3.4. Association test for mineral e

3.4. Association test for mineral elements
Preliminary association test was used to find the genetic factor
affecting the genetic diversity in the 7 mineral elements. Seventeen
QTLs locating on chromosome 1, 2, 6, 8, 10 and 11 were identified
(Table 6 and Supplementary Fig. 1). The Manhattan plots of association
mapping results for K and Na were shown in Supplementary
Fig. 2 in the 2 years, respectively.
Nine of 17 QTLs were detected in 2011, while the others were
identified in the 2012. Only one QTL for Cu and Zn content was
detected in 2011, indicating that the QTLs for Cu and Zn in rice
grains were largely environment-dependent. Five QTLs were identified
for Ca in the 2 years, of which two QTLs on chromosome 1
and 6 with different positions could be detected in each year. A
large number of QTLs for K and Na were detected (Table 6 and
Supplementary Figs. 1 and 2), but none of them could be detected
simultaneously in both years.
4. Discussion
The 20 rice accessions introduced from the OryzaSNP project
represent wide genetic diversity in various phenotypes (McNally
et al., 2009), such as agronomic traits (Xu et al., 2014), biomass
traits (Jahn et al., 2011), bioactive compounds (Heuberger et al.,
2010; Shao et al., 2014), and grain quality traits (Tong et al.,
2014). However, genetic and environmental effects on the mineral
elements in 20 rice accessions have not been reported before.
In this study, the concentrations of Ca, Mg, Na, K, Fe, Zn, and Cu
in brown rice of 20 genotypes were evaluated. Each mineral
element is essential for the growth and development of plants,
animals, and humans. The results showed that 7 minerals of the
20 rice accessions varied greatly among genotypes. For example,
the largest variation of mineral elements concentrations were
5.6-fold (0.217–1.216 mg/kg) for Cu in 2011 and 5.07-fold (7.67–
38.86 mg/kg) for Na. Genetic variation for mineral contents has
been reported by many research groups in different rice accessions
(Anuradha et al., 2012; Garcia-Oliveira et al., 2009; Gregorio, 2002;
Jiang et al., 2007). Brar, Jain, Singh, and Jain (2011) showed large
variation in Fe (5.1–441.5 lg/g) and Zn (2.12–39.4 lg/g) contents
in brown rice in a collection of 220 rice genotypes and identified
three rice genotypes with exceptionally higher Fe content
(400 lg/g). Jiang et al. (2007) indicated that the differences in
mineral contents among genotypes might be due to different
genetic resources involved. In this study, the genotype effects
accounted for more than 70% of variance for the elements of Ca,
Na and K, which implied that genotypic variations might provide
opportunities to select for higher mineral element contents
(Gregorio, 2002).
The mineral contents among different rice accessions were not
only influenced by genotypes but also affected by the environment
factors. Some previous studies have demonstrated that environment
plays a tremendous impact on the accumulation of minerals
in rice grain. Du et al. (2013) found the mineral concentrations in
grains of the two parents grown in Hangzhou and Lingshui,
China, were significantly different, especially for Ca, Fe, and Zn.
Variations in mineral concentrations in plants may depend on
variations in many factors, such as mineral mobilization, uptake,
trafficking, and sequestration, which are all relevant processes in
the mineral transport pathway from roots to shoots (Clemens,
2001; Ghandilyan et al., 2009). Moreover, the climate may also

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

3.4. สมาคมการทดสอบแร่ธาตุใช้ทดสอบความสัมพันธ์เบื้องต้นเพื่อค้นหาปัจจัยทางพันธุกรรมส่งผลกระทบต่อความหลากหลายทางพันธุกรรมใน 7 แร่ธาตุ 17QTLs ที่ตำแหน่งบนโครโมโซม 1, 2, 6, 8, 10 และ 11 ระบุ(ตารางที่ 6 และเสริมรูปที่ 1) โครงการแมนฮัตตันของสมาคมผลลัพธ์ของการแม็ปสำหรับ K และ Na ที่แสดงในฉากรูปที่ 2 ในปี 2 ตามลำดับเก้า QTLs ที่ 17 พบใน 2011 ในขณะที่คนอื่น ๆระบุใน 2012 ถูก QTL เดียวสำหรับเนื้อหา Cu และ Znพบใน 2011 ระบุว่า QTLs ที่สำหรับ Cu และ Zn ในข้าวธัญพืชขึ้นกับสภาพแวดล้อมส่วนใหญ่ ระบุ QTLs ที่ห้าสำหรับในปีที่ 2 ของ QTLs ที่สองบนโครโมโซม 1และ 6 กับตำแหน่งต่าง ๆ ถูกตรวจพบในแต่ละปี Aพบจำนวนมาก QTLs K และ Na (ตารางที่ 6 และเสริมมะเดื่อ. 1 และ 2), แต่ไม่สามารถตรวจพบพร้อมกันในปีนี้4. สนทนาAccessions ข้าว 20 ที่นำจากโครงการ OryzaSNPแสดงถึงความหลากหลายทางพันธุกรรมกว้างในหลากหลายฟี (McNallyet al. 2009), เช่นลักษณะทางนิสัย (Xu ร้อยเอ็ด 2014), ชีวมวลลักษณะ (Jahn ร้อยเอ็ด 2011), สารออกฤทธิ์สำคัญ (ฮิวเบอเกอร์ et al.,2010 Shao et al. 2014), และเมล็ดลักษณะคุณภาพ (ตอง et al.,2014) . อย่างไรก็ตาม แร่ผลทางพันธุกรรม และสิ่งแวดล้อมองค์ประกอบในข้าว 20 accessions ไม่ได้รับรายงานก่อนในการศึกษานี้ ความเข้มข้น ของ Ca, Mg, Na, K, Fe, Zn, Cuในข้าวกล้องของ 20 พันธุ์ที่ประเมิน แร่แต่ละองค์ประกอบจำเป็นสำหรับการเจริญเติบโตและพัฒนาของพืชน้ำมันเชื้อเพลิง สัตว์และมนุษย์ ผลลัพธ์แสดงให้เห็นว่าแร่ 7 ของการaccessions ข้าว 20 แตกต่างกันมากระหว่างจีโนไทป์ เช่นมีการเปลี่ยนแปลงที่ใหญ่ที่สุดของความเข้มข้นของแร่ธาตุ5.6-fold (0.217 – 1.216 มิลลิกรัม/กิโลกรัม) สำหรับ Cu 2011 และ 5.07-fold (7.67 –38.86 มิลลิกรัมต่อกิโลกรัม) สำหรับ Na. พันธุ การหาแร่ได้การรายงานกลุ่มวิจัยมากในข้าวต่าง ๆ accessions(Anuradha et al. 2012 การ์เซีย-Oliveira et al. 2009 Gregorio, 2002Jiang et al. 2007) Brar เจน สิงห์ และเจน (2011) ได้แสดงขนาดใหญ่ความผันแปรใน Fe (5.1 – 441.5 lg/g) และเนื้อหาของ Zn (2.12-39.4 lg/g)ในข้าวกล้องในคอลเลกชันของพันธุ์ข้าว 220 และระบุสามข้าวพันธุ์ มีปริมาณ Fe สูงเป็นพิเศษ(400 lg/กรัม) Jiang et al. (2007) ระบุว่า ความแตกต่างในเนื้อหาแร่ระหว่างพันธุ์อาจเนื่องจากการแตกต่างกันทรัพยากรพันธุกรรมที่เกี่ยวข้อง ในการศึกษานี้ ผลกระทบของลักษณะทางพันธุกรรมคิดเป็นกว่า 70% ของผลต่างสำหรับองค์ประกอบของ CaNa และ K ซึ่งนัยว่า อาจให้เปลี่ยนแปลงจีโนไทป์โอกาสที่จะเลือกสำหรับเนื้อหาแร่ธาตุสูง(Gregorio, 2002)หาแร่ระหว่าง accessions ข้าวแตกต่างกันไม่ได้เพียงอิทธิพลพันธุ์ แต่ยัง ได้รับผลกระทบจากสิ่งแวดล้อมปัจจัย บางการศึกษาก่อนหน้านี้ได้แสดงให้เห็นสภาพแวดล้อมเล่นผลกระทบอย่างมากในการสะสมของแร่ธาตุในเมล็ดข้าว ดูร้อยเอ็ด (2013) พบความเข้มข้นแร่ในเมล็ดของพ่อแม่ที่สองปลูกในหางโจวและ Lingshuiจีน แตกต่าง โดยเฉพาะอย่างยิ่ง การ Ca, Fe, Znในความเข้มข้นของแร่ธาตุในพืชอาจขึ้นอยู่กับการเปลี่ยนแปลงในปัจจัยหลายประการ เช่นระดมแร่ ดูดซึมค้ามนุษย์ และการอายัด ซึ่งเป็นกระบวนการที่เกี่ยวข้องทั้งหมดเส้นทางขนส่งแร่จากรากไปหน่อ (Clemens2001 Ghandilyan et al. 2009) นอกจากนี้ สภาพอากาศยังอาจ

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

3.4 ทดสอบสมาคมแร่ธาตุ
เบื้องต้นทดสอบสมาคมใช้ในการหาปัจจัยทางพันธุกรรม
มีผลกระทบต่อความหลากหลายทางพันธุกรรมใน 7 แร่ธาตุ Seventeen
QTLs ตำแหน่งบนโครโมโซม 1, 2, 6, 8, 10 และ 11 ถูกระบุ
(ตารางที่ 6 และเสริมรูป. 1) แปลงแมนฮัตตันของสมาคม
ผลการทำแผนที่ของ K และนาที่แสดงในเสริม
รูป 2 ใน 2 ปีตามลำดับ.
เก้า 17 QTLs ถูกตรวจพบในปี 2011 ในขณะที่คนอื่น ๆ ที่ถูก
ระบุไว้ในปี 2012 เพียงหนึ่ง QTL สำหรับ Cu Zn และเนื้อหาได้รับการ
ตรวจพบในปี 2011 แสดงให้เห็นว่า QTLs สำหรับ Cu และสังกะสีในข้าว
ธัญพืช เป็นส่วนใหญ่ขึ้นอยู่กับสภาพแวดล้อม ห้า QTLs ที่ถูกระบุ
สำหรับ CA ใน 2 ปีที่สอง QTLs บนโครโมโซม 1
และ 6 ที่มีตำแหน่งที่แตกต่างกันสามารถตรวจพบได้ในแต่ละปี
จำนวนมากของ QTLs ของ K และนาถูกตรวจพบ (ตารางที่ 6 และ
เสริมมะเดื่อ. 1 และ 2) แต่ไม่มีของพวกเขาจะได้รับการตรวจพบ
พร้อมกันทั้งในปีที่ผ่านมา.
4 อภิปราย
สาย 20 ข้าวที่นำมาจากโครงการ OryzaSNP
แทนความหลากหลายทางพันธุกรรมที่กว้างใน phenotypes ต่างๆ (เนลลี
et al., 2009) เช่นลักษณะทางการเกษตร (Xu et al., 2014), ชีวมวล
ลักษณะ (Jahn et al., 2011) สารออกฤทธิ์ทางชีวภาพ (Heuberger, et al.,
2010; Shao et al, 2014.) และลักษณะที่มีคุณภาพข้าว (Tong, et al.,
2014) อย่างไรก็ตามผลกระทบทางพันธุกรรมและสิ่งแวดล้อมในแร่ธาตุ
องค์ประกอบใน 20 สายข้าวยังไม่ได้รับรายงานมาก่อน.
ในการศึกษานี้มีความเข้มข้นของ Ca, Mg, Na, K, Fe, Zn และทองแดง
ในข้าวกล้อง 20 สายพันธุ์ได้รับการประเมิน แร่แต่ละ
องค์ประกอบเป็นสิ่งจำเป็นสำหรับการเจริญเติบโตและการพัฒนาของพืช
สัตว์และมนุษย์ ผลการศึกษาพบว่าแร่ธาตุ 7 ของ
สายข้าว 20 แตกต่างกันอย่างมากในหมู่ยีน ยกตัวอย่างเช่น
การเปลี่ยนแปลงที่ใหญ่ที่สุดของความเข้มข้นของแร่ธาตุเป็น
5.6 เท่า (0.217-1.216 มิลลิกรัม / กิโลกรัม) สำหรับลูกบาศ์กในปี 2011 และ 5.07 เท่า (7.67-
38.86 mg / kg) นา การเปลี่ยนแปลงทางพันธุกรรมสำหรับเนื้อหาแร่ได้
รับการรายงานโดยกลุ่มวิจัยจำนวนมากในสายข้าวที่แตกต่างกัน
(Anuradha et al, 2012;. การ์เซียร่า et al, 2009;. เปา 2002;
. เจียง et al, 2007) Brar เชนซิงห์และเชน (2011) แสดงให้เห็นว่ามีขนาดใหญ่
การเปลี่ยนแปลงในเฟ (5.1-441.5 LG / g) และ Zn (2.12-39.4 LG / g) เนื้อหา
ในข้าวกล้องในคอลเลกชันของ 220 สายพันธุ์ข้าวและระบุ
สามสายพันธุ์ข้าว ที่มีเนื้อหาเฟสูงพิเศษ
(? 400 LG / g) เจียง, et al (2007) ชี้ให้เห็นว่าแตกต่างใน
เนื้อหาแร่หมู่ยีนอาจจะเกิดจากการที่แตกต่างกัน
ทรัพยากรพันธุกรรมที่เกี่ยวข้อง ในการศึกษานี้ผลกระทบจีโนไทป์
คิดเป็นกว่า 70% ของความแปรปรวนองค์ประกอบของ Ca ที่
นาและ K ซึ่งส่อให้เห็นว่าการเปลี่ยนแปลงทางพันธุกรรมอาจให้
โอกาสในการเลือกเนื้อหาองค์ประกอบแร่สูง
(เปา, 2002).
เนื้อหาแร่หมู่ สายข้าวที่แตกต่างกันไม่ถูก
ผลกระทบโดยเฉพาะสายพันธุ์ แต่ยังได้รับผลกระทบจากสภาพแวดล้อม
ปัจจัย บางการศึกษาก่อนหน้านี้ได้แสดงให้เห็นว่าสภาพแวดล้อมการ
เล่นผลกระทบอย่างมากต่อการสะสมของแร่ธาตุ
ในข้าว Du, et al (2013) พบว่าความเข้มข้นของแร่ธาตุใน
ธัญพืชของพ่อแม่ทั้งสองเติบโตขึ้นในหางโจวและ Lingshui,
ประเทศจีนมีความแตกต่างอย่างมีนัยสำคัญโดยเฉพาะอย่างยิ่งสำหรับ CA, Fe และ Zn.
การเปลี่ยนแปลงในระดับความเข้มข้นของแร่ธาตุในพืชอาจขึ้นอยู่กับ
รูปแบบในหลายปัจจัยเช่น แร่ระดมดูดซึม,
การค้าและการอายัดซึ่งเป็นกระบวนการที่เกี่ยวข้องทั้งหมดใน
การขนส่งทางเดินแร่จากรากหน่อ (Clemens,
2001. Ghandilyan et al, 2009) นอกจากนี้สภาพภูมิอากาศอาจ

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

3.4 . สมาคมการทดสอบสำหรับองค์ประกอบของแร่สมาคมการทดสอบเบื้องต้นพบว่าปัจจัยทางพันธุกรรมมีผลต่อความหลากหลายทางพันธุกรรมใน 7 แร่ธาตุ สิบเจ็ดตำแหน่งที่อยู่บนโครโมโซมคู่ที่ 1 , 2 , 6 , 8 , 10 และ 11 ระบุ( ตารางที่ 6 และเสริมรูปที่ 1 ) แมนฮัตตันแปลงของสมาคมแผนที่ผลลัพธ์ของ K และ Na ถูกแสดงเพิ่มเติมรูปที่ 2 ใน 2 ปี ตามลำดับเก้า 17 ตำแหน่งพบในปี 2011 ในขณะที่คนอื่นๆระบุใน 2012 เพียงหนึ่งความสําหรับปริมาณทองแดงและสังกะสีตรวจพบในปี 2011 ระบุว่า รับผิดชอบ สำหรับทองแดงและสังกะสีในข้าวธัญพืชส่วนใหญ่สภาพแวดล้อมขึ้นอยู่กับ ห้าตำแหน่งที่ถูกระบุว่าสำหรับ CA ใน 2 ปี ซึ่งทั้งสองยีนบนโครโมโซม 1และ 6 กับตำแหน่งต่าง ๆ สามารถตรวจพบได้ในแต่ละปี เป็นจำนวนมากตำแหน่งค่า K และ Na พบ ( ตารางที่ 6 และเสริมลูกมะเดื่อ . 1 และ 2 ) , แต่ไม่มีพวกเขาอาจจะตรวจพบพร้อมกันทั้ง 2 ปี4 . การอภิปราย20 สายพันธุ์ข้าวที่นำมาจากโครงการ oryzasnpเป็นตัวแทนของความหลากหลายที่กว้างในฟีโนไทป์ต่างๆ ( แม็คแนลลี่et al . , 2009 ) เช่น ลักษณะทางเกษตร ( Xu et al . , 2010 ) , ชีวมวลลักษณะ ( จ้าน et al . , 2011 ) , สารออกฤทธิ์ทางชีวภาพ ( heuberger et al . ,2010 ; โช et al . , 2010 ) และคุณลักษณะคุณภาพเมล็ด ( ถง et al . ,2014 ) อย่างไรก็ตาม อิทธิพลของพันธุกรรมและสภาพแวดล้อมในแร่องค์ประกอบใน 20 สายพันธุ์ข้าวยังไม่ได้รับรายงานก่อนในการศึกษานี้ความเข้มข้นของแคลเซียม , แมกนีเซียม โพแทสเซียม เหล็ก สังกะสี และทองแดงในข้าวกล้อง 20 สายพันธุ์ โดยศึกษาถึง แร่แต่ละชนิดเป็นธาตุที่จำเป็นสำหรับการเจริญเติบโตและพัฒนาการของพืชสัตว์และมนุษย์ ผลการศึกษาพบว่า 7 แร่ธาตุของ20 สายพันธุ์ข้าวที่แตกต่างกันอย่างมากระหว่างพันธุ์ . ตัวอย่างเช่นการเปลี่ยนแปลงที่ใหญ่ที่สุดของแร่ธาตุปริมาณ5.6-fold ( 0.217 – 2.329 มิลลิกรัม / กิโลกรัม ) สูงกว่าใน 2011 และ 5.07-fold ( 7.67 จำกัด38.86 มิลลิกรัม / กิโลกรัม ) สำหรับนา การแปรผันทางพันธุกรรมสำหรับเนื้อหาแร่มีมีรายงานวิจัยหลายกลุ่มในสายพันธุ์ข้าวต่างๆ( anuradha et al . , 2012 ; การ์เซีย Oliveira et al . , 2009 ; Gregorio , 2002 ;เจียง et al . , 2007 ) brar Jain , สิงห์ และ เจน ( 2011 ) มีขนาดใหญ่การเปลี่ยนแปลงของ Fe ( 5.1 ) LG / 441.5 กรัม ) และสังกะสี ( 2.12 ) และ LG / G ) เนื้อหาในข้าวกล้องในคอลเลกชันของ 220 ข้าวพันธุ์และระบุข้าว 3 พันธุ์กับเนื้อหา Fe โคตรสูง( LG / 400 กรัม ) เจียง et al . ( 2007 ) พบว่า ความแตกต่างในเนื้อหาของแร่ชนิดต่าง ๆ อาจจะเนื่องจากทรัพยากรทางพันธุกรรมเข้ามาเกี่ยวข้อง ในการศึกษานี้ กับผลคิดเป็นกว่า 70% ของความแปรปรวนสำหรับองค์ประกอบของแคลิฟอร์เนียNa และ K ซึ่งแสดงให้เห็นว่าการเปลี่ยนแปลงทางพันธุกรรมอาจให้โอกาสในการเลือกเนื้อหาแร่ธาตุสูง( Gregorio , 2002 )แร่เนื้อหาระหว่างสายพันธุ์ข้าวที่แตกต่างกันไม่ได้เท่านั้นแต่ยังได้รับอิทธิพลจากเมื่อได้รับผลกระทบจากสิ่งแวดล้อมปัจจัย การศึกษาก่อนหน้านี้ได้แสดงให้เห็นว่าสภาพแวดล้อมบางอย่างเล่นผลกระทบอย่างมากเกี่ยวกับการสะสมของแร่ธาตุในเมล็ดข้าว du et al . ( 2013 ) พบว่า ความเข้มข้นของแร่เม็ดสองพ่อแม่ในหางโจวและ lingshui โต ,จีน แตกต่างกันอย่างมีนัยสำคัญทางสถิติ โดยเฉพาะแคลเซียม เหล็ก และสังกะสีการเปลี่ยนแปลงความเข้มข้นของแร่ธาตุในพืชอาจขึ้นอยู่กับการเปลี่ยนแปลงในหลายปัจจัย เช่น การระดมการดูดแร่ ,การค้าและการ ซึ่งกระบวนการทั้งหมดที่เกี่ยวข้องในแร่การขนส่งทางเดินจากรากถึงยอด ( เครเมนส์2001 ghandilyan et al . , 2009 ) นอกจากนี้ สภาพอากาศที่อาจยัง