Methods to detect infectious human

Methods to detect infectious human enteric viruses in environmental water
samples


Currently, a wide range of analytical methods is available for virus detection in environmental water
samples. Molecular methods such as polymerase chain reaction (PCR) and quantitative real time PCR
(qPCR) have the highest sensitivity and specificity to investigate virus contamination in water, so they
are the most commonly used in environmental virology. Despite great sensitivity of PCR, the main limitation
is the lack of the correlation between the detected viral genome and viral infectivity, which limits
conclusions regarding the significance for public health. To provide information about the infectivity of
the detected viruses, cultivation on animal cell culture is the gold standard. However, cell culture infectivity
assays are laborious, time consuming and costly. Also, not all viruses are able to produce cytopathic
effect and viruses such as human noroviruses have no available cell line for propagation. In this brief
review, we present a summary and critical evaluation of different approaches that have been recently
proposed to overcome limitations of the traditional cell culture assay and PCR assay such as integrated cell
culture-PCR, detection of genome integrity, detection of capsid integrity, and measurement of oxidative
damages on viral capsid protein. Techniques for rapid detection of infectious viruses such as fluorescence
microscopy and automated flow cytometry have also been suggested to assess virus infectivity in water
samples.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

วิธีการตรวจหาโรคติดเชื้อไวรัส enteric มนุษย์ในสิ่งแวดล้อมน้ำตัวอย่างปัจจุบัน วิธีวิเคราะห์ที่หลากหลายจะพร้อมใช้งานสำหรับการตรวจหาไวรัสในสิ่งแวดล้อมน้ำตัวอย่างการ วิธีโมเลกุลปฏิกิริยาลูกโซ่พอลิเมอเรส (PCR) และเชิงปริมาณจริงเวลา PCR(qPCR) มีความไวสูงสุดและ specificity การตรวจสอบไวรัสปนเปื้อนในน้ำ ดังนั้นพวกเขาที่มักใช้ในชเป็นสิ่งแวดล้อม แม้ มีความไวดีของ PCR ข้อจำกัดหลักคือการขาดความสัมพันธ์ระหว่างกลุ่มตรวจพบไวรัสและไวรัส infectivity ซึ่งจำกัดบทสรุปเกี่ยวกับความสำคัญสำหรับสาธารณสุข เพื่อให้ข้อมูลเกี่ยวกับ infectivity ของตรวจพบไวรัส เพาะปลูกเพาะเลี้ยงเซลล์สัตว์ในมาตรฐานทองคำได้ อย่างไรก็ตาม เซลล์ infectivity วัฒนธรรมassays เป็นลำบาก ใช้เวลานาน และค่าใช้จ่าย ไวรัสไม่หมดยังสามารถผลิต cytopathicผลและไวรัสเช่น noroviruses มนุษย์มีเส้นไม่มีเซลล์สำหรับการเผยแพร่ ในบทสรุปนี้ตรวจทาน เรานำเสนอประเมินผลสรุป และความสำคัญของแนวทางต่าง ๆ ที่ได้รับล่าสุดเสนอที่จะเอาชนะข้อจำกัดของการวิเคราะห์วัฒนธรรมเซลล์ดั้งเดิมและ PCR assay เช่นเซลล์ที่รวมวัฒนธรรม-PCR ตรวจความสมบูรณ์ของจีโนม ตรวจความสมบูรณ์ของ capsid และวัด oxidativeความเสียหายใน capsid ไวรัสโปรตีน เทคนิคการตรวจโรคติดเชื้อไวรัสเช่น fluorescence อย่างรวดเร็วmicroscopy and automated flow cytometry have also been suggested to assess virus infectivity in watersamples.

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

วิธีการในการตรวจจับไวรัสลำไส้ติดเชื้อของมนุษย์ในน้ำสิ่งแวดล้อมตัวอย่างปัจจุบันที่หลากหลายของวิธีการวิเคราะห์สามารถใช้ได้สำหรับการตรวจหาไวรัสในน้ำสิ่งแวดล้อมตัวอย่าง วิธีโมเลกุลเช่นวิธี polymerase chain reaction (PCR) และเชิงปริมาณ PCR เวลาจริง(qPCR) มีความไวและความจำเพาะสูงที่สุดในการตรวจสอบการปนเปื้อนเชื้อไวรัสในน้ำเพื่อให้พวกเขาเป็นส่วนใหญ่ที่ใช้กันทั่วไปในไวรัสวิทยาสิ่งแวดล้อม แม้จะมีความไวที่ดีของ PCR ที่ข้อ จำกัด หลักคือการขาดของความสัมพันธ์ระหว่างจีโนมของไวรัสตรวจพบและการติดเชื้อไวรัสที่จำกัดข้อสรุปเกี่ยวกับความสำคัญสำหรับสุขภาพของประชาชน เพื่อให้ข้อมูลเกี่ยวกับการติดเชื้อของไวรัสที่ตรวจพบในการเพาะปลูกในเซลล์เพาะเลี้ยงสัตว์เป็นมาตรฐานทองคำ อย่างไรก็ตามการติดเชื้อการเพาะเลี้ยงเซลล์การตรวจมีความลำบากเสียเวลาและค่าใช้จ่าย นอกจากนี้ไม่ไวรัสทั้งหมดจะสามารถผลิต cytopathic ผลและไวรัสเช่น noroviruses มนุษย์ไม่มีเซลล์สามารถใช้ได้สำหรับการขยายพันธุ์ ในนี้สรุปทบทวนเรานำเสนอบทสรุปและการประเมินผลที่สำคัญของวิธีการที่แตกต่างกันที่เพิ่งได้รับการเสนอที่จะเอาชนะข้อจำกัด ของเซลล์ทดสอบวัฒนธรรมดั้งเดิมและการทดสอบ PCR เช่นเซลล์แบบบูรณาการวัฒนธรรม-PCR ตรวจสอบความสมบูรณ์ของจีโนมการตรวจสอบความสมบูรณ์ของ capsid, และการวัดออกซิเดชันความเสียหายโปรตีนcapsid ไวรัส เทคนิคการตรวจสอบอย่างรวดเร็วของไวรัสติดเชื้อเช่นการเรืองแสงกล้องจุลทรรศน์และการไหลอัตโนมัติภูมิคุ้มกันยังได้รับการแนะนำในการประเมินการติดเชื้อไวรัสที่อยู่ในน้ำตัวอย่าง

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

วิธีการตรวจสอบการติดเชื้อไวรัสในมนุษย์ต่อสิ่งแวดล้อมน้ำ



ตัวอย่างในปัจจุบัน หลากหลายวิธีวิเคราะห์สามารถใช้ได้สำหรับการตรวจหาไวรัสในตัวอย่างน้ำ
สิ่งแวดล้อม วิธีการระดับโมเลกุล เช่น เทคนิคพีซีอาร์ ( PCR ) และปริมาณเวลา PCR จริง
( qpcr ) ได้สูงสุดที่ความไวและเฉพาะเจาะจงเพื่อตรวจสอบการปนเปื้อนไวรัสในน้ำ ดังนั้นพวกเขา
เป็นส่วนใหญ่ที่ใช้กันทั่วไปในวิทยาสิ่งแวดล้อม แม้จะมีความไวที่ดีของ PCR
ข้อจำกัดหลักคือการขาดความสัมพันธ์ระหว่างตรวจพบไวรัสและการติดเชื้อไวรัส ( ซึ่งจำกัด
สรุปเกี่ยวกับความสำคัญสำหรับสาธารณสุข เพื่อให้ข้อมูลเกี่ยวกับการติดเชื้อของ
การตรวจพบไวรัส การเพาะปลูก การเลี้ยงสัตว์เซลล์เป็นมาตรฐานทองคำอย่างไรก็ตาม การเพาะเลี้ยงเซลล์พยาธิวิทยา
) จะลำบาก เวลานาน และค่าใช้จ่ายสูง นอกจากนี้ ไวรัสไม่ทั้งหมดจะสามารถผลิตผล cytopathic
และไวรัสเช่นมนุษย์โนโรไวรัสไม่มีเซลล์ สามารถขยายพันธุ์โดยการเพาะเมล็ด ในการตรวจสอบนี้สั้น
เรา ปัจจุบัน สรุปและการประเมินผลของวิธีการที่แตกต่างกันที่ได้รับเมื่อเร็ว ๆนี้
เสนอที่จะเอาชนะข้อจำกัดของวิธี PCR assay และเซลล์วัฒนธรรมดั้งเดิมเช่น PCR เซลล์
รวม การตรวจหาความสมบูรณ์ของจีโนมการตราหน้าและการวัดปฏิกิริยา
ความเสียหายเกี่ยวกับไวรัสแคปซิดโปรตีน เทคนิคสำหรับการตรวจหาไวรัสติดเชื้อเช่นเรืองแสง
อย่างรวดเร็วเครื่องนับเซลล์อัตโนมัติปยังได้รับการแนะนำเพื่อประเมินการติดเชื้อไวรัสในตัวอย่างน้ำ