Plant genome sizes span several ord

Plant genome sizes span several orders of magnitude from the carnivorous corkscrew plant (Genlisea aurea) at 63 megabases (Mb) to the rare Japanese Paris japonica at 148,000 Mb (Bennett and Leitch, 2011). The smallest published genome is the carnivorous bladderwort (Utricularia gibba) at 82 Mb, while the largest, the Norway Spruce (Picea abies), stands by itself at 19,600 Mb, compared to the second largest of maize at 2300 Mb and the overall median of 480 Mb (Table 1, Fig. 1B). Access to high quality reference genomes confirmed that long terminal repeats (LTRs) retrotransposons are a primarily driver of the dramatic size range in plants (El Baidouri and Panaud 2013). For the large barley genome (5100 Mb), where retrotransposons are abundant and more recently active, a powerful genomics resource was generated through an alternative “gene-ome” approach by anchoring a high quality genespace assembly on a deep physical map merged with high-density genetic maps (International Barley Genome Sequencing Consortium, 2012). In contrast, large gymnosperm genomes have highly diverged ancient repeats, which could make assembling these genomes tractable with current sequencing and assembly technologies (Kovach et al., 2010). The smallest reported conifer genome is the same size as maize and the median genome size is 9700 Mb, which is why a large push to sequence gymnosperms may have to wait for the next wave of sequencing technologies with increased read length and decreased price. As the community moves forward to choose the next round of genomes to sequence, the Kew Genome Size database will continue to provide a rich resource of non-model/non-crop species to investigate (Bennett and Leitch, 2011).

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

ขนาดกลุ่มพืชขยายขนาดของใบสั่งหลายจากการกินเนื้อเหล็กไขจุกขวดพืช (Genlisea ยาธร) ที่ 63 megabases (Mb) ไป japonica ปารีสญี่ปุ่นหายากที่ 148,000 Mb (เบนเนตและ Leitch, 2011) กลุ่มเผยแพร่เล็กสุดเป็น bladderwort กินเนื้อ (Utricularia gibba) ที่ 82 Mb ขณะ Spruce นอร์เวย์ (Picea abies), ยืน ด้วยตัวเองที่ 19,600 Mb เมื่อเทียบกับใหญ่เป็นอันดับสองของข้าวโพดที่ 2300 Mb และค่ามัธยฐานโดยรวม 480 เมกะไบต์ (ตารางที่ 1, Fig. 1B) ยืนยันถึงคุณภาพอ้างอิง genomes ทำซ้ำนานเทอร์มินัล (LTRs) retrotransposons เป็นโปรแกรมควบคุมหลักช่วงขนาดละครในพืช (El Baidouri และ Panaud 2013) สำหรับกลุ่มใหญ่ข้าวบาร์เลย์ (5100 Mb), retrotransposons อุดมสมบูรณ์ และล่าสุดอยู่ genomics มีประสิทธิภาพทรัพยากรถูกจัดสร้าง โดยวิธีการอื่น "ยีน-ome" โดย anchoring แอสเซมบลี genespace คุณภาพสูงบนแผนที่จริงลึกที่ผสานกับแผนที่พันธุ high-density (นานาชาติข้าวบาร์เลย์จีโนมลำดับเบส Consortium, 2012) ในทางตรงกันข้าม genomes ใหญ่ gymnosperm มีสูง diverged ทำซ้ำโบราณ ซึ่งช่วยให้การประกอบ genomes เหล่านี้ tractable ด้วยปัจจุบันลำดับและแอสเซมบลีเทคโนโลยี (Kovach et al., 2010) น้อยที่สุดรายงานกลุ่มสนขนาดเดียวกันกับข้าวโพด และขนาดจีโนมมัธยฐาน 9700 Mb ซึ่งเป็นเหตุผลดัน gymnosperms ลำดับมีขนาดใหญ่อาจจะต้องรอคลื่นถัดไปของลำดับเทคโนโลยีอ่านยาวเพิ่มขึ้นและราคาลดลง เป็นชุมชนย้ายไปเลือกรอบถัดไปของ genomes ลำดับ ต่อคิวขนาดจีโนมจะยังมีทรัพยากรที่อุดมไปด้วยพันธุ์ไม่ใช่การจำลอง/ไม่ครอบตัดการตรวจสอบ (เบนเนตและ Leitch, 2011)

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

ขนาดจีโนมพืชครอบคลุมคำสั่งหลายขนาดจากโรงงานเกลียวกินเนื้อ (Genlisea aurea) ที่ 63 megabases (Mb) เพื่อ japonica ปารีสญี่ปุ่นที่หายากที่ 148,000 Mb (เบนเน็ตต์และลิทซ์ 2011) จีโนมตีพิมพ์เล็กที่สุดเป็น bladderwort กินเนื้อ (Utricularia gibba) ที่ 82 Mb ใ​​นขณะที่ใหญ่ที่สุดในนอร์เวย์โก้ (Picea abies) ยืนด้วยตัวเองได้ที่ 19,600 ล้านบาทเมื่อเทียบกับที่ใหญ่ที่สุดของข้าวโพดที่สองที่ 2,300 Mb และเฉลี่ยโดยรวมของ 480 Mb (ตารางที่ 1, รูป. 1B) การเข้าถึงการอ้างอิงจีโนมที่มีคุณภาพสูงที่ได้รับการยืนยันซ้ำขั้วยาว (LTRs) retrotransposons เป็นคนขับส่วนใหญ่ของช่วงขนาดอย่างมากในพืช (El BAIDOURI และ Panaud 2013) สำหรับจีโนมข้าวบาร์เลย์ขนาดใหญ่ (5100 Mb) ซึ่ง retrotransposons มีความอุดมสมบูรณ์และอื่น ๆ ที่ใช้งานเมื่อเร็ว ๆ นี้เป็นทรัพยากรที่ฟังก์ชั่นที่มีประสิทธิภาพถูกสร้างขึ้นผ่านทางเลือก "ยีนโอม" วิธีการโดยยึดคุณภาพสูงประกอบ genespace บนแผนที่ทางกายภาพลึกรวมกับสูง แผนที่ทางพันธุกรรมที่มีความหนาแน่น (ข้าวบาร์เลย์นานาชาติลำดับจีโนม Consortium 2012) ในทางตรงกันข้าม gymnosperm จีโนมที่มีขนาดใหญ่มีความสูงแยกซ้ำโบราณซึ่งจะทำให้การประกอบจีโนมของเหล่าซูฮกกับลำดับในปัจจุบันและเทคโนโลยีกระบวนการผลิต (Kovach et al., 2010) จีโนมต้นสนรายงานที่เล็กที่สุดมีขนาดเดียวกับข้าวโพดและขนาดจีโนมเฉลี่ยอยู่ที่ 9,700 ล้านบาทซึ่งเป็นเหตุผลที่ผลักดันขนาดใหญ่ลำดับ gymnosperms อาจจะต้องรอให้คลื่นต่อไปของเทคโนโลยีการจัดลำดับที่มีความยาวที่เพิ่มขึ้นและการอ่านลดลงราคา ขณะที่ชุมชนเคลื่อนที่ไปข้างหน้าในการเลือกรอบต่อไปของจีโนมลำดับที่จีโนมคิวฐานข้อมูลขนาดจะยังคงให้เป็นทรัพยากรที่อุดมไปด้วยรูปแบบที่ไม่ได้ / ไม่ใช่สายพันธุ์พืชในการตรวจสอบ (เบนเน็ตต์และลิทซ์ 2011)

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

ขนาดจีโนมพืชช่วงคําสั่งหลายขนาดจากโรงงานเหล็กไขจุกกินแมลง ( genlisea Aurea ) ที่ 63 megabases ( MB ) เพื่อหายากจาปปารีสญี่ปุ่นในบางครั้ง ( และองค์การระหว่างประเทศเพื่อเบนเน็ตต์ลิช , 2011 ) ที่เผยแพร่โดยเป็นสาหร่ายข้าวเหนียวกินแมลง ( utricularia gibba ) 82 MB ในขณะที่ใหญ่ ต้นสนนอร์เวย์ ( picea abies ) ยืนด้วยตัวเองที่ 19 , 600 MB ,เมื่อเทียบกับสองที่ใหญ่ที่สุดของข้าวโพดที่ 2300 MB และค่ามัธยฐานรวม 480 MB ( ตารางที่ 1 รูป 1B ) การเข้าถึงเพื่อหาอ้างอิงคุณภาพยืนยันว่า ยาวปลายซ้ำ ( ltrs ) retrotransposons เป็นหลักควบคุมช่วงขนาดอย่างมากในพืช ( El baidouri และ panaud 2013 ) สำหรับจีโนมข้าวขนาดใหญ่ ( 5 , 100 MB ) ที่ retrotransposons มีมากมายและมากขึ้นเมื่อเร็ว ๆนี้อยู่ทรัพยากรพันธุกรรมที่มีประสิทธิภาพถูกสร้างขึ้นผ่านทางเลือก " ยีนโอม " แนวทางโดยทอดสมอประกอบ genespace คุณภาพสูงบนลึกทางกายภาพแผนที่ผสานกับความหนาแน่นสูง ( แผนที่พันธุกรรมข้าวบาร์เลย์จีโนมลำดับสมาคมนานาชาติ 2012 ) ในทางตรงกันข้าม , จีโนมพืชเมล็ดเปลือยขนาดใหญ่มีการแยกออกโบราณอีกครั้งแล้วซึ่งจะทำให้การประกอบจีโนมเหล่านี้ควบคุมได้ง่ายด้วยการปัจจุบันและประกอบ Technologies ( โคแวค et al . , 2010 ) ที่เล็กที่สุดที่รายงานโดยโคนิเฟอร์เป็นขนาดเดียวกับข้าวโพดโดยเฉลี่ยและขนาด 9700 MB ซึ่งเป็นเหตุผลที่ผลักดันขนาดใหญ่เพื่อลำดับ gymnosperms อาจต้องรอให้คลื่นต่อไปของเทคโนโลยีที่มีการเพิ่มความยาวอ่านและราคาที่ลดลงเป็นชุมชนที่ย้ายไปข้างหน้าเพื่อเลือกรอบต่อไปของจีโนมดับ , คิวจีโนมขนาดฐานข้อมูลจะยังคงมีทรัพยากรอุดมสมบูรณ์ของพืชชนิดที่ไม่ใช่แบบไม่ศึกษา ( เบนเน็ตต์ และลิช
, 2011 )