Sequences from each of the 23 spide

Sequences from each of the 23 spider monkey samples were aligned with one another and with homologous sequences of Lagothrix, Alouatta, Cebus, and Callicebus using the program Muscle v3.6 with the program default parameters (number of iterations = 16, maximum memory allocated = 30,000,000 MB). We trimmed our initial alignment to a concatenated alignment of only the three coding regions (NAD5, NAD6, cytochrome B), excluding flanking sequence and excising the terminal codons of NAD6, which overlap with those of NAD5. We used the software MEGA 6.0 to estimate the mean pairwise genetic distance (calculated as base pair substi- tutions per site using a Maximum Composite Likelihood model) among the taxa included in the final alignment (Tamura and Nei,1993; Tamura et al., 2004; Tamura et al., 2013).

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

ลำดับจากแต่ละตัวอย่างลิงแมงมุม 23 ได้สอดคล้องกัน และ มีลำดับ homologous Lagothrix, Alouatta, Cebus และ Callicebus ด้วยการเล่นกล้ามเนื้อโปรแกรมพารามิเตอร์เริ่มต้นโปรแกรม (หมายเลขซ้ำ = 16 ปันส่วนหน่วยความจำสูงสุด = 30,000,000 MB) เราตัดตำแหน่งของเราเริ่มต้นการจัดตำแหน่งต่อเพียง 3 รหัสภูมิภาค (NAD5, NAD6, cytochrome B), ยกเว้นลำดับที่ flanking และ excising codons ของ NAD6 เทอร์มินัลซึ่งทับซ้อนกับ NAD5 เราใช้ซอฟต์แวร์ร็อค 6.0 ประเมินค่าเฉลี่ย pairwise (คำนวณเป็น tutions substi ฐานคู่ต่อไซต์ใช้แบบผสมโอกาสสูง) ระยะทางพันธุกรรมระหว่าง taxa ที่รวมอยู่ในตำแหน่ง final (Tamura และ Nei, 1993 Tamura et al., 2004 Tamura et al., 2013)

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

ลำดับจากแต่ละ 23 ตัวอย่างแมงมุมลิงถูกจัดชิดกับคนอื่นและวนเวียนอยู่กับความคล้ายคลึงกันของ Lagothrix, Alouatta, Cebus และ Callicebus ใช้โปรแกรมกล้ามเนื้อ v3.6 กับพารามิเตอร์เริ่มต้นโปรแกรม (จำนวนซ้ำ = 16, หน่วยความจำสูงสุดจัดสรร = 30,000,000 บาท) เราตัดการจัดตำแหน่งเริ่มต้นของเราในการจัดตำแหน่งการตัดแบ่งเพียงสามภูมิภาคเข้ารหัส (NAD5, NAD6, cytochrome B) ไม่รวม Anking ลำดับชั้นและ excising codons ขั้ว NAD6 ซึ่งทับซ้อนกับผู้ NAD5 เราใช้ซอฟแวร์ MEGA 6.0 ค่าเฉลี่ยระยะทางพันธุกรรมคู่ (คำนวณเป็น Tutions ฐานคู่เป็นตัวแทนต่อเว็บไซต์ที่ใช้น่าจะเป็นรูปแบบคอมโพสิตสูงสุด) ในกลุ่มแท็กซ่าที่รวมอยู่ในการจัดตำแหน่งสายเอ็น (ทามูระและ Nei,. 1993; ทามูระและคณะ, 2004. ทามูระและคณะ, 2013)

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

ลำดับจำนวน 23 ตัวอย่างแมงมุมลิง ชิดกันและความคล้ายคลึงกับลำดับของ lagothrix alouatta cebus , , , และ callicebus โดยใช้โปรแกรม v3.6 กล้ามเนื้อด้วยโปรแกรมเริ่มต้นพารามิเตอร์ ( จํานวนซ้ำ = 16 , หน่วยความจำสูงสุดจัดสรร = 30000000 MB ) เราตัดการเริ่มต้นของเรากับมาจัดเพียงสาม ( nad5 รหัสภูมิภาค ,nad6 ไซ , B ) ไม่รวมและลำดับfl anking ตัดขั้วของ nad6 ซิส ซึ่งทับซ้อนกับบรรดา nad5 . เราใช้ซอฟต์แวร์ที่เมกา 6.0 ประมาณหมายถึงคู่ระยะทางพันธุกรรม ( คำนวณเป็นฐานคู่ substi - tutions ต่อเว็บไซต์ โดยใช้รูปแบบของความเป็นไปได้สูงสุดประกอบ ) และรวมอยู่ในระบบการถ่ายทอด ( ทามูระ กับ เนย , 1993 ; ทามูระ et al . , 2004 ;ทามูระ et al . ,
) )