และ WUS รวมโดเมน และโดเมน CLV3 และแฟ้รวม มันเป็นแนะนำว่า หานี้สะท้อนผลงานโดยเป้าหมายทั้งทางตรง และทางอ้อมในหมู่ WUS ตอบสนองยีน และเชื่อมโยงความชุกของใบด้วยลดนิพจน์ในโดเมน WUS ให้แสดงหลักฐานที่WUS ทำหน้าที่หลักเป็น repressor transcriptional (Leibfried et al. 2005 อิเคดะ et al. 2009), เลตเป้าหมายแสดงออกของยีน ผลการวิจัยของเราจะสอดคล้องกับเหล่านี้hypotheses และยังอาจสะท้อนของ WUSนิพจน์ใน cLRP และกิจกรรมอิสระ WUS-เซลล์ (เมเยอร์และ al. 1998 Gallois et al. 2004 Yadav et al.,2011)

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

ตรวจสอบการกระจายของลำดับที่เกี่ยวข้องกับ
WUS CIS องค์ประกอบที่เราพบลำดับ CACGTG 6-BP
อย่างมีนัยสำคัญมากกว่าตัวแทน 500-1000 bp ต้นน้ำของ degs จากเซลล์แถม :: mGFP5 เอ้อใน cLRP (รูปที่ 8).
สองหรือ TAATTSS เพิ่มเติม ลำดับภายใน introns นอกจากนี้ยังได้
ตั้งข้อสังเกตที่ความถี่ที่สูงกว่าที่คาดไว้ แต่ตัดของ P <0.05 ไม่ได้พบกัน (p = 0.056) การเพิ่มปริมาณของ
degs จากโดเมนนี้มีองค์ประกอบเป็นสื่อกลางการตอบสนองการถอดรหัสเพื่อ WUS มีความสอดคล้องกับการตอบสนองการถอดรหัสอย่างรวดเร็วเพื่อ WUS แสดงออกภายใน cLRP.
จากนั้นเราจะตรวจสอบการกระจาย WUS-ตอบสนอง
ยีนที่ระบุไว้ในการวิเคราะห์ยีนของเรา WUS
กลายพันธุ์และผู้ที่ระบุ Busch, et ​​al . (2010),
หมู่ degs จากเซลล์แถม :: mGFP5 เอ้อใน cLRP ที่น่าสนใจยีนพบว่ามีการเพิ่มขึ้นการแสดงออกใน
เซลล์แถม :: mGFP5 เอ้อถูกอุดมในหมู่ผู้ที่
พบว่ามีการแสดงออกที่เพิ่มขึ้นใน WUS (รูป 9a.)
ในทางกลับกันผู้ที่มีลดลงในการแสดงออกของแถม ::
เซลล์ mGFP5 เอ้อถูกอุดมหมู่เหล่า กับการ
ลดลงในการแสดงออก WUS (รูป 9a) ในทำนองเดียวกัน
WUS ที่เกิดขึ้นและยีน WUS-อัดอั้น (Busch et al.,
2010) พบว่ามีความอุดมหมู่ผู้ที่มี
ลดลงและเพิ่มการแสดงออกตามลำดับใน
แถม :: เซลล์ mGFP5 เอ้อ (รูป 9b) การค้นพบนี้สะท้อน
ผู้ Busch, et ​​al (2010) ซึ่งพบว่า WUS-อัดอั้น
ยีนผสานภายในโดเมน WUS ของแซม
ขณะที่ยีน WUS ถูกเหนี่ยวนำให้เกิดในหมู่อุดมยีนที่แสดงออกในการรวม CLV3 และ WUS
โดเมนและรวม CLV3 และโดเมน FIL มันก็
บอกว่าการค้นพบนี้สะท้อนให้เห็นถึงการมีส่วนร่วมโดย
เป้าหมายทั้งโดยตรงและโดยอ้อมในหมู่ WUS ตอบสนอง
ยีนและเชื่อมโยงความชุกของการถอดเสียงที่มี
การแสดงออกที่ลดลงในโดเมน WUS เพื่อหลักฐานว่า
WUS ทำหน้าที่หลักเป็นอดกลั้นการถอดรหัส (Leibfried et al., 2005 อิเคดะ, et al, 2009) เป้าหมายเลต.
การแสดงออกของยีน ผลการวิจัยของเราอยู่ในแนวเดียวกันกับเหล่า
สมมติฐานและยังอาจสะท้อนให้เห็นระยะเวลาของการ WUS
แสดงออกใน cLRP และ WUS ไม่ใช่เซลล์กิจกรรมอิสระ (เมเยอร์ et al, 1998;. Gallois et al, 2004;.. ดัฟ, et al,
2011)