million generations; trees were sam

million generations; trees were sampled every 100 generations
for a total sample of 100 000 trees. Log-likelihood scores against
generation time were plotted using Tracer 1.4 (Rambaut &
Drummond 2007) to determine when the stationarity of likelihood
values had been reached as a guide for where to set the
burn-in stage (Ronquist et al. 2005). Burn-in was set at five million
generations (the first 50 000 sampled trees) and a majority
rule consensus tree was calculated from the posterior sample
of 50 001 trees. The convergence of the chains was confirmed
by the convergent diagnostic of the Potential Scale Reduction
Factor (PSRF), which approached 1 (Ronquist et al. 2005). The
phylogenetic trees were visualized in TreeView (Page 1996)

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

รุ่นล้าน ต้นไม้มีความทุกรุ่น 100สำหรับตัวอย่างทั้งหมดของ 100 000 คะแนนโอกาสล็อกกับเวลาสร้างถูกพล็อตใช้ 1.4 ติดตาม (Rambaut &ดรัม 2007) เพื่อกำหนดเวลา stationarity ของโอกาสมีถึงเป็นคู่มือสำหรับการตั้งค่าเขียนในระยะ (Ronquist et al. 2005) ในการเขียนได้ตั้งห้าล้านรุ่น (50 000 แรกตัวอย่างต้นไม้) และส่วนใหญ่คำนวณแผนภูมิกฎมติอย่างหลังต้นไม้ 50 001 การบรรจบกันของเครือข่ายได้รับการยืนยันโดยวินิจฉัย convergent ลดมาตราส่วนอาจเกิดขึ้นปัจจัย (PSRF), ซึ่งประดับ 1 (Ronquist et al. 2005) ที่ต้นไม้ phylogenetic มี visualized ใน TreeView (หน้า 1996)

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

ล้านคนรุ่น; ต้นไม้ตัวอย่างทุก ๆ 100
รุ่นสำหรับกลุ่มตัวอย่างทั้งหมด100 000 ต้นไม้ เข้าสู่ระบบคะแนนความน่าจะเป็นกับเวลารุ่นที่ได้รับการวางแผนการใช้ Tracer 1.4 (Rambaut และดรัมมอนด์2007) เพื่อตรวจสอบเมื่อ stationarity ของความน่าจะเป็นค่าที่มาถึงเป็นแนวทางในการที่จะตั้งค่าการเผาไหม้ในขั้นตอน(Ronquist et al. 2005) การเผาไหม้ในเป็นที่ตั้งห้าล้านคนรุ่น (ครั้งแรก 50 000 ต้นไม้ตัวอย่าง) และส่วนใหญ่ต้นไม้กฎฉันทามติที่คำนวณได้จากตัวอย่างหลัง50 001 ต้นไม้ คอนเวอร์เจนซ์ของกลุ่มได้รับการยืนยันโดยบรรจบวินิจฉัยของเครื่องชั่งที่มีศักยภาพการลดปัจจัย(PSRF) ซึ่งเดินเข้ามาที่ 1 (Ronquist et al. 2005) ต้นไม้ถูกมองเห็นใน TreeView (หน้า 1996)

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

ล้านชั่วอายุ จำนวน 100 ต้น ทุกรุ่น
ตัวอย่างทั้งหมด 100 , 000 ต้น บันทึกความน่าจะเป็นคะแนนกับ
เวลารุ่นวางแผนใช้ติดตาม 1.4 ( rambaut &
ดรัมมอนด์ 2007 ) เพื่อตรวจสอบเมื่อความนิ่งของความน่าจะเป็น
ค่าได้ถึงเป็นคู่มือที่กำหนด
เผาเวที ( ronquist et al . 2005 ) . การเผาในที่ถูกกำหนดไว้ที่ 5 ล้าน
generations ใช้ , สนใจโนชงคุม trees นละคร
สะสม consensus tree was calculated เริ่มต้น posterior sample
ของ 50 001 trees . การบรรจบกันของโซ่ที่ได้รับการยืนยันโดยการวินิจฉัยของ

ลดศักยภาพระดับปัจจัย ( psrf ) ซึ่งเข้าใกล้ 1 ( ronquist et al . 2005 )
ต้นไม้ซึ่งเป็นปรากฏการณ์ในเพลงเพจ ( 2539 )