Genetic diversity of the giant tige

Genetic diversity of the giant tiger shrimp (Penaeus monodon) collected from 5 areas, Chumphon and Trat (Gulf of Thailand), and Phangnga, Satun, and Trang (Andaman Sea), was examined by randomly amplified polymorphic DNA (RAPD) and mitochondrial DNA (16S ribosomal DNA and an intergenic COI-COII) polymorphism. A total of 53 polymorphic fragments from UBC299, UBC273, and UBC268 was consistently scored across all samples. From the respective primers 26, 32, and 30 genotypes were generated. A 260-bp RAPD fragment generated by the primer UBC268 was specifically observed in 95.8% of Trat P. monodon, suggesting that this RAPD could be used as a marker for comparing phenotypic performance of P. monodon from Trat and other geographic samples. In addition, 37 mtDNA composite haplotypes were observed from restriction analysis of the same P. monodon samples. High haplotype diversity (0.855) and nucleotide diversity (3.328%) of Thai P. monodon were observed. Population differentiation of P. monodon between the Andaman Sea and Gulf of Thailand was clearly illustrated by both techniques (P < .0001). Nevertheless, contradictory results on patterns of differentiation were observed between P. monodon within the Gulf of Thailand. Analysis of nuclear DNA polymorphism (RAPD) indicated a genetically significant difference between Chumphon and Trat (P < .0001), whereas mtDNA polymorphism did not show differentiation between these samples (P= .0497). Under the presumption of selective neutrality of these markers, biased female gene flow between Trat and Chumphon P. monodon may exist and be responsible for an anomalous differentiation pattern between these geographic samples.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

พันธุกรรมยักษ์กุ้ง (กุ้งกุลาดำ) รวบรวมจาก 5 พื้นที่ ชุมพร และตราด (อ่าวไทย), พังงา สตูล และตรัง (ทะเลอันดามัน), ถูกตรวจสอบ โดยสุ่มเอาต์ polymorphic ดีเอ็นเอ (อาร์เอพีดี) และโพลีมอร์ฟิซึม mitochondrial DNA (ดีเอ็นเอ ribosomal 16S และ COI-COII การ intergenic) จำนวนชิ้นส่วน polymorphic 53 UBC299, UBC273 และ UBC268 ได้อย่างต่อเนื่องคะแนนในกลุ่มตัวอย่างทั้งหมด จากไพรเมอร์ที่เกี่ยวข้อง 26, 32 และ 30 ศึกษาจีโนไทป์ถูกสร้างขึ้น 260-bp อาร์เอพีดีส่วนสร้างพื้น UBC268 ถูกโดยเฉพาะสังเกต 95.8% ของตราด P. monodon แนะนำว่า อาร์เอพีดีนี้สามารถใช้เป็นเครื่องหมายการเปรียบเทียบประสิทธิภาพไทป์ของ P. monodon จากตราดและอื่น ๆ ตัวอย่างทางภูมิศาสตร์ นอกจากนี้ mtDNA haplotypes รวม 37 สุภัคจากวิเคราะห์ข้อจำกัดอย่าง P. monodon เดียว ความหลากหลายทางชีวภาพสูง haplotype (0.855) และความหลากหลายของนิวคลีโอไทด์ (3.328%) ของไทย P. monodon ถูกสังเกต สร้างความแตกต่างของประชากรของ P. monodon ระหว่างทะเลอันดามันและอ่าวไทยถูกแสดง โดยเทคนิคทั้งสองอย่างชัดเจน (P < .0001). อย่างไรก็ตาม ได้สังเกตผลขัดแย้งในรูปแบบของการสร้างความแตกต่างระหว่าง P. monodon ภายในอ่าวไทย วิเคราะห์ของนิวเคลียร์ดีเอ็นเอโพลีมอร์ฟิซึม (อาร์เอพีดี) ระบุความแตกต่างที่สำคัญแปลงพันธุกรรมระหว่างชุมพรและตราด (P < .0001), ในขณะที่โพลิมอร์ฟิซึม mtDNA ได้แสดงการสร้างความแตกต่างระหว่างตัวอย่างเหล่านี้ (P = .0497). ภายใต้ข้อสันนิษฐานของความเป็นกลางที่ใช้เครื่องหมายเหล่านี้ ยีนหญิง biased กระแสระหว่างตราดและชุมพร P. monodon อาจอยู่ และรับผิดชอบเป็นลาย anomalous สร้างความแตกต่างระหว่างตัวอย่างเหล่านี้ทางภูมิศาสตร์

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

ความหลากหลายทางพันธุกรรมของกุ้งกุลาดำ ( Penaeus monodon ) เสือยักษ์ที่รวบรวมจากพื้นที่ 5 , ชุมพร และตราด ( อ่าวไทย ) และ พังงา สตูล และตรัง ( อันดามัน ) ถูกตรวจสอบ โดยสุ่ม amplified polymorphic DNA ( RAPD ) และ ( 16S ไรโบโซมอลดีเอ็นเอดีเอ็นเอและส่า coi-coii ) ) . จำนวน 53 จากชิ้นส่วนที่มี ubc299 ubc273 , ,ubc268 อย่างต่อเนื่องและมีคะแนนผ่านทุกตัวอย่าง จากแต่ละชนิด 26 , 32 และ 30 สายพันธุ์ ถูกสร้างขึ้น เป็นเพียงส่วนที่สร้างขึ้นโดย 260 คู่เบสรองพื้น ubc268 ถูกเฉพาะเมื่อเปรียบเทียบ % ของจังหวัดตราด กุ้งกุลาดำ บอกว่าชื่อเรื่อง นี้สามารถใช้เป็นเครื่องหมายสำหรับการเปรียบเทียบการแสดงฟีโนไทป์ของกุ้งกุลาดำจากจังหวัดตราด และตัวอย่างทางภูมิศาสตร์อื่น ๆ นอกจากนี้37 haplotypes ที่พบจากการวิเคราะห์แสดงคอมจำกัดเหมือนกับกุ้งกุลาดำ ตัวอย่าง ความหลากหลายที่พบสูง ( 0.855 ) และความหลากหลายของนิวคลีโอไทด์ ( 3.328 % ) ของกุ้งกุลาดำ พบว่า ความแตกต่างของประชากรกุ้งกุลาดำ ระหว่างทะเลอันดามันและอ่าวไทยอย่างชัดเจนภาพประกอบ โดยทั้ง 2 วิธี ( P < . 001 ) อย่างไรก็ตามผลดำเนินงานในรูปแบบของความแตกต่างระหว่างกุ้งกุลาดำ พบในอ่าวไทย การวิเคราะห์รูปแบบดีเอ็นเอนิวเคลียร์ ( RAPD ) พบความแตกต่างทางพันธุกรรมอย่างมีนัยสำคัญระหว่างชุมพร และตราด ( P < . 001 ) ส่วนแสดง - ไม่แสดงความแตกต่างระหว่างตัวอย่างเหล่านี้ ( P = . 0497 ) ตามข้อสันนิษฐานของความเป็นกลางที่เลือกของเครื่องหมายเหล่านี้ลำเอียงหญิงยีนโฟลว์ระหว่างจังหวัดตราด และชุมพร กุ้งกุลาดำ อาจมีอยู่ รับผิดชอบในการความแตกต่างระหว่างตัวอย่างที่รูปแบบทางภูมิศาสตร์เหล่านี้